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第五章真核基因的表達調(diào)控ThreelevelscontrolGeneregulationverycomplexineukaryotescells!Multipleplacescontrol!真核生物基因表達調(diào)控的特點:在真核生物中,染色體的結(jié)構(gòu)對基因的表達有明顯的調(diào)控作用;真核基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯是在不同地點不同時間進行,從而使真核基因的表達有多種轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機制;基因表達具有時間性和空間性。時間性:個體發(fā)育的不同階段,基因表達的種類和數(shù)量是不同的;空間性:在不同組織和器官中,基因表達的種類和數(shù)量是不同的。真核生物基因表達存在細胞特異性或組織特異性。真核生物的基因表達調(diào)控是多因子、多步驟的調(diào)控過程。基因重排DNA甲基化與基因的表達成反比關(guān)系直接改變基因的構(gòu)型影響轉(zhuǎn)錄因子與順式作用元件結(jié)合5′端調(diào)控序列甲基化后與核內(nèi)甲基化CG序列結(jié)合蛋白結(jié)合DNaseⅠ高敏感區(qū)為去甲基化的標志

染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變組蛋白與DNA結(jié)合與解離(活性與非活性)非組蛋白與組蛋白競爭結(jié)合DNA,解除組蛋白對基因表達的抑制組蛋白修飾(甲基化、乙?;?、磷酸化)常染色質(zhì)與異染色質(zhì)的互變DNA甲基化1、

啟動子(promotor)位于轉(zhuǎn)錄起始位點附近,具有相對固定位置,且為轉(zhuǎn)錄起始所必需的序列元件。啟動子一般模式:核心啟動子,TATAbox上游啟動子成分(UPE),CAATbox等TATA框控制轉(zhuǎn)錄的精確性,而UPE則控制轉(zhuǎn)錄的起始頻率,啟動子的強度決定于UPE的數(shù)目和種類。CorePromotorICorePromotorIIAssemblyofRNApolIII2、

增強子(enhancer)位于轉(zhuǎn)錄起始位點較遠位置上,具有參與、激活和增強轉(zhuǎn)錄起始功能的序列元件。增強子元件常常是組織特異性或短暫調(diào)節(jié)的靶位點。增強子特點:與啟動子的相對位置和取向無關(guān),只要存在于同一DNA分子上都能起作用;沒有基因?qū)R恍?,可以在不同的基因組合中表現(xiàn)增強效應(yīng);嚴格的組織特異性和細胞特異性;增強子(enhancer)4、

應(yīng)答元件(responseelement)一組受共同調(diào)控的基因,各基因都有一個相同的序列元件,該元件是誘導型轉(zhuǎn)錄因子(inducibleactivator)識別靶基因的位點,稱為應(yīng)答元件(responseelement)。 如:熱休克應(yīng)答元件(HSE)、血清應(yīng)答元件(SRE)、糖皮質(zhì)激素應(yīng)答元件(GRE)特點:是啟動子的上游元件(如HSE)或增強子(如GRE)都含有短的共有序列,但不一定完全相同轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合區(qū)在共有序列的任一側(cè)附近應(yīng)答元件動物模型植物模型DNAStructure–MajorandMinorGrooves反式作用因子根據(jù)作用方式分為三類:

①通用轉(zhuǎn)錄因子。普遍存在的轉(zhuǎn)錄因子。如TATAbox結(jié)合因子TFⅡD、GCbox結(jié)合因子SP1等。②組織特異性轉(zhuǎn)錄因子。與基因表達的組織特異性有很大關(guān)系。③誘導性反式作用因子?;钚阅鼙惶禺惖恼T導因子所誘導。

(A)鋅指結(jié)構(gòu)示意圖(Cys2/His2鋅指結(jié)構(gòu))兩個半胱氨酸殘基和兩個組氨酸殘基(His),通過與位于中心的鋅離子以配位鍵結(jié)合,形成穩(wěn)定的指狀結(jié)構(gòu)。

(B)

Cys2/Cys2鋅指結(jié)構(gòu)示意圖ZincFingerMotif②同源結(jié)構(gòu)域(homeodomain,HD)同源盒基因家族各基因間具有一相同的保守序列,稱為同源結(jié)構(gòu)域。所含的至少二個α螺旋中形成“轉(zhuǎn)折”,第三個α螺旋與DNA大溝相互作用是同源盒蛋白與DNA結(jié)合的主要力量。

功能:調(diào)節(jié)與機體各部分正常發(fā)育或正常分化的有關(guān)基因的表達。同源結(jié)構(gòu)域及其作用③堿性亮氨酸拉鏈(basic1eucinezipper,bLZ)

有些肽鏈C末端有一段30個氨基酸序列以α-螺旋構(gòu)型出現(xiàn)的結(jié)構(gòu)單元,每間隔6個氨基酸出現(xiàn)一個亮氨酸殘基,能形成兩性α-螺旋。兩個具有這種結(jié)構(gòu)的因子接觸后可借助側(cè)鏈疏水性交錯對插,形成穩(wěn)定卷曲螺旋結(jié)構(gòu)的二聚體。

功能:可使堿性區(qū)與DNA的親和力明顯增加。LeucineZipper④螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix,HLH)結(jié)構(gòu):

含兩個雙性α-螺旋,每3~4個氨基酸含一個疏水性殘基,中間為非螺旋環(huán)區(qū),內(nèi)含一個或多個能阻斷螺旋的氨基酸殘基。helix-loop-helix⑤Helix-turn-helix(α螺旋-β轉(zhuǎn)角-α螺旋)結(jié)構(gòu)為第一個被確立的DNA-結(jié)合結(jié)構(gòu),是最常見DNA結(jié)合域之一,常結(jié)合CAAT盒,屬常見的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白因子。Helix-turn-helix

2)轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域(transcriptionalactivationdomain)反式作用因子并非都需要其直接與DNA結(jié)合,轉(zhuǎn)錄活化域是反式作用因子必須具備的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。轉(zhuǎn)錄活化域通常是依賴于DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域以外的30~100個氨基酸殘基。轉(zhuǎn)錄因子通常具有一個以上的轉(zhuǎn)錄活化區(qū)。轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域模型有以下幾種:①酸性α-螺旋(acidicα-helixdomain)含有較多的負電荷。能非特異性地與起始復合物(如TATA盒結(jié)合因子)相互作用發(fā)揮轉(zhuǎn)錄活化功能。②富含谷氨酰胺的結(jié)構(gòu)域(glutamine-richdomain)最強的轉(zhuǎn)錄活化域之一。

③富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域(proline-richdomain)三轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控反式作用因子的活性調(diào)節(jié)表達式調(diào)節(jié)合成后即有活性,不能積累共價修飾磷酸化、去磷酸化,糖基化配體結(jié)合激素受體蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用復合物的解離與形成反式作用因子與順式元件的結(jié)合反式作用因子的作用方式成環(huán)使相應(yīng)位點接近而發(fā)揮作用扭曲改變DNA構(gòu)型滑動沿DNA滑動到另一特異序列而發(fā)揮作用連鎖反應(yīng)(Oozing)轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合后促進與另一轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合反式作用因子的組合式調(diào)控作用組合式基因調(diào)控(conbinatorialgeneregulation)幾種反式作用因子組合而發(fā)揮特定作用真核基因的調(diào)控模型:Britten—Davidson模型原始模型改進模型Ⅰ:多重調(diào)節(jié)基因改進模型Ⅱ:多重受體基因四轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控1.加帽和加尾的調(diào)控意義5ˊ端加帽:真核生物轉(zhuǎn)錄生成的mRNA在轉(zhuǎn)錄后,在5ˊ端加上7-甲基鳥苷(m7GPPPmNp-)

意義:①能被核糖體小亞基識別,促使mRNA和核糖體的結(jié)合;②m7Gppp結(jié)構(gòu)能有效地封閉RNA5’末端,以保護mRNA免疫5’核酸外切酶的降解,增強mRNA的穩(wěn)定。③有助于mRNA越過核膜,進入胞質(zhì)。3ˊ端加尾:轉(zhuǎn)錄后在mRNA在3ˊ末端加上50~200個腺苷酸,即poly(A)尾(成熟mRNA)。意義:①可能有助mRNA從核到細胞質(zhì)轉(zhuǎn)運;②避免在細胞中受到核酶降解,增強mRNA的穩(wěn)定性。2.mRNA前體的剪接、選擇性剪接對基因表達的調(diào)控作用

(1)mRNA前體的剪接真核細胞基因表達所轉(zhuǎn)錄出的mRNA前體在剪接酶作用下,有序刪除每一個內(nèi)含子并將外顯子拼接起來,形成成熟的mRNA,這一過程即為剪接。

生物體內(nèi)內(nèi)含子的主要類型:

GU-AG、AU-AC、Ⅰ類內(nèi)含子、Ⅱ類內(nèi)含子5種snRNA(,U1、U2、U4、U5、U6)+100多種蛋白

GU-AG、AU-AC類內(nèi)含子的剪接剪接體(spliceosome)I、II類內(nèi)含子的自我剪接

高等真核細胞中,某個內(nèi)含子5ˊ的供點在特定條件下可與另一個內(nèi)含子3ˊ受點進行剪接,同時刪除這兩個內(nèi)含子及其中間的全部外顯子或內(nèi)含子,即一個外顯子或內(nèi)含子是否出現(xiàn)在成熟的mRNA中是可以選擇的,這種剪接方式稱為選擇性剪接。

(2)mRNA的選擇性剪接Exon,Intron是否出現(xiàn)在成熟mRNA是可以選擇。

意義:在高等生物細胞的高度異質(zhì)性中起重要作用。由于剪接的多樣化,一個基因在轉(zhuǎn)錄后通過mRNA前體的剪接加工而產(chǎn)生兩個或更多的蛋白質(zhì)。3.RNA的編輯RNA編輯(editing):是指轉(zhuǎn)錄后的RNA在編碼區(qū)發(fā)生堿基的突變、加入或丟失等現(xiàn)象。五翻譯水平的調(diào)控mRNA運輸控制mRNA穩(wěn)定性調(diào)節(jié)mRNA結(jié)構(gòu)調(diào)控翻譯起始的調(diào)控

翻譯過程和翻譯后水平的調(diào)控主要表現(xiàn)在翻譯的起始、延長、蛋白質(zhì)的加工修飾及定位等方面。1.mRNA運輸控制運輸控制(transportcontrol)是對轉(zhuǎn)錄本從細胞核運送到細胞質(zhì)中的數(shù)量進行調(diào)節(jié)。合成的RNA大約有1/2能被運出核進入細胞質(zhì),50%左右的在核內(nèi)降解,還有一些留在核。

2.mRNA穩(wěn)定性調(diào)節(jié)原核生物mRNA的半衰期很短,平均大約3min。高等真核生物迅速生長的細胞中mRNA的半衰期平均3h。在高度分化的終端細胞中許多mRNA極其穩(wěn)定,有的壽命長達數(shù)天。3.mRNA結(jié)構(gòu)的影響3.1mRNA5’前導序列對翻譯水平的影響5’m7G帽結(jié)構(gòu)是否存在和是否易于接近eIF-4F的程度對翻譯效率有著明顯的影響。起始密碼子AUG的位置和其側(cè)翼的序列對翻譯的效率也有影響。

5’端非翻譯區(qū)的長度也會影響到翻譯的效率和起始的精確性,當此區(qū)長度在17~80Nt之間時,體外翻譯效率與其長度變成正比。在5’UTR中存在堿基配對區(qū)時,可以形成發(fā)夾式或莖環(huán)二級結(jié)構(gòu),這類結(jié)構(gòu)會阻止核糖體40S亞基的遷移,對翻譯起始有抑制作用。3.2mRNA3’端的結(jié)構(gòu)對翻譯速率和mRNA壽命的影響mRNA3′端的poly(A)不僅和mRNA穿越核膜的能力有關(guān),而且影響到

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