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SciFinder檢索介紹的教案第1頁/共103頁ChemicalAbstractService化學(xué)文摘社今天:全球最大的學(xué)協(xié)會(huì)組織本部擁有800多博士從事文獻(xiàn)編輯工作為全球超過1200多個(gè)學(xué)校提供SFS桌面檢索平臺(tái)第2頁/共102頁第2頁/共103頁通過此次培訓(xùn),您可以掌握掌握SciFinder中文獻(xiàn)檢索方法與分析掌握SciFinder中結(jié)構(gòu)檢索的方法與分析掌握SciFinder中結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)和定義掌握SciFInder中的反應(yīng)檢索與分析了解SciFinder最新的版本SciFinderWeb第3頁/共102頁第3頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第4頁/共102頁第4頁/共103頁SciFinder介紹由CAS自主開發(fā)研究的.一站式的信息檢索平臺(tái),可以檢索全球最大的,有關(guān)生物化學(xué),化學(xué),化學(xué)工程,醫(yī)藥等化學(xué)相關(guān)學(xué)科的信息從中可以檢索來自專利,期刊的文獻(xiàn).最大的二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫.全球最大的物質(zhì)數(shù)據(jù)庫。……第5頁/共102頁第5頁/共103頁期刊專利論文會(huì)議報(bào)告溶劑,催化劑,產(chǎn)率等物質(zhì)基因合成信息CAPlusMedlineRegistryCASReactChemcatsChemlistSciFinder介紹第6頁/共102頁第6頁/共103頁SciFinder介紹第7頁/共102頁第7頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第8頁/共102頁第8頁/共103頁SciFinder中的檢索方法主題機(jī)構(gòu)名專利號(hào)作者名結(jié)構(gòu),亞結(jié)構(gòu)俗名分子式官能團(tuán)相似結(jié)構(gòu)文獻(xiàn)反應(yīng)物質(zhì)第9頁/共102頁第9頁/共103頁SciFinder中的檢索方法所以,在SciFinder中,只要得到一點(diǎn)信息,就可以獲得最為全面的文獻(xiàn)……物質(zhì)……反應(yīng)……第10頁/共102頁第10頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第11頁/共102頁第11頁/共103頁第12頁/共102頁第12頁/共103頁主題檢索舉例第13頁/共102頁第13頁/共103頁提出問題獲得有關(guān)血清白蛋白制備的納米顆粒的參考文獻(xiàn)存在問題:主要用于哪些方面的研究國際上哪些機(jī)構(gòu)的研究處于領(lǐng)先水平獲得和顆粒大小和形狀有關(guān)的參考文獻(xiàn)第14頁/共102頁第14頁/共103頁我們用Nanoparticlewithserumalbumin來做初次的檢索“Closelyassociatedwithoneanother”
表示在同一個(gè)句子當(dāng)中出現(xiàn)第15頁/共102頁第15頁/共103頁獲取文摘獲取全文分析/限定我們注意到所列文獻(xiàn)中出現(xiàn)了Nanoparticles這樣的詞那是SciFinder能夠自動(dòng)識(shí)別同義詞,近義詞,縮寫,并有截詞,斷詞等功能第16頁/共102頁第16頁/共103頁系統(tǒng)分類工具第17頁/共102頁第17頁/共103頁一共11種分析手段分析工具提供11種分析方法,包括索引詞,作者名,機(jī)構(gòu)名,文獻(xiàn)類型,期刊名稱,出版年限等。在這些分析工具中,索引詞(IndexTerm):可以幫助我們對(duì)文獻(xiàn)的內(nèi)容進(jìn)行大致的了解學(xué)科分析(CASectionTitle):可以幫助我們對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行學(xué)科分類第18頁/共102頁第18頁/共103頁一共7種限定手段限定工具提供7種限定方法,包括主題詞,作者名,機(jī)構(gòu)名,文獻(xiàn)類型等。在這些限定工具中,主題詞(ResearchTopics):可以讓我們用我們關(guān)心的主題詞再次限定文獻(xiàn)文獻(xiàn)類型(DocumentType):可以讓我們直接獲得我們感興趣的文獻(xiàn)類型第19頁/共102頁第19頁/共103頁分析工具----組織機(jī)構(gòu)名分析第20頁/共102頁第20頁/共103頁分析工具----出版年限分析第21頁/共102頁第21頁/共103頁分析工具----期刊名分析第22頁/共102頁第22頁/共103頁一級(jí)目錄二級(jí)目錄點(diǎn)擊感興趣的二級(jí)分類,在這里可以出現(xiàn)一些索引詞條系統(tǒng)分類工具Categorize第23頁/共102頁第23頁/共103頁查看更加細(xì)節(jié)的內(nèi)容第24頁/共102頁第24頁/共103頁第25頁/共102頁第25頁/共103頁文獻(xiàn)檢索小結(jié)SciFinder文獻(xiàn)檢索小結(jié)向SciFinder提一個(gè)最為廣泛的問題可以通過SciFinder的Analyze/Refine功能來不斷的修正我們的檢索思路可以通過SciFinder的Analyze/Refine功能來縮小檢索的范圍可以通過SciFinder的Analyze/Refine功能來獲取新的知識(shí)點(diǎn)和靈感嘗試將不同的Analyze/Refine功能組合起來用,會(huì)有更多的收益使用Categorize可以讓系統(tǒng)來實(shí)現(xiàn)自動(dòng)分類通過GetRelated來獲得更多的信息,可以實(shí)現(xiàn)從文獻(xiàn)到物質(zhì),反應(yīng),引文的鏈接第26頁/共102頁第26頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第27頁/共102頁第27頁/共103頁當(dāng)我們知道一個(gè)物質(zhì)的名稱,CAS注冊(cè)號(hào),或者商品名,俗名等時(shí)。第28頁/共102頁第28頁/共103頁第29頁/共102頁第29頁/共103頁第30頁/共102頁第30頁/共103頁如果我們知道的是物質(zhì)的結(jié)構(gòu)或者分子式,可以……第31頁/共102頁第31頁/共103頁結(jié)構(gòu)檢索舉例第32頁/共102頁第32頁/共103頁結(jié)構(gòu)工具第33頁/共102頁第33頁/共103頁結(jié)構(gòu)相關(guān)工具鉛筆元素周期表可變基團(tuán)重復(fù)基團(tuán)工具結(jié)構(gòu)模版橡皮正電子選擇工具原子鎖定工具碳鏈工具常用基團(tuán)R基團(tuán)定義工具可變位置連接工具多元環(huán)工具旋轉(zhuǎn)工具負(fù)電子環(huán)鎖定工具索套選擇工具第34頁/共102頁第34頁/共103頁精確結(jié)構(gòu)檢索第35頁/共102頁第35頁/共103頁得到物質(zhì)的鹽,或者其他的混合物第36頁/共102頁第36頁/共103頁但是有的時(shí)候我們需要獲得一些通式結(jié)構(gòu)信息我想找到包含以下通式結(jié)構(gòu)的物質(zhì)R1,R2,R3=任意基團(tuán)第37頁/共102頁第37頁/共103頁亞結(jié)構(gòu)檢索第38頁/共102頁第38頁/共103頁得到物質(zhì)的修飾信息33246種修飾信息第39頁/共102頁第39頁/共103頁實(shí)際上我們有的時(shí)候,更多關(guān)注的是結(jié)構(gòu)上面的信息修飾信息?修飾上某一特定原子后該原子的修飾信息?……第40頁/共102頁第40頁/共103頁第41頁/共102頁第41頁/共103頁修正結(jié)構(gòu)第42頁/共102頁第42頁/共103頁對(duì)所得結(jié)果再次使用真實(shí)原子附屬性分析第43頁/共102頁第43頁/共103頁有的時(shí)候,我們對(duì)我們關(guān)心的結(jié)構(gòu)只有一定的了解,不確定的信息太多我們來看我們所要找的結(jié)構(gòu):結(jié)構(gòu)中含有苯環(huán),苯環(huán)上含有一個(gè)雜環(huán)雜環(huán)為5元環(huán),6元環(huán)或7元環(huán),且雜原子不能直接接在苯環(huán)上雜環(huán)上原子必須是O或者S苯環(huán)上與雜環(huán)相鄰的位置接個(gè)Br苯環(huán)上某2個(gè)處于間位的C必須有1個(gè)C接鹵素,但是接什么鹵素不確定該2個(gè)位置之間的C必須接一個(gè)基團(tuán),該基團(tuán)可以是H,OH,X第44頁/共102頁第44頁/共103頁得到具備一定條件的結(jié)構(gòu)信息問題:存在多少種環(huán)結(jié)構(gòu)X=F,Cl,Br,I分別有多少種物質(zhì)R2=H,OH,X分別有多少物質(zhì)R1=O,SR2=H,OH,X第45頁/共102頁第45頁/共103頁第46頁/共102頁第46頁/共103頁環(huán)骨架分析第47頁/共102頁第47頁/共103頁可變基團(tuán)分析第48頁/共102頁第48頁/共103頁R基團(tuán)分析第49頁/共102頁第49頁/共103頁相似結(jié)構(gòu)檢索第50頁/共102頁第50頁/共103頁得到相似結(jié)構(gòu)信息第51頁/共102頁第51頁/共103頁SciFinder的3種結(jié)構(gòu)檢索包容關(guān)系亞結(jié)構(gòu)檢索相似結(jié)構(gòu)檢索精確結(jié)構(gòu)檢索精確結(jié)構(gòu)檢索:得到的是物質(zhì)的鹽,本身,聚合物,混合物亞結(jié)構(gòu)檢索:畫出來的結(jié)構(gòu)必須存在相似結(jié)構(gòu)檢索:給出相似度在60分以上的物質(zhì)第52頁/共102頁第52頁/共103頁精確結(jié)構(gòu)檢索: 獲得物質(zhì)的鹽,聚合物,混合物,配合物等,母體結(jié)構(gòu)不能修改,不能修飾亞結(jié)構(gòu)檢索: 所畫的結(jié)構(gòu)必須存在,母體結(jié)構(gòu)不能修改,但可以被修飾相似結(jié)構(gòu)檢索: 獲得相似度在60分以上的結(jié)構(gòu),母體結(jié)構(gòu)可以修改,也可以被修飾,用相似度來控制獲得的結(jié)果物質(zhì)檢索小結(jié)第53頁/共102頁第53頁/共103頁分子式檢索舉例第54頁/共102頁第54頁/共103頁分子式輸入規(guī)則CH寫在前面,其他按照字母順序?qū)τ诙嘟M分物質(zhì),用“.”將不同的組分分開聚合物括號(hào)表示,括號(hào)外用x表示起始物,用n表示終產(chǎn)物區(qū)分大小寫第55頁/共102頁第55頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第56頁/共102頁第56頁/共103頁SciFinder中的反應(yīng)檢索和分析反應(yīng)查詢工具第57頁/共102頁第57頁/共103頁SciFinder中的反應(yīng)檢索和分析反應(yīng)位置標(biāo)記工具反應(yīng)箭頭反應(yīng)官能團(tuán)列表反應(yīng)原子標(biāo)記工具反應(yīng)角色工具第58頁/共102頁第58頁/共103頁獲得特定物質(zhì)的合成方法第59頁/共102頁第59頁/共103頁第60頁/共102頁第60頁/共103頁第61頁/共102頁第61頁/共103頁一共10種分析手段分析工具提供反應(yīng)中的催化劑(Catalyst),溶劑(Solvent),反應(yīng)步數(shù)(Numberofsteps),產(chǎn)率(ProductYield)等的分析第62頁/共102頁第62頁/共103頁一共4種限定手段限定工具,可以根據(jù)進(jìn)一步的條件去限定反應(yīng)中出現(xiàn)的物質(zhì)(ReactionStructure),以及反應(yīng)類型(ReactionClassification)等第63頁/共102頁第63頁/共103頁第64頁/共102頁第64頁/共103頁第65頁/共102頁第65頁/共103頁溶劑分析第66頁/共102頁第66頁/共103頁或者,有的時(shí)候我們想獲得某些官能團(tuán)之間變化的反應(yīng)某些特定物質(zhì)類似物的合成路線結(jié)構(gòu)中包含某些特殊結(jié)構(gòu)要求的反應(yīng)拓展思路的反應(yīng)檢索第67頁/共102頁第67頁/共103頁官能團(tuán)之間的反應(yīng)第68頁/共102頁第68頁/共103頁假如我們只想得到一步反應(yīng)第69頁/共102頁第69頁/共103頁假如我們規(guī)定反應(yīng)物必須是乙酰氯第70頁/共102頁第70頁/共103頁那么如何獲得不是從乙酰氯出發(fā)的反應(yīng)呢?讓我們先返回初次檢索到的683條反應(yīng)。第71頁/共102頁第71頁/共103頁再按照上面的檢索獲得從乙酰氯出發(fā)的反應(yīng),一共16條第72頁/共102頁第72頁/共103頁運(yùn)用Combine功能將不需要的答案集排除第73頁/共102頁第73頁/共103頁第74頁/共102頁第74頁/共103頁第75頁/共102頁第75頁/共103頁檢索思路回顧獲得1步從酰鹵到醛的反應(yīng)限定反應(yīng)物獲得反應(yīng)物是乙酰氯的反應(yīng)運(yùn)用Combine功能將乙酰氯是產(chǎn)物的反應(yīng)去除第76頁/共102頁第76頁/共103頁COMBINE-----組合答案集功能可以對(duì)于任意兩個(gè)同類型的集合進(jìn)行AND,OR,NOT的操作ANDORNOTNOT第77頁/共102頁第77頁/共103頁*.SFR格式保存-----書簽格式保存功能將結(jié)果保存成書簽,可以使用SFS再次打開,繼續(xù)進(jìn)行檢索,也可以對(duì)同類的書簽進(jìn)行COMBINE操作第78頁/共102頁第78頁/共103頁獲得某些物質(zhì)的類似合成路線想獲得1步合成該物質(zhì)的反應(yīng)第79頁/共102頁第79頁/共103頁亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)檢索必須的條件:羥基接的C必須是CH2整個(gè)C鏈不允許是某個(gè)環(huán)結(jié)構(gòu)的部分結(jié)構(gòu)其余的3個(gè)C原子鏈接什么基團(tuán)對(duì)反應(yīng)沒有影響據(jù)此,我們修改我們的檢索方式第80頁/共102頁第80頁/共103頁亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)檢索用環(huán)鎖定功能,鎖定C鏈,保證其不成為環(huán)結(jié)構(gòu)的一部分用原子鎖定功能,鎖定C原子,保證C原子上兩個(gè)H不被取代第81頁/共102頁第81頁/共103頁第82頁/共102頁第82頁/共103頁對(duì)反應(yīng)位置和原子有特定要求的反應(yīng)O原子反應(yīng)前后必須配對(duì)C=O鍵必須發(fā)生反應(yīng)除已有的環(huán)外,不能成環(huán)第83頁/共102頁第83頁/共103頁用mappingtool鍵標(biāo)示O原子反應(yīng)前后位置用sitemarkingtool鍵標(biāo)示C=O鍵反應(yīng)的位置。用Lockoutringtool鍵鎖定環(huán)對(duì)反應(yīng)作出條件限定第84頁/共102頁第84頁/共103頁第85頁/共102頁第85頁/共103頁SciFinder反應(yīng)檢索小結(jié)多用Analyze/Refine,來獲得催化劑,溶劑,產(chǎn)率等信息如果反應(yīng)只涉及基團(tuán)之間的變化,用官能團(tuán)反應(yīng)可以獲得更多的參考信息當(dāng)無法找到具體反應(yīng),或者檢索結(jié)果并不滿意,嘗試用亞結(jié)構(gòu)反應(yīng)查詢,可以獲得更多的參考信息第86頁/共102頁第86頁/共103頁提綱SciFinder介紹SciFinder中的檢索方法SciFinder中的文獻(xiàn)檢索與分析SciFinder中的物質(zhì)檢索與分析SciFinder中的反應(yīng)檢索與分析SciFinderWeb介紹第87頁/共102頁第87頁/共103頁SciFinderWeb介紹SciFinderWeb是通過Web來訪問SciFinder數(shù)據(jù)庫的方式友好的用戶界面更加詳盡的文獻(xiàn)信息和詳盡的物質(zhì)信息即時(shí)跟蹤特定研究領(lǐng)域的全球最新動(dòng)態(tài)永久的信息分享鏈接……第88頁/共102頁第88頁/共103頁SciFinderWeb是通過Web來訪問SciFinder數(shù)據(jù)庫的方式第89頁/共102頁第89頁/共103頁友好的用戶界面第90頁/共102頁第90頁/共103頁更加詳盡的文獻(xiàn)信息和詳盡的物質(zhì)信息對(duì)于苯這個(gè)物質(zhì),在哪些文獻(xiàn)類型中有過報(bào)道對(duì)于苯這個(gè)物質(zhì),在專利和非專利文獻(xiàn)中的情況第91頁/共102頁第91頁/共103頁即時(shí)跟蹤特定研究領(lǐng)域的全球最新動(dòng)態(tài)第92頁/共102頁第92頁/共103頁永久的信息分享鏈接第93頁/共102頁第93頁/共103頁請(qǐng)合理使用SciFinder!!!
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