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文檔簡介
進(jìn)階臨床試驗(yàn)Meta-analysis統(tǒng)合分析實(shí)務(wù)百年前的「臨床試驗(yàn)」?
詹姆斯·林德(James
Lind,
1716年
-
1794年6月13日)–英國皇家海軍外科醫(yī)生(1739年
-
1748年),英格蘭衛(wèi)生學(xué)的創(chuàng)始人–發(fā)起利用柑桔類水果和新鮮蔬菜治療和預(yù)防壞血病–
Atreatise
ofthe
scurvy
壞血病論2百年前的「臨床試驗(yàn)」?
百年前的歐洲,長期在海上航行的水手經(jīng)常遭受壞血病的折磨,患者常常牙齦出血,甚至皮膚淤血和滲血,最后痛苦地死去,人們一直查不出病因。奇怪的是,只要船只靠岸,這種疾病很快就不治而愈了。?問題:水手們?yōu)槭裁磿?huì)得壞血病呢??
書中提到他在1747年在船上做了一個(gè)臨床試驗(yàn):–出現(xiàn)壞血病的船員,大家都吃完全相同的食物–唯一不同的是有些病人每天吃兩個(gè)橘子和一個(gè)檸檬,其他的人喝蘋果
酒、稀硫酸、醋、海水。?
實(shí)驗(yàn)的結(jié)論:
吃柑橘水果的兩人好轉(zhuǎn),其它人病情依然。3偏差??
從現(xiàn)代的觀點(diǎn)看,林德的臨床試驗(yàn)不夠嚴(yán)謹(jǐn):–病人的分派Allocation–每一組的病人數(shù)
Sample
size–臨床指標(biāo)Clinical
indication/
Outcome–統(tǒng)計(jì)分析
Statistical
analysis4–Deviationofstudy
resultfrom
the
truth,
不能靠統(tǒng)計(jì)處理–測量時(shí)即發(fā)生錯(cuò)誤
(內(nèi)因):
Information
bias,
recall
bias,
report
bias–外因:Confounding
bias
~Confoundingfactors?Risk
of
Bias–
Infact,we
never
knowthetruth–The
resultsfromastudy
might
be
unbiaseddespite
methodologicalflaws
E.g.,
poor
randomizationor
losttofollow
up,
but
unbiased
results抽樣所造成測量值與真
實(shí)值之間的差異,統(tǒng)計(jì)
可處理:通過多次測量或增加樣“Bias”v.s.“Riskof
Bias”本數(shù),獲得的均值盡量
逼近?Error一
Systematicerrorv.s.?Bias一
SystematicerrorRandomerror5?
文獻(xiàn)的證據(jù)等級(jí)與研究設(shè)計(jì)相關(guān)證據(jù)金字塔
→
隨機(jī)對照試驗(yàn)
(RCT):
Level
1(GoldStandard)實(shí)證醫(yī)學(xué)的證據(jù)等級(jí)6實(shí)證醫(yī)學(xué)的證據(jù)等級(jí)?
文獻(xiàn)的證據(jù)等級(jí)與研究設(shè)計(jì)相關(guān)?
證據(jù)的等級(jí):良好研究設(shè)計(jì)可以減少偏差的程度
→
隨機(jī)對照試驗(yàn)(RCT)7為什么要進(jìn)行Meta-analysis?統(tǒng)合多個(gè)臨床研究的樣本數(shù)和結(jié)果,證據(jù)力高花費(fèi)研究經(jīng)費(fèi)和人力相對低8Meta-analysisMeta-analysisStata
統(tǒng)計(jì)軟件教育訓(xùn)練課程Meta-analysisQuickTutorialtoStataTo
Installandupdatethe
metanmodule
in
Stata
9.0
↑
(因?yàn)榕f版每次都要更新)若
metan
不是最新版本,輸入指令:which
metansscinstallmetaaggr’
all
replaceUnderSTB-44’clickon
sbe24UnderSTB-45’clickon
sbe24.1(按—more—或空白鍵,可以到下一頁)若需要指令的協(xié)助:
help
(metan)search
(metan)--Twovariables:
metan
logesselogesmetan
logRRselogRR(log,effectsizes)(standarderror,
log,effectsizes)insheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clear--Threevariables:
metan
loges
logll
logulmetan
rr
ll
ul(log,effectsizes)(log,lower
and
upper
limits)metantcasestnoncasesccasescnoncases兩組數(shù)字:logRR,selogRRgen
logRR=
ln(
(tcases/ttotal)
/
(ccases/ctotal)
)genselogRR=sqrt(
1/tcases+1/ccases
-1/ttotal
-1/ctotal
)三組數(shù)字:
RR,UL,
LL3組數(shù)字轉(zhuǎn)2組數(shù)字gen
logrr=ln(rr)genselogrr=(ln(ul)-ln(ll))/3.92Introductiontothe“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)四組數(shù)字:
tcasestnoncasesccasescnoncasesIntroduction
to
the
“metan”ModuleForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)insheetusing"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearIntroduction
to
the
“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncasesForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)Introduction
to
the
“metan”Moduleinsheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncases若需要指令的協(xié)助:
help
(metan)Forbinary
(count)
data:4variables(2*2
data).0688114.5%Weight0.19
(0.08,0.46)0.39
(0.12,
1.26)0.25
(0.14,0.42)1.56
(0.37,6.55)0.71
(0.57,0.89)0.98
(0.58,
1.66)0.80
(0.51,
1.26)0.23
(0.18,0.31)0.62
(0.39,
1.00)0.20
(0.08,0.50)1.01
(0.89,
1.15)0.25
(0.07,0.91)0.38
(0.32,0.47)0.62
(0.57,0.68)insheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\bcg.csv",clearmetantcasestnoncasesccasescnoncases,orrandomForbinary
(count)
data:4variables(2*2
data)RandomeffectIntroductiontothe“metan”Module1.880.664.290.2011.991.852.8616.672.991.0532.600.73Overall(I-squared
=
92.7%,
p
=0.000)22.24100.00StudyID101112OR
(95%
CI)34513268971insheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clearmetan
rr
ll
ulIntroductiontothe“metan”ModuleForbinary
(count)
data:3variablesinsheet
using"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季\20221228-初探Meta-analysis\nodm.csv",clearmetan
logrrselogrrForbinary
(count)
data:3組數(shù)字轉(zhuǎn)2組數(shù)字gen
logrr=ln(rr)genselogrr=(ln(ul)-ln(ll))/3.92Introductiontothe“metan”ModuleI2
≤50%:
Homogeneous(fixed
effect)I2
>50%:
Heterogeneity(randomeffect
mode)研究出現(xiàn)高異質(zhì)性怎么辦?20研究出現(xiàn)高異質(zhì)性怎么辦?l
不要先急著作統(tǒng)合分析
統(tǒng)合性回歸分析(meta-regression)
次群組分析(subgroup-analysis):找出具有明顯的
category差別的變項(xiàng)
總論文數(shù)小于10篇以下,盡量不要作統(tǒng)合性回歸分析→Egger’s
test
敏感度分析(sensitivity
analysis):
將某些不合適的論文(例如板報(bào)或質(zhì)量差的論文)刪除
使用Random
effect
model21「出版性偏差」
(publication
bias):研究的質(zhì)素相若,但報(bào)告較大效應(yīng)值的大型研
究,相比于報(bào)告較小、或沒有效應(yīng)的小型研究更常被發(fā)表出版的情況?!赋霭嫘云睢沟娘L(fēng)險(xiǎn):會(huì)令綜合性的研究并不能準(zhǔn)確地代表某主題的所有研究,而只偏
重于較極端的結(jié)果。圖像化評(píng)估
Publication
Bias:Funnel
Plot漏斗圖:
(A)有出版性偏差、(B)無出版性偏差22Funnel
plot
with
pseudo95%confidence
limits-2-1.5
-1
-.50logORFunnelplotwith
pseudo95%
confidence
limits-1
-.5
0.5logRRinsheetusing"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\afreg.csv“,clearmetafunnel
logrrselogrrmetafunnel
logorselogorIntroductiontothe“metafunnel”Module圖像化評(píng)估PublicationBias:Funnel
Plotsearch(metafunnel)
search(metabias)5
4
3
2
.143.2.100Funnel
plot
with
pseudo95%
confidence
limits-1.5
-1
-.50
logORinsheetusing"D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\111年第4季
\20221228-初探Meta-analysis\afreg.csv“,clearmetafunnel
logor
selogor,
egger
metabias
logor
selogor,
eggerIntroductiontothe“metafunnel”Module圖像化評(píng)估PublicationBias:Funnel
Plot
→
Smallsizeeffect:
Egger’stestsearch(metafunnel)
search(metabias)5
432.1-20Stata
統(tǒng)計(jì)軟件教育訓(xùn)練課程N(yùn)etworkMeta-analysis*從以下開始安裝*
MA/NMAnet
from
"http://www.homepages.ucl.ac.uk/~rmjwiww/stata/meta/"
net
install
network.pkg,
replacenet
install
mvmeta.pkg,
replace*Networkplotssc
install
netplotnet
from
"https://clinicalepidemio.fr/Stata"
net
install
network_graphs.pkg,
replacenet
install
metamiss2.pkg,
replace*SE
codenet
from
"/software/sj10-4/"
net
install
st0043_2.pkg,
replace安裝Network
Meta-analysis相關(guān)套件help
network
graph2627PreparingforAnalysis:先設(shè)定長檔案use“D:\助理研究員\中榮醫(yī)研部-生統(tǒng)小組\全院教育課程規(guī)劃-2022oct\112年d:
numberof
eventsn:total
sample
sizestudyvar→study:variable
of
study
titletrtvar→trt:variable
oftreatmentref:A
or
Placebo生統(tǒng)課程規(guī)劃\護(hù)理部-Stata\Stata-Network
meta_new\long_data.dta
clearnetworksetupd
n,studyvarFor
binary
(count)data:(study)trtvar(trt)ref(A)“,_single
useIV_double
useTopical_useCombination_IV_and_topical先設(shè)定檔案for
Network
Meta-analysis28network
setup
d
n,
studyvar
(study)
trtvar(trt)
ref(A)BCD
EAPlaceboIVStep1:Generating
Network
Geometry-Network
plot:
輸入指令network
map●
所包含研究的數(shù)量—所使用相關(guān)數(shù)據(jù)的數(shù)量2930Step2:TestingforInconsistency-
Global
inconsistency
Test
輸入指令network
meta
inconsistency無法拒絕虛無假說一致性
consistency的水平可接受Step2:TestingforInconsistency-
LocalinconsistencyTest輸入指令networksidesplitall無法拒絕虛無假說一致性
consistency
的水平可Because
inconsistencywas
found
to
be
absent
in
both
global
and
local
tests,
the
consistency
assumptionwas
accepted31Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-先設(shè)定
network
meta
consistencyFornetworkforest32Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)
輸入:networkforest33\
Globaltestoninconsistency<diamond>uses
adiamondshape
to
show
summary
effect
sizes<eform>generatestransformed
indices
tomake
it
easy
to
interpret
the
forest
plotStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)輸入:eform
xlabel(0.1
1
10
100)network
forest,msize(*0.15)diamondcolors(blackblue
red)
list34ES:
effect
sizeStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-
Networkforestplot(NFP)
輸入:intervalplot35Step3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-Networkforest
plot(NFP)
andinterval
plot
輸入:intervalplot,eformES:
effect
size<eform>generatestransformed
indices
tomake
it
easy
to
interpret
the
forest
plot36intervalplot,eformnull(1)labels(Placebo
IV_singleIV_doubleTopicalCombination)
separatemargin(1085
10)textsize(2)xlabel
(0.01
0.1
1
10)<eform>generates
transformed
indices
to
make
it
easy
tointerpret
the
forest
plot<separate>and<margin>set
the
ranges
to
generate
easy-
to-read
plots,
the
values
ofwhich
should
be
appropriately
determined
by
the
userStep3:CreatingPlotsandLeagueTableof
EffectSizebyTreatment-Network
forest
plot(NFP)and
interval
plot
輸入:intervalplot,eformnull(1)labels(Placebo
IV_singleIV_doubleTopical
Combination)margin
(108510)textsize(2)xlabel
(0.01
0.1
1
10)37Step4:DeterminingRelative
RankingsofTreatments-
Identify
superiority
輸入:networkrankmin38networkrankmaxD:
最早達(dá)到最佳Step4:
Determining
Relative
RankingsofTreatments-
Identifysuperiority
輸入:network
ran
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