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第二十一章DNA重組及重組DNA技術2023最新整理收集do

something

重組DNA技術(recombinantDNAtechnology):

又稱分子克隆或DNA克隆或基因工程技術,其主要過程包括:在體外將目的DNA片段與能自主復制的遺傳元件(又稱載體)連接,形成重組DNA分子,進而在受體細胞中復制、擴增,從而獲得單一DNA分子的大量拷貝。在克隆目的基因后,還可針對該基因進行表達產(chǎn)物蛋白質(zhì)或多肽的制備以及基因結構的定向改造。特點

分子水平操作和細胞水平表達定向地改造生物的遺傳性狀,

獲得人類所需要的品種

克隆特定基因表達特定基因,產(chǎn)生蛋白質(zhì)建立基因文庫建立cDNA文庫進行DNA測序克隆(clone)

是指通過無性繁殖過程所產(chǎn)生的與親代完全相同的子代群體。重組DNA技術的目的操作過程可形象歸納為分─目的DNA的分離獲取選─載體的選擇與構建接─目的DNA與載體的連接轉(zhuǎn)─重組DNA轉(zhuǎn)入受體細胞篩─重組體的篩選與鑒定載體雙酶切產(chǎn)生粘性末端目的基因帶有與載體相同粘性末端重組DNA分子轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)染對細菌進行培養(yǎng)對克隆菌進行篩選、鑒定和擴增目的基因的表達與表達產(chǎn)物的提取與純化含重組載體的細菌重組DNA技術操作流程圖重組DNA技術的基本原理和操作步驟

(一)目的DNA的分離獲取——分(二)載體的選擇與構建——選化學合成法從染色體中直接分離反轉(zhuǎn)錄合成cDNA構建基因組DNA文庫和cDNA文庫聚合酶鏈反應(PCR)(一)目的DNA的分離獲取——分目的DNA是指所要研究或應用的基因。也是需要克隆或表達的基因1.對已知短鏈多肽,根據(jù)基因的核苷酸序列或按編碼轉(zhuǎn)換成核苷酸序列→人工合成(DNA合成儀)。2.對于大分子多肽,首先分為幾個片段進行合成→再合成有缺口的雙鏈→最后用連接酶連接。例:由已知氨基酸序列推測可能的DNA序列氨基酸序列色trp色苯丙phe苯丙蛋met蛋賴lys賴ACCAAGTACT

T

TACCAAATACT

T

TACCAAGTACT

TCACCAAATACT

TC可能的DNA序列說明:由于密碼存在簡并性,合成出來的DNA可能與基因組DNA有所差異,此問題可通過基因測序解決。如果是為了獲得表達產(chǎn)物蛋白質(zhì),這種差異也無所謂。一、化學合成法特別適合于低等生物(物理圖譜已確定、背景資料清楚)。因原核

生物基因組、噬菌體、DNA病毒基因組比較小,且基因間無間隔序列。從受體菌中篩選克隆載體導入受體菌基因組DNA限制性內(nèi)切酶消化重組DNA分子二、從染色體中直接分離逆轉(zhuǎn)錄酶制備cDNA的基本過程12~18個寡聚d(T)片段(引物)AAAAAAAA(n)3

mRNA5

AAAAAAAA(n)3

T

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AAAAAAAA(n)3

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逆轉(zhuǎn)錄酶RNaseHDNA聚合酶S1核酸酶分離提取特異性蛋白質(zhì)的mRNAcDNA雙鏈cDNA反轉(zhuǎn)錄酶復制說明:這種cDNA中不包含內(nèi)含子,便于在宿主細胞中表達,適用于真核生物基因。三、反轉(zhuǎn)錄合成cDNA組織或細胞染色體DNA基因片段(n個目的基因)重組DNA分子(n個重組體)

培養(yǎng)、擴增得到重組分子的轉(zhuǎn)化菌落混合體(n個)–DNA文庫限制性內(nèi)切酶部分消化克隆載體(n個)引入受體菌(n個)說明:部分消化是指當DNA中有兩個或兩個以上相同酶切位點時,通過控制酶的用量和時間,只切斷一個或部分位點。篩選基因組DNA文庫:存在于轉(zhuǎn)化細胞內(nèi)由克隆載體所攜帶的所有基因組DNA的集合。即所有克隆DNA片段的總和應為整個基因組的DNA序列。四、構建基因組文庫及cDNA文庫左臂

右臂cosLRcos限制酶部分消化限制酶消化除去中間片段真核生物染色體DNA連接反應體外包裝15~25KbDNA片段~20Kb外源DNA片段cosLRcos基因文庫限制酶切位點外源DNA與載體DNA混合cosLRcos

噬菌體DNA用重組噬菌體感染大腸桿菌cDNA文庫是指某種特定細胞及特定狀態(tài)下的全部cDNA克隆。說明:一個個體所有體細胞均有相同的基因,但不同種類的組織細胞或同一細胞在生長發(fā)育的不同階段,以及所受環(huán)境因素的不同,基因表達的種類和數(shù)量各不相同,因此只有細胞內(nèi)存在的mRNA,才能構建相應的cDNA文庫。cDNA文庫的構建對于真核生物可以從cDNA文庫中獲得目的基因:cDNA文庫篩選特定cDNA克隆cDNA片段酶切分離提取mRNAcDNA雙鏈cDNA重組DNA分子cDNA文庫克隆載體反轉(zhuǎn)錄酶復制受體菌方法:1.目的基因的兩端部分序列已知,通過合成適當引物,即可擴增得到(用于細胞內(nèi)目的基因少,提取困難)。2.mRNA已知,采用反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)方法直接從mRNA獲得特定基因的cDNA。

是一種對已知基因的體外特異擴增的方法。五、聚合酶鏈反應(PCR)(二)載體的選擇與構建——選載體(vector)

是攜帶目的DNA片段進入受體細胞進行擴增和表達的運載工具(也是DNA)

??寺≥d體(cloningvector)為使插入的外源DNA序列被擴增而特意設計的載體稱為克隆載體。需要復制子、多克隆位點和篩選標志。表達載體(expressionvector)為使插入的外源DNA序列可轉(zhuǎn)錄翻譯成多肽鏈而特意設計的載體稱為表達載體[將常用克隆載體中加入一些與表達調(diào)控有關的元件(DNA序列)。如啟動子、SD序列、終止子]。能自主復制;具有兩個以上的遺傳標記物,便于重組體的篩選和鑒定;有克隆位點(外源DNA插入點),常具有多個單一酶切位點,稱為多克隆位點(MCS),便于外源基因的插入。如在這些位點有外源基因的插入,會導致某種標志基因的失活,便于篩選;分子量小,以容納較大的外源DNA。常用載體有:細菌質(zhì)粒、噬菌體、黏粒、病毒(腺病毒;腺病毒相關病毒;

痘病毒;逆轉(zhuǎn)錄病毒;猴空泡病毒.)克隆載體的選擇標準質(zhì)粒細菌染色體質(zhì)粒是存在于細菌染色體外的具有自主復制能力的小型環(huán)狀雙螺旋DNA分子,其分子變化相當大。

特點:能在宿主細胞內(nèi)獨立自主復制;帶有某些遺傳信息,會賦予宿主細胞一些遺傳性狀,以便識別質(zhì)粒的存在。

一、質(zhì)粒(plasmid)依據(jù)復制調(diào)節(jié)的嚴密性嚴緊型:只隨細菌染色體復制,每個細胞只含1~5個拷貝。松弛型:自主復制,每個細胞含10~200個拷貝。噬菌體按生活周期分溶菌性溶源性用于克隆載體的噬菌體

噬菌體雙鏈噬菌體M13噬菌體單鏈噬菌體頭部尾尾部纖維蛋白衣殼DNA

感染細菌后將自身的DNA整合到細菌的染色體中,和細菌染色體一起復制。

感染細菌后連續(xù)增殖,直到細菌裂解,釋放出噬菌體再感染其它細菌。二、噬菌體(phage)溶菌性噬菌體溶源性噬菌體主要有

gt系列(插入型,克隆容量7kb,適用cDNA克隆)EMBL系列(置換型,克隆容量9~23kb,適用基因組克隆)EMBL系列21kb13kb10kbSalⅠBamHⅠEcoRⅠSalⅠBamHⅠEcoRⅠ44kbEMBL344kbEMBL4SalⅠBamHⅠEcoRⅠSalⅠBamHⅠEcoRⅠ有外源DNA插入––可包裝無外源DNA插入––不能包裝1.噬菌體DNA改造系統(tǒng)

gt10和

gt11結構簡圖BglⅡBamHⅠBamHⅠXh0ⅠSmaⅠHindⅢA:

gt10右臂0.032.743.3kb左臂λCIHindⅢSmaⅠBamHⅠHindⅢSmaⅠBglⅡBamHⅠEcoRⅠBglⅡBamHⅠ遺傳標志有外源DNA插入––透明噬菌斑無外源DNA插入––混濁噬菌斑KpnⅠPvuⅠB:

gt11左臂右臂0.043.7kb19.6LacZBamHⅠKpnⅠEcoRⅠSstⅠPvuⅠXbaⅠSstⅠHindⅢBamHⅠXh0ⅠBamHⅠPvuⅠHindⅢHindⅢ遺傳標志有外源DNA插入––白色噬菌斑無外源DNA插入––藍色噬菌斑2.M13噬菌體

M13噬菌體是一種絲狀噬菌體,單鏈閉合環(huán)狀DNA,長約為6.5kb,只能感染雄性大腸桿菌,進入大腸桿菌后復制成雙鏈的復制型DNA(RFDNA),RFDNA可作為克隆載體。M13噬菌體DNA改造系統(tǒng)(含lacZ基因)M13mp系列pUC系列LacDNA6.5kb多克隆位點(含Lac啟動子-操縱基因和

-半乳糖苷酶基因

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