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文檔簡介
第一章糖類
提要
糖類是四大類生物分子之一,廣泛存在于生物界,特別是植物界。糖類在生物體內(nèi)不僅作為結(jié)構(gòu)成分
和主要能源,復(fù)合糖中的糖鏈作為細(xì)胞識別的信息分子參與許多生命過程,并因此出現(xiàn)一門新的學(xué)科,糖
生物學(xué)。
多數(shù)糖類具有(CH2)n的實驗式,其化學(xué)本質(zhì)是多羥醛、多羥酮及其衍生物。糖類按其聚合度分為單
糖,1個單體:寡糖,含2-20個單體;多糖,含20個以.上單體。同多糖是指僅含一種單糖或單糖衍生物
的多糖,雜多糖指含一種以上單糖或加單糖衍生物的多糖。糖類與蛋白質(zhì)或脂質(zhì)共價結(jié)合形成的結(jié)合物稱
復(fù)合糖或糖復(fù)合物。
單糖,除二羥丙酮外,都含有不對稱碳原子(C*)或稱手性碳原子,含C*的單糖都是不對稱分子,當(dāng)然
也是手性分子,因而都具有旋光性,一個C*有兩種構(gòu)型【)-和L-型或R-和S-型。因此含n個C*的單糖有
2"個旋光異構(gòu)體,組成2”1對不同的對映體。任一旋光異構(gòu)體只有一個對映體,其他旋光異構(gòu)體是它的非
對映體,僅有一個C*的構(gòu)型不同的兩個旋光異構(gòu)體稱為差向異構(gòu)體。
單糖的構(gòu)型是指離按基碳最遠的那個C*的構(gòu)型,如果與D-甘油醛構(gòu)型相同,則屬D系糖,反之屬L
系糖,大多數(shù)天然糖是D系糖FischerE論證了己醛糖旋光異構(gòu)體的立體化學(xué),并提出了在紙面上表示單
糖鏈狀立體結(jié)構(gòu)的Fischer投影式。許多單糖在水溶液中有變旋現(xiàn)象,這是因為開漣的單糖分子內(nèi)醇基與
醛基或酮基發(fā)生可逆親核加成形成環(huán)狀半縮醛或半縮酮的緣故。這種反應(yīng)經(jīng)常發(fā)生在C5羥基和C1醛基之
間,而形成八元環(huán)毗喃糖(如砒唯葡糖)或C5經(jīng)基和C2酮基之間形成五元環(huán)吠喃糖(如味喃果浦)。成環(huán)時
由于皴基碳成為新的不對稱中心,出現(xiàn)兩個異頭差向異構(gòu)體,稱a和6異頭物,它們通過開鏈形式發(fā)生互
變并處于平衡中。在標(biāo)準(zhǔn)定位的Hsworth式中D-單糖異頭碳的羥基在氧環(huán)面下方的為a異頭物,上方的為
B異頭物,實際上不像Haworth式所示的那樣氧環(huán)面上的所有原子都處在同?個平面,毗喃糖環(huán)?般采取
椅式構(gòu)象,吠喃糖環(huán)采取信封式構(gòu)象。
單糖可以發(fā)生很多化學(xué)反應(yīng)<醛基或伯醇基或兩者氧化成竣酸,談基還原成醇;一般的羥基參與成脂、
成健、氨基化和脫氧等反應(yīng);異頭羥基能通過糖管鍵與醇和胺連接,形成糖杏化合物。例如,在寡糖和多
糖中單糖與另一單糖通過0-糖昔鍵相連,在核甘酸和核酸中戊糖經(jīng)N-糖昔鍵與心啼咤或噂吟堿相連。
生物學(xué)上重要的單糖及其衍生物有Glc,Gal,Man,Fru,GlcNAc,GalNAc,L-Fuc,NeuNAc(Sia),GlcUA
等它們是募糖和多糖的組分,許多單糖衍生物參與復(fù)合糖聚糖鏈的組成,此外單糖的磷酸脂,如6-磷酸葡
糖,是重要的代謝中間物。
蔗糖、乳糖和麥芽糖是常見的二糖。蔗糖是由a-Gia和B-Fru在兩個異頭碳之間通過糖甘鍵連接而
成,它已無潛在的自由醛基,因而失去還原,成豚、變旋等性質(zhì),并稱它為非還原糖。乳糖的結(jié)構(gòu)是Gal
P(l-4)Glc,爰芽糖是Glca(IT)Glc,它們的末端葡萄搪殘基仍有潛在的自由醛基,屬還原糖。環(huán)糊精由
環(huán)糊精葡糖基轉(zhuǎn)移酶作用于直鏈淀粉生成含6,7或8個葡萄糖殘基,通過口-1,4糖昔鍵連接成環(huán),屬非還
原糖,由于它的特殊結(jié)構(gòu)被用作穩(wěn)定劑、抗氧化劑和增溶劑等。
淀粉、糖原和纖維素是最常見的多糖,都是葡萄糖的聚合物。淀粉是植物的貯存養(yǎng)料,居貯能多糖,
是人類食物的主要成分之一。糖原是人和動物體內(nèi)的貯能多糖。淀粉可分直鏈淀粉和支鏈淀粉。直鏈淀粉
分子只有aT,4連鍵,支鏈淀粉和糖原除Q7,4連鍵外尚有aT,6連鍵形成分支,糖原的分支程度比支
鏈淀粉高。纖維素與淀粉、糖原不同,它是由前萄糖通過B
肽聚糖是細(xì)菌細(xì)胞壁的成分,也屬結(jié)構(gòu)多糖。它可看成由一種稱胞壁肽的基本結(jié)構(gòu)單位重復(fù)排列構(gòu)成。
胞壁肽是一個含四有序側(cè)鏈的二糖單位,GlcNAcP(l-4)MurNAc,二糖單位問通過B-1,4連接成多糖,鏈
相鄰的多糖鏈通過轉(zhuǎn)肽作用交聯(lián)成一個大的囊狀分子。青霉素就是通過抑制轉(zhuǎn)肽干擾新的細(xì)胞壁形成而起
抑菌作用的。磷壁酸是革蘭氏陽性細(xì)菌細(xì)胞壁的特有成分;脂多糖是陰性細(xì)菌細(xì)胞壁的特有成分。
糖蛋白是一類復(fù)合糖或一類綴合蛋白質(zhì)。許多膜內(nèi)在蛋白質(zhì)加分泌蛋白質(zhì)都是糖蛋白糖蛋白和糖脂中
的套糖鏈,序列多變,結(jié)構(gòu)信息豐富,甚至超過核酸和蛋白質(zhì)。一個哀搪鏈中單糖種類、連接位置、異頭
碳構(gòu)型和糖環(huán)類型的可能排列組合數(shù)目是一個天文數(shù)字。糖蛋白中寡糖鏈的還原端殘基與多肽鏈氨基酸殘
基之間的連接方式有:N-糖太鍵,如IB-GlcNAc-Asn和0-糖肽鏈,如a-GalNAc-Thr/Ser,B-Gal-llyl,B
-L-Araf-Hyp,N-連接的寡糖鏈(N-糖鏈)都含有一個共同的結(jié)構(gòu)花式稱核心五糖或三甘露糖基核心,N-糖鏈
可分為復(fù)雜型、高甘露糖型和雜合型三類,它們的區(qū)別王要在外周鏈,0-糖鏈的結(jié)構(gòu)比N-糖鏈簡單,但連
接形式比N-糖鏈的多。
糖蛋白中的寡糖鏈在細(xì)胞識別包括細(xì)胞粘著、淋巴細(xì)胞歸巢和精卵識別等生物學(xué)過程中起重要作用。
在人紅細(xì)胞表面.上存在很多血型抗原決定簇,其中多數(shù)是募糖鏈。在ABO血型系統(tǒng)中A,B,0(H)三
個抗原決定簇只差一個單糖殘基,A型在寡糖基的非還原端有一個GalNAc,B型有一個Gal,0型這兩個殘基
均無。
凝集素是一類非抗體的能與糖類專一結(jié)合的蛋白質(zhì)或糖蛋白,伴刀豆凝集素A(ConA),花生凝集素等屬
植物凝集素;細(xì)菌和病毒也有凝集素,如流感病毒含紅細(xì)胞凝集素。作為各類白細(xì)胞CAM的選擇蛋白家族
也屬于凝集素。此家族中已知有L、E、P三種選擇蛋白,它們通過細(xì)胞粘著產(chǎn)生多種生物學(xué)效應(yīng),如免疫
應(yīng)答、炎癥反應(yīng)、腫瘤轉(zhuǎn)移等。
糖胺聚糖和蛋白聚糖是動物細(xì)胞外基質(zhì)的重要成分??钒肪厶鞘怯杉禾侨┧岷图禾前方M成的二糖單位
重復(fù)構(gòu)成。多數(shù)糖胺聚糖都不同程度地被硫酸化如4-硫酸軟骨素、硫酸角質(zhì)素等。糖胺聚搪多以蛋白聚糖
形式存在,但透明質(zhì)酸是例外。蛋白聚糖是一類特殊的糖蛋白,由一條或多條糖胺聚糖鏈和一個核心蛋
白共價連接而成。有的蛋白聚糖以聚集體(透明質(zhì)酸分子為核心)形式存在。它們是高度親水的多價陰離子,
在維持皮膚、關(guān)節(jié)、軟骨等結(jié)締組織的形態(tài)和功能方面起重要作用。
寡糖鏈結(jié)構(gòu)分析的一般步驟是:分離提純待測定的完整糖鏈,對獲得的均一樣品用GLC法測定單糖組
成,根據(jù)高碘酸氧化或甲基化分析確定糖背鍵的位置,用專一性糖背陋確定糖甘鍵的構(gòu)型。糖鏈序列可采
用外切糖昔酶連續(xù)斷裂或FAB-MS等方法加以測定。
習(xí)題
1.環(huán)狀己醛糖有多少個可能的旋光異構(gòu)體,為什么?[2732]
解:考慮到Cl、C2、C3、C4、C5各有兩種構(gòu)象,故總的旋光異構(gòu)體為2232個。
2.含D-毗喃半乳糖和D-II比喃他菊糖的雙糖可能有多少個異構(gòu)體(不包括異頭物)?含同樣殘基的糖蛋白上
的二糖鏈將有多少個異構(gòu)體?[20;32]
解:一個單糖的C1可以與另一單糖的Cl、C2、C3、C4、C6形成糖昔鍵,于是a-D-毗喃半乳基-D-1此喃葡
萄糖甘、B-D-毗喃半乳基-D-毗喃葡萄糖苜、a-D-毗喃葡萄糖基-D-哦喃半乳糖昔、B-D-噴喃葡萄糖基
-DT此喃半乳糖昔各有5種,共5X4=20個異構(gòu)體。
糖蛋白上的二糖鏈其中一個單糖的C1用于連接多肽,C2、C3、C4、C6用于和另一單糖的C1形成糖苜
鍵,算法同上,共有4X4=16個,考慮到二糖與多肽相連時的界頭構(gòu)象,異構(gòu)體數(shù)目為16X2=32個。
3.寫出B-D-脫氧核糖、a-D-半乳糖、B-L-山梨糖和B-D-N-乙酰神經(jīng)氨酸(唾液酸)的Fischer投影
式,Haworth式和構(gòu)象式。
4.寫出下面所示的(A).(B)兩個單糖的正規(guī)名稱(D/L,a/B,f/p),指出(C).(D)兩個結(jié)構(gòu)用RS系統(tǒng)表示
的構(gòu)型(R/S)
[A.B—D-f-Fru;B、a-L-p-Glc;C、R;D、S]
5.L7-葡萄糖的a和B異頭物的匕旋[aD20?!?。當(dāng)a°°。計算平衡混合液中a和B異頭物的比率。假設(shè)
開鏈形式和吠喃形式可忽略。
解:設(shè)a
6.將500mg糖原樣品用放射性氟化鉀(K"CN)處理,被結(jié)合的"CN-umol,另一500mg同一糖原樣品,
用含3%HC1的無水甲醉處理,使之形成還原末端的甲基輻糖昔。然后用高碘酸處理這個還原端成為甲基
葡糖背的糖原,新產(chǎn)生的甲酸準(zhǔn)確值是347uX10"
XiO^XlO6
(b)347X106X
7.D-葡萄糖在31℃水中平衡時,a-毗喃葡糖和時由a異頭物轉(zhuǎn)變?yōu)锽AG°=-1.31kJ/mol]
解:AG°X300X
XX】09=7800殘基/s
9.經(jīng)還原可生成山梨醇(D-前萄醇)的單糖有哪些?[L-山梨糖;D-福萄糖;L-古洛糖;D-果糖]
10.寫出麥芽糖(a型)、纖維二糖(B型)、龍膽糖和水蘇糖的E規(guī)(系統(tǒng))名稱的簡單形式,并指出其中哪
些(個)是還原糖,哪些(個)是非還原糖。
解:麥芽糖(Q型):Glca(1-4JG1C
纖維二糖(B型):GlcB(l-4)Glc
龍膽糖:GlcP(l-*6)Glc
水蘇糖:Gala(l->6)Gala(l->6)Glc(a1-B2)Fru
11.纖維素和糖原雖然在物理性質(zhì)上有很大的不同,但這兩種多糖都是1-4連接的D-葡萄糖聚合物,相對
分子質(zhì)量也相當(dāng),是什么結(jié)構(gòu)特點造成它們在物理性質(zhì)上的如此差別?解釋它們各自性質(zhì)的生物學(xué)優(yōu)點。
12.革蘭氏陽性細(xì)菌和陰性細(xì)菌的細(xì)胞壁在化學(xué)組成上有什么異同?肽聚糖中的糖肽健和糖蛋白中的糖肽
鍵是否有區(qū)別?
答:肽聚糖:革蘭氏陽性細(xì)菌和陰性細(xì)菌共有;磷壁酸:革蘭氏陽性細(xì)菌特有:脂多糖:革蘭氏陰性
細(xì)菌特有。兩種糖肽鍵有區(qū)別:肽聚糖中為NAM的C3羥基與D-Ala股基相連;糖蛋白中是糖的C1羥基與
多J太Asny-氨基N或Thr/Ser/Hyl/Hyp羥基0相連。
13.假設(shè)一個細(xì)胞表面糖蛋白的一個三糖單位在介導(dǎo)細(xì)胞與細(xì)胞粘著中起關(guān)鍵作用。試設(shè)計一個簡單試驗
以檢驗這一假設(shè)。[如果糖蛋白的這個三糖單位在細(xì)胞相互作用中是關(guān)鍵的,則此三糖本身應(yīng)是細(xì)胞粘著
的競爭性抑制劑]
14,糖蛋白中N-連接的聚糖鏈有哪典類型?它們在結(jié)構(gòu)上有什么共同點和不同點?
答:(1)復(fù)雜型(complextype)這類N-糖鏈,除三甘露糖基核心外,不含其他甘露糖殘基。還原端殘
基為GlcNAcB1一的外鏈與三甘露糖基核心的兩個a-甘露糖殘基相連,在三類N-糖鏈中復(fù)雜型結(jié)構(gòu)變化最
大,
(2)高甘露糖型(high-mannosetype)此型N-糖鏈除核心五糖外只含a-甘露糖殘基。
(3)雜合型(hybridtype)此型糖鏈具有復(fù)雜型和高H.露糖型這兩類糖鏈的結(jié)構(gòu)元件。
15.舉出兩個例子說明糖蛋白寡糖鏈的生物學(xué)作用。
答:(1)糖鏈在糖蛋白新生肽鏈折疊和締合中的作用;
(2)糖鏈影響糖蛋白的分泌和穩(wěn)定性。(例見教材P60vP61)
16.寫出人ABH血型抗原決定簇的前體結(jié)構(gòu),指出A抗原、B抗原和??乖?H物質(zhì))之間的結(jié)構(gòu)關(guān)系,[答
案見表1-9]
17.具有重復(fù)二糖單位,GlcUA13(l-3)GlcNA,而單位間通過B(1—4)連接的天然多糖是什么?[透明質(zhì)酸]
18.糖胺聚糖如硫酸軟骨素,其生物功能之一與該分子在水中所占的體積遠比脫水時大這一生質(zhì)有關(guān)。為
什么這些分子在溶液中所占體積會這樣大?
答:由于分子表面含有很多親水基團,能結(jié)合大量的水,形成透明的高粘性水合凝膠,如一個透明質(zhì)
酸(HA)分子在水中將占據(jù)1000'10000倍于自身體積的空間。
19.舉例說明內(nèi)切糖甘酶和外切糖甘酶在聚糖鏈結(jié)構(gòu)測定中的作用。(見教材P73)
20.一種三糖經(jīng)B-半乳糖昔酶完全水解后,得到D-半乳糖和D-葡萄糖,其比例為2:1,將原有的三糖用
還原,繼而使其完全甲基化和酸水解,然后再進行一次NaBHi還原,最后用醋酸酊乙酸化,得到二種
產(chǎn)物:①2,3,4,6-四甲基1,5二乙?;?半乳糖醇,②③B(1-*6)D-Gal3(1->4)D-Glc]
第二章脂質(zhì)
提要
脂質(zhì)是細(xì)胞的水不溶性成分,能用有機溶劑如乙醛、氯仿等進行提取。
脂質(zhì)按化學(xué)組成可分為單純脂質(zhì)、復(fù)合脂質(zhì)和衍生脂質(zhì);按生物功能可分為貯存脂質(zhì)、結(jié)構(gòu)脂質(zhì)和活
性指質(zhì)。
天然脂肪酸通常具有偶數(shù)碳原子,鏈長一般為12-22碳。脂肪酸可分為飽和、單不飽和與多不飽和脂
肪酸。不飽和脂肪酸的雙鍵位置,有一個雙鍵幾乎總是處于C9-C10之間(△?并且一般是順式的。脂肪酸
的物理性質(zhì)主要決定于其燒鏈的長度與不飽和程度。
必需脂肪酸是指對人體的功能不可缺少,但必須由膳食提供的兩個多不飽和脂肪酸,亞油酸和a-亞
麻酸;前者屬3-6家族,后者3-3家族。
類二十碳烷主要是由20碳的花生四烯酸衍生而來并因此得名,包括前列腺素、凝血惡烷和白三烯,
它們是體內(nèi)的局部激素。
三酰甘油或甘油三脂(TG)是由脂肪酸與甘油形成的三脂。三酰甘油可分簡單三酰甘油和混合三酰甘
油,天然油脂是簡單和混合三酰甘油的混合物。三酰甘油與堿共熱可發(fā)生皂化,生成脂肪酸鹽(皂)和甘油。
三酰甘油也和游離脂肪酸一樣,它的不飽和鍵能發(fā)生氧化、鹵化和過氧化作用。測定天然油脂的皂化值、
碘值、酸值和乙?;?,可確定所給油脂的特性。三酰甘油主要作為貯存燃料,以油滴形式存在于細(xì)胞中。
蠟是指長鏈脂肪酸和長鏈一元醇或固醇形成的酯。天然蠟如蜂蠟是多種蠟酯的混合物。蠟是海洋浮游
生物中代謝燃料的主要貯存形式,蠟還有其他的生物功能如防水、防侵襲等。
脂質(zhì)過氧化定義為多不飽和脂肪酸或多不飽和脂質(zhì)的氧化變質(zhì)。它是典型的活性氧參與的自由基鏈?zhǔn)?/p>
反立?;钚匝酰?。2、?0H、卜[2。2、-0?等)使生物膜發(fā)生脂質(zhì)過氧化,造成膜的損傷、蛋白質(zhì)和核酸等大分子
的異常。脂質(zhì)過氧化與多種疾病有關(guān)。體內(nèi)的抗氧化劑如超氧化物歧化酶(S0D)、維生素E等是與脂質(zhì)過
氧化坑衡的保護系統(tǒng)。
磷脂包括廿汕磷脂和鞘磷脂,廿汕磷脂是由sn-廿汕-3-磷酸衍生而來,最簡單的廿汕磷脂是3-sn-磷
脂酸,它是其他甘油磷脂的母體c磷脂酸進一步被一個極性醇(如膽堿、乙醇胺等)酯化,則形成各種甘油
磷指如磷脂酰膽堿和磷脂酰乙醉按。鞘磷脂是由鞘氨醇代替甘油磷脂中的u?油形成的磷脂。鞘寂醇是種長
鏈的氨基醉。其2-位氨基以酰胺鍵與脂肪酸連接形成神經(jīng)酰胺,這是這類磷脂的母體。神經(jīng)酰胺的1-位
羥基被磷酰膽堿或磷酰乙醇胺脂化則形成鞘磷脂。磷脂是兩親分子,有一個極性頭基和一個非極性尾,在
水介質(zhì)中能形成脂雙層;它們主要參與膜的組成。
糖脂主要是鞘糖脂,它也是神經(jīng)酰胺的衍生物,在神經(jīng)酰胺的1位羥基通過糖甘鍵與糖基連接而成鞘
糖指。重要的鞘糖脂有腦甘脂和神經(jīng)節(jié)甘脂,后者含有唾液酸。作為膜脂的鞘糖脂與細(xì)胞識別以及組織、
器官的特異性有關(guān)。
砧類可看成是異戊二烯(CS)的聚合物,有倍半帖、雙帖、三砧、四站等。站的結(jié)構(gòu)有線形的,也有環(huán)
狀的。許多植物精油、光合色素和笛類的前體鯊烯都是朝。
類固醇或稱俗類,是環(huán)戊烷多氫菲的衍生物。固醉或第醇是類固醉中的一大類,其結(jié)構(gòu)特點是在俗核
的C3上有一個B羥基,C17上有一個含8~10個碳的燃鏈。固醉存在于大多數(shù)真核細(xì)胞的膜中但細(xì)菌不含
固醇。膽固醇是最常見的一種動物固醇,參與動物細(xì)胞膜的組成。膽固醇也是體內(nèi)類固醇激素和膽汁酸(膽
酸、鵝膽酸和脫氧膽酸)的前體。膽固醇與動脈粥樣硬化有關(guān)。植物固醇如谷固醇、豆固醇,它們自身不
易被腸粘膜吸收并能抑制膽固醇吸收。
脂蛋白是由脂質(zhì)和蛋白質(zhì)以非共價鍵結(jié)合而成的復(fù)合體。脂蛋白中的蛋白質(zhì)部分稱載脂蛋白。血漿脂
蛋白是血漿中轉(zhuǎn)運脂質(zhì)的脂蛋白顆粒。由于各種血漿脂蛋白的密度不同可用超離心法把它們分成5個組分
(按密度增加為序):乳糜微粒,極低密度脂蛋白(VLDL),中間密度脂蛋白(IDL),低密度脂蛋白(LDL)和高密
度指蛋白(HDL)。血漿脂蛋白都是球形顆粒,有一個由三酰甘油和膽固醉脂組成的疏水核
心和一個由磷脂、膽固醇和載脂蛋白參與的極性外殼。載脂蛋白的主要作用是增溶疏水脂質(zhì)和作為脂蛋白
受體的識別部位。
測定脂質(zhì)組成時,脂質(zhì)可用有機溶劑從組織中提取,用薄層層析或氣液色譜進行分離。單個的脂質(zhì)可
根據(jù)其層析行為,對專一性酶水解的敏感性或質(zhì)譜分析加以鑒定。
習(xí)題
1.天然脂肪酸在結(jié)構(gòu)上有哪些共同的特點?
答:天然脂肪酸通常具有偶數(shù)碳原子,鏈長一般為12-22碳。脂肪酸可分為飽和、單不飽和與多不飽
和指肪酸。不飽和脂肪酸的雙鍵位置,有一個雙鍵幾乎總是處于C9-C10之間(△?,并且一般是順式的。
2.(a)由甘油和三種不同的脂肪酸(如豆蔻酸、棕檎酸和硬脂酸)可形成多少種不同的三酰甘油(包括簡單
型和混合型在內(nèi))?(b)其中定量上不同組成的三酰甘油可有多少種?[(a)27種;(b)10種]
解:(a)3227種;
(b)3X3+1=10種
3.(a)為什么飽和的18碳脂肪酸一一硬脂酸的熔點比18碳不飽和脂肪酸一一油酸的熔點高?(b)干酪乳
桿菌產(chǎn)生的乳杯菌酸(19碳脂肪酸)的熔點更接近硬脂酸的熔點述是更接近油酸的熔點?為什么?
答:(a)油酸有一個49順式雙鍵,有序性校差;而硬脂酸有序性高,故熔點也高:
(b)硬脂酸。因為熔點隨鏈長的增加而增加。
4.從植物種子中提取出1g油脂,把它等分為兩份,分別用于測定該油脂的電化值和碘值。測定皂化值的
一份樣品消耗KOH65mg,測定碘值的一份樣品消耗I?510mg.試計算該油脂的平均相對分子質(zhì)量和碘值。
[1292:102]
解:Mr=(3X56X1000)/(2X65)=1292
12X2的克數(shù))
5.某油脂的碘值為68,皂化值為210。計算每個油脂分子平均含多少個雙健。[2個]
解:100g油脂的物質(zhì)的量二(210X100)/(3X56X
^2個
6.(a)解釋與脂質(zhì)過氧化育關(guān)的幾個術(shù)語:自由基、活性氧、自由基鏈反應(yīng)和抗氧化劑;(b)為什么PUFA
容易發(fā)生脂質(zhì)過氧化?
答:⑸
自由基;自由基也稱游離基,是指含有奇數(shù)價電子并因此在一個軌道上具有一個未(不)成對電子
(unpairedelectron)的原子或原子團。
活性氧:氧或含氧的高反應(yīng)活性分子,如()2、?OH、也0八-a(單線態(tài)氧)等統(tǒng)稱為活性氧。
自由基鏈反應(yīng):自由基化學(xué)性質(zhì)活潑,能發(fā)生抽氫、歧化、化合、取代、加成等多種反應(yīng),但是自由
基反應(yīng)的最大特點是傾向于進行鏈「式」反應(yīng)(chainreaction),鏈反應(yīng)一般包括3個階段:引發(fā)、增
長和終止。
抗氧化劑:凡具有還原性而能抑制靶分子自動氧化即抑制自由基鏈反應(yīng)的物質(zhì)稱為抗氧化劑
(antioxidant)。
(b)多不飽和脂肪酸(PUFA)中的雙鍵具有潛在的還原性,容易發(fā)生過氧化作用。
7.為解決甘油磷脂構(gòu)型上的不明確性,國際生物化學(xué)命名委員會建議采取立體專一編號命名原則。試以
磷酸甘油為例說明此命名原則。
8.寫出下列化合物的名稱:
(a)在低pH時,攜帶一個正凈電荷的甘油磷脂;(b)在中性pH時攜帶負(fù)凈電荷的甘油磷脂;(c)在中性
pH時,凈電荷為零的甘油磷脂。
答:(a)磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醉I按;(b)磷脂酰絲氨酸、磷脂酰肌醇、磷脂酰甘油,T:雙磷脂酰甘油(心
磷指),-2;(c)磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺。
9.給定下列分子成分:甘油、脂肪酸、磷酸、長鏈醉和糖。試問(a)哪兩個成分在蠟和鞘脂脂中都存在?(b)
哪兩個成分在脂肪和磷脂酰膽堿中都存在?(c)哪些(個)成分只在神經(jīng)節(jié)苜脂而不在脂肪中存在?[(a)脂肪
酸,長鏈醇;(b)甘油,脂肪酸;(c)糖,長鏈醇]
10.指出下列膜脂的親水成分和疏水成分:(a)磷脂酰乙醇胺;(b)鞘磷脂;(c)半乳糖基腦昔脂;(d)神經(jīng)節(jié)
昔指;(。)膽固醇。
答:(a)乙醇胺;脂肪酸
(b)磷酰膽堿或磷酰乙靜胺;脂肪酸和燃鏈
(c)半乳糖;脂肪酸和燒鏈
(d)連有唾液酸的寡糖鏈;脂肪酸和燃鏈
(e)C3羥基;一核和C17烷為側(cè)鏈
11.(a)造成類固醉化合物種類很多的原因是什么?(b)人和動物體內(nèi)膽固靜可轉(zhuǎn)變?yōu)槟男┚哂兄匾硪?/p>
義的類固醇物質(zhì)?
答:⑸①環(huán)上的雙鍵數(shù)日和位置不同;②取代基的種類、數(shù)目、位置和取向(QB)不同;③環(huán)和環(huán)稠
合的構(gòu)型(順反異構(gòu))不同。
(b)動物中從膽固醇衍生來的類固醇包括5類激素:雄激素、雌激素、孕酮、糖皮質(zhì)激素和鹽皮質(zhì)
激素,維生素D和膽汁酸。
12.膽酸是人膽汁中發(fā)現(xiàn)的A-B順式類固醉(圖2T8)。請按圖2-15所求椅式構(gòu)象畫出膽酸的構(gòu)象式,并
以直立鍵或平伏鍵標(biāo)出C3,C7和C12上3個羥基。
333
XXX
14.一種低密度脂蛋白(LDL含apoB-100("為500000)和總膽固醇(假設(shè)平均Mr為590)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別
為25%和50%。試汁算apoB-10。與總膽固醇的摩爾比[1:1695]
解:設(shè)摩爾比為1/x,則有500000/590x=25/50,解得x=1695
15.用化學(xué)方法把鞘磷脂與磷脂酰膽堿區(qū)分開來。
第三章泉及薇
提要
a-氨基酸是蛋白質(zhì)的構(gòu)件分子,當(dāng)用酸、堿或蛋白酶水解蛋白質(zhì)時可獲得它們。蛋白質(zhì)中的氨基酸
都是L型的。但堿水解得到的氨基酸是I)型和L型的消旋混合物。
參與蛋白質(zhì)組成的基本氨基酸只有20種。此外還有若干種氨基酸在某些蛋白質(zhì)中存在,但它們都是
在蛋白質(zhì)生物合成后由相應(yīng)是基本氨基酸(殘基)經(jīng)化學(xué)修飾而成。除參與蛋白質(zhì)組成的氨基酸外,還有
很多種其他氨基酸存在與各種組織和細(xì)胞中,有的是B-、丫-或6-氨;基酸,有些是D型氨基酸。
氨基酸是兩性電解質(zhì)。當(dāng)pH接近1時,氨基酸的可解離基團全部質(zhì)子化,當(dāng)pH在13左右時,則全
部去質(zhì)子化。在這中間的某一pH(因不同氨基酸而異),氨基酸以等電的兼性離子(HNCHRCOO)狀態(tài)存
在,某一氨基酸處于凈電荷為零的兼性離子狀態(tài)時的介質(zhì)pH稱為該氨基酸的等電點,用pl表示。
所有的a-氨基酸都能與瑋三酮發(fā)生顏色反應(yīng)。a-NH?與2,4-二硝基氟紫(DNFB)作用產(chǎn)生相應(yīng)的DNP-
氨基酸(Sanger反應(yīng));a-NFL與笨乙硫毓酸酯(PITC)作用形成相應(yīng)氨基酸的苯胺基硫甲酰衍生物(Edman
反應(yīng))。胱氨酸中的二硫鍵可用氧化劑(如過甲酸)或還原劑(如疏基乙醇)斷裂。半胱氨酸的SH基在空
氣中氧化則成二硫鍵。這幾個反應(yīng)在氨基酸荷蛋白質(zhì)化學(xué)中占有重要地位。
除甘氨酸外a-氨基酸的a-碳是一個手性碳原子,因此a-氨基酸具有光學(xué)活性。比旋是a-氨基酸的
物理常數(shù)之一,它是鑒別各種氨基酸的一種根據(jù)。
參與蛋白質(zhì)組成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外區(qū)有光吸收,這是紫外吸收法定最蛋白
質(zhì)的依據(jù)。核磁共振(NMR)波譜技術(shù)在氨基酸和蛋白質(zhì)的化學(xué)表征方面起重要作用。
氨基酸分析分離方法主要是基于家基酸的酸堿性質(zhì)和極性大小。常用方法有離子交換柱層析、高效液
相層析(HPLC)等。
習(xí)題
1.寫出下列氨基酸的單字母和三字母的縮寫符號:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰軀、谷氨酸、苯丙氨酸、色
氨酸和酪氨酸。[見表3T]
表3T氨基酸的簡寫符號
三字
三字母符單字母單字母
名稱名稱母符
號符號符號
號
丙氨酸(alanine)AlaA光氨酸(leucine)LeuL
精氨酸(arginine)ArgR賴氨酸(lysine)LysK
甲硫氮酸(蛋氨
天冬酰氨(asparagines)Asn\Met\\
酸)(methionine)
天冬氨酸(asparticacid)AspD苯丙氨酸(phenylalanine)PhcF
半胱氨酸(cysteine)CysC脯氨酸(praline)ProP
谷氨酰氨(glutamine)GinQ絲氨酸(serin。)SerS
谷氨酸(glutamicacid)GluE蘇氨酸(threonine)ThrT
甘氨酸(glycine)GlyG色氨酸(tryptophan)TrpW
組氨酸(histidine)HisH酪氨酸(tyrosine)TyrY
異亮氨酸(isoleucine)HeI綴氨酸(valine)VaiV
Asn和/或AspAsxBGin和/或GluGlsZ
2、計算賴氨酸的£Q-NH;
解:(見表3-3.P133)
3、計算谷氨酸的YY00H三分之二被解離時的溶液pH
解:pH=pKa+lg2/3pKa=
mol/L溶液的pH:(a)亮氨酸鹽酸鹽;(b)亮氨酸鈉鹽;(c)等電亮颯酸。[(a)約約約]
5、根據(jù)表3-3中氨基酸的pKa值,計算下列氨基酸的pl值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸???/p>
解:pl=1/2(pKal+pKa2)
pl(Ala)=1/2
pl(Cys)=1/2(1.71+10.78)=
pI(Glu)=1/2(2.19+4.25)=
pl(Ala)=1/2(9.04+12.48)=
6、向lUmol/LmolHCl,問所得溶液的pHmolNaOH以代替HC1時,pH將是多少?[pH
7、將丙氨酸溶液(400ml)調(diào)節(jié)到pHPhmol/LNaOH溶液250mlg]
mol/L的組氨酸溶液在pHmol/L)<[HisZ'Xl()4,His'His°X10*]
解;ChpH=pKl+lg(His2710)=pKr+lg(HisVHis24)=pK2+lg(His0/His*)
得His’XlO",HisHis°X101
)和Imol/LKOH配制ILpHmol/L,加入352nli1mol/LKOH,用水稀釋至IL]
10、為什么氨基酸的苛三酮反應(yīng)液能用測壓法定量氨基酸?
解:荀三酮在弱酸性溶液中與氨基酸共熱,引起氨基酸氧化脫氨脫段反映,(其反應(yīng)化學(xué)式見P139),
其中,定量釋放的COz可用測壓法測量,從而計算出參加反應(yīng)的氨基酸量。
g/50ml6mol/L1IC1)在20cm°。計算L-亮氨酸在6moi/LHC1中的比旋(㈤)?!鉣
12、標(biāo)出異亮氨酸的4個光學(xué)異構(gòu)體的(R,S)構(gòu)型名稱。[參考圖3-15]
13、甘氨酸在溶劑A中的溶解度為在溶劑B中的4倍,苯丙氨酸在溶劑A中的溶解度為溶劑B中的兩倍。
利用在溶劑A和B之間的逆流分溶方法將甘氨酸和苯丙氨酸分開。在起始溶液中甘氨酸含量為lOOmg,苯
丙氨酸為81mg,試回答下列問題:(l)mgGly+24mgPhemgGly+36mgPhe]
解:根據(jù)逆流分溶原理,可得:
對于Gly:Kd=CA/CB=4=q(動相)/p(靜相)p+q=1=(1/5+4/5)
4個分溶管分溶3次:(1/5+4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125
對于Phe:Kd=G/CR=2二q(動相)/p(靜相)p+q=1=(1/3+2/3)
4個分溶管分溶3次:(1/3+2/3)=1/27+6/27+12/27+8/27
故利用4個分溶管組成的分溶系統(tǒng)中,甘氨酸和苯丙氨酸各在4管和第3管中含量最高,其中:
第4管:Gly:64/125XmgPhe:8/27X81=24mg
第3管:Gly:48/125XmgPhe:12/27X81=36mg
14、指出在正丁醇:醋酸:水的系統(tǒng)中進行紙層析時,下列混合物中氨基酸的相對遷移率(假定水相的pHIle,
Lys;(2)Phe,Ser(3)Ala,Vai,Leu;(4)Pro,Vai(5)Glu,Asp;(6)Tyr,Ala,Ser,His.
[Ile>lys:Phe,>Ser;Leu>Vai>Ala,;Vai>Pro:Glu>Asp:Tyr>Ala>Ser=His]
解:根據(jù)P151圖3-25可得結(jié)果。
15.將含有天冬氨酸、甘氨酸、亮氨酸和賴氨酸的檸檬酸緩沖液,加到預(yù)先同樣緩沖液平衡過的強陽離交
換樹脂中,隨后用愛緩沖液析脫此柱,并分別收集洗出液,這5種氨基酸將按什么次序洗脫下來?[Asp,Thr,
Gly,Leu,Lys]
解:在pH3左右,氨基酸與陽離子交換樹脂之間的靜電吸引的大小次序是減刑氨基酸(小)>中性氨基酸(髀)》
酸性氨基酸(A,)。因此氨基酸的洗出順序大體上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是堿性氨基酸,由于氨
基酸和樹脂之間還存在疏水相互作用,所以其洗脫順序為:Asp,Thr,Gly,Leu,Lys。
第四章蛋白質(zhì)的共價牯構(gòu)
提要
蛋白質(zhì)分子是由一條或多條肽鏈構(gòu)成的生物大分子。多肽鏈?zhǔn)怯砂被嵬ㄟ^肽鍵共價連接而成的,各
種多肽鏈都有自己特定的氨基酸序列。蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量介于6000到10000()0或更高。
蛋白質(zhì)分為兩大類:單純蛋白質(zhì)和綴合蛋白質(zhì)。根據(jù)分子形狀可分為纖維狀蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)和膜
蛋白質(zhì)。此外還可按蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能分類。
為了表示蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同組織層次,經(jīng)常使用一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu)這樣一些
專門術(shù)語。一級結(jié)構(gòu)就是共價主鏈的氨基酸序列,有時也稱化學(xué)結(jié)構(gòu)。二、三和四級結(jié)構(gòu)又稱空間結(jié)構(gòu)(即
三堆結(jié)構(gòu))或高級結(jié)構(gòu)。
蛋白質(zhì)的生物功能決定于它的高級結(jié)構(gòu),高級結(jié)構(gòu)是由一級結(jié)構(gòu)即氨基酸序列決定的,二氨基酸序列
是由遺傳物質(zhì)DNA的核甘酸序列規(guī)定的。
肽鍵(CO—MI)是連接多肽錐主鏈中氨基酸殘缺的共價鍵,二硫鍵是使多肽鏈之間交聯(lián)或使多肽鏈成
環(huán)的共價鍵。
多肽鏈或蛋白質(zhì)當(dāng)發(fā)生部分水解時,可形成長短不一的肽段。除部分水解可以產(chǎn)生小肽之外,生物界
還存在許多游離的小肽,如谷胱甘肽等。小肽晶體的熔點都很高,這說明短肽的晶體是離子晶格、在水溶
液中也是以偶極離子存在的。
測定蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的策略是:(1)測定蛋白質(zhì)分子中多肽鏈數(shù)目;(2)拆分蛋白質(zhì)分子的多肽鏈;
(3)斷開多肽鏈內(nèi)的二硫橋;(4)分析每一多肽鏈的某基酸組成;(5)鑒定多肽鏈的N-末端和C-末端殘
基;(6)斷裂多肽鏈成較小的肽段,并將它們分離開來;(7)測定各肽段的氨基酸序列;(8)利用重疊肽
重建完整多肽鏈的一級結(jié)構(gòu);(9)確定半胱氨酸殘基形成的S-S交聯(lián)橋的位置。
序列分析中的重要方法和技術(shù)有:測定上末端基的苯異硫就酸酯(PITC)法,分析C-末端基的我肽
酶法,用于多肽鏈局部斷裂的酶裂解和CNBr化學(xué)裂解,斷裂二硫橋的疏基乙醉處理,測定肽段朝基酸序
列的Edman化學(xué)降解和電噴射串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),重建多肽鏈一級序列的重置肽拼湊法以及用于二硫橋定位的
對角線電泳等。
在不同生物體中行使相同或相似功能的蛋白質(zhì)稱同源蛋白質(zhì)。同源蛋白質(zhì)具有明顯的序列相似性(稱
序列同源),兩個物種的同源蛋白質(zhì),其序列間的氨基酸差異數(shù)目與這些物種間的系統(tǒng)發(fā)生差異是成比例
的,并根據(jù)同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列資料建立起進化樹。同源蛋白質(zhì)具有共同的進化起源。
在生物體內(nèi)有些蛋白質(zhì)常以前體形試合成,只有按一定方式裂解除去部分肽鏈之后才出現(xiàn)生物活性,
這一現(xiàn)象稱蛋白質(zhì)的激活。血液凝固是涉及氨基酸序列斷裂的一系列酶原被激活的結(jié)果,酶促激活的級聯(lián)
放大,使血凝塊迅速形成成為可能。凝血酶原和血清蛋白原是兩個最重要的血凝因子。血纖蛋白蛋白原在
凝血酶的作用下轉(zhuǎn)變?yōu)檠宓鞍啄龎K(血塊的主要成分)。
我國在20世紀(jì)60年代首次在世界上人工合成了蛋白質(zhì)——結(jié)晶牛胰島素。近二、三十年發(fā)展起來的
固相肽合成是控制合成技術(shù)上的一個巨大進步,它對分子生物學(xué)和基因工程也就具有重要影響和意義。至
今利用Merrifield固相肽合成儀已成功地合成了許多肽和蛋白質(zhì)。
習(xí)題
1.如果一個相對分子質(zhì)量為12000的蛋白質(zhì),含10種氨基酸,并假設(shè)每種氨基酸在該蛋白質(zhì)分子中的數(shù)
目相等,問這種蛋白質(zhì)有多少種可能的排列順序?[10w]
解:10—加儂
2、有一個A肽,經(jīng)酸解分析得知為Lys、His、Asp、Glu2、Ala以及Vai、Tyr和兩個Nlh分子組成。當(dāng)A
肽與FDNB試劑反應(yīng)后得DNP-Asp;當(dāng)用竣肽酶處理后得游離綴氨酸。如果我們在實驗中將?A肽川胰蛋白酶
降解時,得到兩種肽,其中一種(Lys、Asp、GlusAla、Tyr)在pHHis、Glu以及Vai)可給除DMP-His,
在pHAsp、Ala、Tyr)在pHLys、His、Glu2以及Vai)在pH[Asr)-Ala-Tyr-Glu-Lys-His-GlrrVal]
解:1、N-末端分析:FDNB法得:Asp-;
2、C-末端分析:歿肽酶法得:-Vai;
3、胰蛋白酶只斷裂賴氨酸或精氨酸殘基的按基形成的肽鍵,得到的是以Arg和Lys為C-末端殘基的
肽斷。酸水解使Asn-*Asp+NII/,由己知條件(Lys、Asp、Glu、Ala、Tyr)可得:
Asn-()-()-()-Lys-()-()-Val:
4、FDNB法分析N-末端得DNP-His,酸水解使Gin-GluZH;由已知條件(His、Glu.Vai)可得:
Asn-()-()-()-Lys-His-Gln-Val;
5、糜蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的竣基端肽鍵。由題,得到的一條肽(Asp、Ala、
Tyr)結(jié)合(3)、(4)可得該肽的氨基酸序列為:Asn-A1a-Tyr-G1u-Lys-His-G1n-Va1
3、某多肽的氨基酸序列如下:G1u~Va1-Lys-Asn-Cys-Phe-Arg-Trp-Asp-Leu-G1y-Ser-Leu-G1u-
Ala-Thr-Cys-Arg-His-Met-Asp-Gln-Cys-Tyr-Pro-Gly-Glu_Glu-LySo(1)如用胰蛋白IW處理,此多肽將
產(chǎn)生幾個肽?并解釋原因(假設(shè)沒有二硫鍵存在);(2)在時,此多肽的凈電荷是多少單位?說明理由(假
設(shè)pKa值:a-a-NH3'Glu和AspLys和Argilis側(cè)鏈基;Cys側(cè)鏈基;TyrCys
4、今有一個七肽,經(jīng)分析它的氨基酸組成是:LysxPro、Arg、Phe、Ala、Tyr和Ser。此肽未經(jīng)糜蛋白
酶處理時,與FDNB反應(yīng)不產(chǎn)生a-DNP-氨基酸。經(jīng)糜蛋白酶作月后,此肽斷裂城兩個肽段,其氨基酸組成
分別為Ala>Tyr>Ser和Pro、Phe、Lys、Arg。這兩個肽段分別與FDNB反應(yīng),可分別產(chǎn)生DNP-Ser和DNP-Lys。
此肽與胰蛋白酶反應(yīng)能生成兩個肽段,它們的氨基酸組成分別是Arg、Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala。
試問此七肽的一級結(jié)構(gòu)怎樣?[它是一個環(huán)肽,序列為:-Phe-Ser-Ala-Tyr-Lys-Pro-Arg-]
解:(1)此肽未經(jīng)糜蛋白酶處理時,與FDNB反應(yīng)不產(chǎn)生a-DNP-氨基酸,說明此肽不含游離末端NHz,即
此技為一環(huán)肽;
(2)糜蛋白酶斷裂Phe、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的粉基端肽鍵,由已知兩肽段氨基酸組成(Ala.
Tyr、Ser和Pro、Ph。、Lys、Arg)可得:-()-()-Tyr-和-()-()-()-Phe-;
(3)由(2)得的兩肽段分別與FDNB反應(yīng),分別產(chǎn)生DNP-Ser和DNP-Lys可知該兩肽段的N-末端分
別為-Ser-和-Lys-,結(jié)合(2)可得:-Scr-Ala-Tyr-和-Lys-()-()-Phe-;
(4)胰蛋白酶專一斷裂Arg或Lys殘基的竣基參與形成的抗鍵,由題生成的兩肽段氨基酸組成(Arg、
Pro和Phe、Tyr、Lys、Ser、Ala)可得:-Pro-Arg-和-()-()-()-()-Lys;
綜合(2)、(3)、(4)可得此肽一級結(jié)構(gòu)為:-Lys-Pro-Arg-Phe-Ser-Ala-Tyr-
5、三肽Lys-Lys-Lys的pl值必定大于它的任何一個個別基團的pKa值,這種說法是否正確?為什么?
[正確,因為此三肽處于等電點時,七解離集團所處的狀態(tài)是C-末端C00(),N末端ML(pKa?£-NH;)
(),因此pl>最大的pKa
6、一個多肽可還原為兩個肽段,它們的序列如下:鏈1為Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg-Arg-
Val-Cys;鏈2為Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys。當(dāng)用嗜熱菌蛋白酶消化原多肽(具有完整的二硫鍵)時可用下列
各3太:(1)(Ala、Cys2、Vai);(2)(Arg、Lys、Phe、Pro);(3)(Arg2、Cys2、Trp、Tyr);(4)(Cys2、
Phe)o試指出在該天然多肽中二硫鍵的位置。(結(jié)構(gòu)如下圖)
Is-s1
Ala-Cys-Phe-Pro-Lys-Arg-Trp-Cys-Arg-Arg-ValCys
S
S
Cys-Tyr-Cys-Phe-Cys
1s-s1
解:嗜熱菌蛋白酶作用專一性較差,根據(jù)題中已知條件:
(1)消化原多肽得到(Ala、Cys2、Vai),說明鏈1在2位Cys后及11位Vai前發(fā)生斷裂,2位Cys
與12位Cys之間有二硫鍵;
(2)由鏈1序列可得該肽段序列為:-Phe-Pro-Lys-Arg-;
(3)由(1)(2)可知該肽段(Arg2、Cys2、Trp.Tyr)中必有一Cys來自鏈2,另一Cys為鏈1中8
位Cys,即鏈1中8位Cys與鏈2中的一個Cys有二硫鍵;
(4)嗜熱菌蛋白酶能水解Tyr、Phc等疏水氨基酸殘基,故此肽(Cys2、Phc)來自鏈2,結(jié)合(3)
中含Tyr,可知(3)中形成的二硫鍵為鏈18位Cys與鏈2中3位Cys與鏈2中3位Cys之間;(4)中(Cys2、
Phe)說明鏈2中1位Cys與5位Cys中有二硫鍵。
綜合(1)、(2)、(3)、(4)可得結(jié)果。
7、?個十肽的氨基酸分析表明其水解液中存在下列產(chǎn)物:
NH*AspGluTyrArg
MetProLysSerPhe
并觀察下列事實:(1)用粉肽酶A和B處理該十肽無效;(2)腹蛋白酶處理產(chǎn)生兩個四肽和游離的Lys;
(3)梭菌蛋白酶處理產(chǎn)生一個四肽和一個六肽;(4)浪化氫處理產(chǎn)生一個八肽和一個二肽,用單字母符
號表示其序列為NP;(5)胰凝乳蛋白酶處理產(chǎn)生兩個三肽和一個四肽,M-末端的胰凝乳蛋白晦水解肽段在
中性pH時攜帶-1凈電荷,在pH12時攜帶-3凈電荷;(6)一輪Edman降解給出下面的PTH衍生物:
寫出該十肽的氨基酸序列。[Ser-Glu-Tyr-Arg-Lys-Lys-Phe-Met-Asn-Pro]
解:(1)用竣肽前A和B處理十肽無效說明該十肽C-末端殘基為-Pro;
(2)胰蛋白酶專一斷裂Lys或Arg殘基的竣基參與形成的肽鍵,該十肽在胰蛋白酶處理后產(chǎn)生了兩個
四技和有利的Lys,說明十肽中含Lys—或-ArgLys-Lys—或-Arg-Lys-…-Lys—ArgT.ys-…四種可
能的肽段,且水解位置在4與5、5與6或4與5、8與9、9與10之間:
(3)梭菌蛋白醉專一裂解Arg殘基的歿基端肽鍵,處理該十肽后,產(chǎn)生一個四肽和一個六肽,則可知
該十肽第四位為-Arg-;
(4)溟化氯只斷裂由Met殘基的竣基參加形成的肽鍵,處理該十肽后產(chǎn)生一個八肽和一個二肽,說明
該十肽第八位或第二位為-Met-;用單字母表示二肽為NP,W-Asn-Pro-,故該十肽第八位為-Met-;
(5)胰凝乳蛋白酶斷裂Phc、Trp和Tyr等疏水氨基酸殘基的竣基端肽鍵,處理該十肽后,產(chǎn)生兩個
三技和一個四肽,說明該十肽第三位、第六位或第七位為Trp或Phe;
(6)一輪Edman降解分析51-末端,根據(jù)其反應(yīng)規(guī)律,可得N-末端氨基酸殘疾結(jié)構(gòu)式為:
-NH-CH(-CH20H)-C(=0)-,還原為-NH-CH(-CH20H)-C00H-,可知此為Ser;
結(jié)合(1)、(2)、(3)、(4)、(5)、(6)可知該十肽的氨:基酸療列為:
Scr-Glu-Tyr-Arg-Lirs-Lys-Phc-Met-Asn-Pro
8、一個四肽,經(jīng)胰蛋白酶水解得兩個片段,一個片段在280nm附近有強的光吸收,并且Pauly反應(yīng)和坂
口反應(yīng)(檢測胭基的)呈陽性。另一片段用澳化鼠處理釋放出一個與苗三酮反應(yīng)呈黃色的氨基酸。寫出此
四加的氨基酸序列。[YRMP]
解:胰蛋白酶酶專一水解Lys和Arg殘基的粉基參與形成的肽鍵,故該四肽中含Lys或Arg;i肽段在280nm
附近有強光吸收且Pauly反應(yīng)和坂口反應(yīng)(檢測呱基的)呈陽性,說明該肽段含Tyr和Arg;澳化鼠專一
斷裂Met殘基的竣基參加形成的肽鍵,又因生成了與瑋三酮反應(yīng)呈黃色的氨基酸,故該肽段為-Met-Pro-;
所以該四肽的氨基酸組成為Tyr-Arg-Met-Pro,即YRMP。
9、蜂毒明肽(apamin)是存在蜜蜂毒液中的一個十八肽,其序列為CNCKAPETALCARRCQQH,已知蜂毒明肽
形成二硫鍵,不與碘乙酸發(fā)生反應(yīng),(1)問此肽中存在多少個二硫鍵?(2)請設(shè)計確定這些(個)二硫
鍵位置的策略。
[(1)兩個;(2)二硫鍵的位置可能是1-3和11T5或1T1和3T5或1T5和3-11,第一種情況,用胰
蛋白的斷裂將產(chǎn)生兩個肽加Arg;第二種情況和第三種,將產(chǎn)生一個肽加Arg,通過二硫鍵部分氧化可以
把后兩種情況區(qū)別開來。]
10、敘述用Mernfield固相化學(xué)方法合成二肽Lys-Ala.如果你打算向Lys-Ala加入一個亮氨酸殘基使成
三技,可能會掉進什么樣的“陷坑”?
解:(1)用B0C保護Ala氨基端,然后將其峻基掛接在樹脂上;
(2)除去N端保護,將用B0C侏護的Arg用縮合劑DDC與Ala相連;
(3)將把樹脂懸浮在無水三氟乙酸中,通人干燥的HBr,使肽與樹脂脫離,同時保護基也被切除。
若打算向Lys-Ala加入一個亮氨酸殘基使成三肽,可能的坑為:Leu可能接在Arg的非a-氨基上。
第五章蛋白質(zhì)的三修精相
提要
每一種蛋白質(zhì)至少都有一種構(gòu)像在生理條件下是穩(wěn)定的,并具有生物活性,這種構(gòu)像稱為蛋白質(zhì)的天
然構(gòu)像。研究蛋白質(zhì)構(gòu)像的主要方法是X射線晶體結(jié)構(gòu)分析。此外紫外差光譜、熒光和熒光偏振、圓二色
性、核磁共振和重氫交換等被用于研究溶液中的蛋白質(zhì)構(gòu)像。
穩(wěn)定蛋白質(zhì)構(gòu)像的作用有氫鍵、范德華力、疏水相互作用和離子鍵。此外二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白質(zhì)的
構(gòu)像種也起重要作用。
多肽鏈折疊成特定的構(gòu)像受到空間上的許多限制。就其主鏈而言,由于肽鏈?zhǔn)怯啥鄠€相鄰的肽平面構(gòu)
成為,主鏈上只有a-碳的二平面角中和中能自由旋轉(zhuǎn),但也受到很大限制。某些中和中
蛋白質(zhì)主鏈的折疊形成由氫鍵維系的重復(fù)性結(jié)構(gòu)稱為二級結(jié)構(gòu)。最常見的二級結(jié)構(gòu)元件有a螺旋、B
轉(zhuǎn)角等。a螺旋是蛋白質(zhì)中最典型、含量最豐富的二級結(jié)構(gòu)。a°nm。a-角蛋白是毛、發(fā)、甲、蹄中的
纖維狀蛋白質(zhì),它幾乎完全由a螺旋構(gòu)成的多肽鏈構(gòu)成。B折疊片中肽鏈主鏈處于較伸展的曲折(鋸齒)
形式,肽鏈之間或?條肽鏈的肽段之間借助氫鍵彼此連接成片狀結(jié)構(gòu),故稱為B折疊片,每條肽鏈或肽段
稱為8折疊股或Bnmnmo大多數(shù)B折疊股和B折疊片都有右手扭曲的傾向,以緩解側(cè)鏈之間的空間應(yīng)力
(stericstrain)。蠶絲心蛋白幾乎完全由扭曲的反平行B折疊片構(gòu)成。膠原蛋白是動物結(jié)締組織中最豐
富的結(jié)構(gòu)蛋白,有若干原膠原分子組成。原膠原是一種右手超螺旋結(jié)構(gòu),稱三股螺旋。彈性蛋白是結(jié)締組
織中另??主要的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)按其外形和溶解度可分為纖維狀蛋白質(zhì)、球狀蛋白質(zhì)和膜蛋白。a-角蛋白、絲心蛋白(8-角
蛋白)、膠原蛋白和彈性蛋白是不溶性纖維狀蛋白質(zhì);肌球蛋白和原肌球蛋白是可溶性纖維狀蛋白質(zhì),是
肌纖維中最豐富的蛋白質(zhì)。球狀蛋白質(zhì)是一類可溶性的功能蛋白,如酹、抗體、轉(zhuǎn)運蛋白、蛋芻質(zhì)激素等,
膜蛋白是一類與膜結(jié)構(gòu)和功能緊密相關(guān)的蛋白質(zhì),它們又可分為膜內(nèi)在蛋白質(zhì)、脂錨定蛋白質(zhì)以及膜周邊
蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)一般被分為4個組織層次(折疊層次),一級、二級、三級和四級結(jié)構(gòu)。細(xì)分時可在二、
三級和四級結(jié)構(gòu)。細(xì)分時可?在二、三級之間增加超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域兩個層次。超二級結(jié)構(gòu)是指在?級序
列上相鄰的二級結(jié)構(gòu)在三維折疊中彼此靠近并相互作用形成的組合體。超二級結(jié)構(gòu)有3種基本形式:aa
(螺旋束)、BaB
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