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文檔簡介
分子生物學(xué)
PBL第一次討論Contents1.人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取2.RT-PCR的原理、方法3.瓊脂凝膠電泳結(jié)果分析及應(yīng)用人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取
真核細(xì)胞質(zhì)總RNA主要由rRNA(80-85%)、tRNA和核內(nèi)小分子RNA(10-15%)、mRNA(1-5%)組成,其rRNA、tRNA和mRNA位于細(xì)胞質(zhì)中。
人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取·分析不同發(fā)育時期基因的表達(dá)狀況·獲得新基因AIMS·研究基因的拼接·分析相應(yīng)的蛋白產(chǎn)物
人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取原理:RNA的不穩(wěn)定性
由于核糖殘基的2’和3’位置帶有羥基,RNA易于被RNA酶切割水解
RNA酶含量豐富,加熱后仍能夠正確折疊恢復(fù)活性,不易失活。所以需要RNA酶抑制劑來抑制RNA酶的活性,從而達(dá)到成功提取RNA。人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取常用RNA酶抑制劑:
焦碳酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。
異硫氰酸胍:目前被認(rèn)為是最有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從核蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。
氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。
RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結(jié)合,使其失活。人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取
RNA提取的一般步驟:破碎組織→分離RNA→沉淀RNA→洗滌RNA→融解RNA→保存RNA
破碎組織和滅活RNA酶可以同步進(jìn)行可以用鹽酸胍、硫氰酸胍、蛋白酶K等破碎組織
加入β-巰基乙醇可以抑制RNA酶活性
分離RNA一般用酚、氯仿等有機溶劑,加入少量異戊醇,經(jīng)過此步,離心,RNA一般分布于上層,與蛋白層分開
沉淀RNA一般用乙醇、3MNaAc(pH=5.2)或異丙醇。
人類細(xì)胞質(zhì)RNA的提取
④洗滌RNA使用70%乙醇洗滌,有時,為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能過于干燥,否則不易溶解
⑤融解RNA一般使用TE(三羥甲基氨基甲烷和EDTA配置而成)
⑥保存RNA應(yīng)該盡量低溫。為了防止痕量RNase(核糖核酸酶)的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的RNA需要貯存在甲醛中以保存高質(zhì)量的RNA,對于長期貯存也應(yīng)該如此
RT-PCR
的原理及方法
RT-PCR:逆轉(zhuǎn)錄PCR,或者稱反轉(zhuǎn)錄PCR(reversetranscription-PCR,RT-PCR),是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的一種廣泛應(yīng)用的變形。在RT-PCR中,一條RNA鏈被逆轉(zhuǎn)錄成為互補DNA,再以此為模板通過PCR進(jìn)行DNA擴增。
RT-PCR
的原理及方法
背景
基因的表達(dá)
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