1、人類基因組計劃和國際癌癥基因組計劃個體化醫(yī)療的奠基石于1990年在美國正式啟動的人類基因組計劃，要把人體內(nèi)約10萬個基因的密碼全部解開，同時繪制出人類基因的譜圖。2006年多國聯(lián)合啟動的國際癌癥基因組計劃，是人類基因組計劃后的又一重大科學(xué)研究。揭示更多地與癌癥相關(guān)的突變類型，獲得50種腫瘤的特定分子異常譜型，探尋DNA變異與腫瘤發(fā)生發(fā)展的機理。腫瘤治療存在的核心問題盲目治療過度治療個體化治療肺癌的傳統(tǒng)分類觀點小細(xì)胞肺癌 (SCLC)非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC)腺癌鱗癌大細(xì)胞癌腺癌鱗癌大細(xì)胞小細(xì)胞肺腺癌的分子亞型KRASEGFRHER2BRAFALK fusionPIK3CAMEK1ROS fu

2、sionPDGFR amp肺腺癌的分子分類腺癌鱗癌大細(xì)胞小細(xì)胞肺癌的傳統(tǒng)分類EGFR基因突變檢測在臨床應(yīng)用的意義IPASS: 根據(jù)突變狀態(tài)的療效分析048121620Time from randomisation (months)0.00.20.40.60.81.0Gefitinib EGFR M+ (n=132)Gefitinib EGFR M- (n=91)Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129)Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85)Gefitinib EGFR M+ (n=132)Gefitinib EGFR

3、 M- (n=91)Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129)Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85)無進展生存率 對象有效率不加選擇的中國患者30根據(jù)臨床特征選擇優(yōu)勢人群50根據(jù)EGFR敏感基因選擇+耐藥基因選擇70-80%80-95% Mok, Wu,Thomprast et al. NEJM, 20090.4檢測EGFR突變的重要性醫(yī)學(xué)指南全球三大腫瘤突變會指南均強調(diào)檢測EGFR突變的重要性EGFR突變檢測的應(yīng)用很好預(yù)測TKI藥物對NSCLC患者的療效HRM血漿突變檢測EML4-ALK融合基因ALK 最早是在間變

4、性大細(xì)胞淋巴瘤（ ALCL)的一個亞型中被發(fā)現(xiàn)的，因此定名為間變性淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）。靶向藥：XALKORI 膠囊（克唑替尼），輝瑞公司。NCCN與ESMO推薦ALK陽性NSCLC的一線治療首選克唑替尼?？傮w突變率：11.4%腺癌突變率：16.1%鱗癌突變率：0.7%優(yōu)勢人群：輕微/從未吸煙；與EGFR突變?nèi)巳合啾?，ALK融合人群年齡更輕；腺癌；EGFR/KRAS野生型；病理學(xué)特（含印戒細(xì)胞的黏液型或?qū)嵭韵侔┲?，ALK融合基因的發(fā)生率高于其他類型的肺腺癌(462VS. 8.0）EML4-ALK融合檢測的意義無進展生存期的概率 (%)100

5、8060402000510152025時間(月) 克唑替尼(n=173)化療(n=174)事件, n (%)100 (58)127 (73)中位數(shù), 個月7.73.0HR (95% CI)0.49 (0.37 - 0.64)P 0.0001Shaw et al., ESMO 2012; Abstract LBA1_PRN Engl J Med 2013;368:2385-94NCCN指南推薦靶向藥物檢測項目匯總藥物基因癌種樣本判斷標(biāo)準(zhǔn)重要程度吉非替尼/厄洛替尼/?？颂婺酔GFR非小細(xì)胞肺癌組織標(biāo)本、血漿、體液標(biāo)本突變敏感必檢KRAS突變耐藥推薦克唑替尼EML4-ALK組織標(biāo)本融合敏感必檢ROS

6、1組織標(biāo)本融合敏感推薦鉑類藥物與ERCC1 mRNA 表達Lord RVN et al, Clin Cancer Res, 2002, 8:2286-91背景 ERCC1（Excision Repair Cross Complement Group 1）是核酸外切修復(fù)家族中重要成員，參與DNA鏈的切割和損傷識別。ERCC1的表達量直接影響DNA修復(fù)的生理過程，DNA修復(fù)是鉑類化療耐藥性產(chǎn)生的主要機制之一。吉西他濱與RRM1 mRNA 表達背景 吉西他濱是脫氧胞嘧啶核苷同系物，屬細(xì)胞周期特異性抗代謝類化療藥，主要作用于DNA合成期（S期）的腫瘤細(xì)胞，同時也阻斷細(xì)胞增殖由G1向S期過渡的進程。臨床

7、研究顯示低RRM1 mRNA水平的肺癌患者對吉西他濱敏感性相對較高，藥物療效較好，中位生存期延長。而且，專家建議RRM1高表達的患者應(yīng)避免使用吉西他濱。Rafael Rosell1. Oncogene (2003) 22, 35483553抗微管類藥物與TUBB3 mRNA 表達背景 抗微管類化療藥是作用于細(xì)胞微管，通過影響紡錘體形成，從而抑制細(xì)胞有絲分裂的一類廣譜化療藥。在多種臨床研究中，TUBB3 mRNA表達水平與抗微管類化療的療效密切相關(guān)。低TUBB3表達水平的腫瘤患者接受紫杉醇類或長春堿類化療的效果較好，中位生存期較長。反之，TUBB3高表達的患者的抗微管類化療療效較差。 Rafae

8、l Rosell1. Oncogene (2003) 22, 35483553氟類藥物與TYMS mRNA 表達背景 TYMS基因編碼的胸苷酸合成酶（TS）是嘧啶核苷酸合成的限速酶，是腫瘤生長的重要因子。5-FU的代謝物5-FdUMP與TS結(jié)合，阻礙TS的正常功能，從而抑制DNA合成。臨床研究表明，低TYMS mRNA水平的腫瘤患者接受氟類化療的效果較好，中位生存期較長。反之，TYMS高表達的患者對氟類療效較差。研究也發(fā)現(xiàn)培美曲賽的療效與TYMS mRNA表達水平呈負(fù)相關(guān)。By Yoshinori Shirota, Journal of Clinical Oncology, 2001,19:

9、4298-4304化療藥物檢測項目（ mRNA 表達）類型藥物基因樣本評價mRNA 表達卡鉑、順鉑奧沙利鉑 ERCC1 石蠟切片新鮮組織低表達敏感抗微管藥物 TUBB3低表達敏感吉西他濱RRM1 低表達敏感氟尿嘧啶培美曲賽TYMS低表達敏感樣本要求石蠟包埋腫瘤組織塊 一般組織塊不小于555（mm），組織包于蠟塊正中央，處理完可歸還蠟塊（推薦）。送檢保存：常溫保存、運輸。新鮮腫瘤組織塊 要求提供50mg左右的樣本，取癌組織的中心位置組織塊，55mm（綠豆大）以上，以PBS或生理鹽水清洗干凈，15分鐘內(nèi)放入RNAlater保存液或液氮中保存。送檢保存：常溫保存、運輸，取樣后24小時內(nèi)送檢。全血標(biāo)本 使用枸櫞酸鈉（1：9）或EDTA-Na2抗凝的采血管，血液樣本2ml以上。禁忌：切勿使用肝素抗凝劑；切勿反復(fù)凍融。送檢保存：4冰箱保存，切不可置于-20中（血細(xì)胞在融解的時候易發(fā)生溶血）；當(dāng)天送檢，冰上運輸。案例分析姓名：王女士年齡：46診斷：非小細(xì)胞肺癌樣品種類：穿刺組織檢測項目：EGFR突變檢測；EML4-ALK基因融合檢測；ERCC1表達量；TYMS表達量；RRM1表達量；TUBB3表達量檢測項