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文檔簡介
ICS11.220
B41
備案號:58536-2018DB21
遼寧省地方標準
DB21/T2827.1—2017
畜禽疫病防治與凈化技術規(guī)范
第1部分:豬繁殖與呼吸綜合征病毒經典株
與高致病性變異株RT-PCR鑒別檢測方法
Teohnicalspecificationsofpreventionanderadicationofanimalepidemicdisease
Part1:ART-PCRmethodtodifferentiatethehighlypathogenicandclassicalporcine
reproductiveandrespiratorysyndromevirus
DB21/T2827.1-2017
前言
標準《畜禽疫病防治與凈化技術規(guī)范》按照GB/T1.1-2009給出的規(guī)則起草,分為七個部分:
——豬繁殖與呼吸綜合征美洲經典株與高致病性變異株病毒RT-PCR鑒別檢測方法
——動物炭疽防治技術規(guī)范
——豬偽狂犬病防治技術規(guī)范
——規(guī)模豬場藍耳病免疫凈化技術規(guī)范
——雞白痢平板凝集試驗操作技術規(guī)范
——種雞場雞白痢凈化技術規(guī)范
——鵝血清HA-HI抗體檢測技術規(guī)范
本部分為標準《畜禽疫病防治與凈化技術規(guī)范》的第1部分
本部分由遼寧省動物疫病預防控制中心提出。
本部分由遼寧省畜牧獸醫(yī)局歸口。
本部分起草單位:遼寧省動物疫病預防控制中心,遼寧省動物醫(yī)學研究院。
本部分主要起草人:楊本勇,曹東,趙鳳菊,申貫男,李井春,關淼,楊國麗,王竹,吳運譜,李
冰,高慎陽,孫傳祿,鄧文超。
II
DB21/T2827.1—2017
畜禽疫病防治與凈化技術規(guī)范
第1部分:豬繁殖與呼吸綜合征美洲經典株與高致病性變異株病毒
RT-PCR鑒別檢測方法
1范圍
本標準規(guī)定了豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)美洲經典株與高致病性變異株RT-PCR檢測方法的
實驗材料、儀器設備、試劑、操作步驟和結果判定,并介紹了其原理。
本標準適用于豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)感染豬血清及臨床病料等樣品中病毒核酸檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對于本文件的應用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T6682-1992分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法
中華人民共和國農業(yè)部公告第302號獸醫(yī)實驗室生物安全技術管理規(guī)范
3縮略語
下列縮略語適用于本標準。
DEPC焦炭酸二乙酯
RNA核糖核酸
RT-PCR反轉錄聚合酶鏈反應
dNTP脫氧核苷酸三磷酸
bp堿基對
4原理
PRRSV是一種RNA病毒。RNA反轉錄產生的cDNA可作為PCR模板進行擴增。根據(jù)高致病性PRRSV基因組
非結構蛋白Nsp2編碼區(qū)缺失90個核苷酸的特點,在缺失區(qū)域的兩端設計一對引物,在DNA聚合酶催化下,
以母鏈DNA為模板,以引物為延伸起點,通過變性、退火和延伸,經典株病毒與高致病性變異株病毒分
別擴增出不同大小的DNA片段。
5實驗材料、儀器設備和試劑
5.1實驗材料
眼科剪、眼科鑷、稱量紙、1.5mL滅菌離心管(經DEPC水處理)、0.2mL薄壁PCR管、瓊脂糖、500
mL量筒、500mL三角瓶、吸頭(10μL、200μL、1000μL)。
5.2儀器設備
1
DB21/T2827.1—2017
分析天平、低溫高速離心機、PCR擴增儀、電泳儀、電泳槽、紫外凝膠成像儀(或紫外分析儀)、
-70℃冰箱、微波爐、組織研磨器、-20℃冰箱、可調移液器(最大量程分別為2μL、20μL、200μL、
1000μL)。
5.3試劑
5.3.12.5mmol/LdNTP。
5.3.2引物:上游引物5′-CGAATCAGACAACCGAACA-3′,下游引物5′-GACGCAGACAAATCCAGAG-3′。
5.3.310倍PCR緩沖液。
5.3.41%溴化乙錠(EB)溶液(見第A.1)。
5.3.5電泳緩沖液(50倍)(見第A.2)。
5.3.61%瓊脂糖凝膠(見第A.3)。
5.3.775%乙醇(見第A.4)。
5.3.8滅菌DEPC水(見第A.5)。
5.3.9上樣緩沖液(見第A.6)。
5.3.10電泳緩沖液(1倍)(見第A.7)。
5.3.11磷酸鹽緩沖液(0.01mol/L、pH7.4)(見第A.8)。
5.3.12阿氏液(見A.9)。
5.3.13其他試劑:10U/μLAMV反轉錄酶、50U/μLRNA酶抑制劑、5U/μLTaqDNA聚合酶、異丙醇、
25mmol/L氯化鎂溶液。
注:除另有規(guī)定,所用試劑均為分析純,水為符合GB/T6682-1992的滅菌雙蒸水或超純水。
6操作步驟
6.1樣品的采集、保存運送和處理
6.1.1樣品采集
組織樣品:無菌采集淋巴結、肺臟、扁桃體、脾臟等組織樣品3~5g裝入潔凈的小瓶內或其他滅菌容
器,編號備用。
6.1.1.1拭子樣品:采集鼻拭子時將棉拭子深入鼻腔來回刮3~5次,取鼻腔分泌物;采肛門拭子時將
棉拭子深入肛門轉一圈沾取糞便。將鼻腔拭子和肛門拭子放入盛有1.0mLPBS的Eppendorf管中,編
號備用。
6.1.1.2血清樣品:用無菌注射器從耳靜脈或前腔靜脈采集血液3~5mL,血清析出后吸入至無菌的
Eppendorf管中,編號備用。
6.1.1.3抗凝血樣品:先用無菌注射器吸入抗凝劑(阿氏液)2~3mL,再從耳靜脈或前腔靜脈采集等
量血液,快速混勻后注入無菌的Eppendorf管中,編號備用。
6.1.2樣品保存與運送
6.1.2.1樣品保存:采集的樣品24小時內冷藏送檢,若不能則冷凍保存,避免反復凍融。
6.1.2.2樣品運送:樣品裝入保溫壺或保溫桶中加冷凍劑和防震材料,加蓋密封,運送到實驗室。按
照《獸醫(yī)實驗室生物安全技術管理規(guī)范》進行樣品的生物安全標識。
6.1.3樣品處理
2
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6.1.3.1組織樣品:取待檢樣品2.0g于潔凈、滅菌并烘干的研缽中充分研磨,加10mL磷酸鹽緩沖
液(0.01mol/L、pH7.4)混勻制成1:5懸液,4℃下3000rpm離心15min,取上清液轉入無菌的
1.5mLEppendorf管中,編號備用。
6.1.3.2拭子樣品:將拭子樣品懸液轉入1.5mLEppendorf管中,4℃下5000rpm離心5min,取
上清液轉入另一新的無菌1.5mLEppendorf管中,編號備用。
6.1.3.3血清樣品:無需處理,直接提取核酸。
6.1.3.4抗凝血樣品:無需處理,直接提取核酸。
6.2RT-PCR檢測
6.2.1病毒RNA的提取
6.2.1.1取n個新的經DEPC水處理過的1.5mL滅菌Eppendorf管,其中n為被檢樣品、陰性對照、
陽性對照的數(shù)量之和,編號。
6.2.1.2每管加入750μL裂解液,然后分別加入處理過的被檢樣品、陰性對照、陽性對照各250μL,
顛倒混勻,室溫靜置5min。
6.2.1.3每管加入250μL氯仿,蓋緊離心管,用手劇烈搖蕩離心管15sec(或混勻器上振蕩混勻15
sec),室溫放置15min。
6.2.1.44℃、12000g離心15min,取上層水相0.5mL于一新的經DEPC水處理過的1.5mL滅菌
Eppendorf管中,每管加入0.5mL異丙醇,顛倒混勻,室溫放置10min,4℃、12000g離心15min。
6.2.1.5小心棄去上清液,倒置于吸水紙上,沾干液體,不同樣品應在吸水紙不同地方沾干,加入-
20℃預冷的75%乙醇1mL,輕輕旋轉洗滌后于4℃、12000g離心10min。
6.2.1.6小心棄去上清液,倒置于吸水紙上,沾干液體,不同樣品應在吸水紙不同地方沾干,室溫放
置或真空干燥5~10min,不能過于干燥,以免降低RNA的溶解度。
6.2.1.7每管加20μLDEPC水和1μLRNA酶抑制劑,輕輕混勻,溶解管壁上的RNA,-70℃保存?zhèn)?/p>
用。
6.2.2RT-PCR擴增
6.2.2.1RT-PCR反應體系組成(總體積24μL)
DEPC水14.5μL
2.5mmol/LdNTP2μL
10μmol/L上游引物1μL
10μmol/L下游引物1μL
25mmol/L氯化鎂溶液1.5μL
10倍PCR緩沖液2.5μL
AMV反轉錄酶0.5μL
RNA酶抑制劑0.5μL
5U/μLTaqDNA聚合酶0.5μL
6.2.2.2擴增體系的配制
設PCR反應數(shù)為n,其中n為被檢樣品、陰性對照、陽性對照的數(shù)量之和,向每個PCR管中分裝24
μL的反應體系。
6.2.2.3加樣
3
DB21/T2827.1—2017
在各設定的PCR管中加入6.2.1中制備的1μLRNA溶液,蓋緊管蓋,離心除去氣泡,放入PCR擴增儀
內,記錄樣品擺放次序。
6.2.2.4RT-PCR反應程序設置
42℃45min,95℃3min;擴增條件為94℃30sec,58℃30sec,72℃45sec,35個循
環(huán)后,72℃延伸10min。
6.2.3電泳
將PCR擴增產物5-8μL與1-2μL上樣緩沖液混合,加樣于1%瓊脂糖凝膠孔中,瓊脂糖凝膠板一側
點樣孔加入DL2000MarkDNA分子質量標準物,以5V/cm電壓電泳30min,用紫外凝膠成像儀觀察結果。
7結果判定
當經典株陽性對照出現(xiàn)約835bp、高致病性變異株陽性對照出現(xiàn)約745bp擴增帶、陰性對照未出現(xiàn)
目的帶時,實驗結果成立。被檢樣品出現(xiàn)835bp擴增帶為經典株PRRSV陽性,出現(xiàn)745bp擴增帶為高致
病性變異株陽性。
M123
M——DNA分子量標準(DL2000Marker);
1——PRRSV高致病性變異株(HuN株)陽性對照;
2——PRRSV經典株(CH-1a株)陽性對照;
3——陰性對照。
4
DB21/T2827.1—2017
附錄A
(規(guī)范性附錄)
試劑的配制
A.11%溴化乙錠(EB)溶液
溴化乙錠0.2g
滅菌雙蒸水加至20mL
A.2電泳緩沖液(50倍)
A.2.10.5mol/L乙二銨四乙酸二鈉(EDTA)溶液(pH8.0)
二水乙二銨四乙酸二鈉(分析純)18.61g
滅菌雙蒸水80mL
氫氧化鈉調pH至8.0
滅菌雙蒸水加至100mL
A.2.2TAE(三羥甲基氨基甲烷-乙酸)電泳緩沖液(50倍)
羥基甲基氨基甲烷(Tris)(分析純)242g
冰乙酸57.1mL
0.5mol/L乙二銨四乙酸二鈉(EDTA)溶液(pH8.0)100mL
滅菌雙蒸水加至1000mL
用時用滅菌雙蒸水稀釋使用。
A.31%瓊脂糖凝膠
瓊脂糖(電泳級)2g
TAE電泳緩沖液4mL
滅菌雙蒸水196mL
微波爐中完全融化,加溴化乙錠(EB)溶液20μL。
A.475%乙醇
無水乙醇(分析純)750mL
滅菌DEPC水250mL
A.5滅菌DEPC水
雙蒸水1000mL
DEPC1mL
用磁力攪拌器室溫下持續(xù)攪拌過夜,分瓶包裝后121℃高壓滅菌25min。
5
DB21/T2827.1—2017
A.6上樣緩沖液
溴酚藍0.2g,加雙蒸水10mL過夜溶解,50g蔗糖加入50mL水溶解后,移入已溶解的溴酚藍溶液
中,搖勻定容至100mL。
A.7電泳緩沖液(1倍)
電泳緩沖液(50倍)10mL
滅菌雙蒸水490mL
A.8磷酸鹽緩沖液(0.01mol/L,pH7.4,PBS)
氯化鈉(NaCl)8.0g
氯化鉀(KCl)0.2g
磷酸氫二鈉(Na2HPO4·12H2O)2.9g
磷酸二氫鉀(KH2PO4)0.2g
將上列試劑按次序加入定量容器中,加適量蒸餾水溶解后,再定容至1000mL,調pH至7.4,高壓
消毒滅菌112kPa20min,4℃冰箱保存。
A.9阿氏液
葡萄糖2.05g
檸檬酸鈉0.8g
檸檬酸0.055g
氯化鈉0.42g
加蒸餾水至100mL,溶解后調pH值至6.1,69kPa15min高壓滅菌,4℃冰箱保存。
_________________________________
6
DB21/T2827.1-2017
目次
前言................................................................................II
1范圍..............................................................................1
2規(guī)范性引用文件....................................................................1
3縮略語............................................................................1
4原理..............................................................................1
5實驗材料、儀器設備和試劑..........................................................1
5.1實驗材料......................................................................1
5.2儀器設備......................................................................1
5.3試劑..........................................................................2
6操作步驟..........................................................................2
6.1樣品的采集、保存運送和處理....................................................2
6.1.1樣品采集..................................................................2
6.1.2樣品保存與運送............................................................2
6.1.3樣品處理..................................................................2
6.2RT-PCR檢測...................................................................3
6.2.1病毒RNA的提取............................................................3
6.2.2RT-PCR擴增...............................................................3
6.2.2.1RT-PCR反應體系組成...................................................3
6.2.2.2擴增體系的配制........................................................3
6.2.2.3加樣..................................................................3
6.2.2.4RT-PCR反應程序設置...................................................4
6.2.3電泳......................................................................4
7結果判定..........................................................................4
附錄A(規(guī)范性附錄)試劑的配制......................................................5
I
DB21/T2827.1-2017
目次
前言................................................................................II
1范圍..............................................................................1
2規(guī)范性引用文件....................................................................1
3縮略語............................................................................1
4原理..............................................................................1
5實驗材料、儀器設備和試劑..........................................................1
5.1實驗材料......................................................................1
5.2儀器設備......................................................................1
5.3試劑
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