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文檔簡介
請統(tǒng)計侯凡凡院士所發(fā)表的期刊文獻(xiàn)你選用的工具A中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng)(SinoMed)B中文期刊全文數(shù)據(jù)庫C百度DGoogle外文摘要信息獲取(1)南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)情報學(xué)教研室梁麗明E-Mail:lianglm@PubMed簡介PubMed與MedlinePubMed檢索檢索結(jié)果的處理個性化服務(wù)外文摘要信息獲取授課內(nèi)容
PubMed簡介網(wǎng)址:世界最具權(quán)威性的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫,由NLM(美國國立醫(yī)學(xué)圖書館)NCBI(美國國家生物技術(shù)信息中心)向因特網(wǎng)用戶提供免費文獻(xiàn)檢索服務(wù)(自1997-6-26起)收錄70余個國家5400多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘,其中收錄中文刊100余種,是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫?,F(xiàn)有1950年以來的1900多萬篇文獻(xiàn)的記錄(其中MEDLINE記錄1700多萬條)目前每年增加60余萬條文獻(xiàn)記錄記錄中90%的文獻(xiàn)為英文。PubMed簡介PubMed的外部鏈接功能
提供NCBI開發(fā)的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的鏈接,如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美國國立醫(yī)學(xué)圖書館多種資源的鏈接提供相關(guān)文獻(xiàn)(RELATEDARTICLES)的鏈接提供其它外部資源的鏈接,如生物醫(yī)學(xué)期刊網(wǎng)站全文鏈接、NCBI資源。PubMed與MedlineMEDLINEPubMed合作?競爭?沒關(guān)系?PubMed與Medline歷史沿革1879年→印刷版創(chuàng)刊-IndexMedicus(IM)1983年→Medline光盤數(shù)據(jù)庫出版發(fā)行1997年→PubMed免費網(wǎng)絡(luò)版JohnShawBillings
PubMed文獻(xiàn)包括三部分:Medline文獻(xiàn)占據(jù)絕大部分OldMedline
1966年以前的Medline文獻(xiàn)非Medline文獻(xiàn)Medline收錄期刊的非生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)及最新文獻(xiàn)。PubMed檢索認(rèn)識PubMed主頁基本檢索高級檢索NLMNationalLibraryofMedicine(美國國立醫(yī)學(xué)圖書館)
NCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(美國國家生物技術(shù)信息中心)
ENTREZPUBMEDNucleotideStructureGenomePopsetOMIMProteinPubMed—生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)Nucleotide—核苷酸序列數(shù)據(jù)庫Protein—蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫Structure—大分子三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)Genome—完整的基因組匯編Popset—以DNA和Pro.分析生物間的進(jìn)化關(guān)系Taxonomy—分類學(xué)數(shù)據(jù)庫OMIM—孟德爾人類遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫Books—生物醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)版圖書Probeset—基因表達(dá)選集3DDomain—特定功能域三維結(jié)構(gòu)Entrez系統(tǒng)包含的數(shù)據(jù)庫基本檢索檢索某主題的文獻(xiàn)檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)檢索發(fā)表在某期刊上的文獻(xiàn)基本檢索:檢索某主題的文獻(xiàn)檢索有關(guān)腫瘤(cancer)的文獻(xiàn)cancer題目作者來源PubMed中的文獻(xiàn)狀態(tài)
PubMed數(shù)據(jù)類型(狀態(tài))PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文獻(xiàn)按處理過程分4種類型(或狀態(tài))PubMed-assuppliedbypublisherPubMed-inprocessPubMedPubMed-indexedforMEDLINE
屬于Medline收錄范圍,建立ti、au、ab等基本書目信息。(暫)不屬于Medline收錄范圍,但也建立ti、au、ab等基本書目信息。賦予MeSH、PT等字段并被index。"neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]檢索有關(guān)紫杉醇(paclitaxel)用于癌癥(cancer)治療的文獻(xiàn)檢索有關(guān)紫杉醇(paclitaxel)用于癌癥(cancer)治療的文獻(xiàn)Paclitaxel
ANDcancer
PubMed檢索式輸入規(guī)則可輸入單詞、詞組或句子進(jìn)行檢索可用的邏輯運算符:AND、NOT、OR(必須大寫)布爾邏輯運算順序是從左至右,圓括號優(yōu)先
PubMed檢索式輸入規(guī)則可使用截詞符*,但詞組強(qiáng)制、作者檢索時無效VaccinaVaccineVaccinesVaccinationvaccinatedVaccin*
詞組強(qiáng)制檢索(精確檢索)用雙引號,例:"lungcancer“詞組強(qiáng)制和截詞檢索時,系統(tǒng)的智能詞語匹配功能將不再被執(zhí)行例如:livercancer*或"livercancer"將不映射到MeSH
詞LiverNeoplasms注意:所有的雙引號、*、()、-等都必須是英文輸入狀態(tài)下(半角)輸入??稍跈z索詞后加[字段名],進(jìn)行限定字段檢索。PubMed常用檢索字段篇名字段檢索[ti]作者字段檢索[au]機(jī)構(gòu)字段檢索[ad]刊名字段檢索[so]
縮寫全稱縮寫全稱ABAbstractLALanguageADAffiliation(機(jī)構(gòu))MHMeSHTermsAUAuthor(作者)
PTPublicationTypeDPPublicationDateSOSourceCPPublicationCountryTAJournalTitle(刊名)TIABTitle/abstractTITitle(篇名)ISISSN
TWTextWords常用字段(檢索時大小寫都可以)請在PubMed數(shù)據(jù)庫中檢索南方醫(yī)科大學(xué)(southernmedicaluniversity)發(fā)表的文獻(xiàn)提示答案:southernmedicaluniversity[ad]請在PubMed數(shù)據(jù)庫中檢索南方醫(yī)院(NanfangHospital,nanfanghospital)發(fā)表的篇名中含有糖尿病(diabetes)的文獻(xiàn)選擇正確的檢索式:NanfanghospitalANDdiabetesNanfanghospitalANDdiabetes[ti]NanfanghospitalORnanfang
hospital[ad]ANDdiabetes[ti]Nanfanghospital[ad]ORnanfang
hospital[ad]ANDdiabetes[ti](Nanfanghospital[ad]ORnanfang
hospital[ad])ANDdiabetes[ti]
自由詞檢索:檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)BarryJ.MarshallJ.RobinWarren檢索某作者發(fā)表的文獻(xiàn):→MarshallBJ→WarrenJR
輸入采用姓前名后,姓全拼,名縮寫
02年以后實現(xiàn)了作者姓名智能轉(zhuǎn)換,可用全拼姓名檢索(僅限于02年以后的文獻(xiàn))。
自由詞檢索:檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)作者姓名書寫格式西方人姓名書寫格式:Firstname、MiddleName、Lastname。美國肯尼迪總統(tǒng)名為:JohnFrankKenedy,Kenedy為Lastname(姓)。Frank為Middlename,比較少看到,多看到JohnF.Kenedy,中間名縮寫了。如果看到姓名中間有逗號,則逗號前一定是姓。如:Kenedy,JohnF.
自由詞檢索:檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)BarryJ.MarshallJ.RobinWarren→MarshallBJ→WarrenJR
自由詞檢索:檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)2、作者姓名書寫格式中國人姓名格式:Lastname、Firstname。如:鐘世鎮(zhèn),就有如下拼寫形式可供檢索:Shi-zhen
Zhong;Shizhen
ZhongZhongshi-zhen;Zhong,shizhenZhong,shi-zhen
→zhong
szShizhen
Zhong,zhong
shizhen→zhongs
自由詞檢索:檢索某一作者發(fā)表的文獻(xiàn)查找PaulNurse發(fā)表的文獻(xiàn)查找姓氏為“black”的作者所發(fā)表的的文獻(xiàn)PaulNurseNursePBlack[au]自由詞檢索:檢索發(fā)表在某期刊上的文獻(xiàn)期刊檢索檢索時可輸入期刊全名,如:molecularbiologyofthecell,系統(tǒng)自動轉(zhuǎn)換為”molbiolcell”[JournalName];也可輸入期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式(如:molbiolcell)或期刊的ISSN(國際標(biāo)準(zhǔn)出版物編號,如:1059-1524)。如果期刊名是一個單詞或恰好是MeSH詞表中的詞,如GeneTherapy、Science、Cell等,則必須在刊名后加[so](期刊名稱字段標(biāo)識符)。我不記得字段我想看看之前的操作有高級檢索呢
高級檢索(advancedsearch)解決問題侯凡凡院士參與發(fā)表的最早一篇英文文獻(xiàn)是什么?檢索歷史記錄了登錄后系統(tǒng)執(zhí)行過的檢索式,最多可保存100條檢索式檢索式之間可進(jìn)行邏輯組配檢索歷史中的檢索式8小時后自動清空,要長久保存檢索式,需使用MyNCBI檢索下列各題,記錄你的檢索操作過程及命中文獻(xiàn)數(shù)了解有關(guān)瘋牛?。╞ovinespongiformencephalopathy,BSE)起源(origin)的情況,最早的報道在哪年,記錄出處。2005年度諾貝爾醫(yī)學(xué)獎授予了幽門螺桿菌的發(fā)現(xiàn)者BarryJ.Marshall(1951-)和J.RobinWarren(1937-),請檢索兩人合作發(fā)表的論文,記錄最早的一篇文獻(xiàn)題錄。南方醫(yī)院王繼德教授在《Gastroenterology》發(fā)表了一篇有關(guān)FHL2表達(dá)的文獻(xiàn),請找到這篇文獻(xiàn),并記錄篇名和在PubMed的被引情況煙堿(Nicotine),俗名尼古丁,是煙草的重要成分,對胎兒(embryo,fetus)有一定的影響。請用篇名字段檢索煙堿對胎兒影響的文獻(xiàn),并寫出最早一篇綜述的出處。RNA干擾(RNAINTERFERENCE,RNAi)用于肝癌(livercancer)治療的文獻(xiàn)。參考答案BSEANDoriginBrVetJ.1989Mar-Apr;145(2):191-42.MarshallbjANDWarrenjr(可用作者字段限定)-----題錄:MarshallBJ,WarrenJR.Unidentifiedcurvedbacilliinthestomachofpatientswithgastritisandpepticulceration.Lancet.1984Jun16;1(8390):1311-5
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