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文檔簡介
1、酶切回收連接第1頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三質粒DNA的酶切第2頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三定義:識別dsDNA的特異序列, 并在識別位點或其周圍切割雙鏈DNA的一類內切酶。限制性核酸內切酶第3頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三類內切酶作用特點能在特殊位點識別和切斷dsDNA,識別序列4-6bp,具有回文結構 (180度旋轉對稱結構)Hind 產生5粘性末端A AGCTTTTCGA AAAGCTTTTCGAA第4頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三Sst GAGCTCCTCGAG產生3粘性
2、末端GAGCT CC TCGAG粘端切口第5頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三GTCCAGHindGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口第6頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三第一個字母取自產生該酶的細菌屬名,用大寫;第二、第三個字母是該細菌的種名,用小寫;第四個字母代表株;用羅馬數字表示發(fā)現的先后次序。3、命名:Hind Haemophilus influenzae d株 流感嗜血桿菌d株的第三種酶 屬 系 株 序書寫方法:前3個字母斜體第7頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三酶活性單位指在限定條件下(溫度、Buff
3、er),1hr消化1ugDNA的酶量稱為一個酶單位(unit)。實際工作中,為保證消化完全,1ugDNA的消化需要3-5個單位的酶,反應時間也要適度延長,通常是反應過夜。第8頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三酶切反應系統(tǒng)的設計回收DNA通常酶切10g實際酶的用量應是理論用量的3-5倍。酶通常保存在50%的甘油中 ,使用時甘油濃度必須小于5%,故酶至少稀釋10倍。Buffer通常是10,使用時稀釋10倍??偡磻w積20-50ul,不足用tdH2O補足。第9頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三DNA的量酶的用量(U/C)酶在50甘油中,甘油在總體積的濃
4、度要小于5反應的總體積Buffer的體積水的體積第10頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三 質粒DNA 15l (10g)Hind III (20U/l) 1.5 l 10 緩沖液 E 3l 三蒸水 9l _總體積 30l XbaI(20U/l 1.5 l 加樣順序加樣后混勻,短暫離心,使之至管底。第11頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三DNA片段的分離純化第12頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三四、操作步驟: 關鍵操作:點樣在加樣孔正上方,不要進入孔中甚至戳穿孔底加樣器一旦按下,就一定保持按住直至加樣器離開加樣孔,否則會將
5、樣品又吸回到tip中,使加樣失敗第13頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三載體 DNA目的基因第14頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三 bp1534 994 695 515 377 237 A B C M 第15頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三酚抽提法切下含目的DNA的膠塊。加入酚,將膠塊沒過即可。振蕩后低溫凍結,視溫度而定時間。30水浴融化,若體積小,可補加TE。振蕩器上振蕩。12,000 rpm離心5 min。取上清200l。第16頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三用200l的氯仿:異戊醇抽提(
6、振蕩,離心12000 rpm,5 min,取上清)。加20 l NaAc,400 l無水乙醇沉淀DNA,冰凍約30 min甚至過夜。12,000 rpm離心10 min,棄上清。將DNA溶于約30l TE中。第17頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三DNA片段的連接反應第18頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三 DNA 連接酶 ligase 催化DNA 5 磷酸基與 3 羥基之間形成磷酸二酯鍵(ATP)5533OHPOHPDNA連接酶DNA連接酶第19頁,共21頁,2022年,5月20日,20點59分,星期三總體積20 l 載體 0.10.2g目的基因:載體mol數= 15:1H2O10buffer載體目的基因ligase總體積20l l l l l l 第20頁,共21頁,2022年,5月20日,2
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