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文檔簡介
8/8多肽的基本常識
保存:?大多肽在—20℃很穩(wěn)定,特別是冷凍干燥并保存在干燥器中,在將它們暴露于空氣之前,冷凍干燥多肽可以放于室溫。這將使?jié)穸扔绊憸p少,當無法冷凍干燥時,最好的方法是以小的工作樣量存放。?對于含Cys,Met,TrP的多肽,脫氧緩沖劑對其溶解必不可少,因為這種多肽可易空氣氧化,在封瓶前,慢慢流過多肽的氮氣或氬氣也會降低氧化作用。含Gln或Asn溶解性:
大多肽的首選溶劑是超純抽氣水。稀乙酸或氨水分別對于堿性或酸性多肽的溶解很重要.這些方法不溶的多肽,需要DMF、脲、guanidiniamchloride或acetonitnle來溶解,這些溶劑可能某些實驗有副作用。所以我們建議設計多肽時要加注意。
殘基Ala,Cys,Ile,Leu,Met,Phe和Val將會增加多肽的溶解難度。
您需要特殊的多肽或任何技術幫助,請隨時與我們聯(lián)系。我們包你完全滿意,對于我們不能適當合成的順序,我們不收費。多肽的保存和操做??包裝1mg或更少的多肽按凈重包裝,聲明的小瓶重不含相關抗離子和水。例如,氨基酸分析決定的肽含量是80%,在1mg樣品中,那么瓶中毛重是1.25mg.?大量的多肽以毛重算。標出的重量含相關抗離子和水,例如,25mg樣品中肽百分比為90%,那么,實際肽量為25mg×90%=22。5mg?不要把肽含量和純度搞混了。肽的純度可能是100%,而肽含量相關帶電基團(如Arg,Lys)的抗離子量和肽親水性決定。這是合成肽的本身特性。凍干肽的保存?所有產(chǎn)品應存于冰箱,最好為-20℃肽溶液的保存?溶液肽遠比凍干形式不穩(wěn)定,溶液應為中性pH(pH5—7),—20℃保存的,為避免樣品的反復凍融,最好分成小樣存放.多肽的重建和操作?
多數(shù)肽溶于無菌蒸溜水。初次溶解時,要注意使初始濃度比要求濃度大,如果多肽僅有限溶解性,這便允許加入其它溶解劑或緩沖鹽.
如果多肽在水中的溶解性有限,有幾種選擇可幫助溶解:?對堿性肽用稀乙酸(含Arg,Lys,His)?酸性肽用稀氨水(含Asp,Glu)
對極疏水的肽用10%有機修飾物(Acetonitnile,Methanol)?極不溶的肽用DMS0或DMF
guaniclinehydrochloride或脲的濃溶液也很有用,與上述方法合用,超聲處理也是溶解多肽的有效手段.多肽的包裝
目錄中所有多肽除特別說明外,純度為95~98%。包裝為小瓶凍干粉。除特別注明外,多肽凈重包裝,例如,1mg瓶的β-amyloid1-40精確含1mg的多肽。多肽凈重由氨基酸分析得到的肽含量計算。例如,一個多肽樣品毛重5mg,氨基酸含量85%,多肽凈重為5mg×0.85=4。25mg。請注意,多肽含量不是多肽純度,與抗離子象乙酸鹽和溶劑,特別是水結合量合成多肽的本身特性。多肽純度可能達100%,但合成品中多肽含量由氨基酸組成,硫水性,和多肽對溶劑和離子的暴露決定,特別是在純化過程中,無論多肽如何純,凍干粉多肽含量一般為70-85%。剩余15—30%由其它基本非肽成份構成.多肽應用和保存?多肽具廣泛的溶解性。多肽不溶的主要問題是形成二級結構。除了最太肽外,這點都會發(fā)生,在有多重疏水殘基的肽中更顯著。鹽會促進二級結構形成.我們建議先在無菌蒸餾水或去離子中溶解多肽.如需要增加溶解率,可用聲處理。溶解仍有問題,加少量稀乙酸(10%)或氨水,會便于溶解。?要長期保存多肽,最好冷凍干燥,冷干粉可在-20℃或更低存放幾年而很少或無降解.溶液中的多肽遠不穩(wěn)定。多肽易受細菌降解,應用無菌純化水溶解。
含有Met,Cys或Ty固相多肽合成Fmoc方法??任何多肽鏈的關鍵連接為肽鍵,由一個氨基酸的氨基與另氨基酸的縮合形成。通常一個氨基酸由一個中心碳原子組成,它由四個基它基團包圍:氨基、羰基、基和側鏈.側鏈,稱為R,區(qū)別不同氨基酸的結構.某些側鏈含有干擾肽鍵形成的功能團。因此側鏈功能團的封閉很重要。?圖工顯示了Fmoc合成的一般流程,首先第一個Fmoc氨基酸通過一個酸性接頭接到不溶載體樹脂上,Fmoc去保護通過用堿處理樹脂來完成,一般是Poperidine.用預先激活或原位激活連接第二個Fmoc氨基酸.要求總多肽合成后,通過TFA分離來除去樹脂和去保護。Fmoc分離固相多肽合成中多肽分離主要用酸解Fmoc法用弱酸,比如TFA或TMSBr.各種添加劑,一般為thiolcompound,水和酚,用來保護多肽的免分離中Carbocat(yī)ion的破壞。下列保護基與TFA和TMSBr分離相合:(略)基于保護基團的類別,必須使用去保護劑的組合。例如,當Boc和tButyl存在時,它們的Carbocat(yī)ion對應物能與Trp,Tyr和Met反應形成tbutyl產(chǎn)物.EDT是極有效的t—butyltrifluoroacetat(yī)e清除劑,但它不保護Trp。因此,必須加水以控制烷基化。Trp的吲哚環(huán)和Tyr的OH極易與Pmc反應.水再次表現(xiàn)出對此反應的抑制。Trt和Mtr基團也有相似情形。較此適當組合清除劑將極大降低副反應。tBoc和CBZ多肽合成tBoc合成法見圖3tBoc法的分離法Boc使用強酸,比如HF,TFMSA或TFMoTf。分離加入各種添加劑,一般為thiol化合物以保護多肽免受carbocation破壞。HF分離法(如下)略TFMSOTf分離TMSOTf分離SPPS的一般連接方法適于固相多肽合成的連接反應要求?;磻?對同源多肽最有效。FmocSPPS連接方法FmocSPPS最常用的連接法是活性酯,要么原位,要預先激活.起初P-nitrophenyl和N-h(huán)ydnxysuccinimide激活酰是常用形式。甚至,有HOBt時,連接反應也很慢,此外,Fmoc氨基酸ONSu、酯與succinimido-carbonyl—β-alanine-N-Hydroxysuccinidide酯副產(chǎn)物的形成相關。今天最常用的激活酯是Opfp和Odhbt。有HoBt時反應速度極快,副產(chǎn)物少。另一方面,使用象DCC,HBTU,BOP,BOP-Ce,或TBTU活化劑時,能原位進行許多連接反應.Carbondiimide的直接添加是最佳選擇.然而,TBTU和HBTU第二個出現(xiàn),接著BoP,最后是BoP-CE。再者,酯連接發(fā)現(xiàn)BoP/HoBt〉Carbodiimido/HoBt>Carbodiimido/ODHbT>Carbodiimide/Opfp.最近以來,HOAt和其對應Uronium鹽同類物HATU的發(fā)展,發(fā)現(xiàn)此HoBt和HBTU具更強催化活性,結果是增加連接產(chǎn)出,縮短連接時間,消旋降低。故此,更適合阻位氨基酸的連接,使得難合成肽的合成更成功。tBocSPPS的普通連接法Carbodiimides,主要是DCC是使用多年的連接試劑,主要的問題是激活和?;^程中dicyclohexylurea的沉淀。并且伴有許多副反應,已有幾種產(chǎn)生可溶脲的Carbodiimide,例如DIC,t-butylmethyl—和t—tatyllethyl-carbodiimide,但是這些試劑未解決副反應的問題。結果生產(chǎn)出了新的激活劑。首先是BOP,隨后是PyBrop,PyBOP,HBTU,TBTU和HATU。所有前述試劑都要活性堿基。所有前面討論的DCC及其衍生物都通過對稱酐的形成起作.通常,對稱酐反應性極強已廣泛用于SPSS,特別t-Boc合成中,對稱酐整合入Fmoc氨基酸有一些困難,例如,從N-(3—dimethylaminopropyl)—N?/FONT〉—ethyl-carbodiimides—HG制備的對稱酐,由于Z—alkory—5(4H)—oxayolne中間體的形成,在Carbodiimidie和tertianyamines存在時重排,還有,不是所有的Fmoc對稱酐都溶于DCM,或者無論所有試劑如何都不溶。對稱酐的另一種改變是混合酐,Carboxglic—Carbonate或Carboxglic-phosphinic混合酐,典型的情況且是,由活性isobutyl—或isopropyl—choroformate制備這些,用Nox被阻氨基酸代替phosphinicchloride.通常反應迅速及少或無有副反應.混合酐,N-carboxy酐(NCAS),也叫,Leuch酐,已廣泛用于多聚氨基酸制備,這類化合物聯(lián)合Nox保護和活化炭基,一旦和另一個氨基酸或肽殘基反應,釋放CO2做為副產(chǎn)物。用光氣處理α氨基酸很容易得到NCA衍生物,在嚴格調控條件下,NCA衍生物常結晶析出,便可使用。這些條件要求嚴格控制合成中的PH,在PH值低于10時,NCA和肽或氨基酸殘基反應產(chǎn)物,肽—Carbamate易失去CO2形成自由α-氨基端,發(fā)生聚合。pH10.5時,NCA便水解隆解。所以反應在PH10.2條件下進行。別的條件要求是反應在0℃液相合成?基于將單個N—α保護氨基酸反復加到生長的氨基成份上,合成一步步地進行,通常從合成鏈的C端氨基酸開始,接著的單個氨基酸的連接通過用DCC,混合炭酐,或N—carboxy酐方法實現(xiàn)。Carbodiimide方法包括用DCC做連接劑連接N-和C—保護氨基酸。重要的是,這種連接試劑促接N保護氨基酸自己炭基和C保護氨基酸自由氨基間的縮水,形成肽鏈,同時產(chǎn)出N,N?/FONT>—dyaylcohercylurea副產(chǎn)物。然而,此方法因其導致消旋的副反應,或在強堿存在時形成5(4H)-oxaylones和N—acylurea而受到影響.慶幸地是,這些副反應能最小化,如果還不能完全消除。方法是加入象HoSu或HoBT這樣的連接催化劑,此外,此方法也可用于合成N保護氨基酸的活性酯衍生物。依次產(chǎn)生的活性酯將自發(fā)與任何別的C保護氨基酸或肽反應形成新的肽。?當從副產(chǎn)品,diaydohexylurea分離活性酯有困難時,可用混合Carbonic酐方法,此方法由兩步組成,第一步是在有tertiary堿的有機溶劑中用適當?shù)孽;燃せ頝x保護氨基酸的炭基,第二步是讓肽或氨基酸的自由氨基與Carbonic酐反應.Carbonic酐通常加到自由氨基的14倍.
雖然此方法在低溫時高效高產(chǎn),產(chǎn)品純,但也有其缺點,例如,由羰基的強激活酐衍生物有消旋傾向。然而此問題在使用Nx-α—Urethane保護基(Cb2,或tBoc)時便不會發(fā)生。進一步:由于高反應性,混合Carbonic酐傾向5(4H)-oxagolomes,Urerbanesdiacyimide,酯的形成,并易失調.?促進這些副反應的條件是高溫,延長激活時間(即,混合酐形成后,加到alkylchlorocarbonat(yī)e和amine成份的時間,amine組成的空間占位,平共處和混合酐的不完整形成。幸運的是,大多這些副反應,除形成啞唑酮和脲烷外,可通過低溫進行反應(~-15℃),大為減少,并且縮短活化時間(~1-2分鐘)。為了使啞唑酮和尿烷形成最少,要實行如下措施:1)必要性須用無水有機溶劑,乙酸,四氫喃,t-butand,或acetonitrile;2)應使用tertiary堿和N—methglmorpholine;3)必須用Cb2或tBocN-α保護氨基酸。?雖然用isobutyl-和ethylchlorocarbonate常用來形成羰酐,但確有別的連接試劑,例如,EEQD和IIQD用來與CarboxaP成份反應形成erhyl-或isobutylcarbonate衍生物.不同于傳統(tǒng)酐程序,EEQD和IIQD不要求堿,也不要求低溫,通常要求一種有機溶劑(有許多也用)中0。1-0.4MHPLC分析和純化
分析HPLC使用柱子和泵系統(tǒng),可以經(jīng)受傳遞高壓,這樣可以用極細的微粒(3-10μm)做填料.由此多肽要在幾分鐘內高度被分析。?HPLC分兩類:離子交換和反相。離子交換HPLC依靠多肽和固相間的直接電荷相互作用.柱子在一定PH范圍帶有特定電荷衍變成一種離子體,而多肽或多肽混合物,由其氨基酸組成表現(xiàn)出相反電荷。分離是一種電荷相互作用,通過可變PH,離子強度,或兩者洗脫出多肽,通常,先用低離子強度的溶液,以后逐漸加強或一步一步加強,直到多肽火柱中洗脫出。離子交換分離的一個例子使用強陽離子交換柱.如sulfoethylaspartimide通過酸性PH中帶正電來分離。?反相HPLC條件與正常層析正相反。多肽通過疏水作用連到柱上,用降低離子強度洗脫,如增加洗脫劑的疏水性。通常柱子由共價吸附到硅上的碳氫烷鏈構成,這種鏈長度為G4—G8碳原子.由于洗脫是一種疏水作用。長鏈柱比短鏈對小的,高帶電肽好。另一方面大的疏水肽用短鏈柱洗脫好.然而,總體實踐中,這兩類柱互變無多少顯著差別,別類載體由碳水化合物構成,比如苯基。
典型的操作常由兩綬沖劑組成,0。1%TFA—H2o和80%acetonitrile0.1%TFA--H2o稀acetonitrile。用線型梯變以每分鐘0。5%到1.0%改變的速度混合。常見分析和純化用柱為
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