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文檔簡介
醫(yī)學信息檢索浙江大學醫(yī)學院從屬第二醫(yī)院景繼勇醫(yī)學信息檢索專家講座第1頁
當代科技造成了科技結果高速發(fā)展。大規(guī)模、高集成度,邊緣學科、交叉學科、橫斷學科層出不窮,新結果從出現(xiàn)到應用時間間隔越來越短等等,“信息爆炸”使得人們獲取和利用有用信息越來越困難。信息檢索目標醫(yī)學信息檢索專家講座第2頁醫(yī)藥學信息資源發(fā)展特點數(shù)量巨大,增加快速內(nèi)容廣泛、分散,各學科相互滲透信息更新周期縮短,交流傳輸速度加緊信息由傳統(tǒng)紙質印刷型快速向電子化、網(wǎng)絡化、數(shù)字化方向發(fā)展醫(yī)學信息檢索專家講座第3頁文件檢索基本知識檢索路徑、檢索技術內(nèi)容計算機檢索策略醫(yī)學信息檢索專家講座第4頁美國科學基金會凱斯工學院基金委員會、日本國家統(tǒng)計局 數(shù)字
一個研究人員全部工作時間分配7.70%9.30%50.90%32.10%思索計劃查閱文件科學試驗編寫匯報醫(yī)學信息檢索專家講座第5頁醫(yī)學信息檢索專家講座第6頁4202882400不一樣學科研究人員平均年閱讀文件 數(shù)量
450 400 350 300 250 200 150 100 50MedScienceEngSocSciHum引自/dlib/october03/king/10king.html醫(yī)學信息檢索專家講座第7頁4337240
不一樣學科研究人員閱讀文章所用 時間分/篇4540353025201510 5MedScienceEngSocSciHum引自/dlib/october03/king/10king.html醫(yī)學信息檢索專家講座第8頁引自田納西大學CarolTenopir研究匯報醫(yī)學信息檢索專家講座第9頁引自田納西大學CarolTenopir研究匯報醫(yī)學信息檢索專家講座第10頁一、文件檢索基本知識醫(yī)學信息檢索專家講座第11頁(一)基本概念1.信息information信息是事物運動狀態(tài)與方式反應,是用文字、數(shù)據(jù)或信號等形式,經(jīng)過一定傳遞和處理,來表現(xiàn)各種相互聯(lián)絡客觀事物在運動改變中所含有特征內(nèi)容總稱。醫(yī)學信息檢索專家講座第12頁2.知識knowledge人們在改造世界實踐中所取得認識和經(jīng)驗總和。醫(yī)學信息檢索專家講座第13頁3.情報information情報是指利用一定形式,傳遞給用戶,并產(chǎn)生效益知識或消息。三要素:知識性、傳遞性、效用性4.文件literature就是統(tǒng)計著知識一切載體。四要素:知識或信息、載體、統(tǒng)計伎倆(文字圖象聲音)、符號文件知識情報信息醫(yī)學信息檢索專家講座第14頁5.信息檢索指利用檢索工具或數(shù)據(jù)庫等情報集合,從中查找所需信息過程。信息檢索方式有手檢、機檢、光盤檢索、聯(lián)機檢索和Internet聯(lián)網(wǎng)檢索。未來檢索將有些人工智能和信息檢索相結合智能情報檢索系統(tǒng)。醫(yī)學信息檢索專家講座第15頁人們獲取信息起源,對于文件檢索來說主要可檢信息。信息源醫(yī)學信息檢索專家講座第16頁信息加工層次零次文件:未經(jīng)出版發(fā)行或未以公開形式進入社會交流最原始文件。一次文件primaryliterature即原始文件二次文件secondaryliterature如:目錄、索引三次文件tertiaryliterature對二次文件進行綜合分析、加工、整理信息資源,如專門用于檢索搜索引擎搜索工具,被稱為“搜索引擎之搜索引擎”(searchengineofsearchengine)醫(yī)學信息檢索專家講座第17頁按撰寫目標和出版類型
圖書期刊科技匯報會議文件學位論文專利文件醫(yī)學信息檢索專家講座第18頁按照公布形式劃分參考數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫事實數(shù)據(jù)庫電子圖書電子期刊醫(yī)學信息檢索專家講座第19頁電子報紙搜索引擎(GOOGLE)網(wǎng)絡學術資源學科導航FTP資源醫(yī)學信息檢索專家講座第20頁參考數(shù)據(jù)庫(Referencedatabase)指包含各種數(shù)據(jù)、信息或知識原始起源和屬性數(shù)據(jù)庫主要包含書目數(shù)據(jù)庫、文摘數(shù)據(jù)庫、索引數(shù)據(jù)庫比如:中國生物醫(yī)學文件數(shù)據(jù)庫(CBMDisc)、中國生物醫(yī)學期刊文件數(shù)據(jù)庫(CMCC)、MEDLINE數(shù)據(jù)庫醫(yī)學信息檢索專家講座第21頁全文數(shù)據(jù)庫(Fulltextdatabase)收錄有原始文件全文數(shù)據(jù)庫以期刊論文、會議論文、政府出版物、研究匯報、法律條文和案例、商業(yè)信息為主比如:中國期刊全文數(shù)據(jù)庫、維普中國科技期刊數(shù)據(jù)庫、EBSCO全文數(shù)據(jù)庫和OVID全文數(shù)據(jù)庫醫(yī)學信息檢索專家講座第22頁事實數(shù)據(jù)庫(Factualdatabase)指包含大量數(shù)據(jù)、事實,直接提供原始資料數(shù)據(jù)庫又分為數(shù)值數(shù)據(jù)庫(Numericdatabase)、指南數(shù)據(jù)庫(directorydatabase)、術語數(shù)據(jù)庫(terminologicaldatabase)等醫(yī)學信息檢索專家講座第23頁電子圖書(electronicbooks)指供在電腦上閱讀一個新型數(shù)字化書籍是多媒體技術和超文本技術發(fā)展產(chǎn)物普通有專用電子圖書閱讀器醫(yī)學信息檢索專家講座第24頁國內(nèi)電子圖書系統(tǒng)超星數(shù)字圖書館讀秀學術系統(tǒng)中國數(shù)字圖書館有限企業(yè)網(wǎng)上圖書館書生之家“中華圖書網(wǎng)”方正Apabi電子圖書醫(yī)學信息檢索專家講座第25頁電子期刊(electronicjournals)簡稱e-journal指以數(shù)字或電子形式出版發(fā)行期刊醫(yī)學信息檢索專家講座第26頁電子期刊類型一、印刷型期刊電子版Electronicversion比如:《科學》雜志電子版《科學在線》/醫(yī)學信息檢索專家講座第27頁二、原生(born-digital)數(shù)字資源只在互聯(lián)網(wǎng)上發(fā)行純電子期刊Electronic–only《新物理學雜志》Newjournalofphysics醫(yī)學信息檢索專家講座第28頁電子報紙(electronicnewspaper)將電子技術應用到包括報刊出版、發(fā)行、利用全過程醫(yī)學信息檢索專家講座第29頁主要電子報紙舉例紐約時報(Http://)華盛頓郵報(泰晤士報(Http://www.thetimes.co.uk)人民日報(Http://)光明日報(Http://)中國日報(Http://)醫(yī)學信息檢索專家講座第30頁搜索引擎、分類指南搜索引擎主要是使用一個計算機自動檢索軟件,在互聯(lián)網(wǎng)上檢索,將檢索到網(wǎng)頁編入到數(shù)據(jù)庫中,并進行一定程度自動標引,用戶使用時輸入檢索詞,搜索引擎將其與數(shù)據(jù)庫中信息匹配,產(chǎn)生檢索結果比如:Yahoo、Hotbot、AltaVista、Google等醫(yī)學信息檢索專家講座第31頁分類指南分類指南是將搜索到網(wǎng)頁按主題內(nèi)容組織成等級結構(主題樹),用戶按照這個目錄逐層深入,直到找到所需文件。通常搜索引擎與分類指南結合在一起,例如Yahoo、Google等醫(yī)學信息檢索專家講座第32頁網(wǎng)絡學術資源學科導航將互聯(lián)網(wǎng)上信息進行科學整理,按學科組織起來,組成完整學科導航系統(tǒng),為教學、科研、技術人員提供各類學術信息醫(yī)學信息檢索專家講座第33頁FTP資源FTP:FileTransferProtocol文件傳送協(xié)議用戶遠程登錄到遠端計算機上,把文件傳回到自己計算機上,或把自己文件上傳到遠端計算機系統(tǒng)上FTP資源,是網(wǎng)上開放FTP站點,他們允許用戶登錄上去,從中下載各類數(shù)據(jù)、資料、軟件等天網(wǎng)(),能夠專門檢索網(wǎng)上FTP站點使用軟件有cuteftp等醫(yī)學信息檢索專家講座第34頁信息檢索原理將檢索提問標識與系統(tǒng)中存貯文獻特征標識進行比較,并輸出命漢字獻,檢索過程為字符串匹配和邏輯運算過程。醫(yī)學信息檢索專家講座第35頁1.存貯過程為納入檢索系統(tǒng)每一個資料或每一篇文件標引檢索標識將相關特征表示著錄下來,形成一條條文件線索將它們系統(tǒng)地排列到檢索系統(tǒng)中去醫(yī)學信息檢索專家講座第36頁2.檢索過程首先主題分析,找出若干能代表情報需要概念將這些概念轉換成情報檢索語言語詞或標識利用這些語詞或標識到檢索系統(tǒng)中查找,將用該語詞或標識所標引文件檢索出來醫(yī)學信息檢索專家講座第37頁主題分析主題概念情報檢索語言語詞或標識
文件檢索工具或系統(tǒng)存放、檢索過程醫(yī)學信息檢索專家講座第38頁檢索路徑、檢索技術醫(yī)學信息檢索專家講座第39頁一檢索語言檢索語言是一個專門人工語言,是在文件存貯與檢索過程中共用語言。分規(guī)范化語言和非規(guī)范化語言兩種醫(yī)學信息檢索專家講座第40頁醫(yī)學信息檢索專家講座第41頁二、檢索路徑(一)主題詞檢索主題詞:經(jīng)過主題詞表規(guī)范后詞稱為主題詞。美國國立醫(yī)學圖書館(NationalLibraryofMedicine,簡稱NLM)編輯《醫(yī)學主題詞表》(MedicalSubjectHeadings,MeSH)AIDS見取得性免疫缺點綜合征醫(yī)學信息檢索專家講座第42頁(二)分類檢索用分類號或者類名進行檢索方法國內(nèi)現(xiàn)在最慣用是《中國圖書分類法》把全部圖書分成二十二大類醫(yī)學R類生物學Q類語言H類計算機TP類醫(yī)學信息檢索專家講座第43頁(三)關鍵詞(或自由詞)檢索關鍵詞:直接從信息資源名稱、正文或者文摘中抽出代表信息主要內(nèi)容主要詞語。醫(yī)學信息檢索專家講座第44頁(四)著者檢索國內(nèi)數(shù)據(jù)庫直接用著者姓名進行檢索國外數(shù)據(jù)庫用著者姓,名縮寫進行檢索Wangxm醫(yī)學信息檢索專家講座第45頁(五)題名檢索題名:信息資源名稱,如論文篇名、圖書書名、網(wǎng)站名稱等。醫(yī)學信息檢索專家講座第46頁(六)引文檢索引文:將文件所引用參考文件作者、篇名、起源出版物抽取出來進行標引。SCI醫(yī)學信息檢索專家講座第47頁(七)全文檢索全文:從資源全部內(nèi)容中自動抽取、查找,是當前網(wǎng)上各類搜索引擎使用最多方法。醫(yī)學信息檢索專家講座第48頁(八)序號檢索如ISSN號檢索醫(yī)學信息檢索專家講座第49頁三、檢索技術1.布爾邏輯檢索AND(邏輯與)比如:AandB醫(yī)學信息檢索專家講座第50頁OR(邏輯或)比如:colororcolour醫(yī)學信息檢索專家講座第51頁NOT(邏輯非)比如:humannotanimal醫(yī)學信息檢索專家講座第52頁優(yōu)先級運算
()>NOT>AND>OR(Childorchildren)andlungcancer醫(yī)學信息檢索專家講座第53頁常見運算符運算符邏輯與AND、+、空格邏輯或OR邏輯非NOT、-醫(yī)學信息檢索專家講座第54頁2.截詞檢索和通配檢索Truncationsearching在不一樣檢索系統(tǒng)里用不一樣符號,普通為:*、?、#、$用邏輯OR對詞頭同、詞尾不一樣詞匯進行檢索能夠防止漏檢,另首先也防止了屢次輸入麻煩醫(yī)學信息檢索專家講座第55頁前截斷:又稱左截斷,截詞符在詞左邊,比如:*magnetic中截斷:截詞符在詞中間,比如:organi?ation,能夠檢索organisationorganization后截斷:是前方一致檢索,又稱右截斷,截詞符放在被截詞右邊,是最慣用檢索技術,比如:librar*醫(yī)學信息檢索專家講座第56頁3、位置算符檢索位置算符(positionoperator)表示兩個檢索詞間位置臨近關系,又叫鄰接檢索(proximity)布爾邏輯運算符表示兩個概念之間邏輯關系,位置算符表示是兩個概念在信息中實際物理位置關系如:lungnearcancer醫(yī)學信息檢索專家講座第57頁Dialog聯(lián)機系統(tǒng)位置算符檢索醫(yī)學信息檢索專家講座第58頁4、字段限定檢索Limitsearching是縮小或約束檢索結果方法,最慣用是對特定字段限定檢索限制符多為:in、=、[]比如:ChineseinLA醫(yī)學信息檢索專家講座第59頁數(shù)據(jù)庫中常見字段和代碼醫(yī)學信息檢索專家講座第60頁5、加權檢索是一個定量檢索技術縮小檢索范圍提升檢索準確率有效方法經(jīng)過判定檢索詞或字符串在滿足檢索邏輯后對文件命中是否影響程度比如:CBM,MEDLINE醫(yī)學信息檢索專家講座第61頁6、聚類檢索依據(jù)不一樣聚類水平要求,能夠形成不一樣聚類層次類目體系主題相近、內(nèi)容相關文件聚在一起,相異被區(qū)分開來比如:CNKI或MEDLINE“relatedarticle”醫(yī)學信息檢索專家講座第62頁7、擴展檢索與縮檢擴展檢索擴展檢索方法:概念擴大;范圍擴大;增加同義詞;年代擴大??s小檢索:二次檢索縮檢方法:即概念縮小、范圍限定、年代降低等。另外,還能夠經(jīng)過以下方法進行限定:關鍵概念限定;語種限定;特定時刊限定。醫(yī)學信息檢索專家講座第63頁檢索策略(一)信息需求分析
,明確檢索要求(二)選擇數(shù)據(jù)庫,確定檢索路徑(三)檢索方式選擇,確定檢索標識(檢索詞
)(四)構建檢索表示式(五)檢索結果判斷和檢索策略調(diào)整(六)整理檢索結果,獲取原始文件醫(yī)學信息檢索專家講座第64頁檢索要求掌握線索查全?查準?醫(yī)學信息檢索專家講座第65頁數(shù)據(jù)庫選擇英文循證資料數(shù)據(jù)庫Cochranelibrary-SRUoToDateNursingReferenceCenterCINAHL護理指南
DrugEssentials(護理人員須了解實時治療及臨床照護藥品信息)PatientEducation(病患教育)HealthNursingNews(護理新聞)MDConsultClinicalEvidence——BMJOVID循證數(shù)據(jù)庫醫(yī)學信息檢索專家講座第66頁數(shù)據(jù)庫選擇英文原始文摘數(shù)據(jù)庫MedlineorPubMedEmbaseWebofscienceCochraneCentralRegisterofControlledTrials英文原始全文數(shù)據(jù)庫Highwarepress,ProQuest,SD,SPRINGERLINK,WILEY…醫(yī)學信息檢索專家講座第67頁數(shù)據(jù)庫選擇漢字數(shù)據(jù)庫CNKI維普萬方臺灣CEPS中國生物醫(yī)學文件數(shù)據(jù)庫中國科學引文數(shù)據(jù)庫中華民國期刊論文索引——臺灣醫(yī)學信息檢索專家講座第68頁translationtranslationdatabaseMedlinequeriesStandard(MeSH)透過控制讓使用者和作者一致自由詞匯派FreeText控制詞匯派ControlledVocabularyuserNeoplasms[MeSH]MeSH:Neoplasmsauthorsarticles使用者要設法和作者心意相通reference:http://www.uofaweb.ualberta.ca/slis/pdfs/LIS_502_week5.ppt較大型或精巧書目數(shù)據(jù)庫通常同時有這兩種機制武林上有兩大派檢索機制ORCancer[TIAB]醫(yī)學信息檢索專家講座第69頁PubMed:PICO方式檢索及彈性組合PIOPICOPICPCOC防止某個面向檢索結果很低,影響整體檢索結果檢索結果低時,易修正檢索策略方便后續(xù)彈性組合檢索PICO何者主要?取決于臨床問題特征、檢索者目標和時間、文件需求質量PIO彈性組合分次搜尋一次搜尋醫(yī)學信息檢索專家講座第70頁搜尋文件障礙不知道怎么定義關鍵詞PICO,plus同義字,MeSHTerms資源太多,不知道從何下手FilteredResourcesFIRST,plusUnfilteredResources不熟悉搜尋方式只找到/看到片面現(xiàn)象(B),而非貼近事實整體(A)(Informationbias)醫(yī)學信息檢索專家講座第71頁臨床人員處境:Solution時間有限、情況緊急:Quickly醫(yī)療信息太多:Effectively醫(yī)學進步太快:Current病人期望:Best醫(yī)學信息檢索專家講座第72頁理想處理方案以最好實證信息,快速回復全部問題把尋找證據(jù)、嚴格評讀以及深入探索重擔交給研究者臨床人員在使用信息資源時快速(最好當下即可取得與應用)確實能夠提供答案醫(yī)學信息檢索專家講座第73頁EBM或EBNResourcesModelfrom:Haynes,R.B.().Ofstudies,syntheses,synopses,summaries,andsystems:the"5S"evolutionofinformationservicesforevidence-basedhealthcaredecisions.ACPJournalClub,145(3),A8.整合證據(jù)提供特定臨床問題之概述與提議ACPPIERBMJClinicalEvidenceDynaMedFirstConsultUpToDate對單篇研究或回顧性文件作摘要與評述ACPJournalClub,Evidence-BasedMedicine(PubMed,OvidMedline)特定臨床問題系統(tǒng)性評論文件CochraneDatabaseofSystematicReviewsDatabaseofAbstractsofReviewsofEffects(PubMed,OvidMedline):SystematicReviews連結個別病歷臨床知識與支持決議系統(tǒng)原始文件(PubMed,OvidMedline,CINAHL,EMBASECochraneCENTRAL,GoogleScholarCEPS漢字電子期刊,漢字期刊篇目索引)3.synopses4.syntheses5.studies1.systemsFilteredResourcesUnfilteredResourcesMetaSearchTRIPSUMsearch2.summaries愈上層信息精萃簡單關鍵詞省時搜尋與評讀快速支持決議由下層積累愈下層文件雜多完整關鍵詞費時搜尋與評讀重視檢索技巧信息新奇醫(yī)學信息檢索專家講座第74頁Wheretostartlookingfor…省力標準:5S由上往下Summaries(Critically-AppraisedTopics)Synopses(Critically-AppraisedIndividualArticles)Syntheses(SystematicReviews)Studies(OriginalPapers)無從下手時:MetaSearch、GoogleSearch不熟悉哪個資源能夠回答這個臨床問題、慣用資源找不到答案但請慎重很多起源缺乏criticalappraisal訂購資源可能不在搜尋范圍內(nèi)只看到片面現(xiàn)象BackgroundInformation/ExpertOpinionE-TextbookDrugInformationMicromedexPubMedOvidMedline醫(yī)學信息檢索專家講座第75頁FilteredResources(secondary)我能相信summaries或systematicreviews嗎?假如…沒有利益沖突清楚陳說問題完整搜尋并取得相關研究明確篩選準則,并列出參考書目嚴格評讀原始研究可再現(xiàn)(reproducible)相關決議定時評論與更新,確保新證據(jù)沒有被遺漏Unsystematicnarrativereview混合個人意見和證據(jù),而證據(jù)也常岀自reviewer個人選擇HeneghanC,BadenochD().Evidence-basedMedicineToolkit.Haynes,RB().Ofstudies,syntheses,synopses,summaries,andsystems:the"5S"evolutionofinformationservicesforevidence-basedhealthcaredecisions.ACPJournalClub,145(3),A8.structuredapproach醫(yī)學信息檢索專家講座第76頁UnfilteredResources(primary)何時需要搜尋UnfilteredResources系統(tǒng)評論來自于underpowered(small)trials。Filteredresources還未處理所關注臨床問題??茖W研究Haynes,RB().Ofstudies,syntheses,synopses,summaries,andsystems:the"5S"evolutionofinformationservicesforevidence-basedhealthcaredecisions.ACPJournalClub,145(3),A8.醫(yī)學信息檢索專家講座第77頁計算機檢索效果評價評價目標、范圍評價標準:查全率查準率影響檢索檢索效果原因醫(yī)學信息檢索專家講座第78頁查全率查全率是指系統(tǒng)在進行某一檢索時,檢出相關文件量與系統(tǒng)文件庫中相關文件總
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