1、一、回穎+成熟模式lncRNA、circRNA、miRNA（調(diào)控性RNA）+外泌體現(xiàn)階邏輯創(chuàng)新頂峰 加入嵌套細胞交互作用，提高故事深度。二、間接機1.間接機制的研一、回穎+成熟模式lncRNA、circRNA、miRNA（調(diào)控性RNA）+外泌體現(xiàn)階邏輯創(chuàng)新頂峰 加入嵌套細胞交互作用，提高故事深度。二、間接機1.間接機制的研究主要聚焦于檢通路分子的磷酸化蛋白及總蛋白的表達情況，如蛋的磷酸化/總量比值，提示通路的活化或抑制的情況由變量與通路之間一定存在能夠介導磷酸化過程的酶（推論自然，所以可偷懶省略）2.主變量存在修飾作用的時候，是否存在省略做法1）舉例：DNA甲基化研究主變量發(fā)生變化的原因，上游

2、找啟動子區(qū)CpG島甲基化測，通過啟動子位點甲基化狀態(tài)的變化，解為什么被封印/解封印，那是否必須去）也可測（類似間接2）舉例：組蛋白甲基化，也可以只檢測組蛋白位點甲基化狀態(tài)3）舉例：RNA修飾，蛋白修飾三、細胞交互的半套機制1.從哪里來到哪里只研究一 某個循環(huán)分子，這個分子作為疾病3）先提出發(fā)現(xiàn)一個分子，伴隨疾病的發(fā)生，有特異性表達增高的現(xiàn)象（致病），明這個分子作為biomarker，關(guān)的表型過程。3）共同套：先建立一個循環(huán)分子與疾病臨床特征之間的相關(guān)性 主變量依舊是循環(huán)分子，作為biomarker，需要符合臨床意義的原則（斷、預后評價、治療療效等） 三表一圖（數(shù)據(jù)套餐：基線資料表、分析表、分析

3、表、預后生存曲線圖Cox回歸分ROC曲線（方法與金標準對效能如何閾值A(chǔ)UC）：AUC正常范圍1（0.5-效能低，0.7-0.9正常，大于性相當好），縱坐標敏感度（真陽率），橫Cox回歸分ROC曲線（方法與金標準對效能如何閾值A(chǔ)UC）：AUC正常范圍1（0.5-效能低，0.7-0.9正常，大于性相當好），縱坐標敏感度（真陽率），橫坐標1-特異度（假陽性率a.交互細胞兩種：供體細主變量、受體細胞接受主變量調(diào)控機一般來說機制解釋：先下后上；真實：分子功能特性決定研究做上還是做下故事開頭主變量的臨床意義先解釋清楚，一個價值的biomarker分子，一定是應分子么否定，它可以是一個表型伴隨的產(chǎn)物，甚至是

4、廢物關(guān)注下游效應的受體細胞途徑，適變量是信號分子，作用是在細胞間傳遞號。當主變量沒有特定的信號傳遞的功能下，解答上游如環(huán)，成為優(yōu)先考往上往下由信號分子決定，信號分子可上可下，半套必然做下；非信號分子不能下，只能做上基礎(chǔ)研究范疇里，大部分故事的主變量是具有信號傳導功能的，往下游找受體細胞機 制是半套研究里更加常見的。循環(huán)分子里存在特殊分子，代謝組學（尿液），泌他們（找上游）。b.交互形式：供體細胞主入/破碎流出，受體細胞膜上接受信號/信號分子具體細節(jié)問題結(jié)合文獻探索。不需要尋找新的交互形式，尋找文獻模板參考舉例蛋白信號肽外泌體胞內(nèi)多泡小體與細胞膜融合，中間有關(guān)鍵的蛋白調(diào)控過程，阻斷關(guān)蛋白，可以驗證分子是否由某些細；細胞間交互模式來源3）驗證主變量與表型關(guān)上游：驗證表型的出現(xiàn)與主變，由主變量的分子類型決的關(guān)下游：主變量被受體細胞接受后，與表型獲得之間的關(guān)操作細節(jié)：gain of function（受體細胞）一般做法是載體過表達，細胞交互課題直接將循環(huán)分子加入培養(yǎng)上清策略，兩種策略都要做double check，增加說服上游與下游的區(qū)別在于表型與分子之間的因果關(guān)系顛上游：表型出現(xiàn)與分子在培養(yǎng)上清中表達變化之間關(guān)系，建立模誘導細胞，然去檢測上