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文檔簡(jiǎn)介
第2章染色體與DNA
名詞解釋
原癌基因:細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞增殖相關(guān)的正?;?,是維持機(jī)體正常生命活動(dòng)所必須的,在進(jìn)化
上高等保守.當(dāng)原癌基因的結(jié)構(gòu)或調(diào)控區(qū)發(fā)生變異,基因產(chǎn)物增多或活性增強(qiáng)時(shí),使細(xì)胞
過(guò)度增殖,從而形成腫瘤,
復(fù)制:以親代DNA或RNA為模板,根據(jù)堿基配對(duì)的原則,在一系列酹的作用下,生成與親代
相同的子代DNA或RNA的過(guò)程。
轉(zhuǎn)座子(transposon或transposableelement):位于染色體DNA上可自主復(fù)制和位移的
基木單位。包括插入序列和復(fù)合轉(zhuǎn)座子。
半保留復(fù)制:以親代DNA雙鏈為模板以堿基互補(bǔ)方式合成子代D5IA,這樣新形成的子代DMA
中,一條鏈來(lái)自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制。
染色體:染色體是遺傳信息的載體,由DNA、RNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其形態(tài)和數(shù)目具有種系
的特性。在細(xì)胞間期核中,以染色質(zhì)形式存在。在細(xì)胞分裂時(shí),染色質(zhì)絲經(jīng)過(guò)螺旋化、折疊、
包裝成為染色體,為顯微鏡;下可見(jiàn)的具不同形狀的小體。
核小體:是構(gòu)成真核生物染色體的基本單位,是DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成的緊密結(jié)構(gòu)形式,包括
2OObp左右的DNA和9個(gè)組蛋白分子構(gòu)成的致密結(jié)構(gòu)。
填空題
L真核細(xì)胞核小體的組成是一DNA和蛋白
2.天然見(jiàn)色體末端不能與其他染色體斷裂片段發(fā)生連接,這是因?yàn)樘烊蝗旧w末端存在遍拉
結(jié)構(gòu)。
3.在聚合酶鏈反應(yīng)中,除了需要模板DNA外,還需加入引物、DNA聚合酶、dNTP和鎂離子。
4.引起DNA損傷的因素有自發(fā)因素、物理因素、化學(xué)因素。
5.DNA復(fù)制時(shí)與DNA解鏈有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)有拓?fù)洚悩?gòu)酶II、解螺旋酶、單鏈DNA結(jié)合蛋
旦。
6.參與DNA切除修復(fù)的酶有DNA聚合酶I、DNA連接有、特異的核酸內(nèi)切酶。
7.在真核生物中DNA豆制的主要酶是DNA聚合酶6。在原核生物中是DNA聚合酶用。
8.端粒酶是端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄是。
9.DNA的修復(fù)方式有錯(cuò)配修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核昔酸切除修復(fù)、DNA的直接修復(fù)。
選擇題
1.真核生物復(fù)制起點(diǎn)的特征包括(B)
A.富含G-C區(qū)B.富含A-T區(qū)C.乙DNAD.無(wú)明顯特征
2.插入序列(IS)編碼(A)
A.轉(zhuǎn)座酶B.逆轉(zhuǎn)錄酶CDNA合成酶D.核糖核酸酶
3.紫外線照射對(duì)DNA分子的損傷主要是(D)
A.堿基替換B.磷酸脂鍵斷裂Co堿基丟失D.形成共價(jià)連接的喀唯二聚體
4.自然界中以DNA為遺傳物質(zhì)的大多數(shù)生物DNA的復(fù)制方式(C)
A.環(huán)式B.D環(huán)式C.半保留D.全保留
5.原核生物基因組中沒(méi)有(A)
A.內(nèi)含子B.外顯子C.轉(zhuǎn)錄因子D.插入序列
6.關(guān)于組蛋白下列說(shuō)法正確的是(D)
A.為中性蛋白B.為酸性蛋白C.進(jìn)化上不具保守性D.染色體結(jié)合蛋白
7.DNA聚合酶I(C)
A.是復(fù)制酣,但不是修復(fù)海B.沒(méi)有模板依賴性C.有5'-3'外切陋活性
D.5Z-3'聚合酶活性極強(qiáng)
簡(jiǎn)述DNA復(fù)制的過(guò)程
DNA的復(fù)制過(guò)程可被分為3個(gè)階段,即復(fù)制的起始、延伸和終止。每個(gè)DNA復(fù)制的
獨(dú)立單元主要包括復(fù)制起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。
DNA復(fù)制的起始包括預(yù)引發(fā)和引發(fā)兩個(gè)階段,在預(yù)引發(fā)階段,DNA解旋解鏈,形成復(fù)
制叉,引發(fā)體組裝;在引發(fā)階段,在引發(fā)酶的催化下以DNA鏈為模板合成一段短的RNA引物。
復(fù)制時(shí)DNA鏈的延伸由DNA聚合酣催化,以親代DNA鏈為模板,引發(fā)體移動(dòng),從5,一3,
方向聚合子代DNA鏈。當(dāng)子鏈延伸到達(dá)終止位點(diǎn)是,DNA復(fù)制就終止了,切除RNA引物,填
補(bǔ)缺口,在DNA連接酶的催化下將相鄰的岡崎片段連接起來(lái)形成完整的DNA長(zhǎng)鏈。
試述真原核生物的DNA復(fù)制的特點(diǎn)的不同之處
①真核生物染色體有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn),多及制眼,呈雙向及制,多復(fù)制子。原核生物的染
色體只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn),單復(fù)制子也呈雙向復(fù)制。
②真核生物岡崎片段長(zhǎng)約200bp比原核生物略短。真核生物DNA復(fù)制速度比原核慢,速
度為1000?3000bp/min(僅為原核生物的1/20?1/50)。
③真核生物復(fù)制的終止在端粒處,原核生物的復(fù)制叉相遇時(shí)即終止。
④真核生物染色體在全部復(fù)制完之前起點(diǎn)不再重新開(kāi)始復(fù)制;而在快速生長(zhǎng)的原核生物
染色體DNA復(fù)制中,起點(diǎn)可以連續(xù)發(fā)動(dòng)復(fù)制。真核生物快速生長(zhǎng)時(shí),往往采用更多的復(fù)制起
點(diǎn)。
⑤真核生物有多種DNA聚合酶,DNA聚合酶6是真正的復(fù)制酶,在PCNA存在下有持續(xù)
的合成能力。PCNA稱為增殖細(xì)胞核抗原,相當(dāng)于大腸桿菌DNA聚合酶III的B-夾子,RFC蛋
白相當(dāng)于夾子裝配器。
原核生物的DNA聚合酶有三種DNA聚合酶HIDNA的真正復(fù)制酶:多亞基酶,含十種亞基,
該酶DNA合成的持續(xù)能力強(qiáng)。
⑥真核生物線性染色體兩端有端粒結(jié)構(gòu),它是由許多成串的重短復(fù)序列組成,端粒功能
是穩(wěn)定染色體末段結(jié)構(gòu),防止染色體間的末端連接,并可補(bǔ)償滯后鏈5'-末段在消除RNA
引物后造成的空缺,使染色體保持一定長(zhǎng)度。端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。
⑦RPA:真核生物的單鏈結(jié)合蛋白;RNaseHl和MF-1切除RNA引物,DNA聚合酶£填補(bǔ)
缺口。
簡(jiǎn)述半保留復(fù)制的生物學(xué)意義
DNA的復(fù)制過(guò)程(以大腸桿菌為例)
復(fù)制起始:
(1)、拓?fù)洚悩?gòu)能解開(kāi)超螺旋。
(2)、DnaA蛋白識(shí)別并在ATP存在下結(jié)合于四個(gè)9bp的重復(fù)序列。
(3)、在類組蛋白(HU、ATP參與下,DanA蛋白變性13個(gè)bp的重復(fù)序列,形成開(kāi)鏈復(fù)合物。
(4)、DnaB借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在DnaC的幫助下沿式一3,方向移動(dòng),解開(kāi)DNA
雙鏈,形成前引發(fā)復(fù)合物,
(5)、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈.
(6)、引物合成酶(DnaG蛋白)開(kāi)始合成RNA引物。
鏈的延長(zhǎng)(岡崎片段的合成):
在DNA聚合前山的催化下,以四種5:脫氧核甘三磷酸為底物,在RNA引物的3,端以磷酸
二酯鍵連接上脫氧核糖核昔酸并釋放出焦磷酸。DNA鏈的延伸同時(shí)進(jìn)行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的
合成。兩條鏈方向相反。
6、PCR的基本原理?
PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體
外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,
以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合醒以dNTP為
原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA,PCR全過(guò)程每一步的轉(zhuǎn)換是通過(guò)溫度的改變來(lái)控制
的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,
即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個(gè)步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就
可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94"C。退火:弓物+
單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70。左右,TaqDNA聚合酶以4種dNTP
為原料,以目的DNA為模板,催化以引物3沫端為起點(diǎn)的夕玲3RNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA
鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過(guò)變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),
使目的DNA得到高效快速擴(kuò)噌.
第三章
啟動(dòng)子:是一段位于結(jié)構(gòu)基因5,端上游區(qū)的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之與模板
DNA準(zhǔn)確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。指RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的一段
特定的DNA序列。
增強(qiáng)子:能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的序列稱為增強(qiáng)子。
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,按照堿基配對(duì)原則合成RNA,即將DNA所含的遺傳信息傳給RNA,形
成一條與DNA鏈互補(bǔ)的RNA的過(guò)程。
RNA的編輯:是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,它導(dǎo)致了DNA所編碼的遺傳信
息的改變。
外顯子(Exon):真核細(xì)胞基因DNA中的編碼序歹U,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA并進(jìn)而翻譯為
蛋白質(zhì)。
內(nèi)含子(Intron):真核細(xì)胞基因DNA中的間插序列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA,但隨即被剪除
而不翻譯。
復(fù)制子:生.物體的復(fù)制單位稱為復(fù)制子(replicon),是在同一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)控制下的一段DNA
序列。
轉(zhuǎn)錄單元:是一段啟動(dòng)子開(kāi)始至終止子結(jié)束的DNA序列。
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn):是與新生RNA鏈的第一個(gè)核甘酸相對(duì)應(yīng)的DNA鏈上的堿基,通常為一個(gè)喋吟。
轉(zhuǎn)錄開(kāi)始時(shí)模板上的第一個(gè)堿基,在原核中常為A或G,而且位置固定。
填空
]轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程包括:模板識(shí)別,轉(zhuǎn)錄起始,轉(zhuǎn)錄的延伸,轉(zhuǎn)錄的終止。
2基因表達(dá)包括:轉(zhuǎn)錄和翻譯兩個(gè)階段。
3RNA的編輯方式:堿基突變,尿甘酸的缺失和添加。
4在原核牛.物中,-35區(qū)在-10區(qū)之間的距離大約是16~19bp
5帽子結(jié)構(gòu)的功能:(1)在翻譯中起識(shí)別作用12)使mRNA免遭核甘酸的破壞
6原核生物只有二種RNA聚合酶而真核生物有三種,每一種都有其特定的功能。聚合酶1合
成四,聚合酶II合成邂&聚合酶IH合成tRNA和5srRNA。三種聚合酶都是具有多亞基
的大的蛋白復(fù)合體。
7轉(zhuǎn)錄因子通常具有兩個(gè)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域:一個(gè)結(jié)合DNA,一個(gè)邀適轉(zhuǎn)錄。
8在真核細(xì)胞mRNA的修飾中,“帽子”結(jié)構(gòu)由甲基組成,“尾”由多聚腺喋吟組成。
9原核生物的絕大部分起啟動(dòng)子都存在共同的序列,即位于TObp處的區(qū)和-35bp處
的區(qū),他們都是RNA聚合的與扇動(dòng)子結(jié)合的位點(diǎn),能與。因子相互識(shí)別而具高度親和
性。真核生物中,在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-25-—35bp處有區(qū)和位于-70—8()用處
的區(qū)。
選擇題
16因子的結(jié)合依靠(A)
A對(duì)■啟動(dòng)子共有序列的長(zhǎng)度和間隔的識(shí)別
B與核心酶的相互作用
C翻譯起始密碼子的距離
D轉(zhuǎn)錄單位的長(zhǎng)度
2下列哪一項(xiàng)是對(duì)三元轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的正確描述(C)
A6因子、核心的和雙鏈DNA在啟動(dòng)子形成的復(fù)合物
B全酶、TFI和解鏈DNA雙鏈形成的復(fù)合物
C全晦、模板DNA和新生RXA形成的更合物
D三個(gè)全酶在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)形成的復(fù)合物
38因子和DNA之間相互的最佳描述是(0
A游離和與DNA結(jié)合的6因子的數(shù)量是一樣的,而且3因子合成的越多,轉(zhuǎn)錄起始的機(jī)會(huì)越
大
B3因子通常與DNA結(jié)合,且沿著DNA搜尋,直到在啟動(dòng)子碰到核心胸,他與DNA的結(jié)合不
需要依靠核心酶
C6因子通常與DNA結(jié)合,且沿著DNA搜尋,直到碰到信動(dòng)子,再有核心酶存在時(shí)與之結(jié)合
D8因子加入三元復(fù)合物而啟動(dòng)RNA合成
46因子專一性表現(xiàn)在(B)
A8因子修飾酶催化S因子變構(gòu),使其成為可識(shí)別應(yīng)激啟動(dòng)子的8因子
B不同基因編碼識(shí)別不同啟動(dòng)子的6因子
C不同細(xì)菌產(chǎn)生可互換的B因子
D5因子參與起始依靠特定的核心酶
5在大腸桿菌的熱激反應(yīng)中,某些蛋白質(zhì)表達(dá)的開(kāi)啟和關(guān)閉的機(jī)制是(C)
A溫度升高使特定阻抑蛋白失活
B編碼熱敏感蛋白的基因的啟動(dòng)子區(qū)域在較高溫度下發(fā)生變形
C在高溫時(shí)合成新的8因子,調(diào)節(jié)熱激基因的表達(dá)
D高溫時(shí),已存在的聚合酶6因子與啟動(dòng)子的結(jié)合能力強(qiáng)
6真核生物中rRNA包括(D)
A28s,23s,5srRNAB23s,16s,5srRNA
C23s,16s,5.8srRNAD28s,23s,5.8s,5srRNA
7內(nèi)含子的剪切位點(diǎn)具有為特征(A)
A5-GU,3'—AGB5—AG,3—GU
C5,—GA,3'—UGI)5—UG,3—GA
8部分原核基因的轉(zhuǎn)錄終止子在終止位點(diǎn)前均有(A)
A回文序列B多聚T序列CTATA序列D多聚A序列
9mRNAS端帽子結(jié)構(gòu)為(C)
ApppmGBGpppGCm7GpppGDGpppmG
簡(jiǎn)答題
1增強(qiáng)子的特點(diǎn)
(1)有遠(yuǎn)距離效應(yīng)(2)無(wú)方向性(3)順勢(shì)調(diào)節(jié)(4)無(wú)物種和基因的特異性
(5)具有組織的特異性(6)有相位性,其作用與DNA的構(gòu)象有關(guān)(7)有的增強(qiáng)子可以對(duì)
外部信號(hào)產(chǎn)生反應(yīng)。
2比較DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)
相同點(diǎn):都以DNA鏈作為模板,合成方向均為5端到3'端,聚合反應(yīng)均遵循堿基配對(duì)原則,
通過(guò)核昔酸之間形成的3,5-一磷酸二酯鍵使核甘酸鍵延長(zhǎng)。
不同點(diǎn):
復(fù)制轉(zhuǎn)錄
模板兩條鏈均被復(fù)制模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄)
原料DntpNTP
酶DNA聚合酶RNA聚合酶
產(chǎn)物子代雙鏈DW(半保留復(fù)制)mRNAtRNArRNA
配對(duì)方式A-TG-CA-UA-TG-C
引物RNA引物不需要引物
DNA復(fù)制與轉(zhuǎn)錄的異同
相同點(diǎn):
都需要模板
都以三磷酸核昔酸為底物(NTP或dNTP)
合成方向都是5-3
不同點(diǎn)
轉(zhuǎn)錄不需引物;
只轉(zhuǎn)錄DNA分子中的一個(gè)片段(稱為轉(zhuǎn)錄單位或操縱子,operon);
雙鋅DNA中只有一條徒具有轉(zhuǎn)錄活性(稱為模板鏈);
哪個(gè)基因被轉(zhuǎn)錄與特定的時(shí)間、空間、生理狀態(tài)有美。
RNA聚合酶無(wú)校對(duì)功能。
原核生物與真核生物mRNA的比較
(1),原核生物mRNA的半衰期短.
(2)、許多原核生物mRNA以多順?lè)醋有问酱嬖冢?/p>
(3)、原核生物夕端無(wú)帽子結(jié)構(gòu),/或只有短的poly(A)。
(4)、真核生物mRNA5,端有帽子結(jié)構(gòu),
(5)、絕大多數(shù)真核生物mRNA?具有poly(A)尾巴,是轉(zhuǎn)錄后加上的,是mRNA從核到
質(zhì)轉(zhuǎn)移所必需的形式,提高mRNA的穩(wěn)定性。
大腸桿菌的轉(zhuǎn)錄過(guò)程:
(1)、識(shí)別階段:RNA聚合酶在。亞基的引導(dǎo)下結(jié)合于啟動(dòng)子上:
(2)、DNA雙鏈局部解開(kāi);
(3)、起始階段:在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初RNA鏈;
(4)、延伸階段:核心酶向前移動(dòng),RNA鏈不斷生長(zhǎng);
(5)、終止階段:RNA聚合酶到達(dá)終止子;
(6)、RNA和RNA聚合酶從DNA上脫落。
論述題
1真核生物轉(zhuǎn)錄的前體hnRNA如何加工為成熟的mRNA?
真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)組成:5端存在帽子結(jié)構(gòu),3端通常具有poly(A)尾巴,無(wú)內(nèi)含子,
部分堿基發(fā)生甲基化。
①5,端加帽:當(dāng)RNA聚合酶1【聚合的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物達(dá)到25堿基長(zhǎng)時(shí),在其5,端加上一個(gè)以5,
-3.方向相連的7一甲基鳥(niǎo)背帽,防止5.核甘酸外切酶的攻擊,有利于剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)和翻譯
的進(jìn)行;②3.端加尾:很多真核生物的hnRNA的3.端經(jīng)過(guò)剪切后再加上多聚A殘基即poly(A)
尾巴,這有助于整個(gè)分子的穩(wěn)定;③剪接:在真核生物的mRNA加工過(guò)程中,內(nèi)含子序列
被切除,兩側(cè)的外顯子片段連接。剪接反應(yīng)在核內(nèi)進(jìn)行,需要內(nèi)含子有5—GU,AU-3以
及一段分支點(diǎn)序列。其過(guò)程是:內(nèi)含子先以一個(gè)具尾的環(huán)狀分子或套索狀分子形式被刪除,
然后被降解,剪接包括snRNP與保守序列結(jié)合,形成剪接體,在其內(nèi)發(fā)生剪接與連接反應(yīng);
④編輯;⑤甲基化修飾:當(dāng)序列為5—RRACX-3,時(shí)會(huì)在第6位N原子位置發(fā)生甲基化。
2概括細(xì)菌細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄過(guò)程
轉(zhuǎn)錄是通過(guò)RNA聚合酶的作用,以一條DNA鏈為模板產(chǎn)生一條單鏈RNA過(guò)程。步驟如下:
⑴與RNA聚合酶全酶的結(jié)合:一個(gè)RNA聚合酶全醉分子與待轉(zhuǎn)錄的DNA編碼序列上游的啟
動(dòng)子序列松弛的結(jié)合。
⑵起始:RNA聚合酹往下游移動(dòng)了兒個(gè)核甘酸到達(dá)啟動(dòng)子的另一段短序列一Pribnow框,緊
密地與DNA結(jié)合。DNA上的啟動(dòng)子區(qū)域解鏈,RNA便從Pribnow框下游的幾個(gè)核甘酸處開(kāi)
始合成,通常是DNA的反義鏈作為模板,合成幾個(gè)核甘酸后,6因子被釋放并循環(huán)使用,
以下步驟不再需要S因子。
⑶延伸:RNA聚合酶核心酶沿著DNA模板移動(dòng),使DNA解性,與DNA模板的下一堿基互補(bǔ)
核苜二磷酸聚合到鏈上。RNA聚合酶繼續(xù)在DNA上移動(dòng),RNA鏈從模板鏈被秤放出來(lái),DNA
雙螺旋重新形成。
⑷當(dāng)所有編碼序列被轉(zhuǎn)錄后,RNA聚合能移動(dòng)一個(gè)終止序列,即終止子。轉(zhuǎn)錄復(fù)合體解體,
RNA聚合酶和新形成的RNA從DNA模板上脫落下來(lái)。
3、復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工方式有幾種?分別是什么?
(1)剪、利用多個(gè)5,端轉(zhuǎn)錄起始為點(diǎn)或接位點(diǎn)產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。
(2)、利用多個(gè)加poly(A)位點(diǎn)和不同的剪接方式產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。
(3)、雖無(wú)剪接,但有多個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)或加poly(A)位點(diǎn)的基因。
第四章
.SD序列:在原核生物mRNA起始密碼AUG上游,存在4~9個(gè)富含喋吟堿的一致性序列,如
-AGGAGG-,稱為S-D序列。位于原核生物起始密碼子上游7-12個(gè)核甘酸處的保守區(qū),該序
列與16SrRNA3,端反向互補(bǔ)。又稱為核蛋白體結(jié)合位點(diǎn)(ribosomalbindingsite,RBS)
正轉(zhuǎn)錄調(diào)控:
負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控:
填空題
1.tRNA的種類有:起始tRNA和延伸tRNA,同工tRNA,校正tRNA。
2.tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)為三葉草型,三級(jí)結(jié)構(gòu)為魚(yú)型。tRNA結(jié)構(gòu)
3.原核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲酰甲硫氨酰一tRNA(fMet-tRNAfMet),它攜帶的氨基
酸是甲酰甲硫氨酸(fMet),而真核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲硫氨酰一tRNA(Met-tRNA
吧2,它攜帶的氨基酸是用硫氨酸(Met)。
4.新生肽鏈每增加一個(gè)緘基酸單位都要經(jīng)過(guò)AA-tRNA與核糖體的結(jié)合,肽鍵形成,移位三
步反應(yīng)。
5.核糖體的作用位點(diǎn)有:A位點(diǎn)、P位點(diǎn)、E位點(diǎn)。
5.在真核生物中蛋白質(zhì)合成起始時(shí)先形成起始因子和起始tRNA復(fù)合物,再和40s亞基形
成40s起始復(fù)合物。
6.氨酰tRNA合成酶既能識(shí)別氨基酸,又能識(shí)別相應(yīng)的tRNA。
7.多肽合成的起始密碼子是梃典,而皿,UAG,皿是終止密碼子。
8.遺傳密碼的特點(diǎn)包括連續(xù)性,簡(jiǎn)并性,擺動(dòng)性,普遍性與特殊性。
9.核酸復(fù)制時(shí),DNA聚合酶沿模板鏈于二支方向移動(dòng):轉(zhuǎn)錄時(shí),RNA聚合酶沿模板鏈才一5,
方向移動(dòng);翻譯時(shí),核糖體沿模板鏈?zhǔn)?方向移動(dòng)。
10.原核生物蛋白質(zhì)合成形成起始復(fù)合物時(shí),其mRNA先與核糖體的30s亞基結(jié)合,然后
再與結(jié)合起始因子和GTP的甲酰甲硫氨酰一tRNA結(jié)合,形成30s起始復(fù)合物,然后再與50s
形成70s起始復(fù)合物。
選擇題
1.在蛋白質(zhì)合成中催化肽鍵合成的是(D)
A.延長(zhǎng)因子EF-TsB.延長(zhǎng)因子EF-TuC.啟動(dòng)因子IF3D.轉(zhuǎn)肽酶
2.翻譯后加工過(guò)程的產(chǎn)物是(B)
A.一條多肽鏈B.一條多肽鏈或一條以上的多肽鏈
C.多條多肽鏈D.多肽鏈的降解產(chǎn)物
3.已知某蛋白質(zhì)多肽鏈編碼序列為....GGA,則其mRNA轉(zhuǎn)錄本(A)
A.以5,............GGA..........T為模板,沿轉(zhuǎn)錄本式一丁方向延長(zhǎng)
B.以5,............GGA..........B為模板,沿轉(zhuǎn)錄本3'fB方向延長(zhǎng)
C.以3,...........GGA...........夕為模板,沿轉(zhuǎn)錄本夕f3,方向延長(zhǎng)
D.以3,............GGA...........5,為模板,沿轉(zhuǎn)錄本3,》5,方向延長(zhǎng)
4.細(xì)菌核糖體RNA中大亞基由以下物質(zhì)組成(C)
A.5SrRNA,18SrRNA,5.8SrRNA和49種蛋白質(zhì)
B.5SrRNA,28SrRNA,5.8SrRNA和49種蛋白質(zhì)
C.5SrRNA,23SrRNA和34種蛋白質(zhì)D.5SrRNA,16SrRNA和34種蛋白質(zhì)
5.肽鏈生物合成時(shí)信號(hào)肽序列(B)
A.決定糖類殘基的附著點(diǎn)B.將新生肽鏈導(dǎo)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)
C.控制蛋白質(zhì)分子的最終構(gòu)象D.具有疏水性
6.真核生物的翻譯起始復(fù)合物在何處形成(B)
A.起始密碼子AUG處B.5,端的帽子結(jié)構(gòu)
C.TATA框D.CAAT框
7.蛋白質(zhì)生物合成的終止信號(hào)由(D)
A.tRNA識(shí)別B.EF識(shí)別C.IF(或elF)識(shí)別D.RF識(shí)別
8.能編碼多肽鏈的最小DNA單位是(A)
A.順?lè)醋覤.操縱子C.啟動(dòng)子D.復(fù)制子
9.參與原核生物肽鏈延長(zhǎng)的因子是(C)
A.IF1B.IF2C.EF-TuD.RF1
10.參與真核生物肽鏈延長(zhǎng)的因子是(D)
A.eRFB.elFlC.EF-TuD.eEFla
簡(jiǎn)答題:
1.簡(jiǎn)述核糖體的結(jié)構(gòu)及功能特點(diǎn):
答:核糖體的結(jié)構(gòu):①真核生物:由60s大亞基和40S小亞基組成的80S的核糖體;②原核
生物:由50S大亞基和3cs小亞基組成的70S的核糖體
功能特點(diǎn):合成蛋白質(zhì)。在單個(gè)核糖體上,包括至少5個(gè)功能活性中心,在蛋白質(zhì)合
成過(guò)程中,各有專?的識(shí)別作用和功能:mRNA的結(jié)合部位一一小亞基,結(jié)合或接受AA-tRNA
的部位一一大亞基A位,結(jié)合或接受肽基tRNA部位一一大亞基,肽基轉(zhuǎn)移部位一一大亞基
P位,形成肽鍵部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)一一大亞基E位。
2.簡(jiǎn)述氨基酸的活化過(guò)程
答:游離的氨基酸必須經(jīng)過(guò)活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨
酰tRNA合成酶催化。活化分兩步:①活化:aa+ATP+E-氨基酰-AMP釋放出PPi
②轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP轉(zhuǎn)移到tRNA并釋放出AMP。
3、論述蛋白質(zhì)的翻譯過(guò)程。
答:蛋白質(zhì)的翻譯即合成過(guò)程可分為四個(gè)階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、延伸和終
止。
①氨基酸的活化:游離的氨基酸必須經(jīng)過(guò)活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化
反應(yīng)由氨酰tRNA合成的催化,最終氨基酸連接在tRMA的3'端合成氨酰-tRNA。
②肽鏈合成的起始:核蛋白體大小亞基分離,mRNA在小亞基上定位結(jié)合,起始氨基酰tR\A
與小亞基結(jié)合,核蛋白體大亞基結(jié)合。
③肽鏈的延伸:肽鏈的延長(zhǎng)是在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,每次循環(huán)增加一個(gè)氨基酸,
分為以下三步:(一)進(jìn)位:根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋
白體A位。(二)成肽:肽酰轉(zhuǎn)移酶將相鄰的兩個(gè)氨基酸相連形成肽鍵,該過(guò)程不需要能最的
輸入;(三)轉(zhuǎn)位:移位酶利用GTP水解釋放的能量使核糖體沿mRNA移動(dòng)一個(gè)密碼子,釋放
出空載的tRNA并將新生肽鏈運(yùn)至P位點(diǎn)。
③肽鏈合成的的終止與程放;釋放因子識(shí)別并與終止密碼子結(jié)合,水解P位上多肽鏈與
tRNA之間的二脂鍵,接著,新生肽鏈和tRNA從核糖體上釋放,核糖體大、小亞基解體,
蛋白質(zhì)合成結(jié)束。
4、原核生物翻譯的起始過(guò)程
(1)核糖體大小亞基分離
(2)30s小亞基通過(guò)SD序列與mRNA模板相結(jié)合
(3)在IF-2和GTP的幫助下fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的P位,tRNA的反密碼子與mRNA
上密碼子配對(duì)。
(4)帶有tRNA、mRNA和三個(gè)翻譯起始因子的小亞基起始復(fù)合物與50s的大亞基結(jié)合,GTP
水解釋放翻譯起始因子。
5、以大腸桿菌為例簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)合成的過(guò)程
從以下四個(gè)方面詳細(xì)論述
(1)氨基酸的活化:
(2)肽鏈合成的起始:
(3)肽鏈的延生:
(4)肽鏈合成的終止:
第六章
乳糖操縱子模型內(nèi)容
(1)Z、Y、A基因產(chǎn)物由同一條多順?lè)醋觤RNA分子所編碼。
(2)乳糖操縱子mRNA分子的啟動(dòng)區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱區(qū)(0)之間,不能單
獨(dú)起始半乳糖甘能和透過(guò)酶基因的高效表達(dá)。
(3)乳糖操縱子的操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。
(4)當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時(shí),lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
(5)誘導(dǎo)物通過(guò)與阻遏物結(jié)合,改變其三維構(gòu)象,使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合,誘發(fā)lacmRNA
的合成。
色氨酸操縱子轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控
通過(guò)核糖體與mRNA前導(dǎo)序列結(jié)合,對(duì)轉(zhuǎn)錄終止進(jìn)行調(diào)至。
Attenuator(衰減子):是位于轉(zhuǎn)錄單位開(kāi)始區(qū)的一種內(nèi)部終止子,由核糖體在mRNA上的
位置決定該終止發(fā)夾是否形成。若不形成發(fā)夾,RNA聚合酶通讀終止子,基因得以表達(dá)。
當(dāng)缺乏色氨酸時(shí),核糖體在trp密碼子上暫停,此密碼子是1區(qū)的一部分。所以1區(qū)被核糖
體隔離,不能與2區(qū)堿基配對(duì),這意味著在4區(qū)轉(zhuǎn)錄之前2區(qū)已和3區(qū)配對(duì),迫使4區(qū)保持
單鏈形式,不能形成終止子發(fā)夾,RNA聚合酶穿越衰減子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄。
核糖體可以合成前導(dǎo)肽,并延伸到mRNA上的UGA密四子,UGA密碼子位于1區(qū)與2區(qū)之
間。當(dāng)核糖體前進(jìn)到此點(diǎn)時(shí),通過(guò)2區(qū)并阻止其形成堿基配對(duì),導(dǎo)致3區(qū)與4區(qū)配對(duì),產(chǎn)生
終止子發(fā)夾。因此,在這種情況下,RNA聚合酶在衰減子處終止。
乳糖操縱子(lacoperon)的結(jié)構(gòu)
1、結(jié)構(gòu)基因
(1)lacZ:編碼b一半乳糖甘酶(使乳糖水解)
(2)lacY:編碼b一半乳糖甘透過(guò)酶
(使b一半乳糖背透過(guò)細(xì)胞壁、質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi))
(3)lacA:編碼b一半乳糖若乙酰轉(zhuǎn)移酶(將乙?;D(zhuǎn)移到b一半乳糖行上)
2、調(diào)節(jié)基因(regulatorygene)
(1)概念:其產(chǎn)物參與調(diào)控其他結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的基因
(2)特點(diǎn):
a、可在結(jié)構(gòu)基因群附近、也可遠(yuǎn)離結(jié)構(gòu)基因
b、不僅對(duì)同一條DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用,而且能對(duì)不同DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起
作用
(3)調(diào)控蛋白:
類型:a、阻遏蛋白(repressiveprotein)與操縱元件結(jié)合后能減弱或阻止所調(diào)控基因轉(zhuǎn)
錄的調(diào)控蛋白b、激活蛋白(activatingprotein):與操縱元件結(jié)合后能增強(qiáng)或啟動(dòng)所調(diào)控基
因轉(zhuǎn)錄的遍控蛋白
3、操縱元件(operator)
(1)與啟動(dòng)子鄰近或與啟動(dòng)子部分序列重疊
(2)具有回文結(jié)構(gòu),能形成十字形結(jié)構(gòu)。
(3)與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達(dá)的作用
4、啟動(dòng)子(promoter)
是指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的?段DNA序列。
(1)-10序列…Pribnow盒:TATAAT;
(2)-35bp序列:TTGACA
操縱子至少有一個(gè)后前子,一般在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5,上游,控制整個(gè)結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄
5、終止子(terminator)是給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的DNA序列
(1)不依賴P因子的終止子
(2)依賴P因子的終止子
在一個(gè)操縱元中至少在結(jié)構(gòu)基因群最后一個(gè)基因的后面有一個(gè)終止子
大腸桿菌乳糖操縱子(lactoseoperon)包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:Z、Y和A,以及啟動(dòng)子、控
制子和阻遏子等。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動(dòng)區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的。
Laci-----阻抑蛋白,LacZ------糖首酹,LacY---------透性的,LacA------轉(zhuǎn)乙?;?。
三種酶的功能:
①.B?半乳糖酶:將乳糖分解成半乳糖和葡萄糖
②.滲透酶:增加糖的滲透,易于攝取乳糖和半乳糖
③.轉(zhuǎn)乙酰酶:B-半乳糖轉(zhuǎn)變成乙酰半乳糖
lac操縱子小結(jié)
通常情況(前萄糖供應(yīng)正常)阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,基因不轉(zhuǎn)錄。
細(xì)胞外的乳糖通過(guò)透性肺吸收到細(xì)胞內(nèi);細(xì)胞內(nèi)的6?半乳糖杏陋將乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)楫惾樘恰?/p>
異乳糖結(jié)合到乳糖阻抑物上使之從操縱序列上脫離,聚合酶迅速開(kāi)始lacZYA基因的轉(zhuǎn)錄。
這就是負(fù)控誘導(dǎo)。
然而,還需要細(xì)菌生長(zhǎng)系統(tǒng)中缺少葡萄糖,使CAMP含量增加,才有足夠量的CAMP與
CRP結(jié)合形成CRP-cAMP復(fù)合物結(jié)合于Plac上游。使DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,轉(zhuǎn)錄才可以有
效地進(jìn)行。
組氨酸操縱子:
與His降解代謝有關(guān)的兩組兩類被稱為hut醐(histidineutilizingenzyme),控制這些海合成的
操縱子被稱為hutoperoj由一個(gè)多重調(diào)節(jié)的操縱子控制,有兩個(gè)啟動(dòng)子,兩個(gè)操縱區(qū)及兩
個(gè)正調(diào)控蛋白。
轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
一、翻譯起始的調(diào)控
遺傳信息的翻譯起始于mRNA上的核糖體結(jié)合位點(diǎn)(RB5)一一起始密子AUG上湖的一
段非翻譯區(qū)。在RBS中有SD序列,與核糖體16srRNA的3,端互補(bǔ)配對(duì),促使核糖體與mRNA
相結(jié)合。
RBS的結(jié)合強(qiáng)度取決于SD序列的結(jié)構(gòu)及與AUG的距離。SD與AUG相距-一般以4-10核
甘酸為佳,9核甘酸最佳。
二、mRNA穩(wěn)定性對(duì)轉(zhuǎn)錄水平的影響
所有細(xì)胞都有一系列核酸的,用來(lái)清除無(wú)用的mRNA。一個(gè)典型的mRNA半衰期為2-3min。
mRNA分子被降解的可能性取決于其二級(jí)結(jié)構(gòu)。
SD序列的微小變化,往往會(huì)導(dǎo)致表達(dá)效率成百上千倍的差異,這是由于核昔酸的變化改
變了形成mRNA5,端一級(jí)結(jié)構(gòu)的自山能,影響了30s亞基與mRNA的結(jié)合,從而造成了蛋白
質(zhì)合成效率上的差異。
三、蛋白質(zhì)的調(diào)控作用
細(xì)菌中有此mRNA結(jié)合蛋白可激活靶基因的翻譯。相反,mRNA特異性抑制蛋白則通過(guò)
與核糖體競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mRNA分子來(lái)抑制翻譯的起始。大腸桿菌中的核糖體蛋白就存在翻譯
抑制現(xiàn)象。
四、反義RNA的調(diào)節(jié)作用
RNA調(diào)節(jié)是原核基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)的另一種重要機(jī)制。細(xì)菌相應(yīng)環(huán)境壓力的改變,會(huì)
產(chǎn)生一些非編碼小RNA分子,能與mRNA中的特定序列配對(duì)并改變其構(gòu)象,導(dǎo)致翻譯過(guò)程
的開(kāi)啟或關(guān)閉等作用。
第七八章
操縱子(operon):是指數(shù)個(gè)功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的
調(diào)控區(qū)(包括啟動(dòng)子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)所構(gòu)成的基因表達(dá)單位,所轉(zhuǎn)錄
的RNA為多順?lè)醋?。在原核生物中,若干結(jié)構(gòu)基因可串聯(lián)在一起,其表達(dá)受到同一調(diào)控系
統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子。
反式作用因子(trans-actingfactor):能直接或間接地以別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序
列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。
弱化子:在trpmRNA5'端有一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),其中123?150位
堿基序列如果缺失,trp基因表達(dá)可提高6-10倍。mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全
沒(méi)有色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個(gè)區(qū)域終止,產(chǎn)生一個(gè)僅有140個(gè)核甘酸的RNA分子,終止trp
基因轉(zhuǎn)錄。這個(gè)區(qū)域被稱為弱化子,該區(qū)mRNA可通過(guò)自我配對(duì)形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)。
順式作用元件(cis-actingelement)影響自身基因表達(dá)活性的非編碼DNA序列。
斷裂基因(splitegene):真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連
續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因
稱為斷裂基因。
基因的分子生物學(xué)定義:產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核昔酸序列。
基因表達(dá)的時(shí)間特異性:
基因表達(dá)的空間特異性:
填空題
1、真核生物中反式作用因子的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域有:螺旋一轉(zhuǎn)角一螺旋,堿性一螺旋-環(huán)?螺
旋,鋅指,堿性一亮氨酸拉鏈,同源域蛋白。
2、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子按功能可以分為:基本轉(zhuǎn)錄因子和特異轉(zhuǎn)錄因子。
3、真核生物有二類RNA聚合酶,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄rRNA基因的RNA聚合酶是:RNA聚合酶I
4、典型的原核啟動(dòng)子的四個(gè)特征是:轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),原核基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)通常是喋吟,
-10區(qū),-35|乂。
5、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)基因有:lacZ,lac操lacA。
選擇題
1、在什么情況下,乳糖操縱子的轉(zhuǎn)錄活性最高(A)
A高乳糖,低葡萄糖B高乳糖,高葡萄糖
C低乳糖,低葡偽糖D低乳糖,高葡荷糖
2、在真核基因表達(dá)調(diào)控中,(B)調(diào)控元件能促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的速率。
A弱化子B增強(qiáng)子CrepressorDTATABox
3、外顯子是(D)
A基因突變的表現(xiàn)BDNA被水解斷裂開(kāi)的片段
C不轉(zhuǎn)錄的DNAD真核生物基因的編碼序列
4、關(guān)于外顯子和內(nèi)含子的敘述,正確的是(C)
A僅外顯子在DNA模板上有相應(yīng)的互補(bǔ)序列BhnRNA上只有外顯子而無(wú)內(nèi)含子序列
C除去內(nèi)含子及連接外顯子的過(guò)程稱為剪接D除去外顯子的過(guò)程稱為剪接
5、不屬于轉(zhuǎn)錄后修飾的是(C)
A腺甘酸聚合B5Z端加帽子結(jié)構(gòu)
C外顯子切除D內(nèi)含子切除
6、AAUAAA序歹U是(D)
A啟動(dòng)子的辨認(rèn)序列B真核生物的轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)
C真核生物的反式作用因子
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