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并行計(jì)算應(yīng)用指南一、并行計(jì)算概述
并行計(jì)算是一種利用多個(gè)處理器或計(jì)算單元同時(shí)執(zhí)行計(jì)算任務(wù)的技術(shù),旨在提高計(jì)算效率和性能。通過(guò)合理分配任務(wù)和優(yōu)化資源利用,并行計(jì)算能夠顯著縮短復(fù)雜應(yīng)用的執(zhí)行時(shí)間。
(一)并行計(jì)算的基本概念
1.并行計(jì)算的定義:指將一個(gè)大型計(jì)算任務(wù)分解為多個(gè)子任務(wù),并由多個(gè)處理器同時(shí)執(zhí)行這些子任務(wù)的過(guò)程。
2.并行計(jì)算的分類:
(1)數(shù)據(jù)并行:將數(shù)據(jù)分塊,每個(gè)處理器處理數(shù)據(jù)的不同部分。
(2)程序并行:將程序分解為多個(gè)獨(dú)立的子任務(wù),每個(gè)處理器執(zhí)行不同的任務(wù)。
3.并行計(jì)算的優(yōu)勢(shì):
(1)提高計(jì)算速度:通過(guò)多核或多機(jī)協(xié)作,大幅縮短任務(wù)執(zhí)行時(shí)間。
(2)資源利用率提升:充分利用硬件資源,減少閑置時(shí)間。
(二)并行計(jì)算的應(yīng)用場(chǎng)景
1.科學(xué)計(jì)算:如天氣預(yù)報(bào)、流體力學(xué)模擬等,需要處理海量數(shù)據(jù)。
2.機(jī)器學(xué)習(xí):大規(guī)模數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練和推理過(guò)程。
3.圖形渲染:實(shí)時(shí)渲染高分辨率3D場(chǎng)景。
4.數(shù)據(jù)分析:處理大規(guī)模數(shù)據(jù)集,如用戶行為分析。
二、并行計(jì)算的關(guān)鍵技術(shù)
(一)并行編程模型
1.OpenMP:基于共享內(nèi)存的多線程編程模型,適用于數(shù)據(jù)并行任務(wù)。
2.MPI:基于消息傳遞的并行編程模型,適用于分布式內(nèi)存系統(tǒng)。
3.CUDA:NVIDIA推出的GPU并行計(jì)算平臺(tái),適用于計(jì)算密集型任務(wù)。
(二)并行算法設(shè)計(jì)
1.任務(wù)分解:將大型任務(wù)分解為可并行執(zhí)行的子任務(wù)。
2.數(shù)據(jù)分割:合理分配數(shù)據(jù),避免數(shù)據(jù)競(jìng)爭(zhēng)和同步開(kāi)銷。
3.約束管理:確保子任務(wù)之間的依賴關(guān)系得到正確處理。
(三)并行計(jì)算平臺(tái)
1.多核CPU:現(xiàn)代CPU通常支持多線程并行計(jì)算,如IntelCore系列。
2.GPU加速器:如NVIDIATesla系列,適用于大規(guī)模并行計(jì)算。
3.分布式計(jì)算集群:通過(guò)多臺(tái)服務(wù)器組成的集群,實(shí)現(xiàn)更高規(guī)模的并行計(jì)算。
三、并行計(jì)算的最佳實(shí)踐
(一)任務(wù)分解與優(yōu)化
1.確保任務(wù)可并行化:選擇適合并行處理的算法,如矩陣乘法。
2.避免數(shù)據(jù)依賴:盡量減少子任務(wù)之間的依賴關(guān)系,降低同步開(kāi)銷。
3.負(fù)載均衡:合理分配任務(wù),避免某些處理器過(guò)載而其他處理器空閑。
(二)性能調(diào)優(yōu)
1.使用性能分析工具:如NVIDIANsight,識(shí)別性能瓶頸。
2.優(yōu)化內(nèi)存訪問(wèn):減少內(nèi)存帶寬占用,提高數(shù)據(jù)局部性。
3.減少同步開(kāi)銷:盡量減少鎖的使用,采用無(wú)鎖編程技術(shù)。
(三)容錯(cuò)與可靠性
1.檢查點(diǎn)與恢復(fù):定期保存計(jì)算狀態(tài),以便在失敗時(shí)恢復(fù)。
2.錯(cuò)誤檢測(cè):實(shí)時(shí)監(jiān)控計(jì)算過(guò)程,及時(shí)發(fā)現(xiàn)并處理錯(cuò)誤。
3.冗余計(jì)算:通過(guò)多次執(zhí)行相同任務(wù),確保結(jié)果一致性。
四、并行計(jì)算的應(yīng)用案例
(一)科學(xué)計(jì)算案例
1.流體力學(xué)模擬:使用MPI將計(jì)算域劃分為多個(gè)部分,每個(gè)處理器計(jì)算一部分。
2.天氣預(yù)報(bào):利用GPU加速數(shù)值計(jì)算,提高預(yù)測(cè)精度和速度。
(二)機(jī)器學(xué)習(xí)案例
1.深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練:使用CUDA在GPU上并行化神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)計(jì)算。
2.數(shù)據(jù)聚類:將數(shù)據(jù)分塊,每個(gè)處理器執(zhí)行聚類算法的一部分。
(三)工業(yè)應(yīng)用案例
1.圖形渲染:使用多線程技術(shù)加速3D場(chǎng)景渲染。
2.大數(shù)據(jù)分析:將數(shù)據(jù)集分割為多個(gè)部分,分布式處理以提高效率。
五、總結(jié)
并行計(jì)算通過(guò)多核或多機(jī)協(xié)作,顯著提高計(jì)算效率和性能。合理選擇并行編程模型、優(yōu)化算法設(shè)計(jì)、利用高性能計(jì)算平臺(tái),并結(jié)合最佳實(shí)踐,能夠充分發(fā)揮并行計(jì)算的優(yōu)勢(shì)。未來(lái),隨著硬件技術(shù)的進(jìn)步,并行計(jì)算將在更多領(lǐng)域發(fā)揮重要作用。
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一、并行計(jì)算概述
并行計(jì)算是一種利用多個(gè)處理器核心或多個(gè)計(jì)算單元同時(shí)執(zhí)行計(jì)算任務(wù)的技術(shù),旨在通過(guò)并發(fā)執(zhí)行來(lái)提高計(jì)算效率和性能,從而縮短復(fù)雜應(yīng)用的執(zhí)行時(shí)間。其核心思想是將一個(gè)大型、復(fù)雜的計(jì)算問(wèn)題分解成多個(gè)較小的、可以獨(dú)立或部分獨(dú)立執(zhí)行的子任務(wù),然后在多個(gè)處理單元上同時(shí)進(jìn)行這些子任務(wù)的計(jì)算。通過(guò)合理地分配任務(wù)、管理數(shù)據(jù)以及優(yōu)化資源利用,并行計(jì)算能夠顯著加速原本需要長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行的計(jì)算密集型或數(shù)據(jù)密集型應(yīng)用。
(一)并行計(jì)算的基本概念
1.并行計(jì)算的定義與核心思想:
并行計(jì)算不僅僅是指有多臺(tái)計(jì)算機(jī)在運(yùn)行,更強(qiáng)調(diào)的是在單一的硬件平臺(tái)上(如多核CPU或GPU)或者跨多個(gè)硬件平臺(tái)(如分布式集群)上,多個(gè)計(jì)算實(shí)體(處理器核心、線程、進(jìn)程等)在同一個(gè)時(shí)間周期內(nèi)執(zhí)行計(jì)算操作的能力。其核心思想是將任務(wù)分解(Decomposition)與并發(fā)執(zhí)行(ConcurrentExecution)相結(jié)合。分解是將大問(wèn)題拆分成小模塊的過(guò)程,而并發(fā)執(zhí)行則是在多個(gè)執(zhí)行單元上同時(shí)啟動(dòng)這些小模塊的計(jì)算。最終的結(jié)果通常需要將這些并發(fā)執(zhí)行產(chǎn)生的部分結(jié)果合并(Aggregation)起來(lái),形成最終的整體解。
并行計(jì)算的目標(biāo)是提高吞吐量(Throughput,單位時(shí)間內(nèi)完成的計(jì)算量)或減少延遲(Latency,任務(wù)從開(kāi)始到完成所需的時(shí)間)。對(duì)于可以并行化的任務(wù),其執(zhí)行時(shí)間理論上隨著可用并行單元數(shù)量的增加而線性減少,但這在實(shí)踐中會(huì)受到并行度(Parallelism)飽和、通信開(kāi)銷、同步開(kāi)銷等因素的影響。
2.并行計(jì)算的分類:
根據(jù)任務(wù)分解和數(shù)據(jù)分配的方式,并行計(jì)算主要可以分為以下幾類:
(1)數(shù)據(jù)并行(DataParallelism):
數(shù)據(jù)并行是最常見(jiàn)的一種并行形式,特別適用于數(shù)組或矩陣運(yùn)算等具有高度結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的應(yīng)用。其基本思想是將一個(gè)大型的數(shù)據(jù)集分割成多個(gè)小的數(shù)據(jù)塊,然后為每個(gè)數(shù)據(jù)塊分配一個(gè)獨(dú)立的處理單元(如CPU核心或GPU線程塊)。每個(gè)處理單元并行地對(duì)各自的數(shù)據(jù)塊執(zhí)行相同的計(jì)算操作。最終結(jié)果通常是所有處理單元計(jì)算結(jié)果的匯總。例如,在矩陣乘法中,可以將一個(gè)矩陣分成塊,每個(gè)核心計(jì)算結(jié)果矩陣的一個(gè)塊。數(shù)據(jù)并行的優(yōu)點(diǎn)是計(jì)算模式簡(jiǎn)單統(tǒng)一,易于實(shí)現(xiàn)。常見(jiàn)的編程模型如OpenMP的`pragmaompparallelfor`就支持簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)并行。
(2)任務(wù)并行(TaskParallelism):
任務(wù)并行適用于計(jì)算任務(wù)本身就可以被分解為多個(gè)相互獨(dú)立或依賴性較小的子任務(wù)的情況。這些子任務(wù)之間可能需要通過(guò)消息傳遞或共享內(nèi)存進(jìn)行通信和同步,但每個(gè)子任務(wù)執(zhí)行的代碼路徑和計(jì)算邏輯是不同的。任務(wù)并行更側(cè)重于利用不同處理單元執(zhí)行不同計(jì)算的能力。例如,在一個(gè)復(fù)雜的數(shù)據(jù)處理流程中,可以將數(shù)據(jù)清洗、特征提取、模型訓(xùn)練等不同階段分解為獨(dú)立的任務(wù),分配給不同的處理器或計(jì)算節(jié)點(diǎn)并行執(zhí)行。MPI(MessagePassingInterface)是任務(wù)并行(尤其是在分布式內(nèi)存系統(tǒng)上)常用的編程接口。
(3)混合并行(HybridParallelism):
在實(shí)際應(yīng)用中,很多復(fù)雜的計(jì)算任務(wù)同時(shí)具有數(shù)據(jù)并行和任務(wù)并行的特性,因此混合并行成為主流。例如,在一個(gè)大規(guī)模機(jī)器學(xué)習(xí)模型訓(xùn)練中,可以將整個(gè)訓(xùn)練過(guò)程分解為多個(gè)獨(dú)立的epoch或batch(任務(wù)并行),在每個(gè)batch中,再將參數(shù)更新計(jì)算分解為對(duì)參數(shù)矩陣的數(shù)據(jù)并行處理?;旌喜⑿行枰鼜?fù)雜的編程模型和調(diào)度策略來(lái)管理不同層次的并行性。
3.并行計(jì)算的優(yōu)勢(shì):
(1)顯著提高計(jì)算性能:這是并行計(jì)算最直接和最重要的優(yōu)勢(shì)。通過(guò)將任務(wù)分散到多個(gè)處理單元,可以同時(shí)處理更多的計(jì)算,從而大幅縮短程序的運(yùn)行時(shí)間,尤其是在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)集或執(zhí)行復(fù)雜計(jì)算時(shí)。性能提升的潛力取決于任務(wù)的并行度、硬件資源的數(shù)量以及并行編程的效率。
(2)提升資源利用率:在多核處理器普及的今天,單個(gè)程序往往無(wú)法充分利用所有核心。并行計(jì)算使得應(yīng)用程序能夠同時(shí)利用多個(gè)核心,減少CPU的空閑時(shí)間,從而提高了整個(gè)系統(tǒng)的資源利用效率。對(duì)于擁有高性能計(jì)算集群或GPU服務(wù)器的研究機(jī)構(gòu)和企業(yè)來(lái)說(shuō),并行計(jì)算是最大化硬件投資回報(bào)的關(guān)鍵。
(3)增強(qiáng)系統(tǒng)的可伸縮性:并行計(jì)算使得應(yīng)用程序能夠隨著硬件資源的增加而性能線性或近線性地提升。這意味著當(dāng)需要處理更大規(guī)模的問(wèn)題或應(yīng)對(duì)更高負(fù)載時(shí),可以通過(guò)增加處理器核心數(shù)量或計(jì)算節(jié)點(diǎn)來(lái)擴(kuò)展系統(tǒng),而無(wú)需對(duì)算法進(jìn)行根本性的重新設(shè)計(jì)。
(4)加速科學(xué)研究和創(chuàng)新:對(duì)于許多科學(xué)和工程領(lǐng)域的前沿研究,如氣候模擬、天體物理學(xué)、材料科學(xué)、生物信息學(xué)等,其研究問(wèn)題天然具有大規(guī)模、高計(jì)算復(fù)雜度的特點(diǎn),傳統(tǒng)單核計(jì)算方式難以在合理時(shí)間內(nèi)完成。并行計(jì)算為這些領(lǐng)域的研究提供了強(qiáng)大的計(jì)算工具,使得科學(xué)家能夠探索更復(fù)雜的模型、處理更大規(guī)模的數(shù)據(jù),從而加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)和技術(shù)創(chuàng)新。
(二)并行計(jì)算的應(yīng)用場(chǎng)景
并行計(jì)算的應(yīng)用范圍非常廣泛,幾乎涵蓋所有需要大量計(jì)算或數(shù)據(jù)處理的應(yīng)用領(lǐng)域。以下是一些典型的應(yīng)用場(chǎng)景:
1.高性能科學(xué)計(jì)算(HPC):
(1)氣候與環(huán)境模擬:運(yùn)行復(fù)雜的全球氣候模型,需要模擬大氣、海洋、陸地表面等多種物理過(guò)程,涉及海量的網(wǎng)格點(diǎn)和時(shí)間步長(zhǎng),計(jì)算量巨大。
(2)流體力學(xué)與空氣動(dòng)力學(xué)模擬:如計(jì)算飛機(jī)、汽車的外部流場(chǎng),或進(jìn)行航空航天器的氣動(dòng)設(shè)計(jì),常使用計(jì)算流體力學(xué)(CFD)軟件,如ANSYSFluent、OpenFOAM等,這些軟件通常包含大規(guī)模的數(shù)據(jù)并行計(jì)算。
(3)計(jì)算化學(xué)與材料科學(xué):分子動(dòng)力學(xué)模擬(MD)用于研究原子和分子的運(yùn)動(dòng),計(jì)算量隨分子系統(tǒng)規(guī)模的增大而迅速增長(zhǎng);第一性原理計(jì)算用于預(yù)測(cè)材料性質(zhì),如晶體結(jié)構(gòu)、電子能帶等,也需要大量的并行計(jì)算。
(4)天體物理學(xué)模擬:如模擬星系形成、黑洞演化、宇宙膨脹等,涉及對(duì)大規(guī)模粒子系統(tǒng)或場(chǎng)方程的數(shù)值求解。
2.人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):
(1)深度學(xué)習(xí)模型訓(xùn)練:現(xiàn)代深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DNNs),特別是大型Transformer模型(如用于自然語(yǔ)言處理或計(jì)算機(jī)視覺(jué)的模型),其訓(xùn)練過(guò)程涉及對(duì)海量數(shù)據(jù)進(jìn)行前向傳播和反向傳播,計(jì)算量極其龐大。GPU和TPU等專用加速器通過(guò)大規(guī)模并行處理(數(shù)據(jù)并行和模型并行)來(lái)加速訓(xùn)練??蚣苋鏣ensorFlow、PyTorch都內(nèi)置了自動(dòng)并行化機(jī)制。
(2)機(jī)器學(xué)習(xí)算法優(yōu)化:如大規(guī)模線性回歸、支持向量機(jī)(SVM)的分類/回歸任務(wù),以及聚類算法(如K-Means在大數(shù)據(jù)集上的應(yīng)用),都可以通過(guò)并行化加速。
(3)特征工程:對(duì)大規(guī)模數(shù)據(jù)集進(jìn)行特征提取和轉(zhuǎn)換(如PCA降維、文本向量化)也是計(jì)算密集型任務(wù),適合并行處理。
3.圖形與多媒體處理:
(1)實(shí)時(shí)3D圖形渲染:現(xiàn)代游戲引擎和實(shí)時(shí)可視化軟件需要同時(shí)處理數(shù)百甚至數(shù)千個(gè)光源、陰影和復(fù)雜的幾何體,GPU通過(guò)其龐大的流處理器(核心)并行處理這些渲染任務(wù),實(shí)現(xiàn)流暢的視覺(jué)效果。
(2)視頻編解碼:高級(jí)視頻編碼標(biāo)準(zhǔn)(如H.264/AVC,H.265/HEVC,AV1)的編解碼算法包含大量的變換(如DCT)、量化、反量化等步驟,這些步驟非常適合數(shù)據(jù)并行處理,以加速視頻壓縮和解壓縮過(guò)程。
(3)圖像處理與分析:對(duì)大規(guī)模圖像庫(kù)進(jìn)行特征提取、人臉識(shí)別、醫(yī)學(xué)影像(如CT、MRI)重建與分析等,可以分解為對(duì)單張或多張圖像的并行處理。
4.大數(shù)據(jù)處理與分析:
(1)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)查詢優(yōu)化:在分布式數(shù)據(jù)庫(kù)或數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)中,對(duì)大規(guī)模數(shù)據(jù)集進(jìn)行復(fù)雜的聚合查詢(如SUM,COUNT,AVG)、連接操作等,可以通過(guò)MapReduce、Spark等分布式計(jì)算框架在多個(gè)節(jié)點(diǎn)上并行執(zhí)行。
(2)機(jī)器學(xué)習(xí)模型的分布式訓(xùn)練:在云平臺(tái)或數(shù)據(jù)中心,使用多臺(tái)機(jī)器的GPU或CPU集群來(lái)訓(xùn)練超大規(guī)模的機(jī)器學(xué)習(xí)模型,以縮短訓(xùn)練時(shí)間并處理無(wú)法在單機(jī)上運(yùn)行的模型。
(3)自然語(yǔ)言處理(NLP):處理大規(guī)模文本語(yǔ)料庫(kù),進(jìn)行分詞、詞性標(biāo)注、命名實(shí)體識(shí)別、情感分析等任務(wù),這些任務(wù)可以分解為對(duì)文本塊的并行處理。
二、并行計(jì)算的關(guān)鍵技術(shù)
實(shí)現(xiàn)并行計(jì)算需要依賴一系列關(guān)鍵技術(shù),包括合適的硬件平臺(tái)、并行編程模型、高效的并行算法以及必要的數(shù)據(jù)管理策略。掌握這些技術(shù)是成功應(yīng)用并行計(jì)算的基礎(chǔ)。
(一)并行編程模型
并行編程模型是開(kāi)發(fā)者用來(lái)編寫(xiě)并行程序的抽象框架和規(guī)范,它定義了如何分配任務(wù)、管理數(shù)據(jù)、處理同步以及進(jìn)行通信。選擇合適的編程模型對(duì)于并行程序的性能和開(kāi)發(fā)效率至關(guān)重要。
1.OpenMP(OpenMulti-Processing):
(1)模型類型:主要基于共享內(nèi)存的多線程編程模型。它通過(guò)在現(xiàn)有串行代碼中插入編譯指令(Directives)、庫(kù)函數(shù)(RuntimeLibraryFunctions)和環(huán)境變量(Environments)來(lái)簡(jiǎn)單地將并行性添加到程序中。
(2)適用場(chǎng)景:非常適合數(shù)據(jù)并行任務(wù),特別是在多核CPU上執(zhí)行的科學(xué)計(jì)算和工程計(jì)算。它易于使用,對(duì)現(xiàn)有Fortran、C/C++代碼的并行化擴(kuò)展比較方便。
(3)核心功能:
-線程管理:`pragmaompparallel`指令用于創(chuàng)建一個(gè)線程團(tuán)隊(duì)(Team),并指定線程數(shù)(可選)。
-數(shù)據(jù)并行:`pragmaompparallelfor`指令可以將循環(huán)迭代分配給不同的線程執(zhí)行。
-任務(wù)并行:`pragmaompparallelsections`或`pragmaomptask`等指令用于并行執(zhí)行代碼塊或函數(shù)。
-同步:`pragmaompbarrier`、`pragmaompcritical`、`pragmaompatomic`等用于控制線程間的同步和數(shù)據(jù)訪問(wèn)。
-共享數(shù)據(jù):通過(guò)`pragmaompshared`或`pragmaompprivate`等管理變量在線程間的共享或私有狀態(tài)。
(4)優(yōu)點(diǎn):語(yǔ)法相對(duì)簡(jiǎn)單,與C/C++/Fortran等主流語(yǔ)言集成良好,對(duì)共享內(nèi)存模型的優(yōu)化比較成熟。
(5)缺點(diǎn):主要適用于共享內(nèi)存系統(tǒng),在分布式內(nèi)存系統(tǒng)(如多臺(tái)獨(dú)立的機(jī)器)上能力有限。
2.MPI(MessagePassingInterface):
(1)模型類型:基于消息傳遞的并行編程模型,是分布式內(nèi)存并行計(jì)算領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn)。它不依賴于共享內(nèi)存,而是通過(guò)顯式的消息發(fā)送(`MPI_Send`)和接收(`MPI_Receive`)操作來(lái)實(shí)現(xiàn)進(jìn)程(Process)間的通信和協(xié)作。
(2)適用場(chǎng)景:非常適合任務(wù)并行和需要跨網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行通信的計(jì)算密集型或通信密集型應(yīng)用,常用于構(gòu)建大規(guī)模分布式計(jì)算集群。在HPC領(lǐng)域占據(jù)主導(dǎo)地位。
(3)核心功能:
-進(jìn)程管理:程序啟動(dòng)時(shí)創(chuàng)建一組進(jìn)程,通常使用`MPI_Init`和`MPI_Comm_size`等函數(shù)。
-通信:提供豐富的點(diǎn)對(duì)點(diǎn)(`MPI_Send`,`MPI_Receive`)和集合通信(`MPI_Bcast`廣播、`MPI_Reduce`歸約、`MPI_Gather`收集、`MPI_Allreduce`全歸約等)操作。
-同步:`MPI_Wait`,`MPI_BARRIER`,`MPI_Synchronize`等用于進(jìn)程間的同步點(diǎn)。
-拓?fù)浣Y(jié)構(gòu):支持理解并利用計(jì)算網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(如網(wǎng)格、樹(shù))。
(4)優(yōu)點(diǎn):具有很高的靈活性和可移植性,可以在各種異構(gòu)的并行計(jì)算平臺(tái)上運(yùn)行(從超級(jí)計(jì)算機(jī)到工作站集群),是HPC的標(biāo)準(zhǔn)。
(5)缺點(diǎn):編程模型相對(duì)復(fù)雜,需要顯式管理進(jìn)程間的通信和同步,對(duì)程序員的要求較高,調(diào)試和性能優(yōu)化也更困難。
3.CUDA(ComputeUnifiedDeviceArchitecture):
(1)模型類型:NVIDIA推出的并行計(jì)算平臺(tái)和編程模型,允許開(kāi)發(fā)者使用C/C++等高級(jí)語(yǔ)言直接編寫(xiě)在GPU上執(zhí)行的代碼(稱為CUDA內(nèi)核,Kernel)。它利用GPU上眾多的流處理器(StreamingMultiprocessors,SMs)和線程(Threads)來(lái)實(shí)現(xiàn)極高的并行度。
(2)適用場(chǎng)景:特別適用于計(jì)算密集型、數(shù)據(jù)密集型且具有大規(guī)模數(shù)據(jù)并行潛力的應(yīng)用,如深度學(xué)習(xí)、物理模擬、圖像處理、分子動(dòng)力學(xué)等。是GPU計(jì)算領(lǐng)域的事實(shí)標(biāo)準(zhǔn)。
(3)核心功能:
-設(shè)備管理:檢測(cè)和選擇可用的GPU設(shè)備。
-內(nèi)存管理:在CPU和GPU之間以及GPU內(nèi)部(全局內(nèi)存、共享內(nèi)存、寄存器)傳輸數(shù)據(jù)。需要顯式管理數(shù)據(jù)拷貝。
-內(nèi)核啟動(dòng):將編譯好的CUDA內(nèi)核代碼加載到GPU,并組織成線程束(Warp)在流處理器上執(zhí)行。需要定義線程塊(Block)和線程網(wǎng)格(Grid)的維度來(lái)管理線程組織。
-原子操作:提供原子加、減等操作,用于線程塊內(nèi)或跨線程塊的同步。
(4)優(yōu)點(diǎn):能夠充分利用GPU的強(qiáng)大并行計(jì)算能力,性能潛力巨大,開(kāi)發(fā)工具鏈(如NVIDIACUDAToolkit,Nsight)完善。
(5)缺點(diǎn):代碼主要運(yùn)行在NVIDIAGPU上,可移植性較差。內(nèi)存管理復(fù)雜,容易出錯(cuò)。對(duì)開(kāi)發(fā)者的硬件知識(shí)要求較高。
4.其他模型:
(1)OpenCL(OpenComputingLanguage):一個(gè)跨平臺(tái)的并行編程框架,支持CPU、GPU、FPGA等多種計(jì)算設(shè)備。語(yǔ)法基于C語(yǔ)言,但增加了并行編程的擴(kuò)展。適合需要跨硬件平臺(tái)進(jìn)行異構(gòu)計(jì)算的場(chǎng)合。
(2)IntelTBB(ThreadingBuildingBlocks):Intel提供的一套C++模板庫(kù),提供高級(jí)的并行編程抽象,如任務(wù)調(diào)度器、并行算法等,簡(jiǎn)化了基于共享內(nèi)存的多線程編程。
(3)HPX(High-PerformanceComputingLibrary):一個(gè)現(xiàn)代的C++并行編程框架,旨在簡(jiǎn)化分布式和共享內(nèi)存并行編程,提供統(tǒng)一的編程模型。
2.并行算法設(shè)計(jì):
(1)任務(wù)分解(TaskDecomposition):
-目標(biāo):將原始計(jì)算任務(wù)有效地分解為多個(gè)獨(dú)立的或弱依賴的子任務(wù),這些子任務(wù)能夠被不同的并行單元同時(shí)執(zhí)行。
-方法:分析任務(wù)的內(nèi)在結(jié)構(gòu),識(shí)別可以并行執(zhí)行的操作。例如,在矩陣運(yùn)算中分解為元素級(jí)計(jì)算;在圖算法中分解為節(jié)點(diǎn)或邊的處理。分解策略需要考慮任務(wù)間的依賴關(guān)系,避免數(shù)據(jù)競(jìng)爭(zhēng)和死鎖。
(2)數(shù)據(jù)分割(DataPartitioning):
-目標(biāo):將需要處理的大數(shù)據(jù)集分割成多個(gè)小數(shù)據(jù)塊,以便并行地處理這些數(shù)據(jù)塊。對(duì)于數(shù)據(jù)并行,這是關(guān)鍵步驟。
-方法:根據(jù)數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)和訪問(wèn)模式進(jìn)行分割。常見(jiàn)的分割方式有:
-循環(huán)劃分(LoopPartitioning):將循環(huán)的迭代變量(如矩陣的行或列)分配給不同的并行單元。
-數(shù)據(jù)劃分(DataPartitioning):將數(shù)據(jù)集沿某個(gè)維度(如列、塊)劃分,每個(gè)單元獲得數(shù)據(jù)的一個(gè)子集。
-空間劃分(SpatialPartitioning):將計(jì)算空間(如圖的鄰域、網(wǎng)格)劃分給不同的單元。
-考慮因素:分割方式應(yīng)盡量保證數(shù)據(jù)局部性(DataLocality),即被同一并行單元訪問(wèn)的數(shù)據(jù)盡可能存儲(chǔ)在相鄰的內(nèi)存位置,以減少內(nèi)存訪問(wèn)延遲。同時(shí),分割粒度需要適中,過(guò)細(xì)會(huì)增加通信開(kāi)銷,過(guò)粗則可能造成負(fù)載不平衡。
(3)約束管理(ConstraintManagement/Synchronization):
-目標(biāo):管理并行單元(線程、進(jìn)程)之間的依賴關(guān)系和執(zhí)行順序,確保計(jì)算的正確性。
-方法:
-同步點(diǎn)(Barriers):確保所有并行單元到達(dá)某個(gè)點(diǎn)后再繼續(xù)執(zhí)行。
-鎖(Locks):用于保護(hù)共享資源,防止多個(gè)并行單元同時(shí)修改同一資源(如互斥訪問(wèn)計(jì)數(shù)器)。常見(jiàn)的有互斥鎖(Mutex)、讀寫(xiě)鎖(RWLock)。
-原子操作(AtomicOperations):執(zhí)行不可中斷的操作,常用于實(shí)現(xiàn)無(wú)鎖(Lock-Free)算法,減少鎖的開(kāi)銷。
-消息傳遞(MessagePassing):如MPI中的`MPI_Send`/`MPI_Receive`,顯式地控制數(shù)據(jù)的發(fā)送和接收時(shí)機(jī),隱式地管理依賴關(guān)系。
-條件變量(ConditionVariables):允許線程等待某個(gè)特定條件成立后再繼續(xù)執(zhí)行。
-考慮因素:同步操作是并行計(jì)算中的主要性能瓶頸之一。設(shè)計(jì)算法時(shí)應(yīng)盡量減少不必要的同步,采用更高效的同步機(jī)制(如原子操作、無(wú)鎖算法),并盡量減少并行單元間的依賴。
3.并行計(jì)算平臺(tái)
(1)多核CPU(Multi-coreCPUs):
-架構(gòu):現(xiàn)代服務(wù)器和工作站普遍采用多核CPU,核數(shù)從幾個(gè)到幾十個(gè)不等。同一CPU芯片上的核心通常共享內(nèi)存控制器和高速緩存(Cache),屬于共享內(nèi)存系統(tǒng)。
-并行方式:主要利用OpenMP、TBB、C++11/14/17的線程庫(kù)(如`<thread>`,`<mutex>`)等在單機(jī)上進(jìn)行多線程并行計(jì)算。
-特點(diǎn):編程相對(duì)簡(jiǎn)單(尤其對(duì)于OpenMP),適合中小規(guī)模并行任務(wù),延遲較低,但每個(gè)核心的計(jì)算能力相對(duì)有限。
(2)GPU加速器(GPUAccelerators):
-架構(gòu):GPU擁有成百上千個(gè)相對(duì)簡(jiǎn)單的流處理器(核心),設(shè)計(jì)用于高吞吐量的并行計(jì)算,特別擅長(zhǎng)處理大規(guī)模數(shù)據(jù)并行任務(wù)。GPU內(nèi)存(通常是高帶寬的GDDR或HBM)與CPU內(nèi)存是分離的,需要顯式數(shù)據(jù)傳輸。
-并行方式:主要利用CUDA、OpenCL、ROCm(AMD)等平臺(tái)在GPU上執(zhí)行大規(guī)模并行計(jì)算。開(kāi)發(fā)者需要編寫(xiě)能在GPU線程和線程塊上執(zhí)行的內(nèi)核函數(shù)。
-特點(diǎn):計(jì)算密度高,內(nèi)存帶寬大,特別適合深度學(xué)習(xí)、科學(xué)計(jì)算、圖像處理等領(lǐng)域。編程相對(duì)復(fù)雜,需要管理CPU-GPU數(shù)據(jù)傳輸開(kāi)銷。
(3)分布式計(jì)算集群(DistributedComputingClusters):
-架構(gòu):由多臺(tái)通過(guò)網(wǎng)絡(luò)(通常是高速以太網(wǎng),如InfiniBand或RoCE)互連的計(jì)算機(jī)(節(jié)點(diǎn))組成。每個(gè)節(jié)點(diǎn)通常包含一個(gè)或多個(gè)CPU,可能還配有本地內(nèi)存、本地存儲(chǔ)和本地網(wǎng)絡(luò)接口。節(jié)點(diǎn)間通過(guò)消息傳遞進(jìn)行通信。
-并行方式:主要利用MPI進(jìn)行節(jié)點(diǎn)間的進(jìn)程級(jí)并行計(jì)算。每個(gè)節(jié)點(diǎn)上的計(jì)算可以進(jìn)一步利用OpenMP或多線程庫(kù)進(jìn)行多核并行。常見(jiàn)的集群架構(gòu)有網(wǎng)格(Grid)、對(duì)等(Peer-to-Peer)和共享nothing(Shared-Nothing)。
-特點(diǎn):規(guī)模巨大,可以提供PB級(jí)別的內(nèi)存和計(jì)算能力,適合超大規(guī)??茖W(xué)計(jì)算、商業(yè)智能、大規(guī)模機(jī)器學(xué)習(xí)訓(xùn)練等。編程復(fù)雜度高(尤其是MPI),通信開(kāi)銷是主要性能瓶頸,需要考慮網(wǎng)絡(luò)帶寬、延遲和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。
三、并行計(jì)算的最佳實(shí)踐
為了充分利用并行計(jì)算的優(yōu)勢(shì),避免常見(jiàn)的陷阱,提高程序的性能和可維護(hù)性,開(kāi)發(fā)者應(yīng)遵循一系列最佳實(shí)踐。
(一)任務(wù)分解與優(yōu)化
1.選擇適合并行化的算法:
-評(píng)估算法的并行性:并非所有算法都容易并行化。優(yōu)先選擇那些具有天然并行結(jié)構(gòu)(如循環(huán)獨(dú)立、數(shù)據(jù)獨(dú)立)的算法。例如,矩陣乘法、排序(如快速排序的部分劃分)、傅里葉變換等適合數(shù)據(jù)并行;而搜索、拓?fù)渑判虻瓤赡芨m合任務(wù)并行。
-避免或減少內(nèi)在依賴:識(shí)別并嘗試消除或減少任務(wù)/數(shù)據(jù)之間的依賴關(guān)系。對(duì)于強(qiáng)依賴的任務(wù),需要仔細(xì)設(shè)計(jì)同步策略,避免不必要的等待。
2.進(jìn)行有效的數(shù)據(jù)分割:
-考慮數(shù)據(jù)訪問(wèn)模式:分割方式應(yīng)盡量與數(shù)據(jù)的訪問(wèn)模式相匹配,以最大化數(shù)據(jù)局部性。例如,對(duì)于需要頻繁訪問(wèn)連續(xù)內(nèi)存的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)(如數(shù)組),循環(huán)劃分通常效果較好。
-平衡負(fù)載:確保分割后的子任務(wù)或數(shù)據(jù)塊大小大致相等,避免某些并行單元過(guò)載而其他單元空閑。可以使用動(dòng)態(tài)負(fù)載平衡策略,但會(huì)增加復(fù)雜性。
-最小化數(shù)據(jù)遷移開(kāi)銷:對(duì)于分布式內(nèi)存系統(tǒng)(如MPI集群),數(shù)據(jù)分割時(shí)要考慮節(jié)點(diǎn)間的數(shù)據(jù)傳輸成本。盡量讓每個(gè)節(jié)點(diǎn)處理與其本地?cái)?shù)據(jù)緊密相關(guān)的計(jì)算任務(wù)。
3.合理設(shè)計(jì)并行單元間的協(xié)作:
-顯式管理依賴:對(duì)于需要協(xié)作的任務(wù),明確它們之間的依賴關(guān)系,并選擇合適的同步機(jī)制(如鎖、條件變量、消息傳遞)來(lái)保證執(zhí)行順序和數(shù)據(jù)一致性。
-減少同步點(diǎn):同步操作會(huì)引入開(kāi)銷。盡量減少不必要的同步點(diǎn),例如,使用原子操作代替鎖,或者設(shè)計(jì)無(wú)鎖算法。
-利用并行編程庫(kù)的抽象:使用成熟的并行編程庫(kù)(如OpenMP,TBB,HPX,MPI)提供的并行算法和數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),可以簡(jiǎn)化編程并利用庫(kù)內(nèi)部的優(yōu)化。
(二)性能調(diào)優(yōu)
1.使用性能分析工具(ProfilingTools):
-識(shí)別性能瓶頸:在開(kāi)發(fā)過(guò)程中和部署后,使用性能分析工具(如NVIDIANsight,IntelVTuneProfiler,AMDuProf,`perf`forLinux,OpenMPruntimelibrary的查詢功能等)來(lái)識(shí)別程序中的熱點(diǎn)(Hotspots),即消耗最多CPU時(shí)間或I/O時(shí)間的代碼段。
-分析并行效率:檢查并行區(qū)域的執(zhí)行效率,如線程利用率、GPU利用率、通信帶寬利用率等。分析同步開(kāi)銷、內(nèi)存訪問(wèn)模式、數(shù)據(jù)傳輸瓶頸等。
-指導(dǎo)優(yōu)化方向:根據(jù)分析結(jié)果,有針對(duì)性地對(duì)瓶頸部分進(jìn)行優(yōu)化。
2.優(yōu)化內(nèi)存訪問(wèn):
-最大化數(shù)據(jù)局部性:遵循“緩存友好”的設(shè)計(jì)原則。盡量讓并行單元訪問(wèn)連續(xù)的內(nèi)存地址,利用CPU緩存和GPU共享內(nèi)存。對(duì)于數(shù)據(jù)并行,確保每個(gè)核心處理的數(shù)據(jù)塊存儲(chǔ)在內(nèi)存中彼此靠近的位置。
-減少內(nèi)存帶寬壓力:避免不必要的內(nèi)存讀寫(xiě)操作。對(duì)于GPU編程,合理使用共享內(nèi)存(SharedMemory)來(lái)緩存頻繁訪問(wèn)的數(shù)據(jù),可以顯著減少對(duì)全局內(nèi)存(GlobalMemory)的訪問(wèn),因?yàn)楣蚕韮?nèi)存訪問(wèn)速度更快且延遲更低。
-考慮內(nèi)存對(duì)齊:確保數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和內(nèi)存訪問(wèn)符合硬件的內(nèi)存對(duì)齊要求,以提高訪問(wèn)效率。
3.減少通信開(kāi)銷(針對(duì)分布式內(nèi)存系統(tǒng)):
-批量通信:盡量使用批量發(fā)送/接收(`MPI_Bsend`,`MPI_Wsend`,`MPI_Sendrecv`,`MPI_Alltoallv`等)代替單個(gè)發(fā)送/接收,以減少通信啟動(dòng)開(kāi)銷。
-重疊計(jì)算與通信:在可能的情況下,讓通信操作與計(jì)算操作并行執(zhí)行(如使用MPI的阻塞/非阻塞通信與計(jì)算重疊)。NVIDIAMPI等庫(kù)提供了這樣的功能。
-選擇合適的通信模式:根據(jù)應(yīng)用需求選擇最合適的集合通信操作(如`Bcast`、`Reduce`、`Gather`、`Scatter`等),避免使用開(kāi)銷過(guò)大的操作。
-考慮網(wǎng)絡(luò)拓?fù)洌毫私庥?jì)算集群的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(如樹(shù)狀、網(wǎng)格),并選擇能夠適應(yīng)該拓?fù)涞耐ㄐ潘惴ê蛿?shù)據(jù)傳輸策略。
4.利用硬件特性:
-發(fā)揮GPU并行能力:在GPU上編程時(shí),合理組織線程塊和線程網(wǎng)格的尺寸,以最大化GPU的并行計(jì)算效率。參考NVIDIA的最佳實(shí)踐指南。
-使用多核CPU的同步指令:現(xiàn)代CPU提供了如Intel的TSX(TransactionalSynchronizationExtensions)等技術(shù),可以在某些場(chǎng)景下減少鎖的開(kāi)銷,可以研究是否適用于特定應(yīng)用。
(三)容錯(cuò)與可靠性
1.實(shí)現(xiàn)檢查點(diǎn)與恢復(fù)機(jī)制(CheckpointingandRecovery):
-定義檢查點(diǎn):定期(或在關(guān)鍵計(jì)算步驟后)保存程序的狀態(tài),包括全局變量、共享內(nèi)存內(nèi)容、GPU內(nèi)存內(nèi)容(如果適用)、以及程序的執(zhí)行進(jìn)度(如當(dāng)前迭代次數(shù))。
-實(shí)現(xiàn)恢復(fù):在計(jì)算失?。ㄈ缬布收?、軟件錯(cuò)誤導(dǎo)致崩潰)后,能夠從最近的檢查點(diǎn)加載狀態(tài),并恢復(fù)執(zhí)行,避免從頭開(kāi)始,從而節(jié)省大量時(shí)間。
-考慮點(diǎn):檢查點(diǎn)的保存和恢復(fù)過(guò)程本身會(huì)帶來(lái)額外的計(jì)算開(kāi)銷和存儲(chǔ)空間需求。需要權(quán)衡開(kāi)銷與容錯(cuò)收益。需要考慮跨節(jié)點(diǎn)恢復(fù)的復(fù)雜性。
2.設(shè)計(jì)魯棒的并行算法:
-減少故障影響范圍:設(shè)計(jì)算法時(shí)考慮故障的可能性,盡量減少一個(gè)并行單元的失敗對(duì)整個(gè)程序的影響。例如,設(shè)計(jì)容錯(cuò)的通信協(xié)議或分布式計(jì)算算法。
-使用冗余計(jì)算:對(duì)于關(guān)鍵結(jié)果,可以采用“三重計(jì)算后選最大/最小值”或“多數(shù)投票”等冗余計(jì)算技術(shù),即使部分計(jì)算單元失敗,也能保證結(jié)果的正確性(以犧牲一定性能為代價(jià))。
3.監(jiān)控與日志記錄:
-實(shí)時(shí)監(jiān)控:在并行程序運(yùn)行時(shí),監(jiān)控關(guān)鍵性能指標(biāo)(如計(jì)算利用率、內(nèi)存使用、通信速率、同步延遲等)和硬件狀態(tài)(如溫度、電壓),及時(shí)發(fā)現(xiàn)異常。
-詳細(xì)日志:記錄程序的執(zhí)行日志,包括并行單元的啟動(dòng)、結(jié)束、同步事件、錯(cuò)誤信息等。這有助于調(diào)試并行程序中的復(fù)雜問(wèn)題,尤其是在出現(xiàn)故障時(shí)。
四、并行計(jì)算的應(yīng)用案例
通過(guò)具體的應(yīng)用案例,可以更直觀地理解并行計(jì)算的關(guān)鍵技術(shù)和最佳實(shí)踐是如何在不同場(chǎng)景下應(yīng)用的。
(一)科學(xué)計(jì)算案例:流體力學(xué)模擬
1.應(yīng)用背景:計(jì)算流體力學(xué)(CFD)是研究流體(液體和氣體)運(yùn)動(dòng)規(guī)律的重要學(xué)科,廣泛應(yīng)用于航空航天、汽車工程、能源、環(huán)境等領(lǐng)域。CFD模擬通常涉及求解復(fù)雜的偏微分方程(如N-S方程),計(jì)算量巨大,是典型的并行計(jì)算應(yīng)用。
2.并行化策略:
(1)空間分解(數(shù)據(jù)并行):將計(jì)算域(如計(jì)算空間劃分為網(wǎng)格)分割成多個(gè)子域,每個(gè)子域分配給一個(gè)MPI進(jìn)程或一個(gè)CPU核心處理。每個(gè)進(jìn)程/核心計(jì)算其子域內(nèi)的流體動(dòng)量、壓力等變量。
(2)時(shí)間分解(任務(wù)并行):將模擬過(guò)程按時(shí)間步長(zhǎng)推進(jìn),每個(gè)時(shí)間步的計(jì)算可以分配給不同的并行單元?;蛘撸瑢⒁粋€(gè)時(shí)間步內(nèi)的多個(gè)物理過(guò)程(如對(duì)流、擴(kuò)散、湍流模型計(jì)算)分解為并行任務(wù)。
(3)負(fù)載平衡:由于網(wǎng)格邊界、激波、分離流等局部現(xiàn)象會(huì)導(dǎo)致計(jì)算量不均,需要采用動(dòng)態(tài)負(fù)載平衡策略,如動(dòng)態(tài)調(diào)整子域大小或任務(wù)分配,以保持所有并行單元的負(fù)載均衡。
(4)數(shù)據(jù)交換(通信):相鄰子域之間存在流體交換(速度、壓力),需要在并行單元間進(jìn)行數(shù)據(jù)交換(如使用MPI的邊界交換通信模式,如`MPI_Bcast`,`MPI_Sendrecv`,`MPI_Alltoall`等)來(lái)更新邊界條件。
3.編程模型選擇:對(duì)于CPU集群,MPI是主流選擇,用于進(jìn)程間的通信和同步。每個(gè)進(jìn)程內(nèi)部可以使用OpenMP來(lái)利用多核CPU進(jìn)行并行計(jì)算。對(duì)于GPU加速,可以使用CUDA或OpenCL將計(jì)算核心部署到GPU上,并通過(guò)CPU-GPU數(shù)據(jù)傳輸(如CUDA內(nèi)存拷貝)與CPU側(cè)代碼交互。
4.性能優(yōu)化關(guān)注點(diǎn):優(yōu)化網(wǎng)格數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)以加速內(nèi)存訪問(wèn);使用高效的通信算法減少邊界數(shù)據(jù)交換開(kāi)銷;利用GPU的并行能力加速計(jì)算密集型的物理模型求解(如湍流模型);設(shè)計(jì)高效的同步策略以平衡計(jì)算和通信。
(二)人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí)案例:深度學(xué)習(xí)模型訓(xùn)練
1.應(yīng)用背景:現(xiàn)代深度學(xué)習(xí)模型(尤其是大型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò))的訓(xùn)練需要處理海量數(shù)據(jù),進(jìn)行多次前向傳播和反向傳播,計(jì)算量極其龐大。單機(jī)訓(xùn)練往往耗時(shí)過(guò)長(zhǎng),甚至無(wú)法完成。并行計(jì)算是加速深度學(xué)習(xí)訓(xùn)練的關(guān)鍵。
2.并行化策略:
(1)數(shù)據(jù)并行(DistributedDataParallel,DDP):這是最常用的并行策略。將訓(xùn)練數(shù)據(jù)集分割成多個(gè)批次(Batches),每個(gè)批次分配給一個(gè)GPU或一個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)。在每個(gè)訓(xùn)練步驟中,所有GPU并行地執(zhí)行相同的前向傳播和反向傳播,更新共享的模型參數(shù)。參數(shù)更新通過(guò)All-reduce算法(如使用NCCL庫(kù))聚合來(lái)自所有GPU的梯度信息。
(2)模型并行(ModelParallelism):對(duì)于超大型模型,其尺寸可能超過(guò)單個(gè)GPU的內(nèi)存容量。此時(shí)需要將模型的不同部分(如不同的層)分配到不同的GPU上執(zhí)行。這通常需要更復(fù)雜的編程控制,并需要處理跨GPU的通信(如使用`nn.DataParallel`或`nn.parallel.DistributedDataParallel`在PyTorch中,或`tf.distribute.Strategy`在TensorFlow中)。
(3)流水線并行(PipelineParallelism):將模型分割成多個(gè)階段,每個(gè)階段由不同的GPU處理,數(shù)據(jù)從前一個(gè)階段流到下一個(gè)階段。這可以隱藏GPU之間的通信延遲。
(4)混合并行:通常結(jié)合數(shù)據(jù)并行、模型并行和流水線并行等多種策略來(lái)處理超大規(guī)模模型。
3.編程框架與庫(kù):現(xiàn)代深度學(xué)習(xí)框架(如TensorFlow,PyTorch,JAX)都內(nèi)置了對(duì)分布式訓(xùn)練的支持,提供了簡(jiǎn)化的API(如`DistributedDataParallel`
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