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文檔簡(jiǎn)介
T/NAIAxxx-xxxx
一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌檢驗(yàn)
實(shí)時(shí)熒光PCR法
1范圍
本文件規(guī)定了一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌的實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)方法。
本文件適用于一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌的定性檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6882-2008分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)則和試驗(yàn)方法
GB/T27403-2008實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)
GB/T19495.2-2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要求
GB15979-2002一次性使用衛(wèi)生用品衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)
3術(shù)語(yǔ)和定義
3.1術(shù)語(yǔ)和定義
本標(biāo)準(zhǔn)采樣下列定義。
一次性一次性使用衛(wèi)生用品
使用一次后即丟棄的、與人體直接或間接接觸的、并為達(dá)到人體生理衛(wèi)生或衛(wèi)生保健(抗菌或抑菌)
目的而使用的各種日常生活用品,產(chǎn)品形狀可以是固體或液體。例如,一次性使用手套或指套(不包括
醫(yī)用手套或指套)、紙巾、濕巾、衛(wèi)生濕巾、電話膜、帽子、口罩、婦女經(jīng)期衛(wèi)生用品(包括衛(wèi)生護(hù)墊)、
尿布等排泄物衛(wèi)生用品(不包括廁所用紙)等。
3.2略縮語(yǔ)
DNA(deoxyribonuleicacid):脫氧核糖核酸
ska(streptokinasegene):鏈激酶基因
PCR(polymerasechainreaction):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
Ct值:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)
4原理
一次性使用衛(wèi)生用品樣品經(jīng)擴(kuò)增培養(yǎng)后,提取增菌液中DNA,以提取的DNA為模板,以溶血性鏈
球菌中(ska)基因中相對(duì)保守且高度特異的引物和探針進(jìn)行目標(biāo)物的實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增,根據(jù)Ct值判
斷樣品中是否含有溶血性鏈球菌。
5試劑和材料
試劑的配制及試驗(yàn)中的操作規(guī)范應(yīng)按GB/T27403的規(guī)定執(zhí)行。
除非另有說(shuō)明,本方法所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的一級(jí)水。所有試劑均用無(wú)DNA
酶污染的容器分裝。
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4.1試劑
5.1.1葡萄糖肉湯培養(yǎng)基:見(jiàn)附錄A.1。
5.1.2PCR擴(kuò)增引物序列:見(jiàn)附錄B.1。
5.1.3熒光探針序列見(jiàn)附錄B.1。
5.1.42X熒光定量PCR預(yù)混液。
5.1.5商品化DNA抽提試劑盒。
5.1.6溶血性鏈球菌和大腸埃希氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株:來(lái)源自國(guó)家認(rèn)可的菌種保藏機(jī)構(gòu)。
4.2耗材
5.1.1離心管:200μL、1.5ml、5mL、10mL。
5.1.2PCR反應(yīng)管:?jiǎn)喂?、八?lián)管或96孔PCR微孔板。
6儀器和設(shè)備
6.1分析天平:感量0.01g。
6.2微量可調(diào)移液器:?jiǎn)蔚?1~10μL、10~100μL、1~1000μL。
6.3恒溫水浴鍋。
6.4渦旋儀。
6.5冷凍高速離心機(jī)。
6.6高壓滅菌鍋。
6.7超凈工作臺(tái)。
6.8二級(jí)生物安全柜。
6.9實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。
6.10恒溫培養(yǎng)箱:35±1℃。
6.11核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)。
6.12普通冰箱:4℃,-20℃。
7實(shí)驗(yàn)操作步驟
7.1取樣
在100級(jí)凈化條件下用無(wú)菌方法打開(kāi)用于檢測(cè)的至少3個(gè)包裝,從每個(gè)包裝中取樣,準(zhǔn)確稱取10±1g
樣品。剪碎后加入200mL無(wú)菌生理鹽水中,充分混勻,得到一個(gè)生理鹽水樣液。液體產(chǎn)品直接用原液
作為樣液。
7.2增菌
取樣液(7.1)5mL,加入到50mL葡萄糖肉湯培養(yǎng)液中,充分混勻,置于35℃±1℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)
24h。
7.3模板DNA的提取與制備
7.3.1從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液。離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),去上清液。
加入600μL核酸裂解液,重懸浮細(xì)菌。100℃水浴5min后冷卻至室溫。12000rpm/min離心3min,將
上清液移至干凈的1.5mL離心管中,加入0.8倍體積異丙醇,置于4℃冰箱靜置1h,12000rpm/min離
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心2min,去上清液。加入200μL70%乙醇輕柔倒置洗滌2~3次,,12000rpm/min離心2min去上清,
風(fēng)干10~15min,加入100μL無(wú)菌雙蒸水重懸后于4℃保存,如不能即時(shí)檢驗(yàn),提取后DNA放置于-20℃
冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
7.3.2試劑盒法。從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液,離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),
按照商品化細(xì)菌基因組提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行細(xì)菌基因組DNA提取,如不能即時(shí)檢驗(yàn),提取后DNA
放置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
7.4DNA濃度和純度測(cè)定
取適量DNA原液加無(wú)菌雙蒸水稀釋至一定倍數(shù)后,使用核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)測(cè)定
260nm和280nm處吸光度,按照式(1)計(jì)算DNA的濃度。
0······························································(1)
式中:?=?260×?×5
—DNA濃度,單位為微克每毫升(μg/mL);
A260—260nm處的吸光值;
Nρ—核酸稀釋倍數(shù);
50—吸光值A(chǔ)260為1時(shí),相對(duì)應(yīng)雙鏈的DNA濃度常數(shù);
當(dāng)比值在1.8~2.0之間時(shí),適用于熒光PCR擴(kuò)增。
260
實(shí)?時(shí)熒光檢測(cè)
7.5?28P0CR
7.5.1實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)體系
試劑成分體積(μL)
2X熒光定量PCR反應(yīng)預(yù)混液12.5
DNA模板1
上游引物(10μM)0.6
下游引物(10μM)0.6
探針(5μM)0.3
ddH2O補(bǔ)齊至25μL
7.5.2實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)參數(shù)
預(yù)變性:95℃、5min,1個(gè)循環(huán);變性:95℃、15s,退火:60℃、30s,同時(shí)收集FAM熒光,延
伸:72℃、30s,44個(gè)循環(huán)。
7.5.3實(shí)驗(yàn)對(duì)照及平行
檢驗(yàn)過(guò)程中分別設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)照。陽(yáng)性對(duì)照為溶血性鏈球菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA,
陰性對(duì)照為大腸埃希氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA,用等體積的無(wú)菌雙蒸水作為空白對(duì)照。每個(gè)待檢樣品提取DNA
溶液進(jìn)行2個(gè)實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)。
8結(jié)果分析及表述
8.1質(zhì)量控制
以下條件有一條不滿足時(shí),實(shí)驗(yàn)視為無(wú)效,需重新進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
a)空白對(duì)照:無(wú)熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),相應(yīng)的Ct值>40.0;
b)陰性對(duì)照:無(wú)熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),相應(yīng)的Ct值>40.0;
c)陽(yáng)性對(duì)照:有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng)且熒光通道出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,相應(yīng)的Ct值<35.0。
8.2結(jié)果分析
在符合8.1情況下,被檢樣品進(jìn)行檢測(cè)時(shí):
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檢驗(yàn)樣本Ct值≤35.0時(shí),則判定被檢樣品為陽(yáng)性
檢驗(yàn)樣本Ct值≥40.0時(shí),則判定被檢樣品為陰性
如35.0<Ct值<40.0,判為結(jié)果可疑,需要重新檢測(cè)。重新檢測(cè)結(jié)果Ct值≥40.0,則判定被檢樣品為
陰性,反之判定為陽(yáng)性。
8.3結(jié)果表述
結(jié)果為陽(yáng)性者,該樣品檢驗(yàn)結(jié)果為溶血性鏈球菌初篩陽(yáng)性,對(duì)樣品增菌液進(jìn)一步按照GB15979-2002
中B5.1的規(guī)定進(jìn)行確證,確證為陽(yáng)性時(shí),報(bào)告檢出溶血性鏈球菌,確證為陰性時(shí),報(bào)告未檢出溶血性
鏈球菌。
結(jié)果為陰性者,表述為被檢樣品未檢出溶血性鏈球菌。
9預(yù)防污染措施
檢測(cè)過(guò)程中防止交叉污染的措施按照GB/T27403中的規(guī)定執(zhí)行。
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附錄A
(規(guī)范性附錄)
培養(yǎng)基和試劑配制
A.1葡萄糖肉湯培養(yǎng)基
A.1.1成分
蛋白胨10g
牛肉膏3g
氯化鈉5g
葡萄糖10g
蒸餾水1000mL
A.1.2制法
將上述成分溶于蒸餾水中,調(diào)節(jié)pH值為7.2~7.4,加熱溶解,分裝,121℃15min高壓滅菌后備用。
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附錄B
(規(guī)范性附錄)
一次性衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌的實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)所用引物及擴(kuò)增片段系列
B.1實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)所用上下游引物及熒光探針系列
溶血性鏈球菌基因引物序列探針序列
ska(耐熱核酸酶)F:5'-CACCTGAAACAAAGCATCCTAAA-3'5'-FAM-TGCTTCAGGGCCATATTTCTCTACACC-BHQ1-3'
R:5'-CGCTAAGCCACGTCCATATT-3'
ska基因的擴(kuò)增片段
1atgaaaaattacttatcttttgggatgtttgcactgctgtttgcattaacatttggaaca
61gtcaagcctgtccaagctattgctggacctgaatggctgctaggccgtccacctgtcaac
121aacagccaattagttgttagtatggccggtatcgttgaaggtaccgataaaaaagttttt
181ataaatttttttgaaatcgatctaacatcacaacctgctcacggaggaaagacagagcag
241ggcttaagtccaaaatcaaaaccatttgctacagataatggcgcaatgccacataaactt
301gaaaaagctgacttattaaaggctattcaagaacggctgatcgctaacgttcacagtaac
361gacggctactttgaggtcattgattttgcaagcgatgcaaccattactgaccgcgacgat
421aacatatactttgctaatcaagatggctcggtaaccttgcccacccagcctatccaacaa
481tttttgttaaggggacatgtgcgcgttagaccatataaagaaaaaccaatacaaactcca
541gcaaaatctgttgatataagatatactgtacagtttactcctttaaaccctgatgatgat
601ttcaaaccagttctcaaagatactaaactattgaaaacattagctatcggcgacaccatc
661acatcccaagaattactagctcaagcacaaagcattttaaacgaaagccatccagattat
721acgatttatgaacgtgattcctcaatcgtcactcatgacaatgacattttccgtacgatt
781ttaccaatagatcaaaagtttacttaccgtgtcaaaaatcgggaacaagcttataaggcc
841aattctaaaacagatattaaagaaaaaacgaacaacaccgaccttatctctgagaaatat
901tacatccttaaaaaaggggaaaagccgtatgatccctttgatcgcagtcacttgaaactg
961ttcaccatcaaatacgttgatgtcgataccaacgaattgctaaaaagtgagcagctctta
1021acagctagcgaacgtaacttagacttcagagatttatacgatcctcgtgataaggctaaa
1081ctactctacaacaatcttgatgcttttgatatcatggactataccttaactggaaaagta
1141gaggataatcacgataagaataatcgtgtcgtcacagtttatatgggtaagcgccctaaa
1201ggggcaaagggtagctatcatttagcttatgataaagatctctataccgaagaagaacga
1261gaagtttacagctacctgcgtgatacagggacacctatacctgataaccctaaagacaaa
1321taa
6
ICS07.100.99
C51
團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
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一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌檢驗(yàn)
實(shí)時(shí)熒光PCR法
DeterminationofStreptococcuspyogenesindisposablesanitaryproducts—
RealtimePCRmethod
xxxx-xx-xx發(fā)布xxxx-xx-xx實(shí)施
寧夏化學(xué)分析測(cè)試協(xié)會(huì)發(fā)布
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一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌檢驗(yàn)
實(shí)時(shí)熒光PCR法
1范圍
本文件規(guī)定了一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌的實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)方法。
本文件適用于一次性使用衛(wèi)生用品中溶血性鏈球菌的定性檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6882-2008分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)則和試驗(yàn)方法
GB/T27403-2008實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)
GB/T19495.2-2004轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要求
GB15979-2002一次性使用衛(wèi)生用品衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)
3術(shù)語(yǔ)和定義
3.1術(shù)語(yǔ)和定義
本標(biāo)準(zhǔn)采樣下列定義。
一次性一次性使用衛(wèi)生用品
使用一次后即丟棄的、與人體直接或間接接觸的、并為達(dá)到人體生理衛(wèi)生或衛(wèi)生保?。咕蛞志?/p>
目的而使用的各種日常生活用品,產(chǎn)品形狀可以是固體或液體。例如,一次性使用手套或指套(不包括
醫(yī)用手套或指套)、紙巾、濕巾、衛(wèi)生濕巾、電話膜、帽子、口罩、婦女經(jīng)期衛(wèi)生用品(包括衛(wèi)生護(hù)墊)、
尿布等排泄物衛(wèi)生用品(不包括廁所用紙)等。
3.2略縮語(yǔ)
DNA(deoxyribonuleicacid):脫氧核糖核酸
ska(streptokinasegene):鏈激酶基因
PCR(polymerasechainreaction):聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
Ct值:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)
4原理
一次性使用衛(wèi)生用品樣品經(jīng)擴(kuò)增培養(yǎng)后,提取增菌液中DNA,以提取的DNA為模板,以溶血性鏈
球菌中(ska)基因中相對(duì)保守且高度特異的引物和探針進(jìn)行目標(biāo)物的實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增,根據(jù)Ct值判
斷樣品中是否含有溶血性鏈球菌。
5試劑和材料
試劑的配制及試驗(yàn)中的操作規(guī)范應(yīng)按GB/T27403的規(guī)定執(zhí)行。
除非另有說(shuō)明,本方法所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的一級(jí)水。所有試劑均用無(wú)DNA
酶污染的容器分裝。
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4.1試劑
5.1.1葡萄糖肉湯培養(yǎng)基:見(jiàn)附錄A.1。
5.1.2PCR擴(kuò)增引物序列:見(jiàn)附錄B.1。
5.1.3熒光探針序列見(jiàn)附錄B.1。
5.1.42X熒光定量PCR預(yù)混液。
5.1.5商品化DNA抽提試劑盒。
5.1.6溶血性鏈球菌和大腸埃希氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株:來(lái)源自國(guó)家認(rèn)可的菌種保藏機(jī)構(gòu)。
4.2耗材
5.1.1離心管:200μL、1.5ml、5mL、10mL。
5.1.2PCR反應(yīng)管:?jiǎn)喂?、八?lián)管或96孔PCR微孔板。
6儀器和設(shè)備
6.1分析天平:感量0.01g。
6.2微量可調(diào)移液器:?jiǎn)蔚?1~10μL、10~100μL、1~1000μL。
6.3恒溫水浴鍋。
6.4渦旋儀。
6.5冷凍高速離心機(jī)。
6.6高壓滅菌鍋。
6.7超凈工作臺(tái)。
6.8二級(jí)生物安全柜。
6.9實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。
6.10恒溫培養(yǎng)箱:35±1℃。
6.11核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)。
6.12普通冰箱:4℃,-20℃。
7實(shí)驗(yàn)操作步驟
7.1取樣
在100級(jí)凈化條件下用無(wú)菌方法打開(kāi)用于檢測(cè)的至少3個(gè)包裝,從每個(gè)包裝中取樣,準(zhǔn)確稱取10±1g
樣品。剪碎后加入200mL無(wú)菌生理鹽水中,充分混勻,得到一個(gè)生理鹽水樣液。液體產(chǎn)品直接用原液
作為樣液。
7.2增菌
取樣液(7.1)5mL,加入到50mL葡萄糖肉湯培養(yǎng)液中,充分混勻,置于35℃±1℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)
24h。
7.3模板DNA的提取與制備
7.3.1從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液。離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),去上清液。
加入600μL核酸裂解液,重懸浮細(xì)菌。100℃水浴5min后冷卻至室溫。12000rpm/min離心3min,將
上清液移至干凈的1.5mL離心管中,加入0.8倍體積異丙醇,置于4℃冰箱靜置1h,12000rpm/min離
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心2min,去上清液。加入200μL70%乙醇輕柔倒置洗滌2~3次,,12000rpm/min離心2min去上清,
風(fēng)干10~15min,加入100μL無(wú)菌雙蒸水重懸后于4℃保存,如不能即時(shí)檢驗(yàn),提取后DNA放置于-20℃
冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
7.3.2試劑盒法。從樣品增菌液(7.2)表層吸取1mL增菌液,離心收集細(xì)菌(4000rpm/min,10min),
按照商品化細(xì)菌基因組提取試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行細(xì)菌基因組DNA提取,如不能即時(shí)檢驗(yàn),提取后DNA
放置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
7.4DNA濃度和純度測(cè)定
取適量DNA原液加無(wú)菌雙蒸水稀釋至一定倍數(shù)后,使用核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)測(cè)定
260nm和280nm處吸光度,按照式(1)計(jì)算DNA的濃度。
0······························································(1)
式中:
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