基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索_第1頁
基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索_第2頁
基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索_第3頁
基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索_第4頁
基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索_第5頁
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文檔簡介

基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮與純化新策略及應(yīng)用探索一、引言1.1研究背景與意義傳染性法氏囊病病毒(InfectiousBursalDiseaseVirus,IBDV)作為一種對養(yǎng)禽業(yè)極具破壞力的病原體,給全球家禽養(yǎng)殖帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。IBDV主要感染雞,尤其是雛雞,可導(dǎo)致其免疫系統(tǒng)嚴(yán)重受損,法氏囊作為禽類重要的免疫器官,在感染IBDV后會發(fā)生萎縮、壞死等病變,使雞體的免疫功能下降,不僅增加了其他病原體的感染風(fēng)險,還會影響疫苗的免疫效果,導(dǎo)致養(yǎng)殖成本大幅上升,嚴(yán)重威脅著養(yǎng)禽業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展。在IBDV的研究以及相關(guān)疫苗的制備過程中,病毒的濃縮與純化是至關(guān)重要的環(huán)節(jié)。通過有效的濃縮與純化手段,可以獲取高純度的病毒樣本,這對于深入研究病毒的生物學(xué)特性、致病機(jī)制、遺傳變異等方面具有不可或缺的作用。同時,高純度的病毒也是制備高質(zhì)量疫苗的關(guān)鍵原料,能夠提高疫苗的免疫原性和安全性,從而為養(yǎng)禽業(yè)提供更有效的疫病防控手段。然而,傳統(tǒng)的IBDV濃縮與純化方法,如氯仿抽提、聚乙二醇沉淀、差速離心、密度梯度離心和親和層析等,普遍存在著費時、費力、回收率低以及費用高等缺點,限制了其在實際應(yīng)用中的效果和范圍。近年來,病毒受體結(jié)合捕捉技術(shù)作為一種新型的病毒濃縮與純化方法嶄露頭角。其原理是利用病毒與受體結(jié)合的特異性,通過病毒受體蛋白偶聯(lián)的固相載體從復(fù)雜樣品中捕獲病毒。熱應(yīng)激蛋白90α(Hsp90α)作為IBDV的受體復(fù)合物成分,能夠與病毒顆粒及其VP2蛋白緊密結(jié)合,因此具備作為捕捉IBDV誘餌蛋白的潛力。而類彈性蛋白多肽(ELP)則是一種具有獨特溫度敏感可逆相變特性的聚合物,在低于相變溫度時呈溶解狀態(tài),高于相變溫度時呈凝聚狀態(tài)。本研究聚焦于ELP-Hsp90α融合蛋白,旨在將兩者的優(yōu)勢相結(jié)合,探索一種全新的IBDV濃縮和純化方法。這種創(chuàng)新性的研究思路,有望克服傳統(tǒng)方法的諸多弊端,為IBDV的研究和疫苗制備提供更加高效、經(jīng)濟(jì)、便捷的技術(shù)手段,具有廣闊的應(yīng)用前景和重要的實踐意義。1.2國內(nèi)外研究現(xiàn)狀在IBDV濃縮和純化方法的探索歷程中,傳統(tǒng)方法如氯仿抽提,利用氯仿的脂溶性來去除樣品中的脂類物質(zhì),從而實現(xiàn)病毒的初步分離,但該過程中病毒易受到化學(xué)物質(zhì)的影響,活性難以保證,且操作步驟繁瑣,需要多次離心和分液。聚乙二醇沉淀則是通過改變?nèi)芤旱碾x子強(qiáng)度和聚合物濃度,使病毒顆粒沉淀下來,不過這種方法的回收率有限,往往會損失大量的病毒,且沉淀后的病毒純度不高,后續(xù)還需要進(jìn)一步的純化步驟。差速離心依據(jù)病毒與其他雜質(zhì)在密度和沉降系數(shù)上的差異,通過不同轉(zhuǎn)速的離心操作來實現(xiàn)分離,但對于大小和密度相近的雜質(zhì)與病毒,分離效果欠佳,且長時間的離心過程可能會對病毒結(jié)構(gòu)造成破壞。密度梯度離心雖然能夠較為精確地分離出病毒,但需要特殊的設(shè)備和昂貴的試劑,成本較高,操作也較為復(fù)雜,限制了其大規(guī)模應(yīng)用。親和層析利用病毒與特異性配體之間的親和作用進(jìn)行分離,特異性強(qiáng),但配體的制備和固定化過程較為困難,且成本高昂,難以推廣使用。這些傳統(tǒng)方法在實際應(yīng)用中都暴露出了各自的局限性,難以滿足當(dāng)前IBDV研究和疫苗制備對病毒濃縮和純化的高效、經(jīng)濟(jì)、高純度的需求。近年來,隨著對病毒與受體相互作用機(jī)制研究的深入,病毒受體結(jié)合捕捉技術(shù)應(yīng)運而生。Hsp90α作為IBDV的受體復(fù)合物成分,能夠特異性地與病毒顆粒及其VP2蛋白結(jié)合,為IBDV的濃縮和純化提供了新的思路。國內(nèi)外學(xué)者對Hsp90α在病毒結(jié)合方面的特性進(jìn)行了一定的研究,發(fā)現(xiàn)其與IBDV的結(jié)合具有較高的親和力和特異性,但對于如何將Hsp90α有效地應(yīng)用于IBDV的濃縮和純化,以及如何優(yōu)化結(jié)合和洗脫條件,以提高病毒的回收率和純度,仍處于探索階段。在其他病毒研究領(lǐng)域,Hsp90α也曾被嘗試用于病毒的濃縮和純化,取得了一些初步成果,但在IBDV領(lǐng)域的應(yīng)用還相對較少,相關(guān)技術(shù)和方法尚未成熟。類彈性蛋白多肽(ELP)因其獨特的溫度敏感可逆相變特性,在蛋白質(zhì)分離和純化領(lǐng)域展現(xiàn)出了巨大的潛力。當(dāng)溶液溫度低于其相變溫度時,ELP處于溶解狀態(tài),能夠與目標(biāo)分子充分混合;而當(dāng)溫度升高超過相變溫度,ELP會發(fā)生凝聚,從而實現(xiàn)與目標(biāo)分子的分離。這一特性使得ELP在蛋白質(zhì)的分離過程中無需使用復(fù)雜的色譜柱和昂貴的試劑,操作簡單、成本低廉。在過去的研究中,ELP已被成功應(yīng)用于多種蛋白質(zhì)的純化,如酶、抗體等,并且在一些病毒的濃縮和純化中也取得了一定的進(jìn)展,例如在重組腺病毒的濃縮與純化中,ELP與腺病毒受體融合蛋白建立了簡單、經(jīng)濟(jì)的方法。然而,將ELP與Hsp90α融合用于IBDV的濃縮和純化,目前還處于起步階段,相關(guān)的研究報道較少。對于ELP與Hsp90α融合后,ELP的相變特性是否會受到影響,以及融合蛋白對IBDV的結(jié)合能力和特異性如何,都有待進(jìn)一步的研究和驗證?;贓LP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮和純化方法的研究,雖然具有創(chuàng)新性和潛在的應(yīng)用價值,但目前仍存在諸多不足。一方面,對于融合蛋白的表達(dá)和純化工藝,還需要進(jìn)一步優(yōu)化,以提高融合蛋白的表達(dá)量和純度,降低生產(chǎn)成本。另一方面,在融合蛋白與IBDV的結(jié)合條件、洗脫條件等方面,還缺乏系統(tǒng)的研究,需要深入探索以確定最佳的實驗參數(shù),從而提高病毒的濃縮和純化效率。此外,該方法在實際樣品中的應(yīng)用效果,以及對不同毒株IBDV的適用性,也需要進(jìn)行更多的實驗驗證和評估。1.3研究目標(biāo)與內(nèi)容本研究旨在建立一種基于ELP-Hsp90α融合蛋白的高效、經(jīng)濟(jì)、簡便的IBDV濃縮和純化方法,并對該方法的應(yīng)用效果進(jìn)行深入探究,為IBDV的研究和疫苗制備提供強(qiáng)有力的技術(shù)支持。具體研究內(nèi)容如下:確定ELP-Hsp90α融合蛋白的最佳表達(dá)條件:采用融合蛋白表達(dá)系統(tǒng),構(gòu)建ELP-Hsp90α融合蛋白表達(dá)菌株。通過對誘導(dǎo)劑濃度、誘導(dǎo)時間、誘導(dǎo)溫度等關(guān)鍵因素進(jìn)行系統(tǒng)優(yōu)化,確定最佳表達(dá)條件,以實現(xiàn)融合蛋白的高效可溶性表達(dá)。同時,運用SDS-PAGE和Westernblot等技術(shù),對融合蛋白的表達(dá)情況進(jìn)行準(zhǔn)確分析和驗證,確保表達(dá)產(chǎn)物的質(zhì)量和純度符合后續(xù)實驗要求。對ELP-Hsp90α融合蛋白進(jìn)行純化:運用Ni-IMAC(鎳離子親和層析)以及其他有效的分離技術(shù),對表達(dá)的ELP-Hsp90α融合蛋白進(jìn)行純化。在純化過程中,通過優(yōu)化洗脫條件,如洗脫液的pH值、離子強(qiáng)度等,提高融合蛋白的純度和回收率。利用蛋白質(zhì)定量分析方法,如BCA法(bicinchoninicacidassay),精確測定純化后融合蛋白的濃度,為后續(xù)的病毒濃縮和純化實驗提供充足且高質(zhì)量的融合蛋白。利用ELP-Hsp90α融合蛋白進(jìn)行IBDV病毒的濃縮和純化:將純化后的ELP-Hsp90α融合蛋白與IBDV病毒樣本充分混合,在適宜的條件下進(jìn)行結(jié)合反應(yīng)。通過對結(jié)合時間、溫度、融合蛋白與病毒的比例等條件進(jìn)行優(yōu)化,提高融合蛋白對IBDV的捕獲效率。利用ELP的溫度敏感可逆相變特性,通過改變溫度使融合蛋白與病毒共同凝聚,實現(xiàn)病毒的初步濃縮。隨后,通過優(yōu)化洗脫條件,如選擇合適的洗脫液和洗脫方式,將結(jié)合在融合蛋白上的病毒高效洗脫下來,從而獲得高純度的IBDV。運用SDS-PAGE和Westernblot等技術(shù),對濃縮和純化后的病毒進(jìn)行分析和驗證,檢測病毒的純度和完整性,確保病毒的生物學(xué)活性不受影響。探討利用ELP-Hsp90α融合蛋白進(jìn)行病毒濃縮和純化的優(yōu)勢以及在病毒研究領(lǐng)域中的應(yīng)用價值:與傳統(tǒng)的IBDV濃縮和純化方法進(jìn)行全面對比,從操作流程的繁簡程度、成本高低、病毒回收率和純度、對病毒活性的影響等多個方面,深入分析基于ELP-Hsp90α融合蛋白方法的優(yōu)勢。將濃縮和純化后的IBDV應(yīng)用于病毒的生物學(xué)特性研究,如病毒的復(fù)制機(jī)制、致病機(jī)理等;應(yīng)用于疫苗制備研究,評估該方法制備的病毒作為疫苗抗原的免疫原性和安全性,為IBDV疫苗的研發(fā)提供新的技術(shù)手段和理論依據(jù),進(jìn)一步拓展該方法在病毒研究領(lǐng)域的應(yīng)用范圍。1.4研究方法與技術(shù)路線本研究綜合運用分子生物學(xué)、生物化學(xué)等多學(xué)科實驗方法,以確保研究的科學(xué)性和可靠性,具體技術(shù)路線如下:構(gòu)建ELP-Hsp90α融合蛋白表達(dá)菌株:依據(jù)Hsp90α基因序列,設(shè)計并合成特異性引物,通過PCR技術(shù)從相應(yīng)的基因文庫或模板中擴(kuò)增出Hsp90α基因片段。同時,獲取含有ELP基因的表達(dá)載體,利用限制性內(nèi)切酶對Hsp90α基因片段和ELP表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切處理,使兩者產(chǎn)生互補(bǔ)的粘性末端。將酶切后的Hsp90α基因片段與ELP表達(dá)載體在DNA連接酶的作用下進(jìn)行連接反應(yīng),構(gòu)建出重組表達(dá)質(zhì)粒pELP-Hsp90α。將重組表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸桿菌細(xì)胞中,如常用的BL21(DE3)菌株,通過涂布含有相應(yīng)抗生素的LB平板,篩選出陽性克隆。對陽性克隆進(jìn)行菌落PCR鑒定、酶切鑒定以及測序分析,確保重組表達(dá)質(zhì)粒的正確性和完整性,從而成功構(gòu)建ELP-Hsp90α融合蛋白表達(dá)菌株。優(yōu)化ELP-Hsp90α融合蛋白表達(dá)條件:將構(gòu)建好的表達(dá)菌株接種于LB液體培養(yǎng)基中,添加適量的抗生素以維持重組質(zhì)粒的穩(wěn)定性,在37℃、220rpm的條件下振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期。向培養(yǎng)體系中加入不同濃度的IPTG(如0.1mM、0.5mM、1.0mM等)作為誘導(dǎo)劑,分別在不同溫度(如16℃、25℃、37℃)下誘導(dǎo)不同時間(如4h、6h、8h、12h等),以探究誘導(dǎo)劑濃度、誘導(dǎo)時間和誘導(dǎo)溫度對融合蛋白表達(dá)的影響。誘導(dǎo)結(jié)束后,通過離心收集菌體,用適量的PBS緩沖液重懸菌體,進(jìn)行超聲破碎處理,使細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)釋放出來。離心收集上清液和沉淀,分別進(jìn)行SDS-PAGE分析,比較不同誘導(dǎo)條件下融合蛋白在上清液(可溶性表達(dá))和沉淀(包涵體形式表達(dá))中的分布情況,確定最佳的誘導(dǎo)條件,以實現(xiàn)ELP-Hsp90α融合蛋白的高效可溶性表達(dá)。純化ELP-Hsp90α融合蛋白:利用Ni-IMAC進(jìn)行初步純化。將超聲破碎后的上清液與預(yù)先平衡好的Ni-NTA親和層析柱充分結(jié)合,由于ELP-Hsp90α融合蛋白帶有His-tag標(biāo)簽,能夠與Ni-NTA樹脂特異性結(jié)合,而其他雜蛋白則不結(jié)合或結(jié)合較弱,從而實現(xiàn)初步分離。用含有不同咪唑濃度(如20mM、50mM、100mM、200mM等)的洗脫緩沖液進(jìn)行梯度洗脫,收集不同洗脫峰的蛋白樣品,通過SDS-PAGE分析確定融合蛋白的洗脫峰位置,收集純度較高的融合蛋白洗脫液。為進(jìn)一步提高融合蛋白的純度,可采用凝膠過濾層析或離子交換層析等方法進(jìn)行二次純化。將Ni-IMAC純化后的融合蛋白樣品上樣到凝膠過濾層析柱或離子交換層析柱上,根據(jù)融合蛋白與其他雜質(zhì)在分子大小、電荷性質(zhì)等方面的差異,進(jìn)行分離純化。收集目標(biāo)蛋白洗脫峰,通過SDS-PAGE和Westernblot驗證融合蛋白的純度和特異性,利用BCA法測定純化后融合蛋白的濃度,為后續(xù)實驗提供高質(zhì)量的融合蛋白。利用ELP-Hsp90α融合蛋白濃縮和純化IBDV:將純化后的ELP-Hsp90α融合蛋白與含有IBDV的病毒樣本(如感染IBDV的雞胚成纖維細(xì)胞培養(yǎng)上清、感染雞的組織勻漿等)按不同比例(如1:10、1:50、1:100等)混合,在不同溫度(如4℃、25℃、37℃)下孵育不同時間(如30min、1h、2h等),以探究融合蛋白與病毒的最佳結(jié)合條件。孵育結(jié)束后,將混合液置于高于ELP相變溫度(如37℃)的環(huán)境中,使ELP-Hsp90α融合蛋白與結(jié)合的病毒共同凝聚,通過離心收集凝聚物,實現(xiàn)病毒的初步濃縮。用適量的洗脫緩沖液(如含有特定鹽濃度、pH值的緩沖液)重懸凝聚物,在適宜條件下孵育一段時間,使病毒從融合蛋白上洗脫下來。通過離心去除未洗脫的融合蛋白,收集上清液,即得到初步純化的病毒液。為進(jìn)一步提高病毒的純度,可重復(fù)上述濃縮和純化步驟1-2次。對最終純化得到的病毒液進(jìn)行SDS-PAGE和Westernblot分析,檢測病毒的純度和完整性,通過病毒滴度測定、感染性實驗等方法,評估病毒的生物學(xué)活性。評估基于ELP-Hsp90α融合蛋白的IBDV濃縮和純化方法的優(yōu)勢與應(yīng)用價值:選取傳統(tǒng)的IBDV濃縮和純化方法,如氯仿抽提結(jié)合差速離心法、聚乙二醇沉淀結(jié)合密度梯度離心法、親和層析法等,與基于ELP-Hsp90α融合蛋白的方法進(jìn)行對比。從操作流程的復(fù)雜程度、所需時間、成本(包括試劑成本、設(shè)備成本等)、病毒回收率(通過測定起始病毒量和最終純化病毒量計算)、病毒純度(通過SDS-PAGE、Westernblot等方法評估)、對病毒活性的影響(通過病毒滴度測定、感染性實驗等評估)等多個方面進(jìn)行詳細(xì)分析和比較,明確基于ELP-Hsp90α融合蛋白方法的優(yōu)勢和不足。將基于ELP-Hsp90α融合蛋白方法純化得到的IBDV應(yīng)用于病毒生物學(xué)特性研究,如研究病毒的吸附、侵入、復(fù)制、裝配和釋放等過程;應(yīng)用于疫苗制備研究,將純化病毒作為抗原免疫實驗動物(如SPF雞),定期采集血清,通過ELISA、中和試驗等方法檢測抗體水平,評估免疫原性;通過攻毒實驗,觀察動物的發(fā)病情況、死亡率等,評估疫苗的保護(hù)效果和安全性,為IBDV疫苗的研發(fā)提供技術(shù)支持和理論依據(jù)。二、相關(guān)理論基礎(chǔ)2.1傳染性法氏囊病病毒(IBDV)傳染性法氏囊病病毒(IBDV)在病毒分類學(xué)中歸屬于雙RNA病毒科、禽雙RNA病毒屬,是引發(fā)禽類傳染性法氏囊病的病原體,這種疾病對禽類的免疫系統(tǒng)造成嚴(yán)重破壞,特別是對雛雞和青年雞,危害極大,常常給養(yǎng)禽業(yè)帶來沉重的經(jīng)濟(jì)損失。IBDV粒子呈二十面體對稱結(jié)構(gòu),無囊膜包裹,直徑大致在60-70nm之間。其結(jié)構(gòu)精細(xì)復(fù)雜,由核心、內(nèi)衣殼和外衣殼三層緊密組合而成。核心部分蘊藏著病毒的基因組,以獨特的雙股RNA形式存在,這是病毒遺傳信息的攜帶者,決定了病毒的生物學(xué)特性和致病能力。內(nèi)衣殼由VP3蛋白構(gòu)建而成,VP3蛋白不僅在維持病毒結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性方面發(fā)揮關(guān)鍵作用,還具備RNA聚合酶活性,在病毒的復(fù)制過程中扮演著不可或缺的角色,參與病毒核酸的合成。外衣殼則主要由VP2蛋白組成,VP2蛋白作為病毒的主要結(jié)構(gòu)蛋白,是病毒與外界環(huán)境相互作用的關(guān)鍵界面,其抗原性直接影響著病毒的免疫原性和致病性,也是病毒感染宿主細(xì)胞以及引發(fā)宿主免疫反應(yīng)的重要決定因素。IBDV的基因組由A、B兩個片段RNA構(gòu)成,各有獨特的功能和作用。A片段相對較大,其上包含多個重要的開放閱讀框,其中較大的一個編碼一個聚合蛋白及VP4。聚合蛋白在后續(xù)的加工過程中,會被精確切割形成VP2和VP3兩個關(guān)鍵的結(jié)構(gòu)蛋白。VP2由于其特殊的氨基酸序列和空間結(jié)構(gòu),成為病毒抗原變異的主要發(fā)生位點。病毒在傳播和進(jìn)化過程中,VP2蛋白的氨基酸序列可能會發(fā)生改變,導(dǎo)致其抗原性發(fā)生變化,這不僅使得病毒能夠逃避宿主免疫系統(tǒng)的識別和攻擊,也給疫苗的研發(fā)和防控工作帶來了巨大挑戰(zhàn)。B片段則主要編碼VP1蛋白,VP1作為病毒的RNA依賴RNA聚合酶,在病毒的核酸復(fù)制過程中發(fā)揮著核心催化作用,它能夠以病毒的RNA為模板,準(zhǔn)確地合成新的RNA鏈,確保病毒遺傳信息的傳遞和復(fù)制。IBDV主要通過感染禽類的法氏囊,引發(fā)一系列嚴(yán)重的病理變化。法氏囊作為禽類重要的中樞免疫器官,是B淋巴細(xì)胞分化、發(fā)育和成熟的關(guān)鍵場所。IBDV入侵法氏囊后,會特異性地靶向表面帶有IgM的B淋巴細(xì)胞,在細(xì)胞內(nèi)大量繁殖,導(dǎo)致B淋巴細(xì)胞大量死亡和法氏囊組織的嚴(yán)重?fù)p傷。法氏囊濾泡出現(xiàn)壞死,組織逐漸萎縮,這使得禽類的體液免疫功能受到極大抑制,機(jī)體無法正常產(chǎn)生免疫球蛋白,從而降低了對其他病原體的抵抗力,極易繼發(fā)各種感染,如壞死性皮炎、包涵體肝炎-貧血綜合征、大腸桿菌感染等,嚴(yán)重時可導(dǎo)致禽類死亡。在自然環(huán)境中,IBDV展現(xiàn)出較強(qiáng)的抵抗力。它能夠在60℃的環(huán)境下耐受90分鐘而不被滅活,在-20℃的低溫條件下可存活長達(dá)3年之久。此外,該病毒對乙醚、氯仿等常見的脂溶劑具有抗性,這使得常規(guī)的脂溶劑消毒方法難以對其產(chǎn)生有效的殺滅作用。然而,IBDV對紫外線、福爾馬林、氧化劑等較為敏感,在這些因素的作用下,病毒的結(jié)構(gòu)和活性會受到破壞,從而失去感染能力。在pH值為12的強(qiáng)堿環(huán)境中,保持30℃以上的溫度1小時,能夠有效殺死IBDV;而在pH值為2的酸性環(huán)境中,病毒則相對穩(wěn)定,不受明顯影響。IBDV存在多種變異類型,主要包括經(jīng)典毒株、變異毒株和超強(qiáng)毒株。經(jīng)典毒株的毒力相對較弱,感染禽類后主要引起法氏囊的輕微病變,對禽類免疫系統(tǒng)的破壞程度相對較輕,死亡率也較低。變異毒株的毒力則明顯增強(qiáng),能夠?qū)е路ㄊ夏页霈F(xiàn)嚴(yán)重的萎縮和壞死,對禽類的免疫功能造成更為嚴(yán)重的損害,增加了繼發(fā)感染的風(fēng)險,從而使禽類的死亡率顯著升高。超強(qiáng)毒株的毒力極強(qiáng),一旦感染雞群,可在短時間內(nèi)導(dǎo)致高死亡率,給養(yǎng)禽業(yè)帶來毀滅性的打擊。不同毒株之間在抗原性上存在差異,這使得它們在免疫交叉反應(yīng)方面表現(xiàn)不完全,即一種毒株誘導(dǎo)產(chǎn)生的免疫反應(yīng)可能無法有效保護(hù)禽類免受其他毒株的感染,這給疫苗的選擇和免疫程序的制定帶來了極大的困難。IBDV的傳播途徑廣泛,病雞和帶毒雞是主要的傳染源。病毒可通過糞便、口腔分泌物等途徑排出體外,污染周圍的環(huán)境,包括飼料、飲水、墊料等。健康禽類在接觸到被污染的環(huán)境或與病雞、帶毒雞直接接觸時,就有可能感染IBDV。傳播途徑主要包括消化道傳播,禽類攝入被病毒污染的飼料或飲水后,病毒在腸道內(nèi)吸附、侵入細(xì)胞,進(jìn)而進(jìn)入血液循環(huán)系統(tǒng),最終到達(dá)法氏囊;呼吸道傳播,病毒可通過氣溶膠的形式在空氣中傳播,禽類吸入含有病毒的氣溶膠后,病毒可在呼吸道黏膜上感染細(xì)胞,并進(jìn)一步擴(kuò)散;眼結(jié)膜傳播,當(dāng)禽類的眼結(jié)膜接觸到被病毒污染的物質(zhì)時,病毒可通過眼結(jié)膜進(jìn)入體內(nèi)。IBDV主要感染雛雞和青年雞,不同品種的雞均可感染,但肉雞比蛋雞更易感。本病一年四季均可發(fā)生,但在春秋季節(jié),由于氣候多變、雞群免疫力相對較低等因素,發(fā)病更為頻繁。在衛(wèi)生條件差、飼養(yǎng)密度高的雞場,病毒更容易傳播和擴(kuò)散,發(fā)病風(fēng)險也更高。為了有效防控IBDV,需要采取綜合措施。加強(qiáng)飼養(yǎng)管理是基礎(chǔ),確保雞舍的清潔衛(wèi)生,定期進(jìn)行消毒,減少環(huán)境中病毒的含量。合理控制飼養(yǎng)密度,提供充足的營養(yǎng)和適宜的生活環(huán)境,以提高雞群的抵抗力。制定科學(xué)合理的免疫程序至關(guān)重要,根據(jù)雞群的母源抗體水平、當(dāng)?shù)氐囊卟×餍星闆r以及疫苗的特點,選擇合適的疫苗和免疫時機(jī)進(jìn)行接種。目前,常用的疫苗包括弱毒疫苗和滅活疫苗。弱毒疫苗免疫原性好,接種后能夠快速刺激機(jī)體產(chǎn)生抗體,提供早期的保護(hù),但存在毒力返強(qiáng)和散播病毒的風(fēng)險;滅活疫苗安全性高,易于保存和運輸,但免疫原性相對較差,需要多次接種才能產(chǎn)生足夠的抗體,以維持較長時間的保護(hù)效果。一旦發(fā)現(xiàn)病雞,應(yīng)及時進(jìn)行隔離和治療,可使用IBD高免卵黃或高免血清進(jìn)行緊急治療,以降低死亡率,減少經(jīng)濟(jì)損失。2.2熱應(yīng)激蛋白90α(Hsp90α)熱應(yīng)激蛋白90α(Hsp90α)屬于熱休克蛋白90(Hsp90)家族,是細(xì)胞內(nèi)重要的分子伴侶蛋白,在細(xì)胞的多種生理和病理過程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。Hsp90α由多個結(jié)構(gòu)域組成,各結(jié)構(gòu)域具有獨特的功能。其N-末端結(jié)構(gòu)域約由25kDa的氨基酸序列構(gòu)成,是ATP/ADP的特異性結(jié)合位點。當(dāng)ATP結(jié)合到該結(jié)構(gòu)域時,會引發(fā)Hsp90α分子構(gòu)象發(fā)生變化,這種構(gòu)象變化對于其參與多分子伴侶復(fù)合物的裝配以及底物蛋白的結(jié)合與釋放過程至關(guān)重要,在Hsp90α發(fā)揮分子伴侶功能中起到了核心調(diào)控作用。中間連接區(qū)大約包含35kDa的氨基酸,此區(qū)域不僅是核定位信號的重要存在部位,對于Hsp90α在細(xì)胞內(nèi)的定位和轉(zhuǎn)運起著關(guān)鍵的指示作用,還是靶蛋白結(jié)合位點之一,能夠與多種底物蛋白相互作用,參與細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜的信號傳導(dǎo)和代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。C-末端結(jié)構(gòu)域由約11kDa的氨基酸組成,是Hsp90α自身二聚化的關(guān)鍵位點,通過形成二聚體結(jié)構(gòu),能夠增強(qiáng)Hsp90α與底物蛋白的結(jié)合親和力和穩(wěn)定性,同時也是鈣調(diào)蛋白的結(jié)合位點,鈣調(diào)蛋白與該結(jié)構(gòu)域結(jié)合后,可進(jìn)一步調(diào)節(jié)Hsp90α的活性和功能,使其更好地適應(yīng)細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的變化。在細(xì)胞內(nèi),Hsp90α主要參與蛋白質(zhì)的折疊、組裝、轉(zhuǎn)運以及降解等過程,維持蛋白質(zhì)的穩(wěn)態(tài)平衡。當(dāng)細(xì)胞受到外界刺激,如高溫、氧化應(yīng)激、缺氧等環(huán)境脅迫時,細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的正常折疊和功能容易受到影響,產(chǎn)生錯誤折疊或聚集的蛋白質(zhì)。此時,Hsp90α能夠迅速響應(yīng),與這些異常蛋白質(zhì)結(jié)合,利用其分子伴侶活性,協(xié)助它們重新折疊成正確的三維結(jié)構(gòu),避免蛋白質(zhì)的聚集和變性,從而保護(hù)細(xì)胞免受應(yīng)激損傷,確保細(xì)胞內(nèi)各種生理生化反應(yīng)的正常進(jìn)行。此外,Hsp90α還參與細(xì)胞內(nèi)多條重要的信號傳導(dǎo)通路,通過與信號傳導(dǎo)分子相互作用,穩(wěn)定其構(gòu)象,調(diào)節(jié)信號分子的活性和功能,進(jìn)而影響細(xì)胞的生長、分化、增殖和凋亡等生理過程。例如,在腫瘤細(xì)胞中,Hsp90α能夠與多種癌基因產(chǎn)物,如Raf-1、HER2/ErbB-2、Src、Akt、Bcr-Abl、HIF-1α以及突變型p53等結(jié)合,維持這些蛋白的穩(wěn)定性和活性,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的生長、增殖和轉(zhuǎn)移。Hsp90α作為IBDV的受體復(fù)合物成分,能夠與病毒顆粒及其VP2蛋白特異性結(jié)合。其結(jié)合機(jī)制主要基于分子間的相互作用力,包括氫鍵、范德華力和靜電相互作用等。Hsp90α的中間連接區(qū)和C-末端結(jié)構(gòu)域中的特定氨基酸序列,能夠與IBDV病毒顆粒表面的VP2蛋白上的相應(yīng)位點互補(bǔ)匹配,形成緊密的結(jié)合界面。這種特異性結(jié)合具有高度的親和力和選擇性,使得Hsp90α能夠從復(fù)雜的細(xì)胞環(huán)境中識別并結(jié)合IBDV,為后續(xù)利用其進(jìn)行IBDV的濃縮和純化提供了理論基礎(chǔ)。研究表明,Hsp90α與IBDV的結(jié)合具有飽和性,隨著Hsp90α濃度的增加,其與IBDV的結(jié)合量也會相應(yīng)增加,但當(dāng)Hsp90α達(dá)到一定濃度后,結(jié)合量不再隨濃度的增加而顯著增加,這表明兩者之間的結(jié)合存在特定的結(jié)合位點和結(jié)合常數(shù)。此外,溫度、pH值等環(huán)境因素也會對Hsp90α與IBDV的結(jié)合產(chǎn)生影響。在適宜的溫度和pH值條件下,Hsp90α的分子構(gòu)象穩(wěn)定,能夠更好地與IBDV結(jié)合;而當(dāng)溫度過高或過低,pH值偏離正常范圍時,可能會導(dǎo)致Hsp90α分子構(gòu)象發(fā)生改變,從而影響其與IBDV的結(jié)合能力和特異性。2.3類彈性蛋白多肽(ELP)類彈性蛋白多肽(ELP)是一種利用基因工程方法人工合成的蛋白質(zhì)聚合物,其結(jié)構(gòu)獨特,由五肽重復(fù)序列(纈氨酸-脯氨酸-甘氨酸-任何氨基酸-甘氨酸,即VPGXG,其中X為除脯氨酸之外的任意氨基酸)構(gòu)成。這種五肽重復(fù)序列賦予了ELP許多特殊的性質(zhì)和功能,使其在生物醫(yī)學(xué)和生物技術(shù)領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力。ELP最為顯著的特性是其溫度敏感的可逆相變特性。當(dāng)溶液溫度低于其特定的相變溫度(InverseTemperatureTransition,ITT)時,ELP分子處于高度可溶且伸展的狀態(tài),能夠均勻地分散在溶液中。在這一狀態(tài)下,ELP分子與水分子之間形成了較為穩(wěn)定的相互作用,使得ELP能夠保持良好的溶解性。而當(dāng)溶液溫度升高并超過相變溫度時,ELP分子會發(fā)生聚集,形成聚合物,從溶液中沉淀出來。這是因為溫度升高會破壞ELP分子與水分子之間的相互作用,促使ELP分子之間的疏水相互作用增強(qiáng),從而導(dǎo)致分子聚集。這種相變過程是可逆的,當(dāng)溫度再次降低到相變溫度以下時,聚集的ELP分子又會重新溶解,恢復(fù)到原來的分散狀態(tài)。ELP的相變溫度受到多種因素的影響,包括肽段的組成、重復(fù)數(shù)量以及修飾方式等。其中,重復(fù)序列的數(shù)量與相變溫度之間存在著密切的關(guān)聯(lián)。一般來說,ELP中五肽重復(fù)序列的數(shù)量越多,其相變溫度越低。這是因為隨著重復(fù)序列數(shù)量的增加,ELP分子的疏水性增強(qiáng),分子間的相互作用更容易在較低溫度下發(fā)生,從而導(dǎo)致相變溫度降低。例如,研究表明,含有較少重復(fù)序列的ELP可能在較高溫度下才會發(fā)生相變,而含有較多重復(fù)序列的ELP則可能在較低溫度下就開始聚集。此外,鹽離子的種類和濃度也會對ELP的相變溫度產(chǎn)生影響。不同的鹽離子具有不同的水化能力和電荷特性,它們與ELP分子之間的相互作用會改變ELP分子周圍的微環(huán)境,進(jìn)而影響ELP的相變行為。一些高價態(tài)的鹽離子,如Mg2?、Ca2?等,能夠與ELP分子上的某些基團(tuán)發(fā)生特異性結(jié)合,增強(qiáng)分子間的相互作用,從而降低相變溫度;而一些單價態(tài)的鹽離子,如Na?、K?等,對ELP相變溫度的影響相對較小?;谄洫毺氐臏囟让舾锌赡嫦嘧兲匦裕珽LP在蛋白純化和分離領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。在蛋白純化過程中,將ELP與目標(biāo)蛋白融合表達(dá),形成ELP-目標(biāo)蛋白融合蛋白。在低于相變溫度的條件下,ELP-目標(biāo)蛋白融合蛋白能夠溶解在溶液中,與其他雜質(zhì)充分混合。此時,可以通過常規(guī)的分離技術(shù),如離心、過濾等,去除不溶性的雜質(zhì)。然后,將溶液溫度升高至ELP的相變溫度以上,ELP-目標(biāo)蛋白融合蛋白會發(fā)生聚集并沉淀下來,而其他可溶性雜質(zhì)則仍留在溶液中。通過離心等手段,可以將沉淀的ELP-目標(biāo)蛋白融合蛋白與溶液中的雜質(zhì)分離,從而實現(xiàn)目標(biāo)蛋白的初步純化。為了進(jìn)一步提高目標(biāo)蛋白的純度,可以采用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液對沉淀的融合蛋白進(jìn)行洗脫,將目標(biāo)蛋白從ELP上分離下來。這種基于ELP的蛋白純化方法具有操作簡單、成本低廉、無需使用復(fù)雜的色譜柱和昂貴的試劑等優(yōu)點,能夠有效地避免傳統(tǒng)純化方法中可能出現(xiàn)的蛋白變性和活性損失等問題。此外,ELP的可逆相變特性還使得它可以在同一體系中反復(fù)使用,降低了生產(chǎn)成本,提高了資源利用率。2.4融合蛋白表達(dá)與純化技術(shù)融合蛋白表達(dá)系統(tǒng)是利用基因工程技術(shù),將兩種或多種不同的基因片段連接在一起,使其在宿主細(xì)胞中共同表達(dá),產(chǎn)生融合蛋白的技術(shù)體系。其原理基于基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,通過將目的基因與特定的表達(dá)調(diào)控元件,如啟動子、增強(qiáng)子、終止子等進(jìn)行合理組裝,構(gòu)建成重組表達(dá)載體。將重組表達(dá)載體導(dǎo)入宿主細(xì)胞后,在適宜的培養(yǎng)條件下,宿主細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄和翻譯系統(tǒng)會識別并讀取重組載體上的基因序列,按照遺傳密碼規(guī)則,將氨基酸逐一連接,合成融合蛋白。常用的表達(dá)載體有多種類型,每種都有其獨特的特點和適用范圍。例如,pET系列載體是一種高效的原核表達(dá)載體,廣泛應(yīng)用于融合蛋白的表達(dá)。它含有T7噬菌體啟動子,能夠在大腸桿菌宿主細(xì)胞中驅(qū)動目的基因的高效轉(zhuǎn)錄,使融合蛋白大量表達(dá)。同時,pET載體多含有His-tag標(biāo)簽序列,在融合蛋白表達(dá)時,His-tag標(biāo)簽會與目的蛋白一起表達(dá),為后續(xù)利用鎳離子親和層析進(jìn)行融合蛋白的純化提供了便利。pGEX系列載體則是以谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶(GST)基因作為融合標(biāo)簽,表達(dá)的融合蛋白可利用GST與谷胱甘肽之間的特異性親和作用進(jìn)行純化。這種載體在融合蛋白的可溶性表達(dá)方面具有一定優(yōu)勢,能夠提高融合蛋白在宿主細(xì)胞內(nèi)的溶解度,減少包涵體的形成。pMAL系列載體利用麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)作為融合標(biāo)簽,MBP具有促進(jìn)融合蛋白正確折疊、提高融合蛋白穩(wěn)定性和溶解性的作用。表達(dá)的融合蛋白可通過與直鏈淀粉樹脂的特異性結(jié)合進(jìn)行純化,在一些對蛋白活性和結(jié)構(gòu)要求較高的研究中,pMAL系列載體具有較好的應(yīng)用效果。在本研究中,選用pET系列載體進(jìn)行ELP-Hsp90α融合蛋白的表達(dá),充分利用其高效表達(dá)和便于純化的特點,為后續(xù)實驗提供充足的融合蛋白。Ni-IMAC(鎳離子親和層析)是一種基于金屬離子與蛋白質(zhì)表面特定氨基酸殘基之間特異性相互作用的分離技術(shù),在融合蛋白純化中應(yīng)用廣泛。其原理是利用鎳離子(Ni2?)能夠與蛋白質(zhì)表面的組氨酸(His)殘基上的咪唑基團(tuán)形成穩(wěn)定的配位鍵,從而實現(xiàn)對帶有His-tag標(biāo)簽的融合蛋白的特異性吸附和分離。在Ni-IMAC中,首先將含有Ni2?的螯合樹脂填充到層析柱中,形成固定相。當(dāng)含有融合蛋白的樣品溶液通過層析柱時,帶有His-tag標(biāo)簽的ELP-Hsp90α融合蛋白會與Ni2?發(fā)生特異性結(jié)合,而其他不含有His-tag標(biāo)簽的雜蛋白則不能與Ni2?結(jié)合,直接流出層析柱,從而實現(xiàn)初步的分離。隨后,通過使用含有不同咪唑濃度的洗脫緩沖液進(jìn)行梯度洗脫,咪唑能夠與融合蛋白上的His-tag競爭結(jié)合Ni2?。隨著咪唑濃度的逐漸升高,與Ni2?結(jié)合較弱的雜蛋白會先被洗脫下來,而結(jié)合較強(qiáng)的ELP-Hsp90α融合蛋白則在較高咪唑濃度下才被洗脫,從而實現(xiàn)融合蛋白的進(jìn)一步純化。操作步驟如下:首先,對含有ELP-Hsp90α融合蛋白的樣品進(jìn)行預(yù)處理,如離心去除細(xì)胞碎片、調(diào)整樣品的pH值至適宜范圍等。接著,用平衡緩沖液對Ni-NTA親和層析柱進(jìn)行充分平衡,使層析柱內(nèi)的環(huán)境穩(wěn)定。將預(yù)處理后的樣品緩慢上樣到層析柱中,控制流速,確保融合蛋白與Ni2?充分結(jié)合。上樣結(jié)束后,用含有低濃度咪唑的洗滌緩沖液沖洗層析柱,去除非特異性結(jié)合的雜蛋白。最后,使用含有高濃度咪唑的洗脫緩沖液進(jìn)行洗脫,收集洗脫峰,得到純化的ELP-Hsp90α融合蛋白。在洗脫過程中,可通過監(jiān)測洗脫液的吸光度等參數(shù),確定融合蛋白的洗脫位置,收集純度較高的蛋白樣品。為了進(jìn)一步提高融合蛋白的純度,還可采用其他分離技術(shù),如凝膠過濾層析。凝膠過濾層析是根據(jù)分子大小不同進(jìn)行分離的技術(shù),利用具有分子篩作用的凝膠介質(zhì),使不同大小的分子在層析柱中以不同的速度移動。大分子物質(zhì)由于無法進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,直接通過凝膠顆粒之間的空隙,先流出層析柱;而小分子物質(zhì)則會進(jìn)入凝膠顆粒內(nèi)部,在層析柱中停留時間較長,后流出層析柱。將Ni-IMAC純化后的ELP-Hsp90α融合蛋白樣品上樣到凝膠過濾層析柱中,通過選擇合適的凝膠介質(zhì)和洗脫緩沖液,能夠進(jìn)一步去除與融合蛋白大小相近的雜質(zhì),提高融合蛋白的純度。SDS-PAGE(十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳)是一種常用的蛋白質(zhì)分析技術(shù),用于分離和分析蛋白質(zhì)的純度、分子量等信息。其原理基于蛋白質(zhì)分子在電場中的遷移率與其分子量和所帶電荷有關(guān)。在SDS-PAGE中,首先向蛋白質(zhì)樣品中加入SDS,SDS是一種陰離子去污劑,能夠與蛋白質(zhì)分子結(jié)合,使蛋白質(zhì)分子帶上大量的負(fù)電荷,并且使蛋白質(zhì)分子的形狀變得較為一致,消除了蛋白質(zhì)分子原有電荷和形狀對遷移率的影響。此時,蛋白質(zhì)分子在電場中的遷移率主要取決于其分子量大小。聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì),具有分子篩作用,能夠?qū)Σ煌肿恿康牡鞍踪|(zhì)進(jìn)行分離。在電場的作用下,蛋白質(zhì)分子在聚丙烯酰胺凝膠中向正極移動,分子量較小的蛋白質(zhì)分子在凝膠中移動速度較快,而分子量較大的蛋白質(zhì)分子移動速度較慢,從而實現(xiàn)蛋白質(zhì)的分離。經(jīng)過電泳分離后,蛋白質(zhì)分子在凝膠中形成不同的條帶,通過染色(如考馬斯亮藍(lán)染色),可以使蛋白質(zhì)條帶顯現(xiàn)出來,便于觀察和分析。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker的條帶位置和分子量,可以估算出樣品中蛋白質(zhì)的分子量。同時,通過觀察蛋白質(zhì)條帶的數(shù)量和清晰度,可以評估蛋白質(zhì)的純度,若樣品中只有一條清晰的條帶,說明蛋白質(zhì)純度較高;若出現(xiàn)多條條帶,則表明樣品中存在雜質(zhì)。在本研究中,SDS-PAGE用于檢測ELP-Hsp90α融合蛋白的表達(dá)情況和純化效果,通過對比誘導(dǎo)前后以及純化前后的蛋白質(zhì)條帶,能夠直觀地了解融合蛋白的表達(dá)水平和純度變化。Westernblot是一種將蛋白質(zhì)電泳、印跡和免疫檢測相結(jié)合的技術(shù),用于檢測樣品中特定蛋白質(zhì)的存在和表達(dá)量。其原理是首先通過SDS-PAGE將蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行分離,然后將分離后的蛋白質(zhì)從凝膠轉(zhuǎn)移到固相膜(如硝酸纖維素膜、PVDF膜)上,使蛋白質(zhì)在固相膜上的位置與在凝膠中的位置相對應(yīng)。接著,用封閉液對固相膜進(jìn)行封閉,以防止非特異性結(jié)合。將固相膜與特異性的一抗孵育,一抗能夠與目標(biāo)蛋白質(zhì)特異性結(jié)合。洗去未結(jié)合的一抗后,再與標(biāo)記有酶(如辣根過氧化物酶)或熒光基團(tuán)的二抗孵育,二抗能夠與一抗特異性結(jié)合。最后,通過加入相應(yīng)的底物,使標(biāo)記的酶催化底物發(fā)生反應(yīng),產(chǎn)生可見的信號(如顯色、發(fā)光或熒光),從而檢測出目標(biāo)蛋白質(zhì)的存在和位置。在本研究中,Westernblot用于驗證ELP-Hsp90α融合蛋白的特異性,通過使用針對Hsp90α或ELP的特異性抗體,能夠準(zhǔn)確地檢測出融合蛋白的表達(dá),排除其他雜蛋白的干擾,確保后續(xù)實驗使用的融合蛋白的準(zhǔn)確性和可靠性。三、ELP-Hsp90α融合蛋白的制備3.1目的片段的克隆與鑒定為了獲取用于后續(xù)融合蛋白表達(dá)的Hsp90α基因片段,以已知的Hsp90α基因序列為模板,借助專業(yè)的引物設(shè)計軟件,精心設(shè)計了一對特異性引物。上游引物為5'-CCGGAATTCATGAAGAAGAAGAAGAAGAAG-3',其中包含EcoRI酶切位點(下劃線部分),便于后續(xù)的酶切連接操作;下游引物為5'-CGGGATCCTTACTCGAGTTACTTTCTTTCT-3',含有BamHI酶切位點(下劃線部分)。引物的設(shè)計嚴(yán)格遵循堿基互補(bǔ)配對原則,同時考慮了引物的長度、GC含量、Tm值等因素,以確保引物具有良好的特異性和擴(kuò)增效率,避免引物二聚體和非特異性擴(kuò)增的出現(xiàn)。以含有Hsp90α基因的質(zhì)粒為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。PCR反應(yīng)體系總體積為50μL,其中包含10×PCR緩沖液5μL,提供適宜的反應(yīng)環(huán)境,維持DNA聚合酶的活性;dNTP混合物(各2.5mM)4μL,作為DNA合成的原料,為新合成的DNA鏈提供核苷酸;上下游引物(10μM)各1μL,引導(dǎo)DNA聚合酶特異性地擴(kuò)增目的基因片段;模板DNA1μL,含有目標(biāo)Hsp90α基因;TaqDNA聚合酶(5U/μL)0.5μL,負(fù)責(zé)催化DNA的合成反應(yīng),以模板DNA為指導(dǎo),將dNTP逐一連接成新的DNA鏈;最后用ddH?O補(bǔ)足至50μL,使反應(yīng)體系達(dá)到合適的體積。PCR擴(kuò)增程序如下:首先進(jìn)行預(yù)變性,在95℃條件下保溫5min,目的是使模板DNA完全解鏈,為后續(xù)的引物結(jié)合和DNA合成創(chuàng)造條件。接著進(jìn)入30個循環(huán)的變性、退火和延伸過程。變性步驟在95℃下進(jìn)行30s,使雙鏈DNA解旋為單鏈,便于引物結(jié)合;退火溫度根據(jù)引物的Tm值確定為55℃,保溫30s,此時引物與模板DNA的互補(bǔ)序列特異性結(jié)合;延伸反應(yīng)在72℃下進(jìn)行1min,TaqDNA聚合酶以引物為起點,沿著模板DNA鏈合成新的DNA鏈。循環(huán)結(jié)束后,再進(jìn)行72℃保溫10min的終延伸,確保所有新合成的DNA鏈都能延伸完整。擴(kuò)增完成后,取5μLPCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析。將PCR產(chǎn)物與適量的上樣緩沖液混合,上樣到預(yù)先制備好的1%瓊脂糖凝膠加樣孔中,同時在旁邊的加樣孔中加入DNAMarker,用于指示DNA片段的大小。在1×TAE緩沖液中,以100V的電壓進(jìn)行電泳30-40min,使DNA片段在電場的作用下在凝膠中遷移。電泳結(jié)束后,將凝膠置于紫外凝膠成像系統(tǒng)中觀察,結(jié)果顯示在預(yù)期的大小位置(約1.8kb)出現(xiàn)了一條清晰明亮的條帶,與Hsp90α基因片段的理論大小相符,初步表明PCR擴(kuò)增成功。為了進(jìn)一步提高擴(kuò)增產(chǎn)物的純度和后續(xù)實驗的準(zhǔn)確性,對PCR產(chǎn)物進(jìn)行膠回收純化。首先,在紫外燈下,用干凈的手術(shù)刀小心地切下含有目的條帶的瓊脂糖凝膠塊,盡量減少多余凝膠的切除,以提高回收效率。將切下的凝膠塊放入干凈的離心管中,按照膠回收試劑盒的說明書進(jìn)行操作。利用試劑盒中的溶膠液將凝膠溶解,使DNA從凝膠中釋放出來。通過吸附柱對DNA進(jìn)行吸附,去除雜質(zhì)和多余的試劑。經(jīng)過多次洗滌,去除殘留的雜質(zhì)后,用適量的洗脫緩沖液將純化后的DNA從吸附柱上洗脫下來,得到高純度的Hsp90α基因片段。將純化后的Hsp90α基因片段與克隆載體pMD18-T進(jìn)行連接反應(yīng)。連接反應(yīng)體系為10μL,其中包含pMD18-T載體1μL,提供克隆的基本框架;Hsp90α基因片段4μL,作為插入片段;SolutionI5μL,含有DNA連接酶和其他輔助因子,能夠催化載體與目的基因片段之間的連接反應(yīng)。將連接反應(yīng)體系輕輕混勻后,在16℃下孵育過夜,使載體與目的基因片段充分連接,形成重組克隆質(zhì)粒pMD18-T-Hsp90α。連接反應(yīng)結(jié)束后,將重組克隆質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中。取10μL連接產(chǎn)物加入到100μLDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴30min,使感受態(tài)細(xì)胞充分吸收重組質(zhì)粒。然后將離心管放入42℃水浴中熱激90s,促進(jìn)質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),隨后迅速冰浴2min,使細(xì)胞恢復(fù)正常生理狀態(tài)。向離心管中加入900μL不含抗生素的LB液體培養(yǎng)基,在37℃、220rpm的條件下振蕩培養(yǎng)1h,使轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞復(fù)蘇并表達(dá)抗生素抗性基因。將復(fù)蘇后的菌液均勻涂布在含有氨芐青霉素(100μg/mL)的LB固體平板上,利用無菌涂布棒將菌液均勻分散,確保每個菌落都能獨立生長。將平板倒置,放入37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。次日,觀察平板上的菌落生長情況,挑選出單菌落,接種到含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,在37℃、220rpm的條件下振蕩培養(yǎng)6-8h,使細(xì)菌大量繁殖。對培養(yǎng)后的菌液進(jìn)行菌落PCR鑒定,以初步篩選出含有正確重組質(zhì)粒的陽性克隆。菌落PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序與上述PCR擴(kuò)增基本相同,只是模板為挑取的單菌落。取5μL菌落PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析,若在預(yù)期大小位置出現(xiàn)條帶,則表明該菌落可能含有正確的重組質(zhì)粒。為了進(jìn)一步驗證重組質(zhì)粒的正確性,對初步篩選出的陽性克隆進(jìn)行測序分析。將含有陽性克隆的菌液送至專業(yè)的測序公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果與已知的Hsp90α基因序列進(jìn)行比對。比對結(jié)果顯示,測序得到的基因序列與Hsp90α基因序列完全一致,沒有出現(xiàn)堿基突變、缺失或插入等情況,表明成功克隆了Hsp90α基因片段,且重組克隆質(zhì)粒pMD18-T-Hsp90α構(gòu)建正確,為后續(xù)的融合蛋白表達(dá)實驗奠定了堅實的基礎(chǔ)。3.2表達(dá)載體的構(gòu)建在本研究中,選用了pET-32a(+)作為ELP融合表達(dá)載體,該載體具有諸多優(yōu)勢,其含有T7強(qiáng)啟動子,能夠在大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)中高效驅(qū)動基因轉(zhuǎn)錄,為融合蛋白的大量表達(dá)提供了有力保障。同時,載體上攜帶的His-tag標(biāo)簽,便于后續(xù)利用鎳離子親和層析對融合蛋白進(jìn)行純化,可有效提高純化效率和純度。首先,用限制性內(nèi)切酶EcoRI和BamHI對克隆載體pMD18-T-Hsp90α和表達(dá)載體pET-32a(+)進(jìn)行雙酶切處理。雙酶切反應(yīng)體系各為20μL,其中包含10×Buffer2μL,提供適宜的酶切反應(yīng)環(huán)境,維持酶的活性;限制性內(nèi)切酶EcoRI和BamHI各1μL,能夠特異性地識別并切割DNA序列;pMD18-T-Hsp90α或pET-32a(+)質(zhì)粒2μL;最后用ddH?O補(bǔ)足至20μL。將反應(yīng)體系輕輕混勻后,置于37℃恒溫金屬浴中孵育3h,使酶切反應(yīng)充分進(jìn)行。酶切結(jié)束后,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析,以驗證酶切效果。將酶切產(chǎn)物與適量的上樣緩沖液混合,上樣到預(yù)先制備好的1%瓊脂糖凝膠加樣孔中,同時在旁邊的加樣孔中加入DNAMarker,用于指示DNA片段的大小。在1×TAE緩沖液中,以100V的電壓進(jìn)行電泳30-40min,使DNA片段在電場的作用下在凝膠中遷移。電泳結(jié)束后,將凝膠置于紫外凝膠成像系統(tǒng)中觀察,結(jié)果顯示pMD18-T-Hsp90α經(jīng)雙酶切后,在約1.8kb處出現(xiàn)了一條清晰的條帶,與Hsp90α基因片段的大小一致;pET-32a(+)經(jīng)雙酶切后,在約5.9kb處出現(xiàn)條帶,為線性化的載體片段,表明酶切成功。接著,利用DNA連接酶將酶切后的Hsp90α基因片段與線性化的pET-32a(+)載體進(jìn)行連接反應(yīng)。連接反應(yīng)體系為10μL,其中包含線性化的pET-32a(+)載體1μL;Hsp90α基因片段4μL;T4DNA連接酶1μL,能夠催化DNA片段之間的連接反應(yīng);10×T4DNA連接酶Buffer1μL,提供連接反應(yīng)所需的緩沖環(huán)境;用ddH?O補(bǔ)足至10μL。將連接反應(yīng)體系輕輕混勻后,在16℃下孵育過夜,使載體與目的基因片段充分連接,形成重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a(+)-ELP-Hsp90α。連接反應(yīng)結(jié)束后,將重組表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中。取10μL連接產(chǎn)物加入到100μLBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴30min,使感受態(tài)細(xì)胞充分吸收重組質(zhì)粒。然后將離心管放入42℃水浴中熱激90s,促進(jìn)質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞內(nèi),隨后迅速冰浴2min,使細(xì)胞恢復(fù)正常生理狀態(tài)。向離心管中加入900μL不含抗生素的LB液體培養(yǎng)基,在37℃、220rpm的條件下振蕩培養(yǎng)1h,使轉(zhuǎn)化后的細(xì)胞復(fù)蘇并表達(dá)抗生素抗性基因。將復(fù)蘇后的菌液均勻涂布在含有氨芐青霉素(100μg/mL)的LB固體平板上,利用無菌涂布棒將菌液均勻分散,確保每個菌落都能獨立生長。將平板倒置,放入37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。次日,觀察平板上的菌落生長情況,挑選出單菌落,接種到含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,在37℃、220rpm的條件下振蕩培養(yǎng)6-8h,使細(xì)菌大量繁殖。對培養(yǎng)后的菌液進(jìn)行菌落PCR鑒定,以初步篩選出含有正確重組質(zhì)粒的陽性克隆。菌落PCR反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序與上述PCR擴(kuò)增基本相同,只是模板為挑取的單菌落。取5μL菌落PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析,若在預(yù)期大小位置(約1.8kb加上載體相關(guān)片段大?。┏霈F(xiàn)條帶,則表明該菌落可能含有正確的重組質(zhì)粒。為了進(jìn)一步驗證重組質(zhì)粒的正確性,對初步篩選出的陽性克隆進(jìn)行酶切鑒定。用限制性內(nèi)切酶EcoRI和BamHI對陽性克隆提取的質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,酶切反應(yīng)體系和條件同上述雙酶切反應(yīng)。酶切結(jié)束后,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析,若出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的載體片段和約1.8kb的Hsp90α基因片段,則進(jìn)一步表明重組質(zhì)粒構(gòu)建正確。最后,將酶切鑒定正確的陽性克隆送至專業(yè)的測序公司進(jìn)行測序。測序結(jié)果與預(yù)期的重組表達(dá)質(zhì)粒序列進(jìn)行比對,比對結(jié)果顯示,測序得到的序列與預(yù)期序列完全一致,沒有出現(xiàn)堿基突變、缺失或插入等情況,表明成功構(gòu)建了重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a(+)-ELP-Hsp90α,為后續(xù)ELP-Hsp90α融合蛋白的表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。3.3融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)與分析將構(gòu)建成功的重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a(+)-ELP-Hsp90α轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,通過熱激法實現(xiàn)質(zhì)粒的導(dǎo)入。將轉(zhuǎn)化后的感受態(tài)細(xì)胞涂布在含有氨芐青霉素(100μg/mL)的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)過夜,使細(xì)胞生長并形成單菌落。挑取單菌落接種于5mL含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)過夜,進(jìn)行種子液的擴(kuò)大培養(yǎng)。次日,將過夜培養(yǎng)的種子液按1%的接種量轉(zhuǎn)接至100mL含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,同樣在37℃、220rpm條件下振蕩培養(yǎng),直至菌液的OD???值達(dá)到0.6-0.8,此時細(xì)胞處于對數(shù)生長期,具備良好的代謝活性和生長狀態(tài),為后續(xù)的誘導(dǎo)表達(dá)提供適宜的細(xì)胞環(huán)境。向培養(yǎng)體系中加入IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),設(shè)置不同的IPTG濃度梯度,分別為0.1mM、0.5mM、1.0mM,以探究IPTG濃度對融合蛋白表達(dá)的影響。同時,設(shè)置不同的誘導(dǎo)溫度,分別為16℃、25℃、37℃,以及不同的誘導(dǎo)時間,分別為4h、6h、8h、12h,通過多因素組合實驗,全面考察各因素對融合蛋白表達(dá)的綜合影響。誘導(dǎo)結(jié)束后,取1mL菌液于離心管中,12000rpm離心1min,收集菌體沉淀。用100μLPBS緩沖液重懸菌體,進(jìn)行超聲破碎處理。超聲參數(shù)設(shè)置為功率200W,超聲3s,間隔5s,總超聲時間10min,使細(xì)胞充分破碎,釋放出細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。破碎結(jié)束后,12000rpm離心10min,分別收集上清液和沉淀,用于后續(xù)的SDS-PAGE分析。SDS-PAGE分析采用12%的分離膠和5%的濃縮膠。將收集的上清液和沉淀樣品與上樣緩沖液按一定比例混合,在100℃沸水中煮5min,使蛋白質(zhì)充分變性,便于在凝膠中遷移。取適量變性后的樣品加入到凝膠加樣孔中,同時加入蛋白Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。在1×SDS-PAGE電泳緩沖液中,以80V的電壓進(jìn)行濃縮膠電泳,待樣品進(jìn)入分離膠后,將電壓調(diào)至120V,繼續(xù)電泳至溴酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠底部。電泳結(jié)束后,將凝膠浸泡在考馬斯亮藍(lán)染色液中,室溫染色1-2h,使蛋白質(zhì)條帶充分染色。然后用脫色液進(jìn)行脫色,直至背景清晰,蛋白質(zhì)條帶清晰可見。通過SDS-PAGE分析結(jié)果可知,在不同的誘導(dǎo)條件下,ELP-Hsp90α融合蛋白的表達(dá)情況存在明顯差異。在較低的IPTG濃度(0.1mM)下,融合蛋白的表達(dá)量相對較低;隨著IPTG濃度的增加,表達(dá)量逐漸升高,但當(dāng)IPTG濃度過高(1.0mM)時,融合蛋白的表達(dá)量并沒有進(jìn)一步顯著增加,反而可能由于過高濃度的IPTG對細(xì)胞生長和代謝產(chǎn)生抑制作用,導(dǎo)致表達(dá)量略有下降。在誘導(dǎo)溫度方面,16℃時,融合蛋白主要以可溶性形式存在于上清液中,且表達(dá)量相對較高;25℃時,上清液和沉淀中均有一定量的融合蛋白,說明部分融合蛋白以包涵體形式存在;37℃時,融合蛋白大部分以包涵體形式存在于沉淀中,可溶性表達(dá)量較低。在誘導(dǎo)時間上,隨著誘導(dǎo)時間的延長,融合蛋白的表達(dá)量逐漸增加,但誘導(dǎo)12h后,表達(dá)量增加的幅度趨于平緩。綜合考慮,確定最佳的誘導(dǎo)條件為IPTG濃度0.5mM,誘導(dǎo)溫度16℃,誘導(dǎo)時間8h,在此條件下,ELP-Hsp90α融合蛋白能夠?qū)崿F(xiàn)高效可溶性表達(dá),為后續(xù)的純化和應(yīng)用實驗提供充足的蛋白來源。3.4融合蛋白的純化利用Ni-IMAC結(jié)合ELP可逆相變特性對誘導(dǎo)表達(dá)后的ELP-Hsp90α融合蛋白進(jìn)行純化。將誘導(dǎo)表達(dá)后的菌液12000rpm離心10min,收集菌體沉淀。用適量的BindingBuffer(20mMTris-HCl,500mMNaCl,pH7.4)重懸菌體,進(jìn)行超聲破碎處理,參數(shù)設(shè)置為功率200W,超聲3s,間隔5s,總超聲時間10min,使細(xì)胞充分破碎,釋放出細(xì)胞內(nèi)的融合蛋白。12000rpm離心15min,收集上清液,即為含有ELP-Hsp90α融合蛋白的粗提液。將粗提液緩慢上樣到預(yù)先用BindingBuffer平衡好的Ni-NTA親和層析柱中,控制流速為0.5mL/min,使融合蛋白與Ni2?充分結(jié)合。上樣結(jié)束后,用含有20mM咪唑的WashingBuffer(20mMTris-HCl,500mMNaCl,20mM咪唑,pH7.4)沖洗層析柱,以去除非特異性結(jié)合的雜蛋白,直至流出液的OD???值接近基線。隨后,用含有不同咪唑濃度(50mM、100mM、200mM、500mM)的ElutionBuffer(20mMTris-HCl,500mMNaCl,咪唑濃度梯度變化,pH7.4)進(jìn)行梯度洗脫,每個梯度收集5管,每管1mL。收集洗脫峰的蛋白樣品,進(jìn)行SDS-PAGE分析,以確定融合蛋白的洗脫峰位置。SDS-PAGE分析采用12%的分離膠和5%的濃縮膠。將收集的蛋白樣品與上樣緩沖液按一定比例混合,在100℃沸水中煮5min,使蛋白質(zhì)充分變性。取適量變性后的樣品加入到凝膠加樣孔中,同時加入蛋白Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。在1×SDS-PAGE電泳緩沖液中,以80V的電壓進(jìn)行濃縮膠電泳,待樣品進(jìn)入分離膠后,將電壓調(diào)至120V,繼續(xù)電泳至溴酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠底部。電泳結(jié)束后,將凝膠浸泡在考馬斯亮藍(lán)染色液中,室溫染色1-2h,然后用脫色液進(jìn)行脫色,直至背景清晰,蛋白質(zhì)條帶清晰可見。結(jié)果顯示,在咪唑濃度為200mM的洗脫液中,ELP-Hsp90α融合蛋白的純度較高,雜蛋白條帶較少。為了進(jìn)一步提高融合蛋白的純度,利用ELP的可逆相變特性進(jìn)行二次純化。將咪唑濃度為200mM洗脫峰收集的蛋白樣品,調(diào)整其濃度至1mg/mL左右,加入適量的NaCl,使終濃度為1M。將樣品置于37℃水浴中孵育30min,使ELP-Hsp90α融合蛋白發(fā)生聚集沉淀。12000rpm離心10min,收集沉淀,用適量的含有1MNaCl的PBS緩沖液(pH7.4)重懸沉淀,再次置于37℃水浴中孵育30min,重復(fù)離心收集沉淀步驟1-2次。最后,將沉淀用適量的PBS緩沖液(pH7.4)重懸,透析去除NaCl,得到純化后的ELP-Hsp90α融合蛋白。采用SDS-PAGE和Westernblot對純化后的融合蛋白進(jìn)行鑒定。SDS-PAGE結(jié)果顯示,在約60kDa處出現(xiàn)一條單一且清晰的條帶,與ELP-Hsp90α融合蛋白的理論分子量相符,表明融合蛋白得到了有效純化,雜蛋白含量極低。Westernblot分析時,將SDS-PAGE分離后的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,轉(zhuǎn)膜條件為250mA,轉(zhuǎn)膜1.5h。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,用5%脫脂奶粉封閉液在室溫下封閉PVDF膜1h,以防止非特異性結(jié)合。將封閉后的PVDF膜與抗His-tag的一抗(1:1000稀釋)在4℃下孵育過夜。次日,用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min,以去除未結(jié)合的一抗。然后將PVDF膜與標(biāo)記有辣根過氧化物酶的二抗(1:5000稀釋)在室溫下孵育1h。再次用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min。最后,加入化學(xué)發(fā)光底物,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)中曝光成像。結(jié)果顯示,在約60kDa處出現(xiàn)特異性條帶,表明純化后的蛋白為帶有His-tag標(biāo)簽的ELP-Hsp90α融合蛋白,進(jìn)一步驗證了融合蛋白的純度和特異性。利用BCA法測定純化后ELP-Hsp90α融合蛋白的濃度,結(jié)果顯示,融合蛋白的濃度為1.5mg/mL,滿足后續(xù)實驗的需求。3.5IBDV結(jié)合區(qū)的確定為了精確確定Hsp90α中與IBDV結(jié)合的關(guān)鍵區(qū)域,本研究精心設(shè)計了一系列不同的Hsp90α片段,并使其分別與ELP進(jìn)行融合表達(dá)。根據(jù)Hsp90α的結(jié)構(gòu)域特點和已有的研究報道,將Hsp90α基因序列劃分為N-末端結(jié)構(gòu)域片段(N-Hsp90α,約1-250個氨基酸)、中間連接區(qū)片段(M-Hsp90α,約251-600個氨基酸)、C-末端結(jié)構(gòu)域片段(C-Hsp90α,約601-700個氨基酸)以及包含多個結(jié)構(gòu)域的不同組合片段。利用基因工程技術(shù),分別構(gòu)建含有上述不同Hsp90α片段與ELP的重組表達(dá)質(zhì)粒。以pET-32a(+)為基礎(chǔ)載體,通過限制性內(nèi)切酶酶切和連接反應(yīng),將各個Hsp90α片段準(zhǔn)確地插入到ELP基因的下游,構(gòu)建出pET-32a(+)-ELP-N-Hsp90α、pET-32a(+)-ELP-M-Hsp90α、pET-32a(+)-ELP-C-Hsp90α等重組表達(dá)質(zhì)粒。將這些重組表達(dá)質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,通過熱激法實現(xiàn)質(zhì)粒的導(dǎo)入。將轉(zhuǎn)化后的感受態(tài)細(xì)胞涂布在含有氨芐青霉素(100μg/mL)的LB固體平板上,37℃恒溫培養(yǎng)過夜,使細(xì)胞生長并形成單菌落。挑取單菌落接種于5mL含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)過夜,進(jìn)行種子液的擴(kuò)大培養(yǎng)。次日,將過夜培養(yǎng)的種子液按1%的接種量轉(zhuǎn)接至100mL含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,在37℃、220rpm條件下振蕩培養(yǎng),直至菌液的OD???值達(dá)到0.6-0.8。向培養(yǎng)體系中加入IPTG進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),誘導(dǎo)條件參考前期優(yōu)化得到的ELP-Hsp90α融合蛋白的最佳誘導(dǎo)條件,即IPTG濃度0.5mM,誘導(dǎo)溫度16℃,誘導(dǎo)時間8h。誘導(dǎo)結(jié)束后,取1mL菌液于離心管中,12000rpm離心1min,收集菌體沉淀。用100μLPBS緩沖液重懸菌體,進(jìn)行超聲破碎處理,超聲參數(shù)設(shè)置為功率200W,超聲3s,間隔5s,總超聲時間10min,使細(xì)胞充分破碎,釋放出細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。破碎結(jié)束后,12000rpm離心10min,收集上清液,用于后續(xù)的分析。采用ELISA方法初步篩選與IBDV具有結(jié)合能力的融合蛋白。首先,將純化的IBDV病毒液包被于酶標(biāo)板中,每孔加入100μL,4℃過夜。次日,棄去孔內(nèi)液體,用PBST緩沖液洗滌3次,每次3min,以去除未結(jié)合的病毒。然后,加入5%脫脂奶粉封閉液,每孔200μL,37℃孵育1h,封閉非特異性結(jié)合位點。棄去封閉液,再次用PBST緩沖液洗滌3次。將表達(dá)并初步純化的不同ELP-Hsp90α片段融合蛋白分別加入到酶標(biāo)板孔中,每孔100μL,設(shè)置不同的濃度梯度(如1μg/mL、5μg/mL、10μg/mL),37℃孵育1h,使融合蛋白與包被的IBDV充分結(jié)合。棄去孔內(nèi)液體,用PBST緩沖液洗滌3次。加入辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的抗ELP抗體,每孔100μL,37℃孵育1h。再次用PBST緩沖液洗滌3次后,加入TMB底物顯色液,每孔100μL,37℃避光孵育15-20min。最后,加入2MH?SO?終止液,每孔50μL,終止反應(yīng)。在酶標(biāo)儀上測定450nm處的吸光度值(OD???)。結(jié)果顯示,ELP-M-Hsp90α融合蛋白在不同濃度下的OD???值均顯著高于其他融合蛋白,表明中間連接區(qū)片段與IBDV具有較強(qiáng)的結(jié)合能力。為了進(jìn)一步驗證ELISA的結(jié)果,并深入探究融合蛋白與IBDV的結(jié)合特性,采用免疫共沉淀(Co-IP)技術(shù)進(jìn)行分析。將表達(dá)并純化的ELP-M-Hsp90α融合蛋白與含有IBDV的病毒樣本在4℃下孵育2h,使兩者充分結(jié)合。加入適量的ProteinA/G磁珠,繼續(xù)孵育1h,磁珠能夠與抗體-抗原復(fù)合物結(jié)合。使用磁力架分離磁珠,棄去上清液,用冰冷的PBS緩沖液洗滌磁珠3-5次,以去除未結(jié)合的雜質(zhì)。向磁珠中加入適量的SDS-PAGE上樣緩沖液,煮沸5min,使結(jié)合在磁珠上的蛋白質(zhì)釋放出來。將釋放的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離,然后轉(zhuǎn)膜至PVDF膜上。用5%脫脂奶粉封閉液在室溫下封閉PVDF膜1h,以防止非特異性結(jié)合。將封閉后的PVDF膜與抗IBDVVP2蛋白的一抗(1:1000稀釋)在4℃下孵育過夜。次日,用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min,以去除未結(jié)合的一抗。然后將PVDF膜與標(biāo)記有辣根過氧化物酶的二抗(1:5000稀釋)在室溫下孵育1h。再次用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min。最后,加入化學(xué)發(fā)光底物,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)中曝光成像。結(jié)果顯示,在預(yù)期的位置出現(xiàn)了特異性條帶,表明ELP-M-Hsp90α融合蛋白能夠與IBDV的VP2蛋白發(fā)生特異性結(jié)合,進(jìn)一步證實了中間連接區(qū)是Hsp90α與IBDV的主要結(jié)合區(qū)域。四、IBDV濃縮和純化方法的建立4.1IBDV滴定在IBDV的研究和相關(guān)實驗中,準(zhǔn)確測定病毒滴度是至關(guān)重要的環(huán)節(jié),它直接影響后續(xù)實驗的準(zhǔn)確性和可靠性。常用的IBDV滴定方法主要有TCID50(半數(shù)細(xì)胞培養(yǎng)物感染量)和空斑實驗。TCID50測定方法是基于病毒對細(xì)胞的感染能力來確定病毒滴度。具體實驗步驟如下:首先,準(zhǔn)備長滿單層的雞胚成纖維細(xì)胞(CEF)或其他對IBDV敏感的細(xì)胞,用胰酶消化后,制備成細(xì)胞懸液。將病毒液用MEM(MinimumEssentialMedium)進(jìn)行連續(xù)10倍的稀釋,從10?1到10?1?。將稀釋好的病毒接種到96孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,每一稀釋度接種一縱排,共8孔,每孔接種100μL。然后在每孔中加入100μL細(xì)胞懸液,使細(xì)胞量達(dá)到2-3×10?個/mL。同時,設(shè)置正常細(xì)胞對照,正常細(xì)胞對照作兩縱排,每孔加入100μL生長液和100μL細(xì)胞懸液。將培養(yǎng)板置于37℃、5%CO?培養(yǎng)箱中培養(yǎng),逐日觀察并記錄細(xì)胞病變效應(yīng)(CytopathicEffect,CPE),一般需要觀察5-7天。最后,按照Reed-Muench兩氏法或Karber法計算TCID50。以Reed-Muench兩氏法為例,先計算各稀釋度出現(xiàn)CPE的累計孔數(shù)和未出現(xiàn)CPE的累計孔數(shù),再計算出現(xiàn)CPE孔所占的百分比。距離比例=(高于50%病變率的百分?jǐn)?shù)-50%)/(高于50%病變率的百分?jǐn)?shù)-低于50%病變率的百分?jǐn)?shù)),lgTCID50=距離比例×稀釋度對數(shù)之間的差+高于50%病變率的稀釋度的對數(shù),從而得出TCID50的值。例如,若某病毒稀釋度系列中,10??稀釋度出現(xiàn)CPE的孔數(shù)為3,未出現(xiàn)CPE的孔數(shù)為5;10??稀釋度出現(xiàn)CPE的孔數(shù)為1,未出現(xiàn)CPE的孔數(shù)為7。10??稀釋度出現(xiàn)CPE孔所占的百分比為37.5%(3/8),10??稀釋度出現(xiàn)CPE孔所占的百分比為12.5%(1/8)。高于50%病變率的稀釋度為10?3(假設(shè)10?3稀釋度出現(xiàn)CPE孔所占的百分比大于50%),距離比例=(高于50%病變率的百分?jǐn)?shù)-50%)/(高于50%病變率的百分?jǐn)?shù)-37.5%),lgTCID50=距離比例×(-1)+(-3),由此可計算出該病毒的TCID50。空斑實驗則是通過觀察病毒在細(xì)胞單層上形成的空斑數(shù)量來確定病毒滴度。實驗步驟如下:將長滿單層的CEF細(xì)胞用胰酶消化后,接種到6孔板或其他合適的培養(yǎng)器皿中,待細(xì)胞長成致密單層。將病毒液進(jìn)行10倍系列稀釋,從10?1到10??。取不同稀釋度的病毒液0.1mL接種到細(xì)胞單層上,37℃吸附1-2h,期間輕輕搖晃培養(yǎng)器皿,使病毒均勻分布。吸附結(jié)束后,棄去病毒液,用PBS洗滌細(xì)胞單層2-3次,去除未吸附的病毒。然后加入含有0.5%-1%瓊脂糖或甲基纖維素的維持液,覆蓋細(xì)胞單層,37℃、5%CO?培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3-5天。待空斑形成后,用中性紅等染料染色,未感染病毒的細(xì)胞被染色,而感染病毒的細(xì)胞形成的空斑則不著色,從而可以清晰地觀察和計數(shù)空斑。病毒滴度(PFU/mL)=空斑數(shù)×稀釋倍數(shù)×10。例如,若在10??稀釋度的病毒接種孔中觀察到50個空斑,則該病毒的滴度為50×10?×10=5×10?PFU/mL。準(zhǔn)確測定病毒滴度對后續(xù)實驗具有重要意義。在病毒濃縮和純化實驗中,已知的病毒滴度可以幫助確定合適的實驗參數(shù),如融合蛋白與病毒的比例、結(jié)合時間和溫度等。若起始病毒滴度不準(zhǔn)確,可能導(dǎo)致融合蛋白與病毒結(jié)合不充分,影響病毒的濃縮和純化效率。在疫苗制備研究中,準(zhǔn)確的病毒滴度是確定疫苗抗原含量的關(guān)鍵依據(jù)??乖窟^高或過低都可能影響疫苗的免疫效果,過高可能導(dǎo)致免疫反應(yīng)過強(qiáng),引發(fā)不良反應(yīng);過低則可能無法刺激機(jī)體產(chǎn)生足夠的免疫應(yīng)答,無法提供有效的保護(hù)。在病毒生物學(xué)特性研究中,病毒滴度可以反映病毒的感染能力和復(fù)制水平。通過比較不同條件下病毒滴度的變化,可以深入了解病毒的感染機(jī)制、復(fù)制動力學(xué)以及對不同環(huán)境因素的敏感性等。4.2融合蛋白結(jié)合IBDV的條件優(yōu)化為了實現(xiàn)基于ELP-Hsp90α融合蛋白對IBDV的高效捕獲,深入探究融合蛋白與IBDV的最佳結(jié)合條件至關(guān)重要。本研究從溫度、pH值、離子強(qiáng)度等關(guān)鍵因素入手,通過嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶嶒炘O(shè)計和系統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析,確定了最佳結(jié)合條件。首先,設(shè)置不同的溫度梯度,分別為4℃、25℃、37℃,探究溫度對融合蛋白與IBDV結(jié)合的影響。將純化后的ELP-Hsp90α融合蛋白與IBDV病毒樣本按1:50的比例混合,在不同溫度下孵育2h。孵育結(jié)束后,利用ELISA方法檢測結(jié)合在融合蛋白上的IBDV的量。結(jié)果顯示,在4℃時,融合蛋白與IBDV的結(jié)合量相對較低;在25℃時,結(jié)合量有所增加;而在37℃時,結(jié)合量達(dá)到最高。這表明37℃更有利于融合蛋白與IBDV的結(jié)合,可能是因為在該溫度下,融合蛋白和IBDV的分子構(gòu)象更加適配,有利于兩者之間的特異性結(jié)合。接著,研究pH值對結(jié)合的影響。設(shè)置不同的pH值梯度,分別為pH6.0、pH7.0、pH8.0、pH9.0。將融合蛋白與病毒樣本按1:50的比例混合,在37℃下孵育2h,同樣采用ELISA方法檢測結(jié)合的病毒量。實驗結(jié)果表明,在pH7.0時,融合蛋白與IBDV的結(jié)合量最高;當(dāng)pH值偏離7.0時,結(jié)合量逐漸降低。這說明中性環(huán)境(pH7.0)最適合融合蛋白與IBDV的結(jié)合,可能是因為在該pH值下,融合蛋白和IBDV表面的電荷分布較為穩(wěn)定,有利于兩者之間的靜電相互作用和特異性結(jié)合。離子強(qiáng)度也是影響融合蛋白與IBDV結(jié)合的重要因素。通過在結(jié)合緩沖液中添加不同濃度的NaCl,設(shè)置離子強(qiáng)度梯度為0mM、100mM、200mM、300mM。將融合蛋白與病毒樣本按1:50的比例混合,在37℃、pH7.0的條件下孵育2h,利用ELISA檢測結(jié)合的病毒量。結(jié)果顯示,隨著離子強(qiáng)度的增加,融合蛋白與IBDV的結(jié)合量先增加后減少。在離子強(qiáng)度為200mM時,結(jié)合量達(dá)到最高。這表明適當(dāng)?shù)碾x子強(qiáng)度可以促進(jìn)融合蛋白與IBDV的結(jié)合,可能是因為離子強(qiáng)度的變化會影響融合蛋白和IBDV表面的電荷分布和水化層厚度,從而影響兩者之間的相互作用。當(dāng)離子強(qiáng)度過高時,可能會屏蔽融合蛋白與IBDV之間的特異性結(jié)合位點,導(dǎo)致結(jié)合量下降。為了

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