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文檔簡介
100mg小鼠肝臟組織,液氮中研磨,組織碎末立即倒入3ml裂解液內。加入苯酚后離心,分三管收集上層水相,TE稀釋40倍測OD。共收集1.5ml。異丙醇沉淀后,可以看見大量白色沉淀,三管合并,600ul裂解液溶解沉淀,TE稀釋160倍測OD。此步共收集600ul。異丙醇再次沉淀,75%乙醇洗滌兩次,盡量洗干液體,超凈臺干燥5min,加入100ulDEPC水溶解RNA。TE稀釋40倍測OD。RNA濃度為:1.23ug/ul,共有100ul,總產量為123ug。100mg組織RNA的含量為400-700ug。5ul裂解液對OD260有非常大的影響,RNA溶于水會導致OD260/280降低。產率不高的原因:1.研磨組織時有損失。2.兩次異丙醇沉淀會有大量損失。3.乙醇洗滌時為避免長時間干燥,吸的很干。沒有計算出回收率,改進辦法:實驗過程中測OD做控制時,使用5ul裂解液+195ulTE調零。1%瓊脂糖凝膠,舊的緩沖液。10ulRNA+5ulRNA酶,37℃孵育1h,加入等體積氯仿,振蕩后離心取上層水相直接電泳。
1.道:5ul1號管+15ulDEP水。2.道:5ul1號管+15ulDEP水,70℃孵育1h。3道:5ul1號管+20ulDEP水,37℃孵育1h。加入25ul氯仿,漩渦振蕩10s,1000g離心3min,吸取上層水相電泳。4道:5ul1號管+15ulDEP水+5ulRNA酶,37℃孵育1h。加入25ul氯仿,漩渦振蕩10s,1000g離心3min,吸取上層水相電泳。5.道:5ul4號管+15ulDEP水。6道:5ul1號管+20ulDEP水,37℃孵育1h。加入25ul氯仿,漩渦振蕩10s,1000g離心3min,吸取上層水相電泳。7道:5ul1號管+15ulDEP水+5ulRNA酶,37℃孵育1h。加入25ul氯仿,漩渦振蕩10s,1000g離心3min,吸取上層水相電。電泳結果說明:1.RNA酶有作用,代表提出的是RNA。2.37℃孵育,氯仿抽提,振蕩對電泳結果沒有影響,但RNA有損失。RNA的消失是酶作用的,而與操作無關。3.第2道目的在于確認RNA溶液是否有殘留的RNA酶。結果說明70℃孵育對結果有影響,RNA有降解。酶解后進行電泳證明確實提出了RNA,但是電泳條代還是不正常,RNA分子量偏小(在溴酚藍附近)。兩種可能,RNA在提取過程中斷裂和出現(xiàn)降解。Trizol試劑提取RNA,2.5×106個細胞,異丙醇沉淀后看到了明顯的白色沉淀,30ulDEPC水溶解后,取5ulTE稀釋30倍測OD。
RNA濃度為0.522ug/ul,共得到15.7ugRNA。5ul提取的RNA,1%瓊脂糖凝膠,新電泳緩沖液。與前幾次的電泳結果一樣,還是看不到28S、18S兩條帶。1.換了一種裂解液,但電泳結果還是很像,說明問題不出在裂解這一步。2.提取時間大大縮短,但電泳結果還是很像,說明長提取時間對結果沒有影響。3.分析用到的有機溶劑,異丙醇和氯仿是在有裂解液的體系里沉淀RNA的,即使有RNA酶污染也不會降解RNA,異丙醇和氯仿污染可以被排除。剩下的就是乙醇了,兩種方法里,加入乙醇操作的時間是相同的,如果乙醇有RNA酶污染,兩種方法提取時RNA被裂解的效率是相同的,可以合理解釋兩次的電泳結果很類似。4.70℃保溫實驗的結果顯示,RNA溶液中殘留的RNA酶能把稍高分子量的RNA降解,以至于條代集中在膠的
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