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ICS65.020.01CCSB16 CodeofPracticeforDetectionofPepinomosaicviruscarriedbySolanaceae2022-10-10發(fā) 2022-11-10實(shí)湖北省植物保護(hù)學(xué) 范圍1規(guī)范性引用文件1術(shù)語(yǔ)和定義1鳳果花葉病毒分類信息-1儀器和試劑1儀器設(shè)備1-主要試劑1-檢測(cè)流程圖1檢測(cè)方法1樣品制備2-種子類2種苗類2RNA2--分子雜交2-結(jié)果判定3-留樣保存與結(jié)果記錄-3留樣保存3-結(jié)果記錄3-建檔3-附錄A(參考性附錄)鳳果花葉病毒基本信息4附錄B(參考性附錄)核酸提取方法-6附錄C(參考性附錄)分子雜交方法-7附錄D(規(guī)范性性附錄)鳳果花葉病毒檢測(cè)流程圖9 --PAGE1GB/T6682SN/T2964學(xué)名:Pepinomosaicvirus類病毒名及縮寫:pepinomosaic,馬鈴薯 1000μL)、常規(guī)冰箱、超低溫冰箱等。 除另有規(guī)定外,所有試劑均為分析純或生化試劑,實(shí)驗(yàn)用水應(yīng)符合GB/T6682中一級(jí)水的規(guī)格。鳳果花葉病毒檢測(cè)流程圖見附錄D。檢測(cè)過程中防擴(kuò)散、防污染的措施按照SN/T2964中的規(guī)定執(zhí) 每份送檢樣本中選取100~200粒種子,表面消毒后,置于鋪有吸水紙的白瓷盤或培養(yǎng)皿中,20℃~25℃、12h/12h光暗交替條件下保濕培養(yǎng)直至萌發(fā)。隨機(jī)抽取葉片1g~5g,置于去RNA酶的研缽g~200g葉片置于去RNA酶的研缽中,加入液氮后迅速研磨成細(xì)粉狀,制成檢測(cè)樣品。 cDNA0.2mLPCR管中加入DEPC處理去離子水10μL、模板RNA3μL(50ng~200ng),隨機(jī)引物1U/μLRNAase抑制劑(Rnasin)0.5μL、200U/μL反轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)0.5μL,混勻后37℃水浴1h;反轉(zhuǎn)錄結(jié)束后瞬時(shí)離心,95℃(或沸水)水浴5min,冰浴3min,直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增。(均為10μmol/L)各1.0μL(見表1),5U/μLTaq酶0.5μL,模板cDNA3μL,加DEPC處理水至總體積25μL。每個(gè)樣品設(shè)置兩個(gè)平行反應(yīng),以雙蒸水代替模板作為空白對(duì)照。1PCR反應(yīng)程序:95℃5min;9530s,56℃30s,7230s,35個(gè)循環(huán);72℃10min 采用RochePepMVRNA-20℃ --PAGE4附錄1980年,Jones首次從秘魯海岸卡內(nèi)特河谷種植的鳳果(Solanummuricatum)中分離到希臘、意大利、荷蘭、英國(guó)、西班牙、瑞士、瑞典、烏克蘭、葡萄牙、芬蘭、匈牙利、愛爾蘭、立陶宛、馬耳他、挪威、波蘭、斯洛伐克、斯洛文尼亞、土耳其等。PepMV長(zhǎng)距離傳播主要通過受感染的種子和苗木。PepMV不侵染胚和胚乳,僅侵染種率較低,為0.005%~0.057,使用被感染的種子有傳播風(fēng)險(xiǎn)。PepMV具有高度的接觸傳染X病毒屬的病毒傳播更快,如番茄花葉病毒(Tomatomosaicvirus,ToMV)、馬鈴薯X病毒(PotatovirusXPVX)。PepMV還可通過花粉可附著在大黃蜂(Bombusimpatiens)身體上傳播,也可通過土壤生息絕對(duì)寄生菌孢子(Olpidiumvirulentus)傳播危害。PpV無(wú)論P(yáng)epV癥狀如何變化,苗期地上和地下部分生長(zhǎng)活躍期前一個(gè)月,均可檢測(cè)到PpVPeM3。功能;ORF2ORF4編碼的蛋白分子量大小分別為26kDa、14kDa和9kDa;ORF5編碼衣附錄DEPC處理超純水:取制備好的去離子水500mL,加入500μLDEPC搖床震蕩過夜,高1mol/LTris-HCl(pH8.0):稱取12.11gTris·base,加50mLDEPC處理超純水溶解,用濃HCl調(diào)pH值至8.0,定容至100mL,高溫高壓滅菌后室溫保存;0.5mol/LEDTA(pH8.0):稱取18.61gNa2EDTA·2H2O,加80mL處理超純水溶解,用約2gNaOH調(diào)pH值至8.0,加DEPC100μL,定容至100mL,搖床震蕩過夜,高溫高壓10×TE(pH8.0):取1mol/LTris-HCl(pH8.0)10mL和0.5mol/LEDTA8.0)2mL,加50mLDEPC處理超純水溶解,定容至100mLTrizol,渦旋振蕩15s,室溫靜置15min;加400μL氯仿,上下顛倒混勻,室溫靜置2min,412000r/m離心15min;取上清于新的離心管中,加無(wú)加入等體積的異丙醇沉淀,輕微顛倒,-20℃沉降1h;12000r/m離心15min;棄上清,沉淀中加1mL預(yù)冷的75酒精,上下顛倒10次,12000r/m離心5min,棄上清;瞬間離心20s,吸去多余液體,室溫干燥5-10min,加30μLDEPC處理的去離子水溶解,-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。附?0×Denhardt’s1gFicoll400,1gPVP-40,1gBSA80mL去離子100mL,過濾除菌及雜質(zhì)后-20℃貯存;雜交液:預(yù)雜交液中加入DIG-RNA0.73gNaCl,0.24gNa2HPO4,0.1gNaH2PO4,5gSDS80mL水中,100mL,過濾除菌后室溫保存;II0.24gTris·base,1.16gNaCl,0.4gMgCl2160mLHClMaleicacid緩沖液:100mmolMaleicacid、150mmolNaCl,pH7.5;洗膜緩沖液:100mmolMaleicacid、150mmolNaCl、0.3%v/v)Tween20,pH7.5;檢測(cè)緩沖液:100mmolTris-HCl(pH9.5)、100mmolNaCl;CSPD:25mmolCSPD(用前稀釋帶正電的尼龍膜為AmershamPharmaciaBiotech挑取PepMV目標(biāo)片段正向插入的克隆質(zhì)粒,用NdeⅠ對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行酶切線性化處理,獲得T7RNA多聚酶進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄隨機(jī)標(biāo)記單鏈RNA探和2μLT7RNA聚合酶、0.5μLRNA酶抑制劑,37℃標(biāo)記反應(yīng)2h,反應(yīng)完成后保存于-20℃1)3μLRNA7μL(33%甲醛、50%2)3μL1200×100J/cm23min;6×SSC(FisherScientificInternationalInc.)68℃1h;20mL~40mL2×SSC0.1%SD
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