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文檔簡(jiǎn)介
諉南去孝
生物科學(xué)專業(yè)本科理論
課程
教案
生命科學(xué)學(xué)院微生物與生物化學(xué)教研室
《生物化學(xué)》教案
一、課程基本信息
課程代碼課程類別專業(yè)必修
中文名稱《生物化學(xué)》英文名稱Biochemistry
適用專業(yè)生物科學(xué)、生物工程開課單位生命科學(xué)學(xué)院
總學(xué)時(shí)81學(xué)分4.5
先修課程無機(jī)化學(xué)、有機(jī)化學(xué)后續(xù)課程分子生物學(xué)、免疫學(xué)等
二、課程教材:生物化學(xué);出版社;高等教育出版社;第三版;2002;
三、教學(xué)對(duì)象:
生物科學(xué)、生物技術(shù)、生物工程專業(yè)及其他生命科學(xué)專業(yè)和醫(yī)學(xué)專業(yè)
四、主要參考資料:
1、鄭集等編著,《普通生物化學(xué)》,北京,高等教育出版社,2002;
2、TrudyMcke(影印版),?Biochemistry:Anintroduction》(SecondEdition),北京,科學(xué)出版社,2000;
3、盛等編著,《生物化學(xué)簡(jiǎn)明教程》(第二版),北京,高等教育出版社,1999.
4、郭藹光.基礎(chǔ)生物化學(xué)(面向21世紀(jì)課程教材).北京:高等教育出版社,2001
5、王希成,生物化學(xué),北京:清華大學(xué)出版社,2000
6、Lubertstryer.Biochemistry.4thEdition.NewYork;W.HFreemanandCompany,Fifthprinting1998.
7^DLNelson.PrinciplesofBiochemistry.3rded.NewYork;Worthpublisher,2000
五、課程考核方式及成績(jī)?cè)u(píng)定
考試形式:閉卷。考試題型:名詞解釋、選擇題、判斷題、填空題、問答題。成績(jī)?cè)u(píng)定方法:平時(shí)成績(jī)
10%、課程論文20%,期末考試占70%。
六、教案(見后)
緒論
一、教學(xué)目的
了解生物化學(xué)的發(fā)展史,明確生物化學(xué)的概念、任務(wù);
了解生物化學(xué)與各學(xué)科之間的聯(lián)系及研究生物化學(xué)現(xiàn)實(shí)意義;
了解生物化學(xué)的進(jìn)展和學(xué)習(xí)方法。
二、教學(xué)重點(diǎn)
一、生物化學(xué)的涵義
二、生物化學(xué)與其它學(xué)科的關(guān)系
三、生物化學(xué)的發(fā)展及突出成就
四、我國(guó)生物化學(xué)的發(fā)展過程
三、教學(xué)時(shí)數(shù)
2學(xué)時(shí)
四、教學(xué)方法
利用多媒體與傳統(tǒng)方法的相結(jié)合;只講重點(diǎn)和難點(diǎn)和前沿性的熱點(diǎn),一般性知識(shí)看書。
五、教學(xué)內(nèi)容
緒論
一、生物化學(xué)的涵義
生物化學(xué)是介于生物和化學(xué)之間的一門邊緣科學(xué),它是用化學(xué)的理論和方法作為主要手段來研究生命
現(xiàn)象,從而揭示生命的奧秘。它是從分子水平來研究生物體(包括人類、動(dòng)物、植物和微生物)內(nèi)基本物
質(zhì)的化學(xué)組成和生命活動(dòng)所進(jìn)行的化學(xué)變化(即代謝反應(yīng))的規(guī)律及其與生理機(jī)能的關(guān)系的門科學(xué)。
生物化學(xué)的任務(wù)就是研究組成生物體基本物質(zhì)的性質(zhì),結(jié)構(gòu)與功能,以及這些物質(zhì)在生命活動(dòng)過程中
所進(jìn)行的化學(xué)變化的規(guī)律及其與生理機(jī)能的關(guān)系,從而闡明生命現(xiàn)象的本質(zhì),并把這些知識(shí)應(yīng)用到社會(huì)實(shí)
踐和生產(chǎn)實(shí)踐中去,以達(dá)到征服自然和改造自然的目的。
二、生物化學(xué)與其它學(xué)科的關(guān)系
19世紀(jì)以前人們主要是通過生物體內(nèi)的化學(xué)變化來認(rèn)識(shí)生物體的生理機(jī)能,直到二十世紀(jì)初才發(fā)展
成為?門獨(dú)立的新型學(xué)科。它是介于生物和化學(xué)之間的?門學(xué)科,它和有機(jī)化學(xué)、生理學(xué)、生物物理學(xué)和
分子生物學(xué)等與生物化學(xué)的關(guān)系極為密切。
隨著對(duì)蛋白質(zhì)、酶、核酸、糖類和脂類等生物大分子結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、功能和代謝的不斷闡釋,越來越
多的科學(xué)工作者被吸引著,越來越多的學(xué)科向其不斷常攏,使生物化學(xué)迅速地跨入突飛猛進(jìn)的時(shí)代。生物
化學(xué)的日新月異也促進(jìn)了其它學(xué)科的發(fā)展,與許多學(xué)科相互聯(lián)系、相互發(fā)展。
如欲深入了解各種生物的生長(zhǎng)、生殖、生理、遺傳、衰老、疾病、生命起源和演化等理解,都需要用
生物化學(xué)的原理和方法進(jìn)行探討。因此,生物化學(xué)是各門生物科學(xué)的基礎(chǔ),特別是生理學(xué)、微生物學(xué)、遺
傳學(xué)、細(xì)胞學(xué)等各科的基礎(chǔ),在分子生物學(xué)中占有特別重要的位置。
三、生物化學(xué)的發(fā)展及突出成就
(一)、生物化學(xué)的發(fā)展階段
第一階段從19世紀(jì)末到20世紀(jì)30年代,主要是靜態(tài)的描述性階段,對(duì)生物體各種組成成分進(jìn)行分離、
純化、結(jié)構(gòu)測(cè)定、合成及理化性質(zhì)的研究。其中菲舍爾測(cè)定了很多糖和氨基酸的結(jié)構(gòu),確定了糖的構(gòu)型,
并指出蛋白質(zhì)是以肽鍵連接的。1926年薩姆納制得了胭酶結(jié)晶,并證明它是蛋白質(zhì)。
第二階段約在20世紀(jì)30?50年代,主要特點(diǎn)是研究生物體內(nèi)物質(zhì)的變化,即代謝途徑,所以稱動(dòng)態(tài)生
化階段。其間突出成就是確定了糖酵解、三殷酸循環(huán)以及脂肪分解等重要的分解代謝途徑。對(duì)呼吸、光合
作用以及腺背三磷酸(ATF)在能量轉(zhuǎn)換中的關(guān)鍵位置有了較深入的認(rèn)識(shí)。
第三階段是從20世紀(jì)50年代開始,主要特點(diǎn)是研究生物大分子的結(jié)構(gòu)與功能。生物化學(xué)在這
?階段的發(fā)展,以及物理學(xué)、技術(shù)科學(xué)、微生物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞學(xué)等其他學(xué)科的滲透,產(chǎn)生了分子
生物學(xué),并成為生物化學(xué)的主體。
(二)、二十世紀(jì)生物化學(xué)的突出成就
在20世紀(jì)前30年代中,生物化學(xué)的研究仍繼續(xù)側(cè)重在酶、激素、維生素的分離和功能以及人體氨基
酸需要等幾個(gè)方面。在20世紀(jì)中最突出的生化成就有:酶的結(jié)果、中間代謝途徑的闡明、生物能量學(xué)的
發(fā)展、生物大分子結(jié)構(gòu)和功能以及分子生物學(xué)的興起幾個(gè)方面:
1)酶的結(jié)晶20世紀(jì)30年代中,最突出的生化成果之就是胭酶(urease)的第一次結(jié)晶成功。
1926年JamesB.Sumner(l877-1855)發(fā)表了他第一次成功地制成了晶體服酶,隨后是JohnH.Northrup
(1891-1987)制得了晶體胃蛋白酶和胰蛋白酶。這兩項(xiàng)研究成果是當(dāng)今酶學(xué)的重大突破。因?yàn)橛辛司w純
酷,就為體外研究個(gè)別酶的生物功能鋪平了道路,從而開辟了醐學(xué)研究的新領(lǐng)域。
2)代謝途徑的闡明HansA.Krebs提出的三竣酸循環(huán)對(duì)糖的分解代謝及尿素循環(huán)對(duì)氮的代謝都
取得巨大進(jìn)展。脂肪、蛋白質(zhì)、氨基酸及其他生物物質(zhì)的分解途徑也得到闡明。由于物質(zhì)分解途徑的闡明
及同位素在代謝研究上的應(yīng)用,大大促進(jìn)了20世紀(jì)晚期的合成代謝研究。
3)生物能研究的發(fā)現(xiàn)生物能的研究使生物化學(xué)更能深入地認(rèn)識(shí)代謝在生命過程中的功用,自
20世紀(jì)50年代以來,許多生化研究人員,包括OttoMeyerhof(】884-1951)、OttoWarburg(1883-1970)等在
代謝能的產(chǎn)生和利用上作了基本闡述。指出了ATP是代謝能的產(chǎn)生作用的關(guān)鍵化合物,提出了呼吸鏈及氧
化磷酸化的理論,從而建立了生物能量學(xué)(Bioenergetics)。
4)生物大分子的結(jié)構(gòu)和功能的研究及分子生物學(xué)的興起從20世紀(jì)50年代起,生物化學(xué)的另
一重要研究成果就是蛋白質(zhì)及核酸的結(jié)構(gòu)和功能。首先是Pauling與RoberCorey利用X射線衍射技術(shù)研
究蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu),提出了著名的蛋白質(zhì)的a-螺旋結(jié)構(gòu)(a-helix)、其次是FrederichSanger在1953年發(fā)
表了他對(duì)胰島素分子中51個(gè)氨基酸序列的研究。
在Pauling的蛋白質(zhì)的a-螺旋結(jié)構(gòu)的啟示HJamesD.Waston與FrancisH.C.Crick制成了DNA雙螺旋
結(jié)構(gòu)模型,這?成就導(dǎo)致人們從DNA分子的三維結(jié)構(gòu)去理解與DNA有關(guān)的生命現(xiàn)象,被認(rèn)為是分子生物
學(xué)的開始。
四、我國(guó)生物化學(xué)的發(fā)展過程
我國(guó)是世界文明發(fā)達(dá)最早的國(guó)家之一,中華民族是一個(gè)具仃悠久歷史和優(yōu)秀文化的民族。我國(guó)勞動(dòng)人
民,遠(yuǎn)在古代即因生活需要,在生產(chǎn)、醫(yī)療和營(yíng)養(yǎng)等方面的實(shí)踐中積累了許多有關(guān)生物化學(xué)的豐富經(jīng)驗(yàn),
并有許多發(fā)明創(chuàng)造,對(duì)生物化學(xué)的發(fā)展做出了許多貢獻(xiàn)。比如,在四千多年前(夏禹時(shí)代)就已發(fā)明用糧
食服酒,釀酒用的酒母稱為曲或媒(即現(xiàn)代的酶)。在商周時(shí)期(公元前12世紀(jì))已知制造醬、醋和飴糖
的技術(shù)。泗、醬、醋和飴都是屬于發(fā)酵釀造業(yè),是利用生物體內(nèi)的酶所催化的化學(xué)產(chǎn)物。
在醫(yī)藥方面,春秋戰(zhàn)國(guó)時(shí)期(公元前6世紀(jì))已知用曲治療消化道疾病,至今仍沿用,如“神曲”等。在
晉朝(公元4世紀(jì))時(shí),已知用海藻(含碘)治療麴?。谞钕倌[)。而在歐洲直到公元1170年始用海藻
治療甲狀腺腫。唐朝初年(公元7世紀(jì))孫思邈已知腳氣病為食米區(qū)一種流行病,并用含維生素B1豐富的
國(guó)草藥如車前、防風(fēng)、大豆、米皮等進(jìn)行治療。他首先用含維生素A豐富的豬肝治療雀目(夜盲癥)。公
元10世紀(jì)起,我國(guó)就用動(dòng)物各種臟器治療疾病,尤其是明朝我國(guó)偉大科學(xué)家李時(shí)珍(公元16世紀(jì))編著
《本草綱目》15,共載?千八百余種,其中有關(guān)動(dòng)物藥(包括代謝產(chǎn)物和分泌物)的記載就有四百多種。
可見,我國(guó)古代人民對(duì)生物化學(xué)已有很大貢獻(xiàn)。只是由于長(zhǎng)期的封建統(tǒng)治和保守落后思想束縛了我國(guó)
生產(chǎn)力和科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,生物化學(xué)也不例外。
中國(guó)生物化學(xué)的發(fā)展是20世紀(jì)20年代開始的。從1917年起,中國(guó)才有生物化學(xué)這門
學(xué)科。在中國(guó),現(xiàn)代生物化學(xué)起源于西方,尤其是美國(guó)、英國(guó)和德國(guó)。所有中國(guó)生物化學(xué)的開拓者,都是
從美國(guó)及歐洲留學(xué)回來的。最早的是前齊魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的江清(1886-1939)、燕京大學(xué)的竇維廉(William
H.Adolph)(1890-1952)和協(xié)和醫(yī)學(xué)院的吳憲(1893-1959)等,對(duì)中國(guó)早期生物化學(xué)的發(fā)展都是有功勞的,特
別是吳憲法對(duì)中國(guó)生化的發(fā)展影響最大。
第一章蛋白質(zhì)化學(xué)
一、教學(xué)目的
1.掌握蛋白質(zhì)的概念和化學(xué)組成;蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位——氨基酸的分類及結(jié)構(gòu);蛋白質(zhì)各級(jí)分子結(jié)構(gòu)
的內(nèi)容和特點(diǎn)。
2.熟悉氨基酸、蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)及分離鑒定方法。
3.了解蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系及蛋白質(zhì)級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定。
二、教學(xué)重點(diǎn)和難點(diǎn):
掌握蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)、重要性質(zhì)及結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。
建議:在學(xué)習(xí)氨基酸的結(jié)構(gòu)時(shí)聯(lián)系有機(jī)化學(xué)的竣酸結(jié)構(gòu):在學(xué)習(xí)氨基酸的化學(xué)性質(zhì)時(shí)聯(lián)系氨基酸的結(jié)構(gòu),
再將氨基酸的結(jié)構(gòu)和特性與蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和特性聯(lián)系起來。同時(shí)注意氨基酸的某些特殊反應(yīng)在蛋白質(zhì)的合
成工作中的實(shí)際意義,認(rèn)識(shí)蛋白質(zhì)的重要生物學(xué)意義和生產(chǎn)實(shí)踐意義。
三、教學(xué)時(shí)數(shù)
18學(xué)時(shí)
四、教學(xué)方法
利用多媒體與傳統(tǒng)方法的相結(jié)合
五、教學(xué)內(nèi)容
第一節(jié)蛋白質(zhì)概論
蛋白質(zhì)是所有生物中非常重要的結(jié)構(gòu)分子和功能分子,幾乎所有的生命現(xiàn)象和生物功能都是蛋白質(zhì)作用的
結(jié)果,因此,蛋白質(zhì)是現(xiàn)代生物技術(shù),尤其是基因工程,蛋白質(zhì)工程、酶工程等研究的重點(diǎn)和歸宿點(diǎn)。
一、蛋白質(zhì)的化學(xué)組成與分類
1、元素組成
碳50%氫7%氧23%氮16%硫03%
微量的磷、鐵、銅、碘、鋅、銅
凱氏定氮:平均含氮16%,粗蛋白質(zhì)含量=蛋白氮X6.25
2、氨基酸組成
從化學(xué)結(jié)構(gòu)上看,蛋白質(zhì)是由20種L型a氨基酸組成的長(zhǎng)鏈分子。
二、蛋白質(zhì)分子大小與分子量
蛋白質(zhì)是由20種基本aa組成的多聚物,aa數(shù)目由兒個(gè)到成百上千個(gè),分子量從兒干到兒千萬。一
般情況下,少于50個(gè)aa的低分子量aa多聚物稱為肽,寡肽或生物活性肽,有時(shí)也罕稱多肽。多于50個(gè)
aa的稱為蛋白質(zhì)。但有時(shí)也把含有一條肽鏈的蛋白質(zhì)不嚴(yán)謹(jǐn)?shù)胤Q為多肽。此時(shí),多肽一詞著重于結(jié)構(gòu)意
義,而蛋白質(zhì)原則強(qiáng)調(diào)了其功能意義。
對(duì)于任一給定的蛋白質(zhì),它的所有分子在氨基酸組成、順序、肽鏈長(zhǎng)度、分子量等方面都是相同的,
均一性。
三、蛋白質(zhì)分子的構(gòu)象與結(jié)構(gòu)層次
蛋白質(zhì)分子是由氨基酸首尾連接而成的共價(jià)多肽鏈,每一種天然蛋白質(zhì)都有自己特有的空間結(jié)構(gòu),這種空
間結(jié)構(gòu)稱為蛋白質(zhì)的(天然)構(gòu)象。
四、蛋白質(zhì)功能的多樣性
細(xì)胞中含量最豐實(shí)、功能最多的生物大分子。
1.酶
2.結(jié)構(gòu)成分(結(jié)締組織的膠原蛋白、血管和皮膚的彈性蛋白、膜蛋白)
3.貯藏(卵清蛋白、種子蛋白)
4.物質(zhì)運(yùn)輸(血紅蛋白、Na+K+ATPase、葡萄糖運(yùn)輸載體、脂蛋白、電子傳遞體)
5.細(xì)胞運(yùn)動(dòng)(肌肉收縮的肌球蛋白、肌動(dòng)蛋白)
6.激素功能(胰島素)
7.防御(抗體、皮膚的角蛋白、血凝蛋白)
8.接受、傳遞信息(受體蛋白,味覺蛋白)
9.調(diào)節(jié)、控制細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、和遺傳信息的表達(dá)(組蛋白、阻遏蛋白
第二節(jié)蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位一氨基酸
蛋白質(zhì)的水解
蛋白質(zhì)可以受酸、堿或酶的作用而水解成氨基酸。
1.酸水解用6MHe1或4MH2s04,105?;亓?0小時(shí)即可完全水解。酸水解不引起氨基酸的消旋,但色氨
酸完全被破壞,絲氨酸和蘇氨酸部分破壞,天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解。如樣品含有雜質(zhì),在酸
水解過程中常產(chǎn)生腐黑質(zhì),使水解液變黑。用3moi/L對(duì)甲苯磺酸代替鹽酸,得到色氨酸較多,可像絲氨酸
和蘇氨酸一樣用外推法求其含量。
2.堿水解用5MNaOH,水解10—20小時(shí)可水解完全。堿水解使氨基酸消旋,許多氨基酸被破壞,但色氨
酸不被破壞。常用于測(cè)定色氨酸含量??杉尤氲矸垡苑乐寡趸?。
3.酶水解酶水解既不破壞氨基酸,也不引起消旋。但酶水解時(shí)間長(zhǎng),反應(yīng)不完全。?般用于部分水解,若
要完全水解,需要用多種酶協(xié)同作用。
一、氨基酸的構(gòu)造、構(gòu)型、分類和命名
(一)氨基酸的構(gòu)造和構(gòu)型
通式:
+(poo-fOOH
H,N—C—H或H,N—C—H
3I
RR
作為生物體內(nèi)合成蛋白質(zhì)的原料的氨基酸的特點(diǎn):
?均為a-氨基酸
?天然氨基酸大多屬于L型
(二)氨基酸的分類
酸性氨基酸(COOH數(shù)目〉NHz數(shù)目)
氨基酸(堿性氨基酸(N”數(shù)目)COOH數(shù)目)
中性氨基酸(N%數(shù)目=COOH數(shù)目)
賴氨酸H?NCH2cH2cH2cH之CH(NH2)C00H
(Asp,D)
pl=9.74
組氨酸?
堿性氨基酸~i|—CH,CH(NH2)C00H
(His,H)LNH
Npl=7.59
精氨酸F
(Arg,R)H2NCNHCH2CH2CH(NH2)COOH
pl=10.76
中性氨基酸(側(cè)鏈非極性)
甘氨酸HCH(NH)COOH脯氨酸H
21>
(G&£)
pl=5.97SOH
(Pro,P)
丙氨酸CH,CH(NH,)COOHpI=6.30
本內(nèi)氨酸\
(A]a,A)
pI=6.02〈2-CH,CH(NH2)COOH
(Phe.F)5~pl=5.48
擷氨酸(CH)CHCH(NH)COOH
322色氨酸Cnr
-CH2CH(NH2)COOH
(AalV)pl=5.96
(pl=5.65H
亮氨酸*(CH5)2CHCH2CH(NH2)COOHpl=5.89
(Leu,L)
pl=5.98*
蛋氨&V
HASCH2CH2CH(NH2)COOH
異亮氨酸C,HQIJCHCH(NH2)COOH(Met,M)
pl=5.74
(ne,0pl=6.()2
必需氨基酸:嫡*號(hào)的8種氨基酸是人體內(nèi)不能合成而又是營(yíng)養(yǎng)所必不可少的,必需依靠食物供應(yīng),
稱為必需氨基酸。
*其它氨基酸:蛋白質(zhì)合成后,分子中某些氨基酸的側(cè)鏈可發(fā)生變化,而形成另一些氨基酸。
胱氨酸:
I-氧化L2H)_%CH,
2HS-CH-C-C00H-|~I~
-%還原(+
2H)CHNH2CHNH,
COOHCOOH
半胱氨酸胱氨酸
(三)氨基酸的命名
系統(tǒng)命名和俗名
二、氨基酸的性質(zhì)
氨基酸的化學(xué)性質(zhì)取決于其分子中的粉基、氨基、側(cè)鏈基團(tuán)以及這些基團(tuán)的相互影響。
氨基酸的性質(zhì)
?兩性電離
?成肽
?脫陵
?與亞硝酸的放氮反應(yīng)
?與苗三酮的顯色反應(yīng)
?與2,4-二硝基氟苯的反應(yīng)
?與金屬離子的螯合作用
(-)兩性電離及等電點(diǎn)
1.兩性電離Neutral,dipolarzwitterions
R—CH-COOHR—CH-COO
NH2+NH3
內(nèi)鹽(兩性離子、偶極離子)
2.等電點(diǎn)(Isoelectricpoint)
R-CH-COOH+H,0R-CH-COO+H,OR-CH-COO-
HO+|J'—Ir"-I.
+NH,-H,0+NH?-H2ONH,
偶極離子
陰離子
ffl離子(氨基酸的主要存在形式)
(pH<1時(shí)的主要存在形式)(pH>l2時(shí)的主要存在形式)
等電點(diǎn):加入酸或堿調(diào)節(jié)某種氨基酸水溶液的pH值,使這種氨基酸的酸式電離與堿式電離的趨向恰
好相等。此時(shí)溶液的pH值就叫做這種氨基酸的等電點(diǎn),以pl表示。
各類氨基酸的pl值范圍:
?中性氨基酸的等電點(diǎn)一般在5.0~6.5之間,
?酸性氨基酸為2.7~3.2,
堿性氨基酸為9.5~10.7。
[思考題I為什么中性氨基酸的等電點(diǎn)不等于7?
中性氨基酸的膠基的酸式電離略大于其氨基的堿式電離,因而溶液的pH值必須達(dá)到偏酸時(shí),才能使
其兩種電離趨向恰好相等。
氨基酸溶液處于等電點(diǎn)時(shí):
?[陰離子]=[陽離子]
?[偶極離子]>99.9%
?氨基酸的溶解度最小,最易從溶液中析出
*溶液pH與溶液離子的關(guān)系:(見幻燈)
(二)脫水生成肽
SC
H-N-CH-C-OH+--M
HR<i>Hd
R,
N肽
CF二
N—IIIOH
HRH
肽鍵
兩個(gè)氨基酸之間所產(chǎn)生的酰胺鍵又稱為肽鍵(peptidebond)。.肽分子的一端有氨基,另一端有竣基,
因此還可繼續(xù)與氨基酸縮合成為三肽、四肽以至多肽。
當(dāng)兩種不同的氨基酸A與B互相結(jié)合時(shí),可按不同的排列方式結(jié)合,形成兩種結(jié)構(gòu)不同而性質(zhì)相似
的二肽A-B與B-Ao例如甘氨酸和丙氨酸可形成如下兩種二肽:
H,N—CH7C—N—CH—COOHH,N—CH—£一廠CH/OOH
&HCH,CH”H
甘氨酰丙氨酸丙氨酰甘氨酸
三肽有6(3!)種可能的異構(gòu)體,其排列順序?yàn)锳BC,ACB,BAC,BCA,CAB.CBA。n肽有n!種異構(gòu)
體。
(三)脫竣反應(yīng)
脫竣反應(yīng)是人體內(nèi)氨基酸代謝的形式之一。例如在腸道細(xì)菌作用下,組氨酸脫竣變成組胺:
N一(j^CH-CH^COO|H-N-^-CH2NH2
HCCHNH,HCCH
\N/■、N/
HH
(四)與亞硝酸的放氮反應(yīng)
凡是具有氨基的化合物都能與亞硝酸作用產(chǎn)生氮?dú)猓ǜ彼峒傲u脯氨酸除外)
R—CH—COOH+HNO,R—CH—COOH+N2T+H20
OH
NH2
利用此反應(yīng),可由氨的體積計(jì)算混合氨基酸的總含量或蛋白質(zhì)分子中氨基的含量。
(五)與苗三明的顯色反應(yīng)
藍(lán)色化合物
反應(yīng)后藍(lán)紫色的深度或二氧化碳的體積可作為a-氨基酸定量分析的依據(jù)。肽類和蛋白質(zhì)也有此反應(yīng)。
由于反應(yīng)非常靈敏,是鑒定氨基酸、肽類和蛋白質(zhì)最迅速而乂簡(jiǎn)便的方法,廣泛用于a-氨基酸、肽類和蛋
白質(zhì)的比色測(cè)定或紙層析與薄層層析的顯色。
(六)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)(桑各試劑)的反應(yīng)
,NO?
—NH-CH~~COOH+HF
F+H2NCH-COOH?
R
DNFB氨基酸DNP-氨基酸
(桑各試劑)(黃)
用于測(cè)定蛋白質(zhì)或多肽N-端氨基酸的方法,稱為二硝基苯法,簡(jiǎn)稱為DNP法。利用此法不斷降解蛋
白質(zhì)或多肽,反復(fù)用DNFB標(biāo)記其氨基末端,就可確定蛋白質(zhì)或多肽鏈中氨基酸的排列順序。
(七)與金屬離子的螯合作用
O=?c—X0、H,LN—CH,
x
H2C—NH2o—C=O
蘭色
利用這類反應(yīng)可作為氨基酸或蛋自質(zhì)的定性試驗(yàn)或定量分析的依據(jù)。
第三節(jié)肽
一、肽的和命名
由氨基酸縮合而成的化合物稱為肽。
分類,般十肽以下的叫寡肽或低聚肽(oligopeptide),+■肽以上稱為多肽(polypeptide)。
多肽分子中的氨基酸單位稱為氨基酸殘基(aminoacidresidue).
蛋白質(zhì)是由多肽組成的,除此之外,在人體內(nèi)還發(fā)現(xiàn)了許多肽類,其中有些是具有重要生理活性的激
素。
環(huán)狀肽鏈沒有首尾之分。開鏈肽為鏈狀,故乂稱多肽鏈。它們有兩端,端具有游離的氨基,稱為氨
基末端(或稱N-端);另一端則具有游離的竣基,稱為叛基末端(或稱C-端)。
在寫多肽的構(gòu)造式或簡(jiǎn)化式時(shí),習(xí)慣上將N-端寫在左邊,C-端寫在右邊。
多肽的命名是以含有C-端(竣基)的氨基酸為母體,而將其余的氨基酸殘基作為?;来闻帕性谀阁w
名稱之前。例如,谷胱甘肽(glutathione)可命名為Y-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸。
二、肽的結(jié)構(gòu)和功能
肽鏈中氨基酸殘基之間的結(jié)合鍵主要是肽鍵。肽鍵是共價(jià)鍵,結(jié)合力很強(qiáng),又較穩(wěn)定,除在酸、堿或
酶的作用下水解外,?般不易被破壞。
肽鏈中的半胱氨酸殘基側(cè)鏈上含有筑基-SH,容易發(fā)生氧化還原反應(yīng)。例如,谷胱廿肽含有-SH,乂稱
還原型谷胱甘肽,可用GSH表示。在氧化反應(yīng)中,筑基被氧化成二硫鍵,肽變成了氧化型谷胱甘肽,可用
GS-SG表示。其氧化型也可被還原。
2GSH—“3叼
+2[H]
谷胱甘肽的還原型及氧化型的轉(zhuǎn)變是可逆的,它在生物氧化過程中起著氫的傳遞作用,能促進(jìn)不飽和
脂肪酸的氧化。體內(nèi)還有許多含航基的酶在生物氧化過程中起著傳遞質(zhì)子的作用。
肽鏈內(nèi)部的兩個(gè)筑基也可以互相結(jié)合成二硫鍵,使肽鏈成部分環(huán)狀.如催產(chǎn)素和抗利尿素:
第四節(jié)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
一、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)按層次可分為四級(jí):
(-)一級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中氨基酸的排列次序
蛋白質(zhì)分子的基本結(jié)構(gòu)是多肽鏈。有些蛋白質(zhì)就是?條多肽鏈,有些是由兩條或兒條多肽鏈構(gòu)成。呈
肽鏈中氨基酸排列的次序稱為蛋白質(zhì)的「級(jí)結(jié)構(gòu)。
我國(guó)科學(xué)家首先合成了具有生理活性的結(jié)晶牛胰島素(圖12-2),它就是由A,B兩條多肽鏈通過二硫鍵
連結(jié)而成的蛋白質(zhì)。在A鏈的第6與第11的兩個(gè)半胱氨酸殘基之間還有一個(gè)二硫鍵相連。
(-)二級(jí)結(jié)構(gòu)
用x射線衍射的方法研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),證明了在蛋白質(zhì)分子的肽鍵(一£一7一)
0H
中C-N鍵的鍵長(zhǎng)為0.132nm,介于C-N鍵長(zhǎng)(0.147nm)和C=N鍵長(zhǎng)(0.127nm)之間。這顯示了肽鍵中的C-N
鍵具有一定程度的雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn),從而使肽鍵-C0NH-上所連接的各原子位于同一平面匕其中
0與H呈反式關(guān)系。這種平面結(jié)構(gòu)稱為“肽鍵平面”或“酰胺平面”。肽鍵平面兩側(cè)的Ca-N和C-Ca鍵則
是。鍵,可以自由旋轉(zhuǎn),即能引起肽鍵平面間的相互旋轉(zhuǎn),使主鏈出現(xiàn)各種構(gòu)象。這種主鏈原子的局部空
間排列,稱為蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)(圖12-3)o
1952年鮑林(Pauling)等人根據(jù)X射線衍射法對(duì)纖維狀蛋白質(zhì)的研究,在肽鍵平面結(jié)構(gòu)及平面間相對(duì)旋
轉(zhuǎn)的基礎(chǔ)上,提出了蛋白質(zhì)肽鏈構(gòu)象的兩種模型。
I.a一螺旋結(jié)構(gòu)模型:肽鏈以螺旋方式伸展,平均每3.6個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成一個(gè)螺旋圈,遞升0.54nm。每
隔18個(gè)殘基即5個(gè)螺旋圈(距長(zhǎng)2.7nm)又出現(xiàn)大的重復(fù)。每個(gè)氨基酸殘基上的氨基氫與其相隔的第五個(gè)氨
基酸殘基中?;跣纬蓺滏I;肽鏈上所有的上環(huán)CO與卜.環(huán)NH都有相應(yīng)的氫鍵對(duì)。這樣,要使一段螺旋
中的肽鏈發(fā)生旋轉(zhuǎn),至少需要打開三個(gè)相鄰的氫鍵才有可能。這就使a-螺旋的構(gòu)象較為穩(wěn)定(圖12-4),
a-螺旋的直徑為1.0?l.lnm,由于此空間太小以致溶劑分子進(jìn)不去。在20種氨基酸中,只有脯氨酸在肽
鏈上時(shí),因其N1二無氫,不能形成氫鍵,a-螺旋在此不能連續(xù),并使后面的肽鏈發(fā)生彎曲。因此脯氨酸的
出現(xiàn)與多肽的立體構(gòu)型有關(guān)。
2.6-片層結(jié)構(gòu)模型:片層結(jié)構(gòu)中肽鏈?zhǔn)钦郫B排列(與a-螺旋不同),每?jī)蓚€(gè)氨基酸殘基的距離約0.35nm
(在a-螺旋結(jié)構(gòu)中為0.15nm),連接各殘基的肽鍵所構(gòu)成的平面有規(guī)則地折疊成折扇狀(圖12-5),肽鏈
中CO與NH間的氫鍵是在兩條平行的或反平行的肽鏈間形成,每個(gè)氨基酸的側(cè)鏈基團(tuán)分別交替地位于折
疊面的上下。
由于空間障礙,就不能盤曲成螺旋,也不能折疊成片層,而呈無確定規(guī)律的線狀卷曲。這部分肽鏈構(gòu)象稱
為無規(guī)卷曲,此外在蛋白質(zhì)分子的肽鏈上還經(jīng)常因脯氨酸的存在而出現(xiàn)180°的回折,這種肽鏈的回折角
稱為6-轉(zhuǎn)角,我/'杷主肽鏈上的a-螺旋、片層、8-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲四種構(gòu)象單元統(tǒng)稱為蛋白質(zhì)的二級(jí)
結(jié)構(gòu)。
(=)三級(jí)結(jié)構(gòu)
上述蛋白質(zhì)的a-螺旋、B-折疊、轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲等二級(jí)結(jié)構(gòu),往往由于側(cè)鏈及各主鏈構(gòu)象單元的
相互作用,而按一定方式進(jìn)一步卷曲,折疊成更復(fù)雜的三度空間結(jié)構(gòu),這就是蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu),三級(jí)結(jié)
構(gòu)是由鹽鍵、氫鍵、二硫鍵及疏水鍵等來維系的。它反映了蛋白質(zhì)分子(或亞基)內(nèi)所有原子的空間排布。
大多數(shù)蛋白質(zhì)都有纖維狀或球狀的三級(jí)結(jié)構(gòu)。
蛋白質(zhì)的變性可解釋為其二級(jí)及三級(jí)結(jié)構(gòu)被破壞的結(jié)果。
(四)四級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)的締合
復(fù)雜的蛋白質(zhì)分子是由兩條或兩條以上具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的肽鏈所組成。這時(shí)每條肽鏈稱為?個(gè)亞基.JL
個(gè)亞基通過氫鍵、疏水鍵或靜電引力締合而成個(gè)蛋白質(zhì)分子,這就是蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。例如,血紅蛋
白(HbA)是一個(gè)含有四條多肽鏈(二條a鏈和二條B鏈,圖12-7)組成的蛋白質(zhì),每條肽鏈各自用副鍵維
系,折疊盤曲成呈四面體形式的三級(jí)結(jié)構(gòu)。具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的四條多肽鏈各自結(jié)合?個(gè)作為輔基的亞鐵血紅
素。四條多肽鏈間通過八個(gè)鹽鍵互相結(jié)合,構(gòu)成血紅蛋白A的四級(jí)結(jié)構(gòu)(圖12-7、12-8)。
二、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)定
推斷預(yù)測(cè)
氨基酸序列(一級(jí)結(jié)構(gòu)〉一空間結(jié)構(gòu)(高級(jí)結(jié)構(gòu))~功能
(-)蛋白質(zhì)測(cè)序的一般步驟
測(cè)定蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的數(shù)目。
(1)拆分蛋白質(zhì)分子中的多肽鏈。
(2)測(cè)定多肽鏈的氨基酸組成。
(3)斷裂鏈內(nèi)二硫鍵。
(4)分析多肽鏈的N末端和C末端。
(5)多肽鏈部分裂解成肽段。
(6)測(cè)定各個(gè)肽段的氨基酸順序
(7)確定肽段在多肽鏈中的順序。
(8)確定多肽鏈中二硫鍵的位置。
(二)蛋白質(zhì)測(cè)序的基本策略
對(duì)于一個(gè)純蛋白質(zhì),理想方法是從N端直接測(cè)至C端,但目前只能測(cè)60個(gè)N端氨基酸。
直接法(測(cè)蛋白質(zhì)的序列)
兩種以上特異性裂解法
NC
A法裂解AlA2A3A4
B法裂解_B[B2B3B4
用兩種不同的裂解方法,產(chǎn)生兩組切點(diǎn)不同的肽段,分離純化每一個(gè)肽段,分離測(cè)定兩個(gè)肽段的氨基酸序
列,拼接成一條完整的肽鏈。
間接法(測(cè)核酸序列推斷第基酸序列)
核酸測(cè)序,一次可測(cè)600-800bp
(=)測(cè)序前的準(zhǔn)備工作
蛋白質(zhì)的純度鑒定
純度要求,97%以上,且均純度鑒定方法。(兩種以上才可靠)
⑴聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)要求一條帶
(2)DNS—cl(:甲氨基蔡磺酰氯)法測(cè)N端氨基酸
測(cè)定分子量
用于估算氨基酸殘基n=mw
110
方法:凝膠過濾法、沉降系數(shù)法
1、確定亞基種類及數(shù)目
多亞基蛋白的亞基間有兩種結(jié)合方式:
⑴非共價(jià)鍵結(jié)合
8mol/L尿素,SDSSDS測(cè)分子量
⑵二硫鍵結(jié)合
過甲酸氧化:
—S—S—+HCOOOH-SO3H
8疏基乙醇還原:
2、測(cè)定氨基酸組成
主要是酸水解,同時(shí)輔以堿水解。氨基酸分析儀自動(dòng)進(jìn)行。
確定肽鏈中各種a.a出現(xiàn)的頻率,便于選擇裂解方法及試劑。
①Trp測(cè)定
對(duì)二甲基氨基苯甲醛590nm.
②Cys測(cè)定
端基分析
①N端分析
DNS-cl法:最常用,黃色熒光,靈敏度極高,DNS-多肽水解后的DNS-氨基酸不需要提取。
DNFB法:Sanger試劑,DNP-多肽,酸水解,黃色DNP-氨基酸,有機(jī)溶劑(乙酸乙酯)抽提分離,
紙層析、薄層層析、液相等
PITC法:Edman法,逐步切下。無色PTH-氨基酸,有機(jī)溶劑抽提,層析。
②C端分析
A.啡解法
HjN-A-B-C-D-COOH無水肌NH2NH2100℃5-10ho
A-NHNH2、B-NHNH2、C-NHNH2、D-COOH
氨基酸的酰腫,用苯甲醛沉淀,C端在上清中,Gin,Asn、Cys、Arg不能用此法。
B.狡肽酶法(Pro不能測(cè))
浚肽酶A:除Pro、Arg、Lys外的所有C端a.a
竣肽酶B:只水解Arg、Lys
NH,NVai—Ser—GlyC
圖Pl18竣肽酶法測(cè)C末端
(二)肽鏈的部分裂解和肽段的分離純化
1、化學(xué)裂解法
①澳化鼠—Met—X—產(chǎn)率85%
②亞碘?;郊姿嵋籘rp—X—產(chǎn)率70-100%
③NTCB(2-硝基-5-硫鼠茶甲雀)一X—Cys—
④羥胺NH20H—Asn—Gly—
約150個(gè)氨基酸出現(xiàn)一次
2、酶法裂解
①胰蛋白酶Lys—
(XWPro)
ArgX
②胰凝乳蛋白酶lyiX
(X#Pro)
Trp——X
Phe——X
胃蛋白醐
PheQrp、Try、Leu)Phe(Trp>Try^Leu)
③Glu蛋白酶GluX
(Vg蛋白酶)
④Arg蛋白酶ArgX
⑤Ly$蛋白酶X——Lys
⑥Pro蛋白酶Pro——X
3、肽段的分離純化
①電泳法SDS-PAGE
根據(jù)分子量大小分離
②離子交換層析法(DEAE—CelluloseDEAE—Sephadex)
根據(jù)肽段的電荷特性分離
③反相HPLC法
根據(jù)肽段的極性分離
④凝膠過濾
4、肽段純度鑒定
分離得到的每一個(gè)肽段,需分別鑒定純度,常用DNS-cl法
要求:SDS—PAGE單帶、HPLC單峰、N端單一。
(=)肽段的序列測(cè)定及肽鏈的拼接
1、Edman法
一次水解一個(gè)N端a.a
(1)耦聯(lián)
PITC+H2N—A-B-C-DpH8—9,40℃PTC——A-*C-D
(2)裂解
PTC—A-B-C-D……TFA無水三氟乙酸ATZ—A+H2N—B-C-D
(3)轉(zhuǎn)化
ATZ—APTI1—A
用GC或HPLC測(cè)定PTH-A”
PTC肽:苯氨基硫甲酰肽
ATZ:曝哇咻酮苯胺(一氨基酸)
PTH:紫乙內(nèi)酰硫胭(一氨基酸)
耦得PTC肽
一次循環(huán)裂理:ATZ-a.a
轉(zhuǎn),:PTH-a.a
反應(yīng)產(chǎn)率99次循環(huán)次數(shù)120
(偶聯(lián)、降98%60
解兩步)90%40
2,DNS-Edman法
用DNS法測(cè)N末端,用Edman法提供(n-1)肽段。
A—B—C—D—E肽
圖
3、有色Edman法
熒光基團(tuán)或有色試劑標(biāo)記的PITC試劑。
4、用自動(dòng)序列分析儀測(cè)序
儀器原理:Edman法,可測(cè)60肽。
1967液相測(cè)序儀
自旋反應(yīng)器,適于大肽段。
1971固相測(cè)序儀
表面接有丙氨基的微孔玻璃球,可耦連肽段的C端。
1981氣相測(cè)序儀
用Polybrcne反應(yīng)器。
(聚陽離子)四級(jí)鍍鹽聚合物
液相:5nmol2Q40肽97%
氣相:5pmol60肽98%
5、肽段拼接成肽鏈
16肽,N端HC端S
A法裂解:ONSPSEOVERLAH0WT
B法裂解:SEOWTONVERLAPSHO
重疊法確定序列:HOWTONSEOVERLAPS
(四)二破鍵、酰胺及其他修飾基團(tuán)的確定
1、二硫鍵的確定(雙向電泳法)
碘乙酰胺封閉-SH
胃蛋白酶酶解蛋白質(zhì)
第一向電泳
過甲酸氧化一s-s一生成-SO3H
第二向電泳
分離出含二硫鍵的兩條短肽,測(cè)序
與拼接出的肽鏈比較,定出二硫鍵的位置。
2、酰胺的確定
Asp-Asn、Glu-Gln
酶解肽鏈,產(chǎn)生含單個(gè)Asx或Glx的肽,用電泳法確定是Asp還是Asn
舉例:Leu-Glx-Pro-Val肽在pH=6.0時(shí),電荷量是Leu+Pro0Vai'
此肽除Glx外,凈電荷為0,可根據(jù)此肽的電泳行為確定是Glu或是Gin。
3、糖、脂、磷酸基位置的確定
糖類逋過Asn、Ser與蛋白質(zhì)連接,-N-糖普-0?糖普
脂類:Ser、Thr、Cys
磷酸:Ser、Thr、His
經(jīng)驗(yàn)性序列:Lys(Arg)-Ser-Asn-Ser(PC)4)
Arg-Thr-Leu-Ser(PO4)
Lys(Arg)-Ala-Ser(PO4)
第五節(jié)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
一、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定高級(jí)結(jié)構(gòu)和功能
蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)舉例:
(1)牛胰島素
(2)核糖核酸酶(RNase)
(3)人血紅蛋白a和B鏈及肌紅蛋白的級(jí)結(jié)構(gòu)
(五)二、同源蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的種屬差異與生物進(jìn)化
同源蛋白質(zhì):在不同的生物體內(nèi)具有同一功能的蛋白質(zhì)。如:血紅蛋白在不同的脊椎動(dòng)物中都具有
輸送氧氣的功能,細(xì)胞色素在所有的生物中都是電子傳遞鏈的組分。
同源蛋白質(zhì)的特點(diǎn):
①多肽鏈長(zhǎng)度相同或相近
②同源蛋白質(zhì)的氨基酸順序中有許多位置的氨基酸對(duì)所有種屬來說都是相同的,稱不變殘基,不變
殘基高度保守,是必需的。
③除不變殘基以外,其它位置的氨基酸對(duì)不同的種屬有很大變化,稱可變殘基,可變殘基中,個(gè)別
氨基酸的變化不影響蛋白質(zhì)的功能。
通過比較同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列的差異可以研究不同物種間的親源關(guān)系和進(jìn)化,親源關(guān)系越遠(yuǎn),
同源蛋白的氨基酸順序差異就越大。
(六)蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的個(gè)體差異一分子病
分子?。夯蛲蛔円鹉硞€(gè)功能蛋白的某個(gè)(些)氨基酸殘基發(fā)生了遺傳性替代從而導(dǎo)致整個(gè)分子
的三維結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,致使其功能部分或全部喪失。
LinusPauling首先發(fā)現(xiàn)鐮刀形紅細(xì)胞貧血現(xiàn)是由于血紅蛋白發(fā)生了遺傳突變引起的,成人的血紅蛋白
是由兩條相同的a鏈和兩條相同的。鏈組成a2%,鐮刀形紅細(xì)胞中,血紅蛋白|3鏈第6位的aa線基由正常的
Glu變成了疏水性的VaL因此,當(dāng)血紅蛋白沒有攜帶02時(shí)就由正常的球形變成了剛性的棍棒形,病人的
紅細(xì)胞變成鐮刀形,容易發(fā)生溶血作用(血細(xì)胞溶解)導(dǎo)致病血.,棍棒形的血紅蛋白對(duì)O?的結(jié)合力比正常的
低。
以血紅蛋白為例:a282寡聚蛋白
正常人血紅蛋白,B.NGlu6
鐮刀型貧血B.NVai6
生理?xiàng)l件下電荷:
Val°Glu
疏水親水
人的血紅蛋白分子的四條肽鏈中(574個(gè)氨基酸殘基)只有兩個(gè)Glu分子變化成Vai分子,就能發(fā)生
鐮刀狀細(xì)胞貧血病。
一級(jí)結(jié)構(gòu)的部分切除與蛋白質(zhì)的激活
一些蛋白質(zhì)、酶、多肽激素在剛合成時(shí)是以無活性的前體形式存在,只有切除部分多肽后才呈現(xiàn)生
物活性,如血液凝固系統(tǒng)的血纖維蛋白原和凝血酶原,消化系統(tǒng)的蛋白酶原、激素前體等。
二、多肽與蛋白質(zhì)的人工合成(自學(xué))
在醫(yī)藥和研究方面意義重大
1958年,北大生物系合成催產(chǎn)素8肽。
1965年,中國(guó)科學(xué)院生化所、有機(jī)所、北大化學(xué)系人工合成牛胰島素。
1969年,美國(guó)Merrifield用自動(dòng)化的固相多肽合成儀合成第一個(gè)酶——牛胰RNase(124aa-)?
P139圖3-46多肽的固相合成
C端_____端。
掛接f去讀第一中和~縮合一去保護(hù)一中和f縮合
第六節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)
()蛋白質(zhì)的兩性離解及等電點(diǎn)
蛋白質(zhì)的兩性離解及其平衡移動(dòng)可用下式表示:(見幻燈)
P表示蛋白質(zhì)大分子。在pH<pI的溶液中,蛋白質(zhì)陽離子的濃度大于蛋白質(zhì)陰離子的濃度;在pH>pI
的溶液中,則蛋白質(zhì)陰離子濃度大于陽離子濃度。在某一pH值溶液中蛋白質(zhì)的兩性離子濃度處于極大值,
離解成陰、陽離子的幾率相等,其凈電荷等于零,這時(shí)溶濃的pH值就是該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(pl)。蛋白質(zhì)在
等電點(diǎn)時(shí)溶解度最小,最易于沉淀。不同種類的蛋白質(zhì)具有不同的等電點(diǎn)。
(-)蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)、鹽析
1.蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì):
實(shí)驗(yàn)室中常選用不同孔徑的半透膜(透析袋)來分離提純蛋白質(zhì),這種方法稱為透析,在膜上增加壓力,
加壓透析的方法稱為超過漉。
使蛋白質(zhì)溶液穩(wěn)定的兩個(gè)因素:電荷與水化膜。
沉淀蛋白質(zhì)的方法:
⑴蛋白質(zhì)的鹽析:向蛋白質(zhì)溶液中加入電解質(zhì)到定濃度時(shí),蛋白質(zhì)便沉淀析出,這個(gè)作用稱為鹽析。鹽
析所需鹽的最小量稱為鹽析濃度。鹽析是電解質(zhì)對(duì)蛋白質(zhì)溶液的沉淀作用。蛋白質(zhì)鹽析的特點(diǎn)是:①電解
質(zhì)用量很大(以mollJ計(jì)算);②鹽析生成的沉淀,加溶劑稀釋時(shí),又可重新溶解。③不同蛋白質(zhì)鹽析
時(shí)所需的鹽析濃度不同。利用此性質(zhì),可用不同濃度的鹽溶液使蛋白質(zhì)分段析出,予以分離。
(2)有機(jī)溶劑的沉淀:甲醇、乙醇、丙酮等極性較大的有機(jī)溶劑,對(duì)水的親和力較大,亦能破壞蛋白質(zhì)
分子的水化膜。在等電點(diǎn)時(shí)加入這些脫水劑可使蛋白質(zhì)沉淀析出。但這些溶劑如與蛋白質(zhì)長(zhǎng)時(shí)間接觸,則
沉淀的蛋白質(zhì)會(huì)發(fā)生性質(zhì)的改變,而不再溶解。在中草藥有效成分的提取過程中,常加適量的乙醇以沉淀
蛋白質(zhì),就是根據(jù)這個(gè)道理。
(3)重金屬鹽沉淀,氯化汞、硝酸銀、醋酸鉛、硫酸銅等重金屬鹽,在溶液的pH值大于蛋白質(zhì)等電點(diǎn)
時(shí),它們的重金屬離子如C『+,Hg2+,Pb",Ag+等能與蛋白質(zhì)的竣基陰離子結(jié)合,生成不溶性的沉淀。
(4)某些酸類的沉淀:鋁酸、苦味酸、糅酸、磺基水楊酸、偏磷酸、:氯醋酸等酸的復(fù)雜酸根,在溶液
的pH值小于蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)時(shí),能與蛋白質(zhì)的鍍陽離子結(jié)合,成為不溶性的沉淀。
(=)蛋白質(zhì)的顯色反應(yīng)
1.縮二朦反應(yīng):蛋白質(zhì)堿性溶液與稀硫酸銅溶液可發(fā)生縮二麻反應(yīng),呈現(xiàn)出紫色或紫紅色。生成的顏色
與蛋自質(zhì)的種類有關(guān)。
2.茴三酮反應(yīng):將蛋白質(zhì)的近中性溶液(pH5?7)與瑋三酮水溶液(1:400)1?2滴混合并加熱煮沸1?2min,
放冷后產(chǎn)生藍(lán)紫色反應(yīng)。蛋白質(zhì)、肽類、氨基酸及其它伯胺類化合物等具有自由氨基的化合物(包括氨)對(duì)
荀三酮均呈陽性反應(yīng)。此反應(yīng)也可用于蛋白質(zhì)的定性與定量分析。
3.其它顯色反應(yīng):氨基酸(及蛋白質(zhì))還與某些試劑發(fā)生顯色反應(yīng)(表12-6),這些反應(yīng)常用于氨基酸的鑒別。
第七節(jié)蛋白質(zhì)的分類
(-)按分子形狀分類
1.纖維狀蛋白形狀似纖維,不溶于水,如膠原蛋白,彈性蛋白,角蛋臼等。纖維蛋白按溶解性可分為可溶
性纖維蛋白與不溶性纖維蛋白。前者如血液中的纖維蛋白原、肌肉中的肌球蛋白等,后者如膠原蛋白,彈
性蛋白,角蛋白等結(jié)構(gòu)蛋白。
2.球狀蛋白分子似球體,較易溶于水,如血紅蛋白、血清球蛋白等。球狀蛋白的長(zhǎng)度與直徑之比一般小于
10o
(-)按組成分類
1.簡(jiǎn)單蛋白完全由氨基酸組成,不含非蛋白成分。如血清清蛋白等。根據(jù)理化性質(zhì)及來源分為清蛋白(乂名
白蛋白,albumin),球蛋白(globulin)、谷蛋白(glutelin)、醇溶谷蛋白(prolamine)、精蛋白(protamine)、組蛋
白(histone)、硬蛋白(scleroprotein)等。
2.結(jié)合蛋白由蛋白質(zhì)和非蛋白成分組成,后者稱為輔基。根據(jù)輔基的不同,分為核蛋白(nucleoprotein)、磷
蛋白(phosphopmtein)、金屬蛋白(metalloprotein)、色蛋白(chromoprotein)等
(三)根據(jù)功能分類
1、活性蛋白質(zhì):包括在生命過程中一切有活性的蛋白質(zhì)及其前體,如酶、激素蛋白質(zhì)、運(yùn)輸和貯存蛋白
質(zhì)、運(yùn)動(dòng)蛋白質(zhì)、受體蛋白質(zhì)、膜蛋白質(zhì)等。
2、非活性蛋白質(zhì):對(duì)生物體起保護(hù)或支持作用,如膠原、角蛋白等。
第八節(jié)蛋白質(zhì)的分離純化
一、蛋白質(zhì)的提取
研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能,首先需要得到純的蛋白質(zhì)樣品。
(1)蛋白質(zhì)來源:微生物細(xì)胞、動(dòng)物細(xì)胞和植物細(xì)胞;
(2)隨時(shí)測(cè)定蛋白質(zhì)活性并檢測(cè)蛋白質(zhì)含量。
(3)分離和純化過程都必須在溫和的條件下進(jìn)行。
蛋白質(zhì)的提取步驟
(1)
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