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文檔簡(jiǎn)介
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1.學(xué)習(xí)在實(shí)現(xiàn)DNA體外重組過(guò)程中,正確選擇合適的載體和限制性內(nèi)切酶并能對(duì)限制性
核酸內(nèi)切能對(duì)載體和目的DNA進(jìn)行切割,產(chǎn)生利于連接的合適末端。
2.學(xué)習(xí)設(shè)計(jì)構(gòu)建重組DNA分子的基本方法,掌握載體和外源目的DNA酶切的操作。
3.學(xué)習(xí)利用T4DNA連接酶把酶切后的載體片段和外源目的D”A片段連接起來(lái),構(gòu)建體外DNA
分子的技術(shù),了解并掌握幾種常用的連接方式。
4.掌握利用Cacl2感受態(tài)細(xì)胞的方法。
5.學(xué)習(xí)掌握熱擊法轉(zhuǎn)化E.coli的原理和方法。
6.掌握a互補(bǔ)篩選法和PCR檢測(cè)法篩選重組子的方法。并鑒定體外導(dǎo)入目的DNA片段的大
小。
二、實(shí)驗(yàn)原理
外源DNA與載體分子的連接即為DNA重組技術(shù),這樣重新組合的DNA分子叫做重組子。重
組的DNA分子式在DNA連接酶的作用卜,有幅2+、ATP存在的連接緩沖系統(tǒng)中,將分別經(jīng)限制
性內(nèi)切酶酶切的載體分子和外源DNA分子連接起來(lái)。將重組質(zhì)粒導(dǎo)入感受態(tài)細(xì)胞中,將轉(zhuǎn)化后
的細(xì)胞在選擇性培養(yǎng)基中培養(yǎng),可以通過(guò)a互補(bǔ)篩選法篩選出重組子,并可通過(guò)酶切電泳進(jìn)行
重組子的鑒定。
1.重組子的構(gòu)建
晦切時(shí)首先要了解目的基因的酶切圖譜,選用的限制性內(nèi)切酶不能目的基因內(nèi)部有專一的
識(shí)別位點(diǎn),否則當(dāng)用一種或兩種限制性內(nèi)切酶切割外源工體DNA時(shí)不能得到完整的目的基因。
其次要選擇具有相應(yīng)的單一酶切位點(diǎn)質(zhì)?;蛘呤删w載體分子。常用的酶切方法有雙酶切法和
單酶切法兩種。本實(shí)驗(yàn)采用單酶切法,即只用一種限制性內(nèi)切酶切割目的DNA片段,酶切后的
片段兩端將產(chǎn)生相同的黏性末端或平末端,再選用同樣的限制性內(nèi)切酶處理載體。在構(gòu)建重組
子時(shí),除了形成正常的重組子外,還可能出現(xiàn)目的DMA片段以相反方向插入載體分子中,或目
的DNA串聯(lián)后再插入載體分子中,甚至出現(xiàn)載體分子自連,重新環(huán)化的現(xiàn)象。單酶切法簡(jiǎn)單易
行單是后期篩選工作比較復(fù)雜。各種限制性內(nèi)切酶都有去最佳反應(yīng)條件,最主要的因素是反應(yīng)
溫度和緩沖液的組成,在雙酶切體系中,限制性內(nèi)切酶在使用時(shí)應(yīng)遵循“先低鹽后高鹽,先低
溫后高溫”的原則進(jìn)行反應(yīng)。
(要達(dá)到高效率的連接,必須酶切完全,酶切的DNA數(shù)量要適當(dāng)。另外,酶切反應(yīng)的規(guī)模
也取決于需要酶切的DNA的量,以及相應(yīng)的所需酶的量??梢赃m當(dāng)增加前的用量,但是最高不
能超過(guò)反應(yīng)總體積的10%,因?yàn)橄拗菩院怂醿?nèi)切酹一般是保存在50%甘油的緩沖液中,如果陶
切反應(yīng)體系中甘油的含量超過(guò)5樂就會(huì)抑制酶的活性。)
連接反應(yīng)總是緊跟酶切反應(yīng),外源DNA片段與載體分子連接的方法即DNA分子體外重組技
術(shù)主要依賴限制性核算內(nèi)切酶和DNA連接酶催化完成的。DNA連接酶催化兩雙鏈DNA片段相鄰
的5'-磷酸和3'-0H間形成磷酸二酯鍵。在分子克隆中最有用的DNA連接的是來(lái)自T4噬菌體
的T4DNA連接酶,它可以連接黏性末端和平末端。連接反應(yīng)時(shí),載體DMA和外源DNA的摩爾
數(shù)之比控制在1:(「3)之間,可以有效地解決DNA多拷貝插入的現(xiàn)象。反應(yīng)溫度介于酶作用
速率和末端結(jié)合速率之間,一般是16C,用常用的連接時(shí)間為12T6L
2.感受態(tài)細(xì)胞的制備及質(zhì)粒轉(zhuǎn)化
構(gòu)建好的重組DNA轉(zhuǎn)入感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行表達(dá)的現(xiàn)象就是轉(zhuǎn)化。能進(jìn)行轉(zhuǎn)化的受體細(xì)胞必
須是感受態(tài)細(xì)胞,即受體細(xì)胞最容易接受外源DNA片段實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的生理狀態(tài),它決定于受體菌
的遺傳特性,同時(shí)與菌齡、外界環(huán)境等因素有關(guān)。人工轉(zhuǎn)化是通過(guò)人為誘導(dǎo)的方法使細(xì)胞具有
攝取DNA的能力,或人為地將DNA導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi),該過(guò)程與細(xì)菌自身的遺傳控制無(wú)關(guān),常用熱擊
法,電穿孔法等。能否實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒DMA的轉(zhuǎn)化還與受體細(xì)胞的遺傳特性有關(guān),所用的受體細(xì)胞?
般是限制修飾系統(tǒng)的缺陷變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變株。
目前常用的感受態(tài)細(xì)胞制備方法有CaC12法,制備好的感受態(tài)細(xì)胞可以加入終濃度為15席
的無(wú)菌甘油,-70C可保存半年至一年。經(jīng)過(guò)CaC12處理的細(xì)胞細(xì)胞膜通透性增加,允許外源
DNA分子進(jìn)入。在低溫下,將攜帶有外源DNA片段的載體與感受態(tài)細(xì)胞混合,經(jīng)過(guò)熱擊或電穿
孔技術(shù),使載體分子進(jìn)入細(xì)胞。進(jìn)入受體細(xì)胞的外源DNA分子通過(guò)復(fù)制、表達(dá),使受體細(xì)胞出
現(xiàn)新的遺傳性狀。將這些轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞在選擇性培養(yǎng)基上培養(yǎng),即可篩選出重組子。本實(shí)驗(yàn)以
E.coliDH5a菌株為受體細(xì)胞,用CaC12處理,使其處于感受態(tài),然后將重組后的PUC19質(zhì)
粒在42c下熱擊90s,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化。
3.重組子的篩選鑒定
重組DNA轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞后,并非所有的受體細(xì)胞都能被導(dǎo)入重組DNA分子,一般僅有少數(shù)
重組DNA分子能進(jìn)入受體細(xì)胞,同時(shí)也只有極少數(shù)的受體細(xì)胞在吸納重組DNA分子之后能良好
增殖。并且它們是與其他大量未被轉(zhuǎn)化的受體菌細(xì)胞混雜在一起。再者,在這些被轉(zhuǎn)化的受體
細(xì)胞中,除部分含有我們所期待的重組DNA分子外,另外一些還可能是由于載體自身或一個(gè)載
體與多個(gè)外源DNA片段形成非期待重組DNA分了?導(dǎo)入所致。因此必須使用各種篩選及鑒定手段
區(qū)分轉(zhuǎn)化子與非轉(zhuǎn)化子,并從轉(zhuǎn)化的細(xì)胞群體中分理出帶有目的基因的重組子。本實(shí)驗(yàn)中采用
的方法是平板篩選法電泳篩選法及PCR檢測(cè)方法。
抗藥性篩選主要用于重組質(zhì)粒DNA分子的轉(zhuǎn)化子的篩選,而不含重組質(zhì)粒DNA分子的受體
菌則不能存活,?;パa(bǔ)篩選法是根據(jù)菌落顏色篩選含有充足質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子。質(zhì)粒PUC19攜帶有
氨羊青霉素抗性基因(Ampr),在含有氨茉青霉素平板上篩選轉(zhuǎn)化子。沒有導(dǎo)入質(zhì)粒PUC19的
受體細(xì)胞,在含有氨節(jié)青霉素的平板上不生長(zhǎng)。質(zhì)粒PUC19進(jìn)入E.coliDH5a后,通過(guò)a-
互補(bǔ)作用,形成完整的B-半乳糖甘酶。在麥康凱培養(yǎng)基平板上,轉(zhuǎn)化了利用B-半乳糖昔酶分
解培養(yǎng)基中的乳糖產(chǎn)生有機(jī)酸,pH降低,培養(yǎng)集中的指示劑變紅,轉(zhuǎn)化子的菌落變紅。不含質(zhì)
粒的E.coliDH5a,沒有半乳糖昔酶活性,不能利用培養(yǎng)集中的乳糖產(chǎn)生有機(jī)酸,而是利
用培養(yǎng)集中的有機(jī)碳源,不使培養(yǎng)基pH降低,在不含有氨葦青霉素的麥康凱培養(yǎng)基上形成白
色菌落。重組后的載體DNA因?yàn)槿盏幕虻牟迦胛稽c(diǎn)在FIC19乳糖利用基因內(nèi)部,不能形成a
-互補(bǔ)作用,所以也不能利用培養(yǎng)集中的乳糖產(chǎn)生有機(jī)酸,在含有氨羊青霉素的麥康凱培養(yǎng)基
上形成白色菌落。
挑選在氨茶青霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的白色菌落,通過(guò)擴(kuò)增培養(yǎng)。因?yàn)樵S多菌落存在假陽(yáng)性情
況,在氨節(jié)青霉素培養(yǎng)基上的白色菌落可能是導(dǎo)入的重組載體DNA菌落,也可能是載體自連后
發(fā)生突變的菌落,所以還要鑒定轉(zhuǎn)化子中重組質(zhì)粒DNA分子的大小,可將重組的載體DNA提取
出來(lái),進(jìn)行后續(xù)的酶切、電泳檢驗(yàn)。
三、實(shí)驗(yàn)儀器和材料試劑
菌株:E.coli1)1i5a
培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基、麥康凱培養(yǎng)基(加入AP)
儀器:高速離心機(jī),恒溫震蕩培養(yǎng)箱,恒溫水浴鍋,微波爐,電泳儀,制膠槽,電泳槽,
梳子,錐形瓶,量筒,移液槍,冰盒,槍尖,Eppendorf管,微量移液器,計(jì)時(shí)器
試劑:TAE電泳緩沖液(10X),瓊脂糖,澳化乙錠(EB),XDNA/HindHIMarker,DL2000plus
DNAPUC19質(zhì)粒,酶切10Xbuffer,Hind川,重蒸水
四、實(shí)驗(yàn)步驟
1.載體與外源片段的酶切
pUC19(自提)ADNA(comm)pUC19(comm)
ddH2o13.5-12.566.037.5
10x/ubuffer2.010.05.0
DNA3.0-4.015.05.0
Hindlll1.59.02.5
Total20.010050.0
混合均勻,上下?lián)u晃400Q轉(zhuǎn)Imin
均分為兩管,R7°「水浴2hrs
lh后,取一管,戰(zhàn)瓊脂糖凝膠電泳,100v電壓40min
2.載體與外源片段的鏈接
CompVol(UI)
1ddH2O3.2
210xT4連接酶Buffer1.0
3pUcl9/lll1.5-2.0
4X/III3.5-3.0
5T4DNA連接酶0.8
Total10.0
混合均勻,上下?lián)u晃4000轉(zhuǎn)Imin
16℃保存
3.感受態(tài)細(xì)胞的制備與轉(zhuǎn)化
E.coliDH5a感受態(tài)細(xì)胞的制備
甘油管一LB平板(活化)-*單菌落-LB平板(37'Co/n)-20mlLB(37℃o/n)一氏轉(zhuǎn)接至新
鮮LB液--37℃2-2.5hrs—冰浴5mlx2,4000rpm/6000rpm5min-*Votex+800mlCaCL
吹吸懸浮細(xì)胞f4000rpm5irin吸棄上清100P10.IMCa012,輕懸,冰浴20min-感受態(tài)細(xì)胞
4.質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化及重組質(zhì)粒的篩選
分組'步驟c.cDNA冰浴熱激冰浴復(fù)蘇培養(yǎng)涂布平板
基
ligation麥+AP50P1x1
l-test1005.05min42c5minLB100M1x2
-lOmin90s900150U1x2
ul/tube200Ulx2
ll-tranf50pUcl937℃lh麥+AP50P1x1
Control0.5
lll-c.c50麥+AP50P1x1
Control麥50P1x1
預(yù)留一個(gè)麥+AP平板
靜置lOmin,于37℃倒置培養(yǎng)16-20hrs
5.重組質(zhì)粒的提取及電泳檢測(cè)鑒定
I中的平板一白色單菌落(無(wú)菌牙簽)一接入預(yù)留麥+AP平板一4-6個(gè)菌落/組-37c倒置
o/n
五、實(shí)驗(yàn)結(jié)果
PUC19和XDNA經(jīng)HindIII單酶切作用結(jié)果的電泳檢測(cè)
入
入
入
Pp未
UU
DDDCC加
NN1R
NA91
A/9N
/HH245A6789
mI-H3酶
a-一
o)J一t
m-
w?
一
電泳結(jié)果表明:
XDNA分子量2萬(wàn)3bp
PUC19商業(yè)和測(cè)試酶切完仝,分子量在2300+,經(jīng)查的2686bp
廣9組提質(zhì)粒結(jié)果均出現(xiàn)兩條亮帶,上面的是酶切切開的質(zhì)粒,下面的為超螺旋結(jié)構(gòu),最下方模
糊條帶為RNA少量殘留,表明RNA酶效果顯著,但仍沒完全除掉RNA,(通過(guò)對(duì)照組未加RNA酶
很明顯能看出)
兩條亮帶上方混雜帶可能是DNA染色體的殘留
在質(zhì)粒轉(zhuǎn)化與重組質(zhì)粒篩選的過(guò)程中,第一次加于麥康凱培養(yǎng)基的AP(氨節(jié)青霉素)效果失活,
導(dǎo)致II號(hào)平板即生K白曲又生K紅菌,篩選失敗。后老師又重新做了批加入新AP的實(shí)驗(yàn)證
明ap抗生素失活。
E.Z.N.A."PlasmidMiniprepKit試劑盒提
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