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文檔簡介
(優(yōu)選)分子生物學(xué)第五六章的損傷修復(fù)基因突變重組與轉(zhuǎn)座補充第一頁,共九十五頁。5.1DNA的損傷由于染色體DNA在生命過程中占有至高無上的地位,DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性以及DNA日常保養(yǎng)中的損傷修復(fù)有著特別重要的意義。第二頁,共九十五頁。5.1DNA的損傷由于染色體DNA在生命過程中占有至高無上的地位,DNA復(fù)制的準(zhǔn)確性以及DNA日常保養(yǎng)中的損傷修復(fù)有著特別重要的意義。第三頁,共九十五頁。DNA損傷是指在生物體生命過程中DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生的任何改變。主要分為兩種:單個堿基改變雙螺旋結(jié)構(gòu)的異常扭曲(鏈內(nèi)T二聚體、單鏈缺口、凸起等)第四頁,共九十五頁。引起DNA損傷的因素很多,包括:DNA分子自發(fā)性損傷物理因素?fù)p傷化學(xué)因素?fù)p傷第五頁,共九十五頁。
DNA復(fù)制過程中的損傷指堿基配對時產(chǎn)生的誤差經(jīng)過DNA聚合酶等綜合校對因素作用后仍未被校正的DNA的損傷。如:大腸桿菌DNA復(fù)制無DNA聚合酶校正時錯配率為10-1~10-2,識別校正后為10-5~10-6,再經(jīng)過其他因素,錯配率達到10-10這類損傷主要包括5種因素5.1.1DNA分子自發(fā)性損傷第六頁,共九十五頁。指堿基發(fā)生烯醇式-酮式結(jié)構(gòu)互變時,氫原子位置的可逆變化,使堿基配對發(fā)生改變,這樣在復(fù)制后的子鏈上就可能出現(xiàn)錯誤。
如:A、C或G、T錯配
互變異構(gòu)移位第七頁,共九十五頁。
主要指胞嘧啶C、A和G分子結(jié)構(gòu)中都含有環(huán)外氨基,氨基有時會自動脫落,使得C變?yōu)閁,A變?yōu)镮,G變?yōu)閄,當(dāng)DNA復(fù)制時,會在鏈中產(chǎn)生錯誤導(dǎo)致?lián)p傷。A—I—C(非T)下一輪C—G導(dǎo)致AT—GC引起突變C—U–A(非G)下一輪A—T導(dǎo)致GC—AT引起突變
亞硝酸鹽、羥胺誘變劑脫氨試劑第八頁,共九十五頁。
DNA復(fù)制時,無論模板還是新生鏈都會發(fā)生堿基的環(huán)出現(xiàn)象,即DNA聚合酶發(fā)生“打滑”,引起一個或數(shù)個堿基的插入或缺失。尤其是模板上有幾個相同的堿基情況。DNA聚合酶的“打滑”第九頁,共九十五頁。細(xì)胞的氧化代謝產(chǎn)生的氧自由基活性很高,DNA堿基至少會遭受到20種氧化損傷?;钚匝鯙檠醴肿与娮訑?shù)大于O2的O2-
可與
C、A配對,DNA聚合酶不能矯正其錯誤,造成GC—TA顛換,這種損傷可以積累,損傷的堿基也能夠被修復(fù)?;钚匝跻鸬恼T變第十頁,共九十五頁。DNA分子在生理條件下可通過自發(fā)性水解,使嘌呤堿和嘧啶堿從磷酸脫氧核糖骨架上脫落下來。哺乳動物每個細(xì)胞每20h脫去的嘌呤堿和嘧啶堿數(shù)分別平均為1000個和500個。堿基丟失第十一頁,共九十五頁。
紫外線(UV)照射引起的DNA損傷主要是同一條鏈內(nèi)相鄰2個嘧啶形成嘧啶二聚體,阻礙DNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。
ATTCGAGTTAGCTAAGCTCAATCG
5.1.2物理因素引起的損傷第十二頁,共九十五頁。第十三頁,共九十五頁。當(dāng)人的皮膚暴露在紫外線下,每小時產(chǎn)生5×104嘧啶二聚體/細(xì)胞第十四頁,共九十五頁。
1.皮膚癌主要見于經(jīng)常暴露于陽光的部位,尤其是頭頸部、手臂及手。
2.鱗癌好發(fā)于陽光照射最多的部位。
3.戶外工作時間較長的人群中皮膚癌發(fā)病率較高。
4.在同膚色人群中,居住于低緯度地區(qū)者,皮膚癌和惡性黑色素瘤發(fā)病數(shù)顯著增多,其他惡性腫瘤則無此傾向。
5.易感人種,典型的易感者為皮膚色素少或有散在的雀斑,易受陽光的灼傷。
第十五頁,共九十五頁。直接效應(yīng)高能r射線和X射線輻射后,對DNA存在環(huán)境的成分沉積能量,直接引起DNA理化性質(zhì)改變間接效應(yīng)細(xì)胞水分解離,產(chǎn)生氧自由基誘變堿基改變輻射后DNA分子堿基糖環(huán)發(fā)生變化,生成各種過氧化物,使堿基破壞或脫落脫氧戊糖受OH-作用,脫氫原子,使其分解引起DNA鏈斷裂引起DNA鏈斷裂及DNA鏈間交聯(lián),DNA-蛋白交聯(lián)等電離輻射引起DNA損傷第十六頁,共九十五頁。非電離輻射第十七頁,共九十五頁。第十八頁,共九十五頁。烷化劑對DNA的損傷烷化劑是一類親電子化合物,很容易與體內(nèi)大分子負(fù)電中心作用。當(dāng)烷化劑和DNA作用時,可以將烷基加到核酸的堿基上去。結(jié)果是形成鏈內(nèi)或鏈間交聯(lián),引起DNA烷基化。
6.1.3化學(xué)因素引起的損傷第十九頁,共九十五頁。堿基類似物對DNA的損傷是一類結(jié)構(gòu)與堿基相似的人工化合物,由于結(jié)構(gòu)相似,進入細(xì)胞后能代替正常堿基摻入到DNA中,干擾DNA合成。5-溴尿嘧啶(5-BU)與U結(jié)構(gòu)類似,酮式能與A配對,烯醇式能與G配對。結(jié)果引起A-T----G-C轉(zhuǎn)變。第二十頁,共九十五頁。
DNA修復(fù)是生物體細(xì)胞在長期進化中形成的一種保護功能,在遺傳信息傳遞的穩(wěn)定性方面具有重要作用。5.2DNA的修復(fù)第二十一頁,共九十五頁。直接修復(fù)切除修復(fù)錯配修復(fù)重組修復(fù)易錯修復(fù)和SOS應(yīng)急反應(yīng)細(xì)胞DNA損傷的修復(fù)系統(tǒng)主要有:第二十二頁,共九十五頁。直接修復(fù)將被損傷堿基回復(fù)到正常狀態(tài)的修復(fù)包括光復(fù)活修復(fù)、O6-甲基鳥嘌呤-DNA甲基轉(zhuǎn)移酶修復(fù)、單鏈斷裂修復(fù)在DNA光解酶(Photolyase)的作用下將在光下或經(jīng)紫外光照射形成的環(huán)丁烷胸腺嘧啶二體及6-4光化物(6-4photoproduct)還原成為單體的過程。生物體內(nèi)還廣泛存在著使O6-甲基鳥嘌呤脫甲基化的甲基轉(zhuǎn)移酶,以防止形成G-T配對。DNA單鏈斷裂可以通過重接(DNA連接酶),直接修復(fù)。第二十三頁,共九十五頁。第二十四頁,共九十五頁。切除修復(fù)
包括堿基切除修復(fù)和核苷酸片段切除修復(fù)堿基切除修復(fù):所有細(xì)胞中都帶有能識別受損核酸位點的糖苷水解酶,它能特異性切除受損核苷酸上的N-β-糖苷鍵,在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(AP位點)。DNA分子中一旦產(chǎn)生了AP位點,AP核酸內(nèi)切酶就會把受損核苷酸的糖苷-磷酸鍵切開,并移去包括AP位點核苷酸在內(nèi)的小片段DNA,由DNA聚合酶I合成新的片段,最終由DNA連接酶把兩者連成新的被修復(fù)的DNA鏈。第二十五頁,共九十五頁。
核苷酸片段切除修復(fù)
當(dāng)DNA鏈上相應(yīng)位置的核苷酸發(fā)生損傷,導(dǎo)致雙鏈之間無法形成氫鍵,則由核苷酸切除修復(fù)(nucleotide-excisionrepair)系統(tǒng)負(fù)責(zé)修復(fù)。第二十六頁,共九十五頁。損傷發(fā)生后,首先由DNA切割酶(exci-nuclease)在已損傷的核苷酸5’和3’位分別切開磷酸糖苷鍵,產(chǎn)生一個12~13個核苷酸(原核生物)或27~29個核苷酸(人類或其他高等真核生物)的小片段,移去小片段后由DNA聚合酶Ⅰ(原核)或ε(真核)合成新的片段,并由DNA連接酶完成修復(fù)中的最后一道工序。第二十七頁,共九十五頁。第二十八頁,共九十五頁。錯配修復(fù)錯配修復(fù)可以將DNA子鏈中的錯配幾乎完全修復(fù)。該系統(tǒng)識別母鏈依賴Dam甲基化酶,它能使位于5’GATC序列中A的N6位甲基化。一旦復(fù)制叉通過復(fù)制起始位點,母鏈就會在開始DNA合成前的一小點時間(幾秒鐘至幾分鐘)內(nèi)被甲基化。第二十九頁,共九十五頁。此后,只要兩條DNA鏈上堿基配對出現(xiàn)錯誤,錯配修復(fù)系統(tǒng)就會根據(jù)“保存母鏈,修正子鏈”的原則,找出錯誤堿基所在的DNA鏈,并在對應(yīng)于母鏈甲基化腺苷酸上游G的5'位置切開子鏈。第三十頁,共九十五頁。第三十一頁,共九十五頁。第三十二頁,共九十五頁。切除修復(fù)發(fā)生在下一輪DNA修復(fù)前,又稱復(fù)制前修復(fù)。機體細(xì)胞對在復(fù)制起始時尚未修復(fù)的DNA損傷部位可以先復(fù)制再修復(fù),這種方式稱為重組修復(fù)。這個過程發(fā)生在復(fù)制后,又稱復(fù)制后修復(fù)。重組修復(fù)第三十三頁,共九十五頁。復(fù)制重組再合成第三十四頁,共九十五頁。重組修復(fù)機制的缺陷,有可能導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。已經(jīng)發(fā)現(xiàn),婦女Brca1和Brca2兩個基因如果有缺陷,發(fā)生乳腺癌的概率為80%。這兩個蛋白質(zhì)參與重組修復(fù)。
第三十五頁,共九十五頁。錯配修復(fù)、直接修復(fù)、切除修復(fù)和重組修復(fù)都能夠識別DNA的損傷部位或錯配堿基而加以消除,在這些修復(fù)過程中不引入錯誤堿基,屬于避免差錯的修復(fù)。易錯修復(fù)和SOS應(yīng)急反應(yīng)第三十六頁,共九十五頁。當(dāng)無法為修復(fù)提供正確模板時,如模板鏈損傷、雙鏈斷裂、雙鏈交聯(lián)等,正常復(fù)制受阻,導(dǎo)致易錯修復(fù)。許多能造成DNA損傷或抑制DNA復(fù)制的過程能引起一系列復(fù)雜的誘導(dǎo)效應(yīng),這種效應(yīng)稱為應(yīng)急反應(yīng)(SOSresponse)。SOS包括誘導(dǎo)DNA損傷修復(fù)、誘變效應(yīng)、細(xì)胞分裂的抑制以及溶源性細(xì)菌釋放噬菌體等,細(xì)胞癌變也與SOS反應(yīng)有關(guān)。第三十七頁,共九十五頁。SOS反應(yīng)是細(xì)胞DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急情況下,細(xì)胞為求生存而產(chǎn)生的一種應(yīng)急措施。SOS反應(yīng)誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)包括:避免差錯的修復(fù)(errorfreerepair)和易產(chǎn)生差錯的修復(fù)(errorpronerepair)兩類。第三十八頁,共九十五頁。由于SOS反應(yīng)還能誘導(dǎo)產(chǎn)生缺乏校對功能的DNA聚合酶,所以在DNA鏈的損傷部位即使出現(xiàn)不配對堿基,復(fù)制也能繼續(xù)進行,以保證細(xì)胞的存活,叫易產(chǎn)差錯的修復(fù)。第三十九頁,共九十五頁。SOS反應(yīng)廣泛存在于原核和真核生物,它是生物體在不利環(huán)境中求得生存的一種基本功能。SOS反應(yīng)意義:①DNA的修復(fù);②導(dǎo)致變異。第四十頁,共九十五頁。作為遺傳物質(zhì)的DNA有三個主要功能:①通過復(fù)制將遺傳物質(zhì)由親代傳給子代;②通過轉(zhuǎn)錄使遺傳信息在子代得以表達;③通過變異在自然過程中獲得新的遺傳信息。5.3基因突變第四十一頁,共九十五頁?;蛲蛔?mutation):是在基因發(fā)生可遺傳的結(jié)構(gòu)和數(shù)量的變化,通常產(chǎn)生一定的表型。廣義的突變包括染色體畸變和基因突變。遺傳重組也導(dǎo)致可遺傳的變異,因此,染色體畸變、基因突變、遺傳重組是可遺傳變異的基礎(chǔ)。第四十二頁,共九十五頁。1、堿基對置換:指DNA錯配對堿基在復(fù)制后被固定下來,由原來的一個堿基對被另一個堿基對所取代,又稱為點突變。堿基對置換有轉(zhuǎn)換和顛換兩種。2、插入突變:指在基因的序列中插入了一個堿基或一段外來DNA導(dǎo)致的突變。包括同義突變、錯義突變和無義突變。基因突變的類型第四十三頁,共九十五頁。3.移碼突變:一個或多個非三整倍數(shù)的核苷酸對插入或缺失,導(dǎo)致編碼區(qū)位點后的三聯(lián)體密碼子可讀框改變,從而使后面的氨基酸都發(fā)生錯誤,是基因產(chǎn)物失活。4.滲漏突變:突變基因的產(chǎn)物尚有部分活性的錯義突變。5.回復(fù)突變:從突變體回復(fù)原先野生型表型的突變過程。第四十四頁,共九十五頁。在自然條件下發(fā)生的突變稱為自發(fā)突變。自發(fā)突變的頻率很低,大腸桿菌及果蠅突變率10-10左右。能夠提高突變率的物理或化學(xué)因子稱為誘變劑(mutagen)。堿基類似物:5-BU與T結(jié)構(gòu)相似;堿基修飾劑:亞硝酸;烷化劑;嵌合染料(EB);紫外線和電離輻射誘變劑種類及機制第四十五頁,共九十五頁。生物功能喪失獲得新功能癌癥發(fā)生基因突變的主要后果第四十六頁,共九十五頁。課后作業(yè)名詞解釋:基因突變無義突變移碼突變回復(fù)突變簡答題:課后思考題1和4第四十七頁,共九十五頁。DNA分子內(nèi)或分子間發(fā)生遺傳信息的重新組合,稱為遺傳重組或基因重排。重組產(chǎn)物稱為重組DNA(recombinantDNA)。真核生物基因組間重組多發(fā)生在減數(shù)分裂時同源染色體之間的交換。細(xì)菌及噬菌體的基因組為單倍體,來自不同親代兩組DNA之間可通過多種形式進行遺傳重組。第6章DNA的重組與轉(zhuǎn)座第四十八頁,共九十五頁。DNA重組對生物進化起著關(guān)鍵性的作用??蛇z傳變異的根本原因是突變。突變的概率很低,且多數(shù)是有害的。如果生物只有突變沒有重組,在積累具有選擇優(yōu)勢突變的同時不可避免地積累許多難以擺脫的不利突變。有利突變隨不利突變一起被淘汰,新的優(yōu)良基因就不可能出現(xiàn)。DNA重組的意義是能迅速增加群體的遺傳多樣性,使有利突變與不利突變分開,通過優(yōu)化組合積累有意義的遺傳信息。此外,DNA重組還參與許多重要生物學(xué)過程,為DNA損傷或復(fù)制障礙提供了修復(fù)機制。第四十九頁,共九十五頁。DNA重組分為4類:同源重組:重組對之間需要同源性位點特異重組:無需同源性,調(diào)節(jié)蛋白識別特異DNA序列轉(zhuǎn)座重組:無需同源,調(diào)節(jié)蛋白識別轉(zhuǎn)座因子異常重組:無需同源或少同源性,屬非正常細(xì)胞行為第五十頁,共九十五頁。同源重組:由兩條同源區(qū)的DNA分子,通過配對、鏈斷裂和再連接而產(chǎn)生的片段間交換的過程。
6.1.1同源重組的分子模型
Holliday等1964年提出,能夠較好解釋同源重組現(xiàn)象。6.1同源重組第五十一頁,共九十五頁。兩條同源染色體DNA相互靠近排列2.兩個同源DNA分子之一發(fā)生斷裂3.斷裂后形成3’游離端侵入雙鏈DNA,尋找同源區(qū),形成短的鏈置換區(qū)4.形成Holliday中間體5.引發(fā)分支遷移6.四鏈DNA復(fù)合體按不同方向拆分,形成片段重組體和拼接重組體第五十二頁,共九十五頁。6.1.2同源重組的酶學(xué)分子機制6.1.3酵母的減數(shù)分裂重組6.1.4異源雙鏈與基因轉(zhuǎn)換
在重組區(qū)段每條雙鏈中均有一段DNA單鏈來自另一雙鏈中的相對鏈,這一部分稱為異源雙鏈。了解第五十三頁,共九十五頁。細(xì)菌可以通過多種途徑進行細(xì)胞間基因轉(zhuǎn)移,并通過基因重組適應(yīng)環(huán)境改變。這種遺傳信息的流動可以發(fā)生在種間和種內(nèi),甚至與高等動植物之間也存在橫向的遺傳信息傳遞。細(xì)菌的基因轉(zhuǎn)移主要有四種機制:接合(conjugation)轉(zhuǎn)化(transformation)轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)細(xì)胞融合(cellfusion)6.1.5細(xì)菌的基因轉(zhuǎn)移與重組第五十四頁,共九十五頁。①細(xì)菌的接合細(xì)菌細(xì)胞相互接觸時遺傳信息可由一個細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一細(xì)胞,稱為接合作用。供體細(xì)胞為雄性,受體為雌性。通過接合而轉(zhuǎn)移DNA的能力由接合質(zhì)粒提供,與接合功能有關(guān)的蛋白質(zhì)均由接合質(zhì)粒所編碼。能夠促使染色體基因轉(zhuǎn)移的接合質(zhì)粒稱為致育因子(fertilityfactor,F(xiàn)因子)。第五十五頁,共九十五頁。大腸桿菌F因子是雙鏈閉環(huán)的大質(zhì)粒,總長約100kb,復(fù)制起點為oriV。F因子可以在細(xì)胞內(nèi)游離存在(F+),也可以整合到宿主染色體內(nèi)。整合F因子的大腸桿菌菌株具有較高頻率的重組(high-frequencyrecombination),稱為Hf菌株。F因子可以整合在染色體不同位置,由此而得到不同的Hf菌株。第五十六頁,共九十五頁。②細(xì)菌的遺傳轉(zhuǎn)化遺傳轉(zhuǎn)化(genetictransformation)是指細(xì)菌品系由于吸收了外源DNA(轉(zhuǎn)化因子)而發(fā)生遺傳性狀的改變現(xiàn)象。第五十七頁,共九十五頁。感受態(tài)細(xì)胞(competentcell):具有攝取周圍環(huán)境中游離DNA分子能力的細(xì)菌細(xì)胞稱為感受態(tài)細(xì)胞。受體細(xì)胞經(jīng)過一些特殊方法(如電擊、CaCl2)處理后,細(xì)胞膜的通透性發(fā)生了暫時性改變,成為能允許外源DNA分子進入的狀態(tài)。第五十八頁,共九十五頁。③細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction):是通過噬菌體將細(xì)菌基因從供體轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞的過程。④細(xì)菌的細(xì)胞融合由細(xì)胞質(zhì)膜融合導(dǎo)致的基因轉(zhuǎn)移和重組。在實驗室中用溶菌酶除去細(xì)菌細(xì)胞壁的肽聚糖,使其成為原生質(zhì)體,可人工促進原生質(zhì)體融合,由此使兩菌株的DNA發(fā)生廣泛的重組。第五十九頁,共九十五頁。6.2特異位點重組廣泛存在于各類細(xì)胞中,有特殊的作用,包括某些基因表達的調(diào)節(jié),發(fā)育過程中程序性DNA重排,以及有些病毒和質(zhì)粒DNA復(fù)制循環(huán)過程中發(fā)生的整合與切除等。一般發(fā)生在某個特定的(重組位點)短DNA序列(20-200bp)內(nèi),有特異的酶和輔助因子對其識別和作用。第六十頁,共九十五頁。1.λ噬菌體DNA的整合與切除2.鼠傷寒沙門氏菌的特異位點重組第六十一頁,共九十五頁。6.3.1轉(zhuǎn)座子的概念轉(zhuǎn)座子(transposon):是在基因組中可以移動的一段DNA序列。一個轉(zhuǎn)座子由基因組的一個位置轉(zhuǎn)移到另一個位置的過程稱為轉(zhuǎn)座或移位(transposition)。本質(zhì)是由轉(zhuǎn)座子(可移位因子)介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。6.3DNA的轉(zhuǎn)座第六十二頁,共九十五頁。早在20世紀(jì)初,遺傳學(xué)家就已發(fā)現(xiàn)玉米中存在決定體細(xì)胞變異的控制因子(controllingelement),事實上就是轉(zhuǎn)座子。第六十三頁,共九十五頁。20世紀(jì)40年代,巴巴拉.麥克林托克(BarbaraMcClintock)在美國康奈爾大學(xué)和冷泉港實驗室所進行的開創(chuàng)性工作,在印第安玉米研究中發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)座子,當(dāng)時稱控制元件,打破了孟德爾關(guān)于基因固定排列于染色體上的概念,在當(dāng)時幾乎不能被科學(xué)界所接受。直到1983年終于在分子水平上得到證實,并使她獲得了諾貝爾生理與醫(yī)學(xué)獎。第六十四頁,共九十五頁。轉(zhuǎn)座子存在于地球上所有生物體內(nèi)人類基因組中有35%以上序列為轉(zhuǎn)座子序列,大部分與疾病有關(guān)(基因重排,影響基因組穩(wěn)定性,導(dǎo)致疾?。?。第六十五頁,共九十五頁。6.3.2轉(zhuǎn)座子的分類插入序列復(fù)合轉(zhuǎn)座子第六十六頁,共九十五頁。
(1)插入(IS)序列
最簡單的轉(zhuǎn)座子只含有與轉(zhuǎn)座有關(guān)的酶基因,不含有任何宿主基因(不含抗藥性基因),常被稱為插入序列(insertionsequence,IS)。
IS序列都是可以獨立存在的單元,它們都是很小的DNA片段(約lkb),帶有介導(dǎo)自身移動的蛋白,兩端具有15~25bp的反向重復(fù)序列,轉(zhuǎn)座時往往復(fù)制宿主靶位點一小段(4~15bp)DNA,形成位于IS序列兩端的正向重復(fù)區(qū)
。第六十七頁,共九十五頁。第六十八頁,共九十五頁。IS常常插入到特定的基因中,造成該基因突變??茖W(xué)上用標(biāo)準(zhǔn)命名法對這些突變進行編號,如λ::IS1表示一個IS1的序列插入到噬菌體λ基因組內(nèi)。第六十九頁,共九十五頁。表2-13IS序列的結(jié)構(gòu)特征長度/bp兩端倒置重復(fù)區(qū)/bp靶位點正向重復(fù)區(qū)/bp靶位點IS1IS2IS4IS5IS10RIS50RIS90376813271428119513291531105723411816229189511或124999隨機有熱點AAAN20TTT有熱點NGCTNAGCN有熱點未知第七十頁,共九十五頁。(2)復(fù)合轉(zhuǎn)座子復(fù)合轉(zhuǎn)座子(compositetransposon):是一類除了轉(zhuǎn)座酶基因之外,還帶有藥物抗性基因(或其他宿主基因)標(biāo)志的轉(zhuǎn)座子。因結(jié)構(gòu)較大而復(fù)雜,故稱為復(fù)合轉(zhuǎn)座子。以Tn表示。第七十一頁,共九十五頁。兩個末端有相同的IS序列,IS序列有正向和反向兩種排列方式。表明IS序列插入到某個功能基因兩端時就可能產(chǎn)生復(fù)合轉(zhuǎn)座子。Ⅰ型:第七十二頁,共九十五頁。第七十三頁,共九十五頁。一旦形成復(fù)合轉(zhuǎn)座子,IS序列就不能再單獨移動,因為它們的功能被修飾了,只有作為復(fù)合體移動。第七十四頁,共九十五頁。
Ⅱ型主要指TnA家族:沒有IS序列、體積龐大(5000bp以上)、帶有3個基因,其中一個編碼β-內(nèi)酰胺酶(AmpR),另兩個則是轉(zhuǎn)座作用所必須的。這類轉(zhuǎn)座子兩翼帶有38bp的倒置重復(fù)序列。
第七十五頁,共九十五頁。第七十六頁,共九十五頁。復(fù)合轉(zhuǎn)座子(Tn)的特點①末端反向重復(fù)序列,為轉(zhuǎn)座酶所必須;②中間的開放閱讀框架(ORF)作為標(biāo)記基因;③轉(zhuǎn)位后靶位點成為正向重復(fù)序列。第七十七頁,共九十五頁。第七十八頁,共九十五頁。6.3.3轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座機制轉(zhuǎn)座時發(fā)生的插入作用的普遍特征是受體分子中有一段很短的(3~l2bp)、被稱為靶序列的DNA會被復(fù)制,使插入的轉(zhuǎn)座子位于兩個重復(fù)的靶序列之間。第七十九頁,共九十五頁。對于一個特定的轉(zhuǎn)座子來說,它所復(fù)制的靶序列長度是一樣的,如IS1兩翼總有9個堿基對的靶序列,而Tn3兩端總有5bp的靶序列。靶序列的復(fù)制起源于特定內(nèi)切酶所造成的粘性DNA末端。第八十頁,共九十五頁。第八十一頁,共九十五頁。6.3.4轉(zhuǎn)座子的基本特征轉(zhuǎn)座不依賴RecA轉(zhuǎn)座后靶序列重復(fù)轉(zhuǎn)座子有插入選擇性區(qū)域性優(yōu)先轉(zhuǎn)座具有排他性轉(zhuǎn)座有極性效應(yīng)活化臨近的沉默基因第八十二頁,共九十五頁。6.3.4轉(zhuǎn)座作用的遺傳學(xué)效應(yīng)(1)轉(zhuǎn)座引起插入突變(10-8~10-3)各種IS、Tn都可以引起插入突變。如果插入位于某操縱子的前半部分,就可能造成極性突變,導(dǎo)致該操縱子后半部分結(jié)構(gòu)基因表達失活;(2)轉(zhuǎn)座產(chǎn)生新的基因如果轉(zhuǎn)座子上帶有抗藥性基因,它一方面造成靶DNA序列上的插入突變,同時也使這個位點產(chǎn)生抗藥性;第八十三頁,共九十五頁。(3)影響插入位置鄰近基因的表達,使宿主表型改變;(4)轉(zhuǎn)座子插入染色體后引起兩側(cè)染色體畸變;第八十四頁,共九十五頁。轉(zhuǎn)座子在分子生物學(xué)中的作用用于難篩選的基因轉(zhuǎn)移基因定位的標(biāo)記篩選插入
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