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文檔簡介
T/NAIAxxx-xxxx
一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌檢驗實時熒光PCR法
1范圍
本文件規(guī)定了一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌的實時熒光PCR檢測方法。
本文件適用于一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌的定性檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6882-2008分析實驗室用水規(guī)則和試驗方法
GB/T27403-2008實驗室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測
GB/T19495.2-2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測實驗室技術(shù)要求
GB15979-2002一次性使用衛(wèi)生用品衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)
3術(shù)語和定義
3.1術(shù)語和定義
本標(biāo)準(zhǔn)采樣下列定義。
一次性一次性使用衛(wèi)生用品
使用一次后即丟棄的、與人體直接或間接接觸的、并為達(dá)到人體生理衛(wèi)生或衛(wèi)生保?。咕蛞志?/p>
目的而使用的各種日常生活用品,產(chǎn)品形狀可以是固體或液體。例如,一次性使用手套或指套(不包括
醫(yī)用手套或指套)、紙巾、濕巾、衛(wèi)生濕巾、電話膜、帽子、口罩、婦女經(jīng)期衛(wèi)生用品(包括衛(wèi)生護(hù)墊)、
尿布等排泄物衛(wèi)生用品(不包括廁所用紙)等。
3.2略縮語
DNA(deoxyribonuleicacid):脫氧核糖核酸
eta(exotoxinAgene):胞外毒素編碼基因
PCR(polymerasechainreaction):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
Ct值:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)
4原理
一次性使用衛(wèi)生用品樣品經(jīng)擴(kuò)增培養(yǎng)后,提取增菌液中DNA,以提取的DNA為模板,以綠膿桿菌
中(eta)基因中相對保守且高度特異的引物和探針進(jìn)行目標(biāo)物的實時熒光PCR擴(kuò)增,根據(jù)Ct值判斷樣品
中是否含有綠膿桿菌。
5試劑和材料
試劑的配制及試驗中的操作規(guī)范應(yīng)按GB/T27403的規(guī)定執(zhí)行。
除非另有說明,本方法所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的一級水。所有試劑均用無DNA
酶污染的容器分裝。
5.1試劑
1
T/NAIAxxx-xxxx
5.1.1SCDLP液體培養(yǎng)基:見附錄A.1。
5.1.2PCR擴(kuò)增引物序列:見附錄B.1。
5.1.3熒光探針序列見附錄B.1。
5.1.42X熒光定量PCR預(yù)混液。
5.1.5商品化DNA抽提試劑盒。
5.1.6綠膿桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株:來源自國家認(rèn)可的菌種保藏機構(gòu)。
4.2耗材
5.1.1離心管:200μL、1.5mL、5mL、10mL。
5.1.2PCR反應(yīng)管:單管、八聯(lián)管或96孔PCR微孔板。
6儀器和設(shè)備
6.1分析天平:感量0.01g。
6.2微量可調(diào)移液器:單道:1~10μL、10~100μL、1~1000μL。
6.3恒溫水浴鍋。
6.4渦旋儀。
6.5冷凍高速離心機。
6.6高壓滅菌鍋。
6.7超凈工作臺。
6.8二級生物安全柜。
6.9實時熒光定量PCR儀。
6.10恒溫培養(yǎng)箱:36±1℃。
6.11核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計。
6.12普通冰箱:4℃,-20℃。
7實驗操作步驟
7.1取樣
在100級凈化條件下用無菌方法打開用于檢測的至少3個包裝,從每個包裝中取樣,準(zhǔn)確稱取10±1g
樣品。剪碎后加入200mL無菌生理鹽水中,充分混勻,得到生理鹽水稀釋樣液。液體產(chǎn)品直接用原液
作為樣液。
7.2增菌
取樣液(7.1)5mL,加入到50mLSCDLP培養(yǎng)液中,充分混勻,置于35℃±1℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)18h。
7.3模板DNA的提取與制備
7.3.1從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液。離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),去上清液。
加入600μL核酸裂解液,重懸浮細(xì)菌。100℃水浴5min后冷卻至室溫。12000rpm/min離心3min,將
上清液移至干凈的1.5mL離心管中,加入0.8倍體積異丙醇,置于4℃冰箱靜置1h,12000rpm/min離
心2min,去上清液。加入200μL70%乙醇輕柔倒置洗滌2~3次,12000rpm/min離心2min去上清,風(fēng)
干10~15min,加入100μL無菌雙蒸水重懸后于4℃保存,如不能即時檢驗,提取后DNA放置于-20℃
冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
2
T/NAIAxxx-xxxx
7.3.2試劑盒法。從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液,離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),
按照商品化細(xì)菌基因組提取試劑盒說明書進(jìn)行細(xì)菌基因組DNA提取,如不能即時檢驗,提取后DNA
放置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
7.4DNA濃度和純度測定
取適量DNA原液加無菌雙蒸水稀釋至一定倍數(shù)后,使用核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計測定
260nm和280nm處吸光度,按照式(1)計算DNA的濃度。
0······························································(1)
式中:?=?260×?×5
—DNA濃度,單位為微克每毫升(μg/mL);
A260—260nm處的吸光值;
Nρ—核酸稀釋倍數(shù);
50—吸光值A(chǔ)260為1時,相對應(yīng)雙鏈的DNA濃度常數(shù);
當(dāng)比值在1.8~2.0之間時,適用于熒光PCR擴(kuò)增。
260
實?時熒光檢測
7.5?28P0CR
7.5.1實時熒光PCR反應(yīng)體系
試劑成分體積(μL)
2X熒光定量PCR反應(yīng)預(yù)混液12.5
DNA模板1
上游引物(10μM)0.6
下游引物(10μM)0.6
探針(5μM)0.3
ddH2O補齊至25μL
7.5.2實時熒光PCR反應(yīng)參數(shù)
預(yù)變性:95℃、5min,1個循環(huán);變性:95℃、15s,退火:60℃、30s,同時收集FAM熒光,延
伸:72℃、30s,44個循環(huán)。
7.5.3實驗對照及平行
檢驗過程中分別設(shè)置陽性對照、陰性對照和空白對照。陽性對照為綠膿桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA,陰性
對照為大腸埃希氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA,用等體積的無菌雙蒸水作為空白對照。每個待檢樣品提取DNA溶
液進(jìn)行2個實時熒光PCR檢測。
8結(jié)果分析及表述
8.1質(zhì)量控制
以下條件有一條不滿足時,實驗視為無效,需重新進(jìn)行實驗。
a)空白對照:無熒光對數(shù)增長,相應(yīng)的Ct值>40.0;
b)陰性對照:無熒光對數(shù)增長,相應(yīng)的Ct值>40.0;
c)陽性對照:有熒光對數(shù)增長且熒光通道出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,相應(yīng)的Ct值<35.0。
8.2結(jié)果分析
在符合8.1情況下,被檢樣品進(jìn)行檢測時:
檢驗樣本Ct值≤35.0時,則判定被檢樣品為陽性
檢驗樣本Ct值≥40.0時,則判定被檢樣品為陰性
3
T/NAIAxxx-xxxx
如35.0<Ct值<40.0,判為結(jié)果可疑,需要重新檢測。重新檢測結(jié)果Ct值≥40.0,則判定被檢樣品為
陰性,反之判定為陽性。
8.3結(jié)果表述
結(jié)果為陽性者,該樣品檢驗結(jié)果為綠膿桿菌初篩陽性,對樣品增菌液進(jìn)一步按照GB15979-2002中
B4.1的規(guī)定進(jìn)行確證,確證為陽性時,報告檢出綠膿桿菌,確證為陰性時,報告未檢出綠膿桿菌。
結(jié)果為陰性者,表述為被檢樣品未檢出綠膿桿菌。
9預(yù)防污染措施
檢測過程中防止交叉污染的措施按照GB/T27403中的規(guī)定執(zhí)行。
4
T/NAIAxxx-xxxx
附錄A培養(yǎng)基和試劑配制
A.1SCDLP液體培養(yǎng)基
A.1.1成分
酪蛋白胨17g
大豆蛋白胨3g
氯化鈉5g
磷酸氫二鉀2.5g
葡萄糖2.5g
卵磷脂1g
吐溫807g
蒸餾水1000mL
A.1.2制法
將上述成分混合后,加熱溶解,調(diào)節(jié)pH值為7.2~7.3分裝,121℃20min高壓滅菌。搖勻,避免
吐溫80沉于底部,冷卻至25℃左右使用。
5
T/NAIAxxx-xxxx
附錄B一次性衛(wèi)生用品中綠膿桿菌的實時熒光PCR檢測所用引物及擴(kuò)增片段系列
B.1實時熒光PCR檢測所用上下游引物及熒光探針系列
綠膿
桿菌引物序列探針序列
基因
etaF:5'-AAGGTGTTCATCCACGAACTGA-3'5'-FAM-CCGGTAACCAGCTCAG-BHQ1-3'
基因
R:5'-ATGGTGTAGATCGGCGACATG-3'
6
ICS07.100.99
C51
團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
T/NAIAxxx—xxxx
一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌檢驗
實時熒光PCR法
DeterminationofPseudomonasaeruginosaindisposablesanitaryproducts—
RealtimePCRmethod
xxxx-xx-xx發(fā)布xxxx-xx-xx實施
寧夏化學(xué)分析測試協(xié)會發(fā)布
T/NAIAxxx-xxxx
一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌檢驗實時熒光PCR法
1范圍
本文件規(guī)定了一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌的實時熒光PCR檢測方法。
本文件適用于一次性使用衛(wèi)生用品中綠膿桿菌的定性檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
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GB/T6882-2008分析實驗室用水規(guī)則和試驗方法
GB/T27403-2008實驗室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測
GB/T19495.2-2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測實驗室技術(shù)要求
GB15979-2002一次性使用衛(wèi)生用品衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)
3術(shù)語和定義
3.1術(shù)語和定義
本標(biāo)準(zhǔn)采樣下列定義。
一次性一次性使用衛(wèi)生用品
使用一次后即丟棄的、與人體直接或間接接觸的、并為達(dá)到人體生理衛(wèi)生或衛(wèi)生保?。咕蛞志?/p>
目的而使用的各種日常生活用品,產(chǎn)品形狀可以是固體或液體。例如,一次性使用手套或指套(不包括
醫(yī)用手套或指套)、紙巾、濕巾、衛(wèi)生濕巾、電話膜、帽子、口罩、婦女經(jīng)期衛(wèi)生用品(包括衛(wèi)生護(hù)墊)、
尿布等排泄物衛(wèi)生用品(不包括廁所用紙)等。
3.2略縮語
DNA(deoxyribonuleicacid):脫氧核糖核酸
eta(exotoxinAgene):胞外毒素編碼基因
PCR(polymerasechainreaction):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
Ct值:每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)
4原理
一次性使用衛(wèi)生用品樣品經(jīng)擴(kuò)增培養(yǎng)后,提取增菌液中DNA,以提取的DNA為模板,以綠膿桿菌
中(eta)基因中相對保守且高度特異的引物和探針進(jìn)行目標(biāo)物的實時熒光PCR擴(kuò)增,根據(jù)Ct值判斷樣品
中是否含有綠膿桿菌。
5試劑和材料
試劑的配制及試驗中的操作規(guī)范應(yīng)按GB/T27403的規(guī)定執(zhí)行。
除非另有說明,本方法所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的一級水。所有試劑均用無DNA
酶污染的容器分裝。
5.1試劑
1
T/NAIAxxx-xxxx
5.1.1SCDLP液體培養(yǎng)基:見附錄A.1。
5.1.2PCR擴(kuò)增引物序列:見附錄B.1。
5.1.3熒光探針序列見附錄B.1。
5.1.42X熒光定量PCR預(yù)混液。
5.1.5商品化DNA抽提試劑盒。
5.1.6綠膿桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株:來源自國家認(rèn)可的菌種保藏機構(gòu)。
4.2耗材
5.1.1離心管:200μL、1.5mL、5mL、10mL。
5.1.2PCR反應(yīng)管:單管、八聯(lián)管或96孔PCR微孔板。
6儀器和設(shè)備
6.1分析天平:感量0.01g。
6.2微量可調(diào)移液器:單道:1~10μL、10~100μL、1
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