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文檔簡介
南京醫(yī)科大學(xué)生化教研室:王磊教學(xué)課件歡迎來到南京醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)課程。本課程由王磊教授主講,將深入淺出地帶領(lǐng)大家探索生命科學(xué)的微觀世界,揭示生物體內(nèi)分子的結(jié)構(gòu)、功能與代謝變化規(guī)律。生物化學(xué)是醫(yī)學(xué)教育的基礎(chǔ)學(xué)科,對理解人體健康與疾病的本質(zhì)具有重要意義。通過本課程的學(xué)習(xí),你將掌握從分子層面理解生命過程的能力,為未來的醫(yī)學(xué)實(shí)踐和科研工作奠定堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。課程簡介與教學(xué)目標(biāo)課程核心內(nèi)容定位本課程聚焦生物大分子的結(jié)構(gòu)與功能,代謝途徑及其調(diào)控機(jī)制,以及生物化學(xué)與醫(yī)學(xué)的緊密聯(lián)系。作為醫(yī)學(xué)教育的關(guān)鍵基礎(chǔ)課程,我們將以臨床應(yīng)用為導(dǎo)向,構(gòu)建系統(tǒng)的生物化學(xué)知識體系。教學(xué)知識體系建設(shè)從分子結(jié)構(gòu)入手,逐步深入代謝網(wǎng)絡(luò),最終達(dá)到對整體生命活動(dòng)的理解。課程將理論與實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,深化對生物化學(xué)原理的理解和應(yīng)用。培養(yǎng)生化分析與應(yīng)用能力通過系統(tǒng)學(xué)習(xí),培養(yǎng)學(xué)生運(yùn)用生物化學(xué)知識解釋生理現(xiàn)象、分析疾病機(jī)制以及探索疾病干預(yù)策略的能力,為后續(xù)醫(yī)學(xué)專業(yè)課程和臨床實(shí)踐奠定基礎(chǔ)。生物化學(xué)的發(fā)展簡史早期探索(18-19世紀(jì))1828年維勒合成尿素,打破了有機(jī)物只能由生物體合成的觀念。1897年布赫納發(fā)現(xiàn)無細(xì)胞酵母提取物能發(fā)酵糖,證明了生物化學(xué)反應(yīng)可在體外進(jìn)行。分子結(jié)構(gòu)解析時(shí)期(20世紀(jì)中期)1953年沃森與克里克闡明DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),開啟了分子生物學(xué)時(shí)代。1958年桑格完成胰島素的氨基酸序列測定,為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究奠定基礎(chǔ)?,F(xiàn)代生物化學(xué)發(fā)展(20世紀(jì)末至今)人類基因組計(jì)劃的完成、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的興起,推動(dòng)生物化學(xué)進(jìn)入系統(tǒng)生物學(xué)階段。CRISPR基因編輯技術(shù)的發(fā)展為生物化學(xué)研究提供了強(qiáng)大工具。中國生物化學(xué)學(xué)科建設(shè)從20世紀(jì)50年代開始,中國生物化學(xué)研究逐步發(fā)展。王應(yīng)睞、鄒承魯?shù)瓤茖W(xué)家為中國生物化學(xué)學(xué)科奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。如今,中國已成為生物化學(xué)研究的重要力量。南京醫(yī)科大學(xué)生化教研室簡介教研室歷史與成就南京醫(yī)科大學(xué)生化教研室始建于1935年,是國內(nèi)最早設(shè)立的醫(yī)學(xué)院校生化教研室之一。經(jīng)過數(shù)代學(xué)者的辛勤耕耘,已發(fā)展成為集教學(xué)、科研于一體的重要學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)。迄今已培養(yǎng)碩博士研究生數(shù)百名,發(fā)表SCI論文千余篇,多次獲得國家級和省部級科研獎(jiǎng)勵(lì)。主要師資與研究方向教研室現(xiàn)有教授10名,副教授15名,講師及實(shí)驗(yàn)員20余名,其中包括國家杰出青年基金獲得者2名,長江學(xué)者1名。主要研究方向涵蓋代謝性疾病機(jī)制、腫瘤代謝重編程、細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)翻譯后修飾等領(lǐng)域,在國內(nèi)外學(xué)術(shù)界具有重要影響力。教學(xué)特色與創(chuàng)新我們注重理論與實(shí)踐結(jié)合,采用案例教學(xué)、PBL教學(xué)、翻轉(zhuǎn)課堂等多種教學(xué)方法,培養(yǎng)學(xué)生的創(chuàng)新思維和解決問題的能力。建立了完善的實(shí)驗(yàn)教學(xué)體系,擁有生物化學(xué)與分子生物學(xué)國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心,為學(xué)生提供先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)平臺。生物分子的基本組成水與無機(jī)元素水是生命的搖籃,占人體重量的65-70%。主要無機(jī)元素包括鈉、鉀、鈣、鎂、氯等,它們在維持酸堿平衡、滲透壓和神經(jīng)傳導(dǎo)中扮演重要角色。有機(jī)元素及其生物意義碳、氫、氧、氮、硫、磷是構(gòu)成生物大分子的基本元素。碳原子的特殊化學(xué)性質(zhì)使其能形成多樣化的生物分子,是生命的核心元素。生物分子分類生物分子主要包括蛋白質(zhì)、核酸、糖類和脂類四大類。它們共同構(gòu)成了細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和功能單元,是生命活動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ)。3微量元素功能鐵、鋅、銅、錳等微量元素雖含量極少,但在酶催化、氧運(yùn)輸、免疫功能等方面具有不可替代的作用。缺乏這些元素會導(dǎo)致嚴(yán)重的生理功能障礙。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能1四級結(jié)構(gòu)多個(gè)蛋白質(zhì)亞基的空間排列組合三級結(jié)構(gòu)多肽鏈的空間折疊構(gòu)象二級結(jié)構(gòu)α-螺旋、β-折疊等局部有序排列一級結(jié)構(gòu)氨基酸的線性排列順序蛋白質(zhì)是由20種基本氨基酸通過肽鍵連接而成的生物大分子。每種氨基酸具有不同的化學(xué)性質(zhì),它們的排列順序決定了蛋白質(zhì)的最終結(jié)構(gòu)和功能。蛋白質(zhì)在生物體內(nèi)承擔(dān)著結(jié)構(gòu)支持、催化反應(yīng)、信號傳導(dǎo)、免疫防御等多種關(guān)鍵功能。蛋白質(zhì)的折疊過程受多種因素影響,包括氫鍵、疏水作用、離子鍵、范德華力等。蛋白質(zhì)折疊錯(cuò)誤可能導(dǎo)致一系列疾病,如阿爾茨海默病、帕金森病等神經(jīng)退行性疾病。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)分析實(shí)驗(yàn)方法X射線晶體學(xué)通過分析X射線在蛋白質(zhì)晶體中的衍射圖案,可以確定原子在三維空間中的精確位置,是解析蛋白質(zhì)高分辨率結(jié)構(gòu)的金標(biāo)準(zhǔn)方法。該技術(shù)已解析了數(shù)萬種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),但需要獲得高質(zhì)量的蛋白質(zhì)晶體。核磁共振(NMR)技術(shù)利用原子核在磁場中的共振現(xiàn)象,測定原子間的空間距離和相互作用,可在溶液狀態(tài)下研究蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)和功能。NMR特別適合于研究小分子蛋白和蛋白質(zhì)的區(qū)域動(dòng)力學(xué)變化。質(zhì)譜分析通過測定蛋白質(zhì)或肽段的質(zhì)荷比,確定氨基酸序列和翻譯后修飾?,F(xiàn)代質(zhì)譜技術(shù)如液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)已成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究的核心工具,可同時(shí)分析成千上萬種蛋白質(zhì)。冷凍電鏡技術(shù)將樣品快速冷凍在玻璃態(tài)冰中,保持其天然結(jié)構(gòu),然后通過電子顯微鏡成像。近年來隨著探測器和圖像處理算法的進(jìn)步,冷凍電鏡已能達(dá)到接近原子分辨率,尤其適合于研究大型蛋白質(zhì)復(fù)合物。酶的本質(zhì)與分類酶的本質(zhì)酶是具有高度特異性的生物催化劑,絕大多數(shù)為蛋白質(zhì),少數(shù)為RNA(核酶)。它們能降低化學(xué)反應(yīng)的活化能,加速生物化學(xué)反應(yīng),但本身不改變反應(yīng)的平衡常數(shù)。催化機(jī)制酶通過與底物形成酶-底物復(fù)合物,提供有利的微環(huán)境促進(jìn)反應(yīng)進(jìn)行。催化過程可能涉及共價(jià)催化、酸堿催化、金屬離子催化和近程效應(yīng)等多種機(jī)制。分類系統(tǒng)國際酶學(xué)委員會將酶分為六大類:氧化還原酶、轉(zhuǎn)移酶、水解酶、裂解酶、異構(gòu)酶和連接酶。每種酶都有特定的EC編號,反映其催化的反應(yīng)類型。酶的活性中心通常只占整個(gè)酶分子的一小部分,其余部分維持適當(dāng)?shù)娜S構(gòu)象。很多酶需要輔因子(如輔酶、金屬離子)參與催化。酶的專一性體現(xiàn)在對底物結(jié)構(gòu)和反應(yīng)類型的選擇性上,是生物體精確調(diào)控生化反應(yīng)的基礎(chǔ)。酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)米氏方程基本原理米氏方程描述了酶促反應(yīng)速率與底物濃度之間的關(guān)系:v=Vmax[S]/(Km+[S])。該方程基于酶與底物形成可逆的酶-底物復(fù)合物,然后產(chǎn)物釋放的假設(shè)。當(dāng)?shù)孜餄舛冗h(yuǎn)低于Km時(shí),反應(yīng)速率與底物濃度成正比;當(dāng)?shù)孜餄舛冗h(yuǎn)高于Km時(shí),反應(yīng)速率接近最大值Vmax,表現(xiàn)為零級反應(yīng)動(dòng)力學(xué)。Km與Vmax的生物學(xué)意義Km(米氏常數(shù))等于使反應(yīng)速率達(dá)到Vmax一半的底物濃度,反映了酶與底物的親和力。Km值越小,親和力越大。不同酶的Km值差異很大,從微摩爾到毫摩爾范圍不等。Vmax(最大反應(yīng)速率)反映了在酶量固定條件下,反應(yīng)能達(dá)到的最大速度,與酶的催化效率和總量有關(guān)。kcat(轉(zhuǎn)換數(shù))表示每個(gè)酶活性中心單位時(shí)間內(nèi)能轉(zhuǎn)化的底物分子數(shù)。通過雙倒數(shù)作圖法(Lineweaver-Burk圖)可以線性化米氏方程,更便于從實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中確定Km和Vmax。酶的效率常用催化效率常數(shù)kcat/Km表示,接近擴(kuò)散限制的酶(10^7-10^9M^-1s^-1)被認(rèn)為達(dá)到了"催化完美"。酶的調(diào)控與抑制劑酶活性調(diào)控機(jī)制酶活性調(diào)控是生物體精確控制代謝流向的關(guān)鍵機(jī)制。基因表達(dá)水平調(diào)控決定了酶的總量;而變構(gòu)調(diào)節(jié)、共價(jià)修飾、蛋白質(zhì)相互作用等機(jī)制則可快速調(diào)節(jié)已存在酶的活性。反饋抑制是最常見的調(diào)控方式之一,代謝途徑的最終產(chǎn)物可抑制該途徑的關(guān)鍵酶,確保產(chǎn)物不會過量產(chǎn)生。這種調(diào)控方式在氨基酸合成等生物合成途徑中尤為重要。酶抑制劑類型與機(jī)制競爭性抑制劑與底物競爭酶的活性位點(diǎn),導(dǎo)致表觀Km增大而Vmax不變。增加底物濃度可克服此類抑制。非競爭性抑制劑結(jié)合在酶的別構(gòu)位點(diǎn),改變酶的構(gòu)象,降低酶的活性,表現(xiàn)為Vmax降低而Km不變。不可逆抑制劑通常與酶活性中心的關(guān)鍵氨基酸殘基形成共價(jià)鍵,永久性地滅活酶。如有機(jī)磷農(nóng)藥抑制乙酰膽堿酯酶,導(dǎo)致神經(jīng)傳遞物質(zhì)積累和中毒癥狀。許多重要藥物是酶抑制劑,如他汀類藥物抑制HMG-CoA還原酶降低膽固醇合成,抗生素如青霉素抑制細(xì)菌細(xì)胞壁合成酶。了解酶的抑制機(jī)制對藥物設(shè)計(jì)和毒理學(xué)研究至關(guān)重要。碳水化合物基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)單糖-基本構(gòu)建單元單糖是最簡單的碳水化合物,不能通過水解產(chǎn)生更小的糖分子。葡萄糖(C?H??O?)是人體最重要的能量來源,在血液中以游離形式存在。其他重要單糖包括果糖、半乳糖、核糖等。單糖可形成環(huán)狀結(jié)構(gòu),α和β構(gòu)型的差異對生物學(xué)性質(zhì)有重要影響。二糖-常見營養(yǎng)物質(zhì)二糖由兩個(gè)單糖通過糖苷鍵連接形成。蔗糖(葡萄糖+果糖)是日常食品中最常見的糖;乳糖(半乳糖+葡萄糖)是哺乳動(dòng)物乳汁中的主要糖;麥芽糖(兩個(gè)葡萄糖)在谷物發(fā)芽過程中產(chǎn)生。這些二糖在消化過程中需要特定的酶水解為單糖才能被吸收。多糖-儲能與結(jié)構(gòu)功能多糖由大量單糖重復(fù)單元組成,分子量可達(dá)數(shù)百萬。儲能多糖如糖原(動(dòng)物)和淀粉(植物)由葡萄糖單元組成,是生物體短期能量儲存形式。結(jié)構(gòu)多糖如纖維素(植物細(xì)胞壁)和幾丁質(zhì)(節(jié)肢動(dòng)物外骨骼)提供機(jī)械支持和保護(hù)功能。糖胺聚糖是結(jié)締組織的重要組成部分。碳水化合物除了作為能量來源外,還參與多種生物學(xué)過程。細(xì)胞表面的糖蛋白和糖脂在細(xì)胞識別、免疫應(yīng)答和信號傳導(dǎo)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。核糖和脫氧核糖是核酸的重要組成部分。糖綴合物的結(jié)構(gòu)多樣性使其成為生物學(xué)信息編碼的重要媒介。糖類代謝重要通路糖酵解糖酵解是細(xì)胞質(zhì)中將葡萄糖分解為丙酮酸的十步反應(yīng)過程。每分子葡萄糖產(chǎn)生2分子ATP、2分子NADH和2分子丙酮酸。關(guān)鍵限速酶包括己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶,它們是調(diào)控點(diǎn)。這一過程在有氧和無氧條件下都能進(jìn)行,是幾乎所有細(xì)胞獲取能量的基本途徑。三羧酸循環(huán)又稱檸檬酸循環(huán)或克雷布斯循環(huán),在線粒體基質(zhì)中進(jìn)行。每個(gè)循環(huán)將一分子乙酰CoA完全氧化為二氧化碳,同時(shí)產(chǎn)生3分子NADH、1分子FADH?和1分子GTP。關(guān)鍵酶包括檸檬酸合成酶、異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體。除提供能量外,TCA循環(huán)還為多種生物合成反應(yīng)提供中間產(chǎn)物。電子傳遞鏈與氧化磷酸化位于線粒體內(nèi)膜上的電子傳遞鏈接受來自NADH和FADH?的電子,通過一系列氧化還原反應(yīng)最終將電子傳遞給氧氣生成水。這一過程釋放的能量用于將質(zhì)子泵出線粒體基質(zhì),形成質(zhì)子梯度。ATP合酶利用質(zhì)子回流的能量合成ATP。這一過程是有氧條件下ATP生成的主要來源,效率遠(yuǎn)高于糖酵解。糖代謝的各途徑緊密連接,形成復(fù)雜的代謝網(wǎng)絡(luò)。在不同組織和不同生理狀態(tài)下,這些途徑的活性受到精確調(diào)控,以滿足細(xì)胞能量需求和生物合成需要。糖代謝異常與多種疾病相關(guān),如糖尿病、癌癥和神經(jīng)退行性疾病等。糖原代謝與調(diào)控糖原合成糖原合成始于糖原合成酶將UDP-葡萄糖的葡萄糖部分轉(zhuǎn)移到已有糖原分子上。新的α-1,4-糖苷鍵形成延長糖鏈。分支酶負(fù)責(zé)形成α-1,6-糖苷鍵創(chuàng)建分支點(diǎn),增加糖原的溶解度和代謝效率。糖原分解糖原磷酸化酶從糖原非還原端逐個(gè)切下葡萄糖,形成葡萄糖-1-磷酸。脫支酶將分支點(diǎn)處的葡萄糖殘基轉(zhuǎn)移到主鏈上,確保完全分解。肝臟中的葡萄糖-6-磷酸酶可將G6P轉(zhuǎn)化為游離葡萄糖釋放到血液中維持血糖水平。代謝平衡調(diào)控糖原合成和分解不會同時(shí)以高速率進(jìn)行,避免無謂的ATP消耗。兩個(gè)過程中的關(guān)鍵酶受到相反的調(diào)控:當(dāng)糖原合成酶活性增強(qiáng)時(shí),糖原磷酸化酶被抑制,反之亦然。這種精確協(xié)調(diào)確保能量儲存和釋放過程的高效性。激素調(diào)節(jié)機(jī)制胰島素促進(jìn)糖原合成,抑制糖原分解;而胰高血糖素、腎上腺素和皮質(zhì)醇則促進(jìn)糖原分解。這些激素通過影響蛋白激酶A和蛋白激酶B等信號通路,改變關(guān)鍵酶的磷酸化狀態(tài),從而控制它們的活性。脂類的分類和結(jié)構(gòu)簡單脂質(zhì)主要包括脂肪酸和三酰甘油。脂肪酸是由碳?xì)滏満鸵粋€(gè)羧基組成的一元羧酸,可分為飽和脂肪酸(無雙鍵)和不飽和脂肪酸(含一個(gè)或多個(gè)雙鍵)。不飽和脂肪酸的雙鍵可呈順式或反式構(gòu)型,對脂肪酸的物理性質(zhì)和生理功能有重要影響。三酰甘油由一分子甘油與三分子脂肪酸酯化形成,是生物體最主要的能量儲存形式。復(fù)合脂質(zhì)磷脂是細(xì)胞膜的主要成分,由甘油骨架、兩條脂肪酸鏈和一個(gè)含磷的極性頭部組成,具有兩親性特點(diǎn)。主要包括磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰絲氨酸和磷脂酰肌醇等。糖脂含有糖基部分,主要存在于細(xì)胞膜外層,參與細(xì)胞識別和信號傳導(dǎo)。鞘脂以鞘氨醇為骨架,包括神經(jīng)鞘磷脂、腦苷脂和神經(jīng)節(jié)苷脂等。衍生脂質(zhì)固醇類是重要的衍生脂質(zhì),膽固醇是其中最著名的代表。膽固醇是細(xì)胞膜的重要組成部分,影響膜的流動(dòng)性,同時(shí)也是類固醇激素和膽汁酸的前體。其他衍生脂質(zhì)包括脂溶性維生素(A、D、E、K)、類胡蘿卜素和前列腺素等。前列腺素由花生四烯酸衍生而來,作為局部激素參與多種生理過程的調(diào)節(jié)。脂肪酸的分解與合成脂肪酸β-氧化通路脂肪酸β-氧化是脂肪酸在線粒體基質(zhì)中分解的主要途徑。過程始于脂肪酸活化形成脂酰CoA,然后通過肉堿穿梭系統(tǒng)進(jìn)入線粒體。在線粒體中,脂肪酸通過四步循環(huán)反應(yīng)(脫氫、水合、再脫氫、硫解)逐步從羧基端切下兩個(gè)碳原子,形成乙酰CoA和縮短兩個(gè)碳的脂酰CoA。每輪β-氧化產(chǎn)生1分子FADH?、1分子NADH和1分子乙酰CoA。乙酰CoA進(jìn)入TCA循環(huán)進(jìn)一步氧化。一個(gè)16碳脂肪酸完全氧化產(chǎn)生約129分子ATP,能量效率遠(yuǎn)高于葡萄糖。脂肪酸合成途徑脂肪酸合成主要在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行,由脂肪酸合成酶復(fù)合體催化。與β-氧化方向相反,但反應(yīng)機(jī)制不同。起始底物是乙酰CoA和丙二酰CoA,經(jīng)過縮合、還原、脫水和再還原四步循環(huán)反應(yīng),每輪循環(huán)延長兩個(gè)碳原子。脂肪酸合成酶是一個(gè)多功能復(fù)合體,包含七個(gè)功能域。合成過程需要NADPH提供還原力,主要來自戊糖磷酸途徑。合成的主要產(chǎn)物是棕櫚酸(C16:0),可進(jìn)一步延長或去飽和形成其他脂肪酸。脂肪酸分解和合成在不同細(xì)胞器中進(jìn)行,受到不同酶系統(tǒng)控制,并通過激素和代謝中間物精確調(diào)節(jié)。瘦素、胰島素和胰高血糖素等激素通過調(diào)控關(guān)鍵酶的表達(dá)和活性,協(xié)調(diào)脂肪酸代謝與整體能量狀態(tài)。肥胖和2型糖尿病常伴有脂肪酸代謝異常。膜脂與生物膜功能生物膜結(jié)構(gòu)模型生物膜遵循液態(tài)鑲嵌模型,由脂質(zhì)雙分子層作為基本骨架,膜蛋白嵌入或附著其中。膜脂的兩親性特點(diǎn)(親水頭部和疏水尾部)使其自發(fā)形成雙分子層結(jié)構(gòu),為細(xì)胞提供物理屏障和功能平臺。磷脂分子特性磷脂是膜的主要成分,包括磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺等。不同磷脂頭部的電荷特性和脂肪酸尾部的長度、飽和度影響膜的流動(dòng)性和曲率。磷脂不對稱分布在膜的兩側(cè),形成功能上的不對稱性。膽固醇調(diào)節(jié)作用膽固醇插入磷脂雙層中,其剛性環(huán)狀結(jié)構(gòu)限制磷脂尾部的運(yùn)動(dòng),在高溫時(shí)降低膜流動(dòng)性,低溫時(shí)防止膜過度剛性。膽固醇含量的調(diào)節(jié)是細(xì)胞適應(yīng)環(huán)境變化的重要機(jī)制。生物膜不僅是細(xì)胞的邊界,還是多種生物學(xué)過程的場所。膜脂參與細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo),如磷脂酰肌醇代謝產(chǎn)物作為第二信使。膜脂筏是富含膽固醇和鞘脂的微區(qū)域,為特定蛋白質(zhì)提供功能平臺。膜脂代謝異常與多種疾病相關(guān),如動(dòng)脈粥樣硬化、神經(jīng)退行性疾病和癌癥。核酸的分子基礎(chǔ)核苷酸基本結(jié)構(gòu)核苷酸是核酸的基本構(gòu)建單元,由三部分組成:含氮堿基、五碳糖(核糖或脫氧核糖)和磷酸基團(tuán)。堿基分為嘌呤(腺嘌呤A和鳥嘌呤G)和嘧啶(胞嘧啶C、胸腺嘧啶T和尿嘧啶U)兩大類。核苷酸通過磷酸二酯鍵連接形成核酸鏈。DNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)DNA通常呈雙螺旋結(jié)構(gòu),兩條多核苷酸鏈通過堿基間的氫鍵配對(A-T、G-C)連接,并圍繞共同軸線螺旋排列。DNA的糖為脫氧核糖,堿基包括A、G、C、T。DNA分子結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,主要功能是儲存和傳遞遺傳信息。DNA可形成不同構(gòu)象,如B型、A型和Z型。RNA多樣性與功能RNA通常為單鏈結(jié)構(gòu),糖為核糖,堿基包括A、G、C、U(代替T)。RNA可通過分子內(nèi)堿基配對形成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)。主要RNA類型包括:mRNA(傳遞遺傳信息)、tRNA(轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸)、rRNA(構(gòu)成核糖體)、以及各種非編碼RNA(如miRNA、lncRNA等),參與基因表達(dá)調(diào)控。核酸是生命的信息分子,DNA中的遺傳信息通過RNA轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)翻譯實(shí)現(xiàn)生物功能。核酸序列分析和操作是現(xiàn)代生物技術(shù)的基礎(chǔ),如PCR、基因測序、CRISPR基因編輯等。理解核酸結(jié)構(gòu)與功能對疾病機(jī)制研究和藥物開發(fā)具有重要意義。DNA的復(fù)制、損傷與修復(fù)復(fù)制起始DNA解旋酶打開雙螺旋,形成復(fù)制起點(diǎn)半保留復(fù)制新合成鏈與模板鏈配對形成兩個(gè)雙螺旋損傷識別特定蛋白識別DNA損傷位點(diǎn)修復(fù)機(jī)制不同損傷類型對應(yīng)特異性修復(fù)途徑DNA復(fù)制是一個(gè)高度精確的過程,錯(cuò)誤率約為10??。復(fù)制過程需要多種酶和蛋白質(zhì)協(xié)同作用:DNA聚合酶催化新鏈合成;引物酶合成RNA引物提供3'-OH端;DNA連接酶連接岡崎片段;拓?fù)洚悩?gòu)酶緩解超螺旋張力。DNA損傷來源廣泛,包括紫外線輻射導(dǎo)致的嘧啶二聚體、化學(xué)物質(zhì)引起的堿基修飾、自發(fā)脫嘌呤/脫嘧啶及氧化損傷等。修復(fù)系統(tǒng)包括直接修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、錯(cuò)配修復(fù)、重組修復(fù)等。DNA修復(fù)缺陷與多種疾病相關(guān),如色素性干皮癥和某些癌癥。轉(zhuǎn)錄與翻譯機(jī)制轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)RNA聚合酶在啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄因子輔助下打開DNA雙鏈,開始合成RNA。真核生物RNA聚合酶II負(fù)責(zé)mRNA合成,需要一系列基本轉(zhuǎn)錄因子(TFIIA、TFIIB等)參與組裝前起始復(fù)合物。啟動(dòng)子上游與下游的調(diào)控元件影響轉(zhuǎn)錄效率。RNA加工修飾真核生物初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物需要經(jīng)過多步加工:5'端加帽、3'端多腺苷酸化、內(nèi)含子剪接等。選擇性剪接使同一基因可產(chǎn)生多種mRNA變體。RNA修飾(如甲基化)進(jìn)一步調(diào)控RNA穩(wěn)定性和功能。成熟mRNA經(jīng)核孔復(fù)合體輸出到細(xì)胞質(zhì)進(jìn)行翻譯。翻譯過程翻譯在核糖體上進(jìn)行,分為起始、延伸和終止三個(gè)階段。起始涉及起始密碼子(AUG)識別和起始復(fù)合物形成;延伸階段tRNA將氨基酸帶到核糖體,通過肽基轉(zhuǎn)移酶活性形成肽鍵;遇到終止密碼子時(shí),釋放因子結(jié)合導(dǎo)致多肽鏈釋放和核糖體亞基解離。翻譯后修飾新合成的多肽鏈可能需要多種修飾才能獲得完全功能:切除信號肽、糖基化、磷酸化、泛素化等。蛋白質(zhì)折疊得到幫助蛋白(如分子伴侶)輔助。某些蛋白質(zhì)需要跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)到特定亞細(xì)胞位置才能發(fā)揮功能。翻譯后修飾顯著擴(kuò)展了蛋白質(zhì)組的多樣性?;虮磉_(dá)調(diào)控原核生物基因表達(dá)調(diào)控原核生物基因調(diào)控相對簡單,主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄水平。典型模式是操縱子系統(tǒng),包括結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控序列(啟動(dòng)子、操縱基因、操縱子)。乳糖操縱子是經(jīng)典例子:無乳糖時(shí),阻遏蛋白結(jié)合操縱子阻止轉(zhuǎn)錄;有乳糖時(shí),乳糖與阻遏蛋白結(jié)合使其構(gòu)象改變,離開操縱子允許轉(zhuǎn)錄。另有正調(diào)控系統(tǒng),如阿拉伯糖操縱子中的CAP蛋白在cAMP存在時(shí)促進(jìn)RNA聚合酶結(jié)合。原核生物基因組緊湊,往往多個(gè)功能相關(guān)基因共同轉(zhuǎn)錄為一個(gè)多順反子mRNA。真核生物調(diào)控的復(fù)雜性真核基因表達(dá)調(diào)控在多個(gè)層面進(jìn)行:染色質(zhì)水平(DNA甲基化、組蛋白修飾)、轉(zhuǎn)錄水平(轉(zhuǎn)錄因子、增強(qiáng)子、沉默子)、RNA加工水平(選擇性剪接、RNA編輯)、轉(zhuǎn)錄后水平(miRNA調(diào)控、RNA穩(wěn)定性)、翻譯水平和蛋白質(zhì)水平(翻譯后修飾、蛋白質(zhì)降解)。真核調(diào)控的顯著特點(diǎn)是遠(yuǎn)距離作用的增強(qiáng)子,它們可位于基因上游、內(nèi)含子中甚至下游很遠(yuǎn)處。染色質(zhì)環(huán)化使增強(qiáng)子與啟動(dòng)子接觸。組織特異性表達(dá)通常由多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同控制,形成復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。表觀遺傳調(diào)控增加了基因表達(dá)的復(fù)雜性,包括DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA和染色質(zhì)重塑等機(jī)制。這些修飾可以穩(wěn)定遺傳,但不改變DNA序列。表觀遺傳變化在發(fā)育、分化和疾病過程中起重要作用。環(huán)境因素也可通過表觀遺傳機(jī)制影響基因表達(dá),形成基因-環(huán)境互作。信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與細(xì)胞通訊3主要信號通路類型囊泡運(yùn)輸信號通路:配體與受體內(nèi)化后在胞內(nèi)傳遞信號;G蛋白偶聯(lián)受體通路:通過G蛋白活化腺苷酸環(huán)化酶或磷脂酶C;受體酪氨酸激酶通路:受體二聚化后自磷酸化激活下游通路20+第二信使種類cAMP、cGMP、IP3、DAG、Ca2?等小分子在細(xì)胞內(nèi)傳遞和放大外部信號。它們激活特定蛋白激酶,引發(fā)級聯(lián)反應(yīng),最終影響基因表達(dá)或細(xì)胞功能500+人類蛋白激酶數(shù)量蛋白激酶通過磷酸化修飾下游蛋白,改變其活性、定位或互作能力。絲氨酸/蘇氨酸激酶和酪氨酸激酶是兩大主要家族,形成復(fù)雜的信號網(wǎng)絡(luò)細(xì)胞通訊是多細(xì)胞生物協(xié)調(diào)功能的基礎(chǔ),包括內(nèi)分泌信號(遠(yuǎn)距離,通過血液)、旁分泌信號(近距離,擴(kuò)散至鄰近細(xì)胞)、自分泌信號(作用于產(chǎn)生細(xì)胞本身)和接觸依賴性信號(需要細(xì)胞直接接觸)。信號轉(zhuǎn)導(dǎo)異常與多種疾病相關(guān),如癌癥(生長因子信號過度活化)、糖尿?。ㄒ葝u素信號缺陷)等。能量代謝基礎(chǔ)能量來源與轉(zhuǎn)換生物體的能量最初來源于太陽,通過光合作用轉(zhuǎn)化為化學(xué)能。動(dòng)物通過食物鏈獲取能量,在體內(nèi)通過食物分解釋放能量,并轉(zhuǎn)化為ATP的化學(xué)能,用于驅(qū)動(dòng)各種生命活動(dòng)。ATP的結(jié)構(gòu)與功能ATP(三磷酸腺苷)由腺嘌呤、核糖和三個(gè)磷酸基團(tuán)組成。高能磷酸鍵水解釋放能量,ATP→ADP+Pi約釋放30.5kJ/mol能量。ATP是細(xì)胞內(nèi)能量的即時(shí)貨幣,不適合長期儲存能量。ATP的生成途徑底物水平磷酸化:在糖酵解和TCA循環(huán)中直接將高能磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到ADP上。氧化磷酸化:在線粒體內(nèi)膜上,電子傳遞鏈產(chǎn)生的質(zhì)子梯度驅(qū)動(dòng)ATP合酶合成ATP,是有氧條件下ATP生成的主要方式。能量平衡與調(diào)控人體每天周轉(zhuǎn)約60-70kgATP,但任一時(shí)刻僅存在約50g。通過精確調(diào)控ATP合成和消耗的平衡,維持能量穩(wěn)態(tài)。能量代謝紊亂與多種疾病相關(guān),如肥胖、糖尿病、神經(jīng)退行性疾病等。生物氧化及呼吸鏈生物氧化是生物體內(nèi)物質(zhì)的氧化過程,通過呼吸鏈完成電子逐步傳遞到氧氣的過程。線粒體是細(xì)胞的"能量工廠",其內(nèi)膜上排列著呼吸鏈復(fù)合體。呼吸鏈由四個(gè)主要復(fù)合體組成:復(fù)合體I(NADH脫氫酶)、復(fù)合體II(琥珀酸脫氫酶)、復(fù)合體III(細(xì)胞色素b-c1復(fù)合體)和復(fù)合體IV(細(xì)胞色素c氧化酶)。電子從NADH或FADH?經(jīng)復(fù)合體I或II進(jìn)入呼吸鏈,經(jīng)泛醌、復(fù)合體III、細(xì)胞色素c、復(fù)合體IV,最終傳遞給氧氣生成水。在這個(gè)過程中,復(fù)合體I、III、IV將質(zhì)子泵出線粒體基質(zhì)到膜間隙,形成質(zhì)子梯度。ATP合酶(也稱復(fù)合體V)利用質(zhì)子回流的能量合成ATP。這種化學(xué)滲透機(jī)制高效地將氧化能轉(zhuǎn)化為ATP的化學(xué)能。代謝物的跨膜運(yùn)輸主動(dòng)運(yùn)輸機(jī)制主動(dòng)運(yùn)輸需要能量輸入,可將物質(zhì)逆濃度梯度運(yùn)輸。初級主動(dòng)運(yùn)輸直接利用ATP水解能量,如Na?/K?-ATPase和Ca2?-ATPase。次級主動(dòng)運(yùn)輸利用離子濃度梯度的電化學(xué)能進(jìn)行協(xié)同運(yùn)輸或反向運(yùn)輸,如葡萄糖Na?共轉(zhuǎn)運(yùn)體和Na?/Ca2?交換體。ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族是重要的主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,參與藥物、脂質(zhì)和多肽的轉(zhuǎn)運(yùn),與多藥耐藥性相關(guān)。P-糖蛋白是最著名的ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,能將多種藥物泵出細(xì)胞。被動(dòng)運(yùn)輸比較被動(dòng)運(yùn)輸不消耗能量,物質(zhì)沿濃度梯度方向移動(dòng)。簡單擴(kuò)散主要適用于小型非極性分子(如O?、CO?和脂溶性小分子)穿過脂雙層。促進(jìn)擴(kuò)散通過特異性載體蛋白進(jìn)行,如葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白GLUT家族和水通道蛋白。離子通道是膜跨越蛋白,形成水性通道使特定離子快速通過。根據(jù)開關(guān)機(jī)制分為電壓門控、配體門控和機(jī)械門控通道。離子通道功能異常與多種疾病相關(guān),如囊性纖維化和某些神經(jīng)肌肉疾病。轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族SLC(溶質(zhì)載體)家族包含400多個(gè)成員,負(fù)責(zé)各種小分子物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸,如氨基酸、糖類、核苷和離子等。不同組織表達(dá)特定的SLC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白譜系,滿足其代謝和功能需求。線粒體內(nèi)膜含有特殊轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白系統(tǒng),如腺嘌呤核苷酸轉(zhuǎn)位酶(交換ATP/ADP)和磷酸鹽載體。這些轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白確保線粒體與細(xì)胞質(zhì)之間的代謝物交換,維持能量代謝的正常運(yùn)行。氨基酸代謝與疾病氨基酸合成與分解概述人體可合成11種非必需氨基酸,其余9種必需氨基酸需從食物獲取。氨基酸分解首先去除α-氨基(轉(zhuǎn)氨基作用和氧化脫氨基作用),氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蛩亟?jīng)腎臟排出。碳骨架根據(jù)其最終去向分為糖原性(可轉(zhuǎn)化為葡萄糖)和酮原性(轉(zhuǎn)化為酮體)。特殊代謝產(chǎn)物功能除構(gòu)成蛋白質(zhì)外,氨基酸還是多種重要生物分子的前體:色氨酸轉(zhuǎn)化為5-羥色胺(血清素);酪氨酸產(chǎn)生兒茶酚胺類神經(jīng)遞質(zhì)和黑色素;精氨酸為一氧化氮合成提供底物;甲硫氨酸提供甲基用于DNA甲基化和其他甲基化反應(yīng)。氨基酸代謝異常疾病苯丙酮尿癥:苯丙氨酸羥化酶缺陷導(dǎo)致苯丙氨酸蓄積,干擾腦發(fā)育;楓糖尿癥:支鏈氨基酸代謝障礙;同型半胱氨酸血癥:甲硫氨酸代謝異常,增加心血管疾病風(fēng)險(xiǎn);高苯丙氨酸血癥、酪氨酸血癥等。這些疾病多為常染色體隱性遺傳,可通過新生兒篩查早期發(fā)現(xiàn)。氨基酸代謝網(wǎng)絡(luò)與其他代謝途徑緊密連接。某些氨基酸可直接進(jìn)入TCA循環(huán)(如谷氨酸);一些氨基酸參與糖異生過程(如丙氨酸);支鏈氨基酸對肌肉能量代謝和蛋白質(zhì)合成具有特殊意義。肝臟是氨基酸代謝的中心器官,也是尿素循環(huán)的唯一場所。嘌呤、嘧啶代謝1合成路徑嘌呤核苷酸從頭合成始于磷酸核糖焦磷酸(PRPP),通過多步酶促反應(yīng)形成肌苷酸(IMP),再轉(zhuǎn)化為腺苷酸(AMP)和鳥苷酸(GMP)。嘧啶合成以天冬氨酸和氨基甲酰磷酸為起始物質(zhì),經(jīng)過途中酶催化形成尿苷酸(UMP),再轉(zhuǎn)化為胞苷酸(CMP)和胸苷酸(TMP)。2補(bǔ)救途徑核苷酸的補(bǔ)救合成利用游離堿基或核苷,是能量高效的再利用方式。主要酶包括腺嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(APRT)和次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(HGPRT)。HGPRT缺陷導(dǎo)致Lesch-Nyhan綜合征,特征為高尿酸血癥和嚴(yán)重神經(jīng)行為異常。3分解代謝嘌呤最終分解為尿酸,在人體內(nèi)幾乎不再進(jìn)一步代謝,通過腎臟排出。嘧啶降解產(chǎn)物如β-氨基異丁酸和β-丙氨酸等,最終可進(jìn)入TCA循環(huán)。尿酸在血液中接近飽和,若濃度過高可形成尿酸鹽晶體沉積在關(guān)節(jié)中,導(dǎo)致痛風(fēng)。核苷酸代謝受到嚴(yán)格調(diào)控。ATP、GTP等終產(chǎn)物對自身合成途徑的關(guān)鍵酶有反饋抑制作用。嘌呤合成第一步受PRPP合成酶活性調(diào)控,該酶受嘌呤核苷酸抑制和PRPP激活。多種抗腫瘤藥物和免疫抑制劑靶向核苷酸代謝通路,如甲氨蝶呤(抑制二氫葉酸還原酶)和6-巰基嘌呤(HGPRT底物)等。激素分子的生化基礎(chǔ)蛋白質(zhì)/多肽激素由氨基酸組成,如胰島素、生長激素、促甲狀腺激素等。這類激素通常不能透過細(xì)胞膜,與細(xì)胞膜表面受體結(jié)合,通過第二信使系統(tǒng)(如cAMP、IP3/DAG和Ca2?)傳遞信號,激活細(xì)胞內(nèi)信號級聯(lián)反應(yīng)。這些激素合成后貯存在分泌顆粒中,根據(jù)需要釋放,作用迅速但持續(xù)時(shí)間較短。類固醇激素源自膽固醇,包括腎上腺皮質(zhì)激素、性激素和維生素D等。脂溶性使其能透過細(xì)胞膜,與胞內(nèi)或核內(nèi)受體結(jié)合,形成激素-受體復(fù)合物直接調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。合成后通常不儲存,而是根據(jù)需要即時(shí)合成。作用較慢但持續(xù)時(shí)間長,多通過特異性結(jié)合蛋白在血液中運(yùn)輸。氨基酸衍生物激素來源于酪氨酸或色氨酸等氨基酸,如甲狀腺激素(T3、T4)和兒茶酚胺類(腎上腺素、去甲腎上腺素)。甲狀腺激素通過核受體作用,調(diào)控代謝和發(fā)育。兒茶酚胺通過膜受體(主要是G蛋白偶聯(lián)受體)作用,調(diào)節(jié)應(yīng)激反應(yīng)、心血管功能和能量代謝。激素系統(tǒng)形成復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),通常采用負(fù)反饋機(jī)制維持穩(wěn)態(tài)。下丘腦-垂體-靶腺軸是典型例子,如下丘腦分泌促甲狀腺激素釋放激素→垂體分泌促甲狀腺激素→甲狀腺分泌甲狀腺激素→抑制上游激素分泌。激素分泌異常導(dǎo)致多種疾病,如糖尿病(胰島素缺乏或抵抗)、甲亢/甲減、庫欣綜合征(皮質(zhì)醇過多)等。血糖穩(wěn)態(tài)維持機(jī)制胰島素作用機(jī)制胰島素由胰腺β細(xì)胞分泌,是唯一降低血糖的激素。當(dāng)血糖升高時(shí),葡萄糖進(jìn)入β細(xì)胞促進(jìn)胰島素釋放。胰島素結(jié)合細(xì)胞表面受體激活胞內(nèi)信號通路,促進(jìn)GLUT4轉(zhuǎn)運(yùn)體轉(zhuǎn)位到細(xì)胞膜,增加葡萄糖攝??;同時(shí)激活糖原合成酶促進(jìn)糖原合成,抑制糖原分解和糖異生。胰高血糖素逆向調(diào)節(jié)胰高血糖素由胰腺α細(xì)胞分泌,當(dāng)血糖降低時(shí)釋放增加。其主要作用是提高血糖:激活肝臟糖原磷酸化酶促進(jìn)糖原分解;誘導(dǎo)糖異生酶表達(dá)增強(qiáng)糖異生;促進(jìn)脂肪分解提供糖異生底物。胰高血糖素與胰島素形成拮抗平衡,共同維持血糖穩(wěn)定。多激素協(xié)同調(diào)控除胰高血糖素外,其他升糖激素包括:腎上腺素和去甲腎上腺素(應(yīng)激狀態(tài)下快速動(dòng)員肝糖原);糖皮質(zhì)激素(促進(jìn)蛋白質(zhì)分解提供糖異生底物,長期作用);生長激素(抑制外周葡萄糖利用,促進(jìn)脂肪分解)。這些激素與胰島素形成復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),維持血糖在4.4-6.7mmol/L的狹窄范圍內(nèi)。血脂代謝與心血管健康高密度脂蛋白(HDL)"好膽固醇",促進(jìn)膽固醇逆轉(zhuǎn)運(yùn)低密度脂蛋白(LDL)向外周組織運(yùn)送膽固醇極低密度脂蛋白(VLDL)從肝臟輸送內(nèi)源性脂質(zhì)乳糜微粒(CM)運(yùn)輸飲食來源的脂質(zhì)脂蛋白是血液中脂質(zhì)的主要運(yùn)輸形式,由脂質(zhì)核心(三酰甘油和膽固醇酯)和表面單層(磷脂、游離膽固醇和載脂蛋白)組成。不同類型脂蛋白按密度遞增排列:乳糜微?!鷺O低密度脂蛋白→中間密度脂蛋白→低密度脂蛋白→高密度脂蛋白。載脂蛋白是脂蛋白表面的蛋白質(zhì)成分,如apoB-100、apoA-I等,參與脂蛋白代謝和受體識別。動(dòng)脈粥樣硬化是心腦血管疾病的主要病理基礎(chǔ),其形成涉及多步驟:內(nèi)皮功能障礙→LDL在內(nèi)皮下氧化修飾→巨噬細(xì)胞吞噬氧化LDL形成泡沫細(xì)胞→炎癥反應(yīng)→平滑肌細(xì)胞增殖和遷移→纖維斑塊形成。高LDL和低HDL是重要危險(xiǎn)因素。他汀類藥物通過抑制HMG-CoA還原酶降低膽固醇合成,是目前最有效的血脂調(diào)節(jié)藥物。維生素與輔酶類別代表維生素生化功能缺乏癥水溶性維生素維生素B1(硫胺素)TPP輔酶形式參與α-酮酸脫羧腳氣病、威尼克腦病水溶性維生素維生素B2(核黃素)FAD、FMN輔酶參與氧化還原反應(yīng)口角炎、舌炎水溶性維生素?zé)熕?維生素B3)NAD?、NADP?輔酶參與氧化還原糙皮病水溶性維生素維生素B6(吡哆醇)PLP輔酶形式參與氨基轉(zhuǎn)移癲癇樣發(fā)作、貧血水溶性維生素維生素B12(鈷胺素)甲基轉(zhuǎn)移反應(yīng),同型半胱氨酸代謝惡性貧血、神經(jīng)損傷水溶性維生素葉酸四氫葉酸參與一碳單位轉(zhuǎn)移巨幼紅細(xì)胞性貧血水溶性維生素維生素C(抗壞血酸)抗氧化劑,羥化反應(yīng)輔因子壞血病,牙齦出血脂溶性維生素維生素A(視黃醇)視覺循環(huán),細(xì)胞分化調(diào)節(jié)夜盲癥,角膜干燥脂溶性維生素維生素D(鈣化醇)鈣磷代謝調(diào)節(jié),基因表達(dá)調(diào)控佝僂病,骨質(zhì)疏松脂溶性維生素維生素E(生育酚)抗氧化劑,保護(hù)細(xì)胞膜神經(jīng)肌肉功能障礙脂溶性維生素維生素K參與凝血因子γ-羧基化出血傾向免疫分子的生化本質(zhì)抗體結(jié)構(gòu)與功能抗體(免疫球蛋白)是由B淋巴細(xì)胞產(chǎn)生的Y形糖蛋白,由兩條重鏈和兩條輕鏈通過二硫鍵連接形成。每條鏈包含可變區(qū)和恒定區(qū),可變區(qū)形成抗原結(jié)合位點(diǎn),決定抗體特異性;恒定區(qū)決定抗體類型(IgG、IgM、IgA、IgE、IgD)和效應(yīng)功能??贵w識別抗原的分子基礎(chǔ)是互補(bǔ)決定區(qū)(CDR)與抗原表位之間的精確三維互補(bǔ),涉及多種非共價(jià)力??乖?抗體結(jié)合的親和力和特異性使抗體成為免疫防御和生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的核心分子。細(xì)胞因子的信號作用細(xì)胞因子是免疫細(xì)胞分泌的小分子蛋白質(zhì),介導(dǎo)細(xì)胞間通訊。主要類別包括:白細(xì)胞介素(IL)調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答;腫瘤壞死因子(TNF)參與炎癥和細(xì)胞死亡;干擾素(IFN)具有抗病毒作用;趨化因子引導(dǎo)免疫細(xì)胞遷移;轉(zhuǎn)化生長因子(TGF)調(diào)控細(xì)胞增殖和分化。細(xì)胞因子通過與特異性受體結(jié)合激活下游信號通路,如JAK-STAT、MAPK和NF-κB等,調(diào)控基因表達(dá)。受體多為跨膜蛋白,具有胞外配體結(jié)合域和胞內(nèi)信號域,配體結(jié)合導(dǎo)致受體二聚化和胞內(nèi)區(qū)域的相互磷酸化。主要組織相容性復(fù)合體(MHC)是細(xì)胞表面的多態(tài)性糖蛋白,參與抗原呈遞。MHCI類分子存在于幾乎所有有核細(xì)胞表面,呈遞胞內(nèi)抗原;MHCII類分子主要分布在專業(yè)抗原呈遞細(xì)胞上,呈遞胞外抗原。理解免疫分子的生化基礎(chǔ)對疫苗開發(fā)、免疫治療和自身免疫病機(jī)制研究具有重要意義。細(xì)胞周期與生化調(diào)控G1期(Gap1)細(xì)胞質(zhì)增長、蛋白質(zhì)合成活躍。G1后期存在限制點(diǎn)(R點(diǎn)),通過后細(xì)胞承諾完成分裂周期。CyclinD-CDK4/6復(fù)合物磷酸化Rb蛋白,部分釋放E2F轉(zhuǎn)錄因子,激活DNA復(fù)制所需基因表達(dá)。S期(Synthesis)DNA復(fù)制發(fā)生,染色體數(shù)量加倍。CyclinE-CDK2和CyclinA-CDK2復(fù)合物活化,進(jìn)一步磷酸化Rb完全激活E2F。參與復(fù)制的關(guān)鍵蛋白包括解旋酶、DNA聚合酶、連接酶等。復(fù)制檢查點(diǎn)確保DNA完整復(fù)制。G2期(Gap2)為有絲分裂準(zhǔn)備,合成與分裂相關(guān)蛋白。CyclinB-CDK1(M期促進(jìn)因子,MPF)開始積累。G2檢查點(diǎn)確保DNA復(fù)制完整無損,解決可能的DNA損傷,防止帶有異常的細(xì)胞進(jìn)入分裂。3M期(Mitosis)細(xì)胞分裂,包括前期、中期、后期和末期。CyclinB-CDK1全面活化,磷酸化多種底物啟動(dòng)染色體凝縮、核膜崩解、紡錘體形成等過程。紡錘體檢查點(diǎn)確保染色體正確連接到紡錘體。細(xì)胞凋亡是程序性細(xì)胞死亡,對組織穩(wěn)態(tài)維持至關(guān)重要。主要途徑包括外源性途徑(死亡受體激活)和內(nèi)源性途徑(線粒體介導(dǎo))。關(guān)鍵執(zhí)行者是caspase蛋白酶級聯(lián),活化的caspase切割多種細(xì)胞底物導(dǎo)致細(xì)胞解體。Bcl-2家族蛋白(如Bcl-2、Bax、Bad等)調(diào)控線粒體外膜通透性,平衡促凋亡和抗凋亡信號。凋亡異常與多種疾病相關(guān),如癌癥(凋亡抑制)和神經(jīng)退行性疾病(凋亡過度)。生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)方法總覽分光光度法基于物質(zhì)對特定波長光的吸收能力,用于定量分析。紫外-可見分光光度計(jì)測定蛋白質(zhì)(280nm)、核酸(260nm)濃度;酶活性測定通過底物或產(chǎn)物的光吸收變化計(jì)算反應(yīng)速率;比色法測定各種代謝物,如葡萄糖(葡萄糖氧化酶法)、膽固醇等。電泳分析利用帶電分子在電場中遷移速率差異進(jìn)行分離。聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)分離蛋白質(zhì),SDS根據(jù)分子量分離;脈沖場凝膠電泳(PFGE)分離大片段DNA;毛細(xì)管電泳結(jié)合高靈敏檢測系統(tǒng)可分離少量復(fù)雜混合物;等電聚焦(IEF)根據(jù)蛋白等電點(diǎn)分離。層析技術(shù)基于物質(zhì)在固定相和流動(dòng)相中分配系數(shù)不同實(shí)現(xiàn)分離。主要類型:高效液相色譜(HPLC)高效分離多種生物分子;親和層析利用特異性結(jié)合分離目標(biāo)分子;凝膠過濾色譜根據(jù)分子大小分離;離子交換色譜基于分子電荷差異分離;氣相色譜分離揮發(fā)性物質(zhì)。同位素與放射性技術(shù)放射性同位素標(biāo)記(如3H、1?C、32P、3?S)用于示蹤代謝途徑、測定酶活性和核酸雜交等。自動(dòng)放射顯影記錄放射性標(biāo)記分子在凝膠或膜上的位置;閃爍計(jì)數(shù)法定量測定β放射性;穩(wěn)定同位素(如13C、1?N)結(jié)合質(zhì)譜分析代謝通量。現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用基因擴(kuò)增技術(shù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是體外擴(kuò)增特定DNA片段的強(qiáng)大工具。通過溫度循環(huán)使DNA變性、引物退火和延伸,目標(biāo)序列呈指數(shù)級擴(kuò)增。關(guān)鍵組分包括耐熱DNA聚合酶(Taq或Pfu)、引物、dNTPs和模板DNA。改良版包括實(shí)時(shí)熒光定量PCR(監(jiān)測產(chǎn)物積累動(dòng)態(tài))、數(shù)字PCR(絕對定量)、多重PCR(同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)靶點(diǎn))等?;蚪M編輯技術(shù)CRISPR-Cas9系統(tǒng)是最新一代基因編輯工具,源自細(xì)菌防御病毒的免疫系統(tǒng)。包含兩個(gè)關(guān)鍵組分:向?qū)NA(gRNA)識別目標(biāo)DNA序列;Cas9核酸酶切割DNA形成雙鏈斷裂。細(xì)胞修復(fù)斷裂可通過非同源末端連接(產(chǎn)生基因敲除)或同源定向修復(fù)(精確編輯)。該技術(shù)具有簡單、高效、多靶點(diǎn)等優(yōu)勢,已廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、作物改良和疾病治療。高通量分析平臺新一代測序技術(shù)(NGS)實(shí)現(xiàn)大規(guī)模平行測序,單次實(shí)驗(yàn)可獲取數(shù)百億堿基信息。應(yīng)用包括全基因組測序、外顯子組測序、轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)、表觀基因組圖譜等。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合質(zhì)譜和生物信息學(xué),實(shí)現(xiàn)數(shù)千蛋白質(zhì)的同時(shí)鑒定和定量。單細(xì)胞分析技術(shù)突破傳統(tǒng)混合樣本限制,揭示細(xì)胞異質(zhì)性,為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)提供支持。分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展促進(jìn)了生物醫(yī)學(xué)研究革命性進(jìn)步。限制性內(nèi)切酶和DNA連接酶等工具實(shí)現(xiàn)了DNA片段的切割和連接,形成基因克隆的基礎(chǔ)。表達(dá)載體系統(tǒng)用于異源蛋白表達(dá),蛋白質(zhì)互作分析技術(shù)(如酵母雙雜交、免疫共沉淀、近鄰生物素化等)闡明蛋白質(zhì)功能網(wǎng)絡(luò)。這些技術(shù)合力推動(dòng)生物化學(xué)研究從傳統(tǒng)描述性階段進(jìn)入分子精確解析階段。臨床生物化學(xué)基礎(chǔ)臨床生物化學(xué)檢驗(yàn)是醫(yī)學(xué)診斷的核心支柱,通過測定體液中的生化指標(biāo)反映人體生理病理狀態(tài)。標(biāo)本收集和處理至關(guān)重要:血液常采用抗凝劑(如EDTA、肝素)防止凝固;離心分離血清或血漿;部分項(xiàng)目要求空腹,某些檢測需要特殊保存條件以維持分析物穩(wěn)定性。肝功能檢查包括:轉(zhuǎn)氨酶(ALT、AST)評估肝細(xì)胞損傷;堿性磷酸酶(ALP)和γ-谷氨酰轉(zhuǎn)肽酶(GGT)反映膽汁淤積;白蛋白和凝血因子評估肝臟合成功能;膽紅素指示肝臟代謝和排泄功能。腎功能指標(biāo)有:肌酐和尿素氮評估腎小球?yàn)V過功能;電解質(zhì)(鈉、鉀、氯、鈣等)反映腎小管功能;尿蛋白和尿微量白蛋白檢測腎小球?yàn)V過屏障完整性。參考范圍受多種因素影響,包括年齡、性別、種族、分析方法等。腫瘤生物化學(xué)機(jī)制基因調(diào)控異常原癌基因(如RAS、MYC)活化促進(jìn)細(xì)胞增殖和存活;抑癌基因(如TP53、RB)失活導(dǎo)致細(xì)胞周期檢查點(diǎn)失效。表觀遺傳改變,包括DNA甲基化異常、組蛋白修飾改變和非編碼RNA表達(dá)異常,共同參與腫瘤發(fā)生。代謝重編程華伯格效應(yīng):即使在氧氣充足條件下,癌細(xì)胞仍偏好糖酵解產(chǎn)能。谷氨酰胺代謝亢進(jìn)提供氮源和碳骨架。脂肪酸合成增強(qiáng)為膜合成和信號傳導(dǎo)提供物質(zhì)。這些代謝改變滿足腫瘤快速增殖需求,并提供對藥物和環(huán)境應(yīng)激的抵抗力。信號通路失調(diào)生長因子信號(如EGFR、IGF1R)過度活化;PI3K/AKT/mTOR通路持續(xù)激活促進(jìn)細(xì)胞生長和代謝;Wnt、Notch等發(fā)育信號通路異常激活;炎癥信號(如NF-κB通路)慢性活化。這些信號異常形成復(fù)雜網(wǎng)絡(luò),支持腫瘤生長、侵襲和轉(zhuǎn)移。腫瘤微環(huán)境是腫瘤細(xì)胞與基質(zhì)細(xì)胞(如腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞、成纖維細(xì)胞)和細(xì)胞外基質(zhì)共同形成的生態(tài)系統(tǒng)。乏氧、酸性和營養(yǎng)缺乏是腫瘤微環(huán)境的典型特征,這些條件選擇性支持更具侵襲性的克隆擴(kuò)張。腫瘤免疫逃逸機(jī)制包括:下調(diào)MHC分子表達(dá);分泌免疫抑制因子;表達(dá)PD-L1等免疫檢查點(diǎn)分子。靶向腫瘤代謝特征的治療策略包括:糖酵解抑制劑、谷氨酰胺代謝阻斷劑、脂肪酸合成抑制劑等。糖尿病的生化基礎(chǔ)胰島素作用機(jī)制胰島素結(jié)合細(xì)胞表面受體活化受體酪氨酸激酶活性,引發(fā)胞內(nèi)信號級聯(lián)反應(yīng)。胰島素受體底物(IRS)磷酸化后招募并激活PI3K,進(jìn)而活化PKB/Akt和下游效應(yīng)分子。主要生理作用包括:促進(jìn)GLUT4葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體轉(zhuǎn)位到細(xì)胞膜,增加葡萄糖攝取;激活糖原合成酶,促進(jìn)糖原合成;抑制糖原磷酸化酶和PEPCK,減少糖異生。胰島素還影響脂質(zhì)代謝(抑制脂解,促進(jìn)脂肪合成)和蛋白質(zhì)代謝(促進(jìn)氨基酸攝取和蛋白質(zhì)合成)。胰島素抵抗機(jī)制胰島素抵抗是2型糖尿病的核心病理機(jī)制,表現(xiàn)為正常濃度胰島素產(chǎn)生減弱的生物學(xué)效應(yīng)。分子機(jī)制包括:受體后信號通路缺陷,如IRS蛋白絲氨酸殘基過度磷酸化;PI3K和Akt活性降低;脂肪因子(如TNF-α、游離脂肪酸)干擾信號傳導(dǎo);細(xì)胞器應(yīng)激(如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激和線粒體功能障礙);慢性炎癥狀態(tài)。胰島素抵抗導(dǎo)致高胰島素血癥,長期代償最終導(dǎo)致β細(xì)胞功能耗竭和相對胰島素不足。高血糖的生化后果持續(xù)高血糖導(dǎo)致多種生化變化,解釋慢性并發(fā)癥的發(fā)生:蛋白質(zhì)糖基化生成晚期糖基化終產(chǎn)物(AGEs),改變蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能;多元醇途徑活化消耗NADPH,增加氧化應(yīng)激;蛋白激酶C激活影響血管功能;己胺途徑活化及糖毒性均導(dǎo)致炎癥反應(yīng)和血管內(nèi)皮功能障礙。這些改變共同導(dǎo)致微血管并發(fā)癥(視網(wǎng)膜病變、腎病變、神經(jīng)病變)和大血管并發(fā)癥(心腦血管疾病)。肥胖與代謝綜合征脂肪組織功能脂肪組織不僅是能量儲存器官,還是活躍的內(nèi)分泌器官。白色脂肪組織主要儲存能量,分泌多種脂肪因子(脂聯(lián)素、瘦素等);棕色脂肪組織富含線粒體,參與產(chǎn)熱。肥胖狀態(tài)下,脂肪組織發(fā)生重塑:脂肪細(xì)胞肥大,脂肪組織血供不足導(dǎo)致局部缺氧,巨噬細(xì)胞浸潤增加,形成慢性炎癥狀態(tài)。脂肪細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)脂肪組織分泌多種脂肪因子參與全身代謝調(diào)控:瘦素抑制食欲,提高能量消耗;脂聯(lián)素提高胰島素敏感性,具有抗炎和抗動(dòng)脈粥樣硬化作用;抵抗素和TNF-α促進(jìn)胰島素抵抗;白細(xì)胞介素-6促進(jìn)炎癥反應(yīng)。肥胖時(shí)脂肪因子分泌譜發(fā)生改變,瘦素和胰島素抵抗,脂聯(lián)素水平下降,炎癥因子升高。代謝綜合征發(fā)生機(jī)制代謝綜合征是腹部肥胖、高血壓、高血糖和血脂異常的綜合表現(xiàn)。胰島素抵抗是其共同病理基礎(chǔ):導(dǎo)致肝臟脂質(zhì)合成增加,VLDL分泌增多;異位脂肪沉積(如肝臟、肌肉、胰腺)加劇胰島素抵抗;交感神經(jīng)系統(tǒng)活性增高導(dǎo)致血壓升高;高胰島素血癥促進(jìn)腎臟鈉潴留。代謝疾病生化標(biāo)志物高敏C反應(yīng)蛋白(hs-CRP)反映低度炎癥狀態(tài);糖化血紅蛋白(HbA1c)反映長期血糖控制水平;血脂譜(總膽固醇、甘油三酯、HDL-C、LDL-C)評估脂質(zhì)代謝狀況;胰島素和C肽評估胰島β細(xì)胞功能;HOMA-IR指數(shù)評估胰島素抵抗程度;脂肪因子(脂聯(lián)素、瘦素)代謝紊亂反映。常見代謝性罕見病介紹疾病類型代表疾病生化缺陷臨床表現(xiàn)診斷方法氨基酸代謝障礙苯丙酮尿癥苯丙氨酸羥化酶缺陷進(jìn)行性智力障礙,膚色較淺血苯丙氨酸升高氨基酸代謝障礙楓糖尿癥支鏈α-酮酸脫氫酶復(fù)合體缺陷喂養(yǎng)困難,昏迷,尿液有楓糖味血支鏈氨基酸升高有機(jī)酸代謝障礙甲基丙二酸血癥甲基丙二酰輔酶A變位酶缺陷酸中毒,高氨血癥,發(fā)育遲緩尿甲基丙二酸升高尿素循環(huán)障礙鳥氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶缺乏癥OTC酶缺陷高氨血癥,神經(jīng)系統(tǒng)癥狀血氨升高,尿內(nèi)酰胺升高糖原累積癥糖原貯積癥I型葡萄糖-6-磷酸酶缺陷低血糖,肝腫大,生長遲緩肝活檢,基因檢測溶酶體貯積癥高雪氏病β-葡萄糖腦苷脂酶缺陷肝脾腫大,骨骼變形,神經(jīng)癥狀酶活性測定,基因檢測線粒體疾病MELAS綜合征線粒體DNA突變腦卒中樣發(fā)作,肌病,乳酸酸中毒肌活檢,基因檢測遺傳代謝病是由于單基因缺陷導(dǎo)致特定酶或轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白功能異常,進(jìn)而引起代謝途徑障礙的一組疾病。雖然單個(gè)疾病罕見,但總體發(fā)病率約1/500。新生兒篩查是早期發(fā)現(xiàn)代謝病的重要手段,常用串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)技術(shù)同時(shí)檢測多種氨基酸和?;鈮A。早期診斷和干預(yù)對改善預(yù)后至關(guān)重要,治療策略包括飲食限制、酶替代、輔因子補(bǔ)充和器官移植等。藥物生化與酶學(xué)基礎(chǔ)90%肝臟藥物代謝比例肝臟是藥物代謝的主要器官,含有豐富的藥物代謝酶系統(tǒng)。肝功能不全患者常需調(diào)整藥物劑量以避免毒性作用57人類CYP450同工酶數(shù)量細(xì)胞色素P450酶是最重要的I相代謝酶家族,其中CYP3A4、CYP2D6、CYP2C9參與大多數(shù)藥物代謝。這些酶的遺傳多態(tài)性是個(gè)體用藥反應(yīng)差異的重要原因2藥物代謝主要相數(shù)I相反應(yīng)涉及氧化、還原和水解,增加極性;II相反應(yīng)包括葡萄糖醛酸化、硫酸化、乙酰化等,進(jìn)一步增加水溶性促進(jìn)排泄藥物的生物化學(xué)作用機(jī)制多樣,包括:與受體結(jié)合(如β受體阻滯劑);抑制特定酶活性(如他汀類藥物抑制HMG-CoA還原酶);影響離子通道功能(如鈣通道阻滯劑);干擾神經(jīng)遞質(zhì)合成、釋放或清除(如SSRIs抑制5-HT再攝?。?;修飾DNA或蛋白質(zhì)(如烷化劑)等。藥物代謝酶誘導(dǎo)和抑制是藥物相互作用的重要機(jī)制:誘導(dǎo)劑(如利福平)促進(jìn)酶表達(dá)增加藥物清除;抑制劑(如酮康唑)抑制酶活性延長藥物半衰期??股睾涂鼓[瘤藥物分子作用抗生素作用機(jī)制β-內(nèi)酰胺類(青霉素、頭孢菌素)抑制細(xì)菌細(xì)胞壁肽聚糖合成,通過與青霉素結(jié)合蛋白(PBPs)共價(jià)結(jié)合,阻斷肽聚糖交聯(lián)。大環(huán)內(nèi)酯類(紅霉素等)結(jié)合細(xì)菌核糖體50S亞基,阻斷肽鏈延伸。氨基糖苷類(鏈霉素等)結(jié)合30S亞基,導(dǎo)致蛋白質(zhì)誤譯。氟喹諾酮類抑制DNA旋轉(zhuǎn)酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶IV,阻斷DNA復(fù)制。細(xì)菌耐藥機(jī)制包括:產(chǎn)生降解酶(如β-內(nèi)酰胺酶);改變藥物靶點(diǎn)(如PBP突變);減少藥物攝取或增加外排;改變代謝途徑。多重耐藥細(xì)菌(如MRSA、CRE)對多種抗生素產(chǎn)生耐藥,治療困難??鼓[瘤藥物分子機(jī)制烷化劑(環(huán)磷酰胺等)與DNA形成共價(jià)交聯(lián),阻斷復(fù)制??勾x藥物(如甲氨蝶呤)干擾核苷酸合成。拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑(如依托泊苷)阻斷DNA拓?fù)渥兓???刮⒐芩幬铮ㄈ缱仙即迹└蓴_微管動(dòng)態(tài)平衡,阻斷有絲分裂。激素類藥物(如他莫昔芬)競爭性結(jié)合激素受體。靶向治療藥物針對特定分子,如酪氨酸激酶抑制劑(伊馬替尼等)和單克隆抗體(曲妥珠單抗等)。腫瘤耐藥機(jī)制包括:藥物外排泵(如P-糖蛋白)過表達(dá);藥物代謝或解毒增強(qiáng);靶點(diǎn)改變;DNA損傷修復(fù)增強(qiáng);細(xì)胞凋亡途徑缺陷;干細(xì)胞樣特性維持等。聯(lián)合用藥和個(gè)體化治療是克服耐藥的重要策略。前沿:生物大分子的結(jié)構(gòu)解析冷凍電鏡技術(shù)近年來實(shí)現(xiàn)了革命性突破,成為解析大型蛋白質(zhì)復(fù)合物和膜蛋白結(jié)構(gòu)的主力。該技術(shù)將生物樣品快速冷凍在玻璃態(tài)冰中,保持其天然狀態(tài),使用低劑量電子束成像,通過計(jì)算機(jī)圖像處理將二維投影重建為三維結(jié)構(gòu)。2017年該技術(shù)獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。最新發(fā)展包括:直接電子探測器提高信噪比;運(yùn)動(dòng)校正算法減少樣品漂移影響;人工智能輔助圖像處理。其他結(jié)構(gòu)生物學(xué)新技術(shù)包括:微電子衍射(MicroED)適用于難以生長大晶體的蛋白質(zhì);X射線自由電子激光(XFEL)可對微小晶體進(jìn)行飛行中衍射;集成混合方法結(jié)合多種技術(shù)優(yōu)勢,如冷凍電鏡與晶體學(xué)、質(zhì)譜或核磁共振聯(lián)用。AlphaFold等AI預(yù)測工具已能從氨基酸序列準(zhǔn)確預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),甚至蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)構(gòu),為理解蛋白質(zhì)功能和藥物設(shè)計(jì)提供強(qiáng)大支持。前沿:多組學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)1基因組學(xué)研究生物體全部遺傳信息轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析所有基因表達(dá)和調(diào)控模式3蛋白質(zhì)組學(xué)研究全部蛋白質(zhì)及其相互作用4代謝組學(xué)檢測所有代謝物變化反映功能狀態(tài)系統(tǒng)生物學(xué)整合多組學(xué)數(shù)據(jù),從整體角度理解生命系統(tǒng)。與傳統(tǒng)生物學(xué)研究單個(gè)基因或蛋白質(zhì)不同,系統(tǒng)生物學(xué)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)模型描述組分間相互作用和調(diào)控關(guān)系。這種方法特別適合研究復(fù)雜疾病,如癌癥、代謝綜合征等,這些疾病通常不是單一因素導(dǎo)致,而是多個(gè)通路和基因網(wǎng)絡(luò)共同作用的結(jié)果。數(shù)據(jù)整合分析實(shí)例:結(jié)合臨床肝癌樣本的基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組數(shù)據(jù),鑒定了驅(qū)動(dòng)腫瘤生長的關(guān)鍵信號網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)了傳統(tǒng)方法難以識別的"隱藏驅(qū)動(dòng)因素";整合多組學(xué)數(shù)據(jù)解析人類微生物組與宿主代謝的相互作用,揭示了腸道菌群影響藥物代謝的分子機(jī)制。南京醫(yī)科大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)利用多組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了胰腺癌特異性代謝特征和潛在干預(yù)靶點(diǎn)。前沿:合成生物學(xué)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用基因線路設(shè)計(jì)合成生物學(xué)以工程學(xué)思維設(shè)計(jì)生物系統(tǒng),創(chuàng)建人工基因線路執(zhí)行特定功能。基本組件包括:傳感器模塊(檢測特定信號);處理模塊(整合信號并做出"決策");執(zhí)行模塊(產(chǎn)生所需輸出)。常用設(shè)計(jì)元件有啟動(dòng)子、轉(zhuǎn)錄因子、核糖體結(jié)合位點(diǎn)、終止子等。計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)工具和標(biāo)準(zhǔn)化生物元件庫極大促進(jìn)了合成線路的開發(fā)效率。細(xì)胞工廠構(gòu)建改造微生物或哺乳動(dòng)物細(xì)胞生產(chǎn)醫(yī)用分子。通過調(diào)整細(xì)胞代謝網(wǎng)絡(luò),優(yōu)化底物利用,減少副產(chǎn)物積累,提高目標(biāo)產(chǎn)物產(chǎn)量。例如:工程化大腸桿菌生產(chǎn)青蒿素前體;酵母細(xì)胞生產(chǎn)阿片類藥物;CHO細(xì)胞生產(chǎn)復(fù)雜單克隆抗體。代謝流分析、基因組尺度模型和高通量篩選技術(shù)加速了細(xì)胞工廠的優(yōu)化過程。醫(yī)學(xué)應(yīng)用實(shí)例CAR-T細(xì)胞治療:工程化T細(xì)胞表達(dá)嵌合抗原受體,特異性識別并殺傷腫瘤細(xì)胞。溶瘤病毒:設(shè)計(jì)能特異性在腫瘤微環(huán)境中復(fù)制的病毒。合成益生菌:工程化益生菌在腸道檢測疾病標(biāo)志物并釋放治療分子。生物傳感器:設(shè)計(jì)微生物或細(xì)胞系檢測血糖或其他生理指標(biāo)并控制藥物釋放。組織工程:結(jié)合生物材料和基因工程細(xì)胞創(chuàng)建功能性人工組織或器官。醫(yī)學(xué)科研中的生物化學(xué)研究范例代謝重編程與腫瘤發(fā)生南京醫(yī)科大學(xué)腫瘤代謝研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了一種新型代謝調(diào)控機(jī)制:代謝酶丙酮酸激酶M2(PKM2)除催化功能外,還可通過與轉(zhuǎn)錄因子STAT3相互作用,促進(jìn)惡性腫瘤的能量代謝重編程。該研究揭示了代謝調(diào)控與基因表達(dá)間的新型聯(lián)系,為腫瘤代謝治療提供了新靶點(diǎn)。腸道菌群與胰島素抵抗代謝病研究中心利用宏基因組學(xué)與代謝組學(xué)聯(lián)合分析,發(fā)現(xiàn)特定腸道菌群代謝產(chǎn)物與2型糖尿病發(fā)生密切相關(guān)。通過小鼠模型驗(yàn)證,證實(shí)這些代謝產(chǎn)物通過影響肝臟胰島素信號通路,誘導(dǎo)胰島素抵抗。這一發(fā)現(xiàn)為基于微生物組的代謝疾病預(yù)防和治療提供了新思路。表觀遺傳與細(xì)胞命運(yùn)決定干細(xì)胞與發(fā)育生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)組蛋白甲基化酶EZH2通過調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài),在心肌細(xì)胞分化過程中起關(guān)鍵作用。敲低EZH2導(dǎo)致心臟發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),促進(jìn)干細(xì)胞向心肌細(xì)胞分化。這一機(jī)制有望應(yīng)用于心肌再生醫(yī)學(xué),為心臟疾病治療提供新策略。實(shí)驗(yàn)課教學(xué)安排與考核基礎(chǔ)技能培訓(xùn)(第1-2周)實(shí)驗(yàn)安全教育,移液器使用,溶液配制,pH測定,離心機(jī)操作等。這些基本技能是后續(xù)實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ),要求學(xué)生掌握科學(xué)的操作方法和嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶?shí)驗(yàn)態(tài)度。第一次實(shí)驗(yàn)報(bào)告占總成績5%。2蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)(第3-6周)蛋白質(zhì)提取與純化,電泳分析,Westernblot技術(shù),
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