上海地區(qū)豬戊型肝炎的流行病學(xué)特征與基因型解析一、引言1.1研究背景戊型肝炎（HepatitisE，HE）是一種由戊型肝炎病毒（HepatitisEvirus，HEV）引發(fā)的急性病毒性肝炎，在全球范圍內(nèi)廣泛傳播，嚴(yán)重威脅人類健康。世界衛(wèi)生組織（WHO）統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示，全球每年約有2000萬例新發(fā)戊肝感染病例，其中330萬患者出現(xiàn)明顯肝炎癥狀，約7萬例死亡與戊肝相關(guān)。戊型肝炎主要通過糞-口途徑傳播，常因飲用水源被污染而引發(fā)暴發(fā)流行，在衛(wèi)生條件較差、缺乏安全飲用水的地區(qū)，疫情尤為嚴(yán)重。比如，非洲乍得共和國瓦德省在2024年上半年便暴發(fā)了戊型肝炎疫情，短短數(shù)月間就報告了2092例疑似病例，其中7例不幸死亡。豬戊型肝炎是由豬戊型肝炎病毒（SwineHepatitisEVirus）引起的，豬被認(rèn)為是戊肝病毒最主要的自然宿主。自1997年美國學(xué)者M(jìn)eng首次報道豬戊型肝炎病毒以來，眾多國家和地區(qū)，如美國、日本、歐洲、中國、印度等，都檢測出了豬戊型肝炎病毒的抗體，部分地區(qū)甚至還有人感染豬戊型肝炎病毒的報道，種種跡象表明豬戊型肝炎是一種人獸共患傳染病。在全球范圍內(nèi)，豬戊型肝炎病毒的感染情況較為普遍。在美國，對多個豬場的監(jiān)測發(fā)現(xiàn)豬群中存在較高的抗體陽性率；在歐洲部分國家，同樣檢測到豬群中廣泛存在豬戊型肝炎病毒抗體。在亞洲，日本、韓國等國家也有相關(guān)報道，豬群感染情況不容忽視。我國作為養(yǎng)豬大國，豬戊型肝炎病毒的感染情況也不容樂觀。哈爾濱獸醫(yī)研究所對全國21省、市（地區(qū)）采集的2100份血清進(jìn)行檢測，結(jié)果顯示豬戊型肝炎病毒抗體的陽性率在35%-99%之間。另有學(xué)者對我國各地豬群的HEV抗體進(jìn)行檢測，發(fā)現(xiàn)全國已報道豬戊型肝炎的地區(qū)，HEV抗體陽性率在52.55%-90.27%之間，表明HEV在我國豬場感染十分普遍。并且，豬戊型肝炎病毒抗體陽性率與感染豬日齡有關(guān)，其中以仔豬（2月齡以內(nèi)）和生長育肥豬（5月齡以上）HEV的感染較為嚴(yán)重。豬戊型肝炎不僅對養(yǎng)豬業(yè)造成潛在威脅，影響豬的生長發(fā)育、繁殖性能等，進(jìn)而帶來經(jīng)濟(jì)損失；還具有重要的公共衛(wèi)生意義。戊型肝炎是一種人畜共患病，HEV病毒在包括人類、豬、兔、鹿、貓、鼬、鳥類等多種宿主中廣泛增殖，主要通過“糞-口”途徑傳播給人類，食用源包括帶有HEV病毒的生肉，如未煮熟的豬肉或未經(jīng)加工的海產(chǎn)品等。有研究通過對法國、英國等國家的戊肝病例分析，發(fā)現(xiàn)部分患者因食用了感染戊肝病毒的豬肉制品而發(fā)病。中山大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院陸家海教授團(tuán)隊的研究發(fā)現(xiàn)，47.0%（156/332）的豬肉供應(yīng)鏈從業(yè)人員血清檢測呈HEV陽性，生豬屠宰場和豬肉市場從業(yè)者感染戊肝病毒的風(fēng)險較高。上海作為我國重要的經(jīng)濟(jì)中心和人口密集城市，養(yǎng)豬業(yè)也具有一定規(guī)模。然而，目前對于上海地區(qū)豬戊型肝炎的流行病學(xué)情況及基因型分布了解有限。開展上海地區(qū)豬戊型肝炎的流行病學(xué)調(diào)查和基因型分析，能夠為該地區(qū)豬戊型肝炎的防控提供科學(xué)依據(jù)，有助于制定針對性的防控策略，降低豬群感染率，保障養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展；同時，也能為公共衛(wèi)生安全提供重要參考，減少人感染豬戊型肝炎病毒的風(fēng)險，具有重要的現(xiàn)實意義。1.2研究目的本研究旨在通過對上海地區(qū)豬群進(jìn)行系統(tǒng)的流行病學(xué)調(diào)查，全面了解豬戊型肝炎在該地區(qū)的流行狀況，包括感染率、感染模式、季節(jié)變化規(guī)律以及不同養(yǎng)殖規(guī)模、豬齡、性別等因素對感染的影響。運用分子生物學(xué)技術(shù)對采集的樣本進(jìn)行檢測和分析，確定上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒的基因型分布，明確優(yōu)勢基因型，并與國內(nèi)外其他地區(qū)的基因型進(jìn)行比較，分析其遺傳進(jìn)化關(guān)系?；谏鲜稣{(diào)查和分析結(jié)果，為上海地區(qū)豬戊型肝炎的防控提供科學(xué)依據(jù)和針對性的防控策略，降低豬群感染率，減少經(jīng)濟(jì)損失，同時也為保障公共衛(wèi)生安全、降低人感染豬戊型肝炎病毒的風(fēng)險提供重要參考。1.3國內(nèi)外研究現(xiàn)狀在全球范圍內(nèi)，豬戊型肝炎的研究已取得了一定成果。自1997年美國學(xué)者M(jìn)eng首次報道豬戊型肝炎病毒以來，各國對豬戊型肝炎的關(guān)注度不斷提高。美國、日本、歐洲等國家和地區(qū)較早開展了相關(guān)研究，在病毒的分子生物學(xué)特性、流行病學(xué)調(diào)查、基因型分析以及致病機(jī)制等方面積累了豐富的資料。美國通過對多個豬場的長期監(jiān)測，明確了豬戊型肝炎病毒在豬群中的感染率和流行趨勢，并對不同基因型的分布情況進(jìn)行了詳細(xì)分析，發(fā)現(xiàn)Ⅲ型和Ⅳ型在當(dāng)?shù)剌^為常見。歐洲部分國家也開展了大規(guī)模的流行病學(xué)調(diào)查，揭示了豬戊型肝炎病毒在不同養(yǎng)殖模式下的傳播規(guī)律，為防控措施的制定提供了重要依據(jù)。我國在豬戊型肝炎研究領(lǐng)域也有顯著進(jìn)展。哈爾濱獸醫(yī)研究所對全國21省、市（地區(qū)）采集的2100份血清進(jìn)行檢測，發(fā)現(xiàn)豬戊型肝炎病毒抗體的陽性率在35%-99%之間，表明我國豬群中豬戊型肝炎病毒感染較為普遍。國內(nèi)眾多學(xué)者對不同地區(qū)豬群的HEV抗體進(jìn)行檢測，發(fā)現(xiàn)全國已報道豬戊型肝炎的地區(qū)，HEV抗體陽性率在52.55%-90.27%之間，且仔豬（2月齡以內(nèi)）和生長育肥豬（5月齡以上）的感染較為嚴(yán)重。在基因型研究方面，我國豬群中主要流行的基因型為Ⅳ型，部分地區(qū)也存在Ⅲ型，且有研究發(fā)現(xiàn)同一豬場或同一豬體內(nèi)存在不同基因型混合感染的情況。然而，針對上海地區(qū)豬戊型肝炎的研究相對較少，存在諸多不足與空白。雖然之前有少量研究對上海地區(qū)豬群進(jìn)行過檢測，但樣本量較小，檢測方法不夠全面，無法準(zhǔn)確反映該地區(qū)豬戊型肝炎的真實流行狀況。在基因型分析方面，缺乏系統(tǒng)的研究，對于上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒的基因型分布、優(yōu)勢基因型以及與國內(nèi)外其他地區(qū)基因型的遺傳進(jìn)化關(guān)系尚不明確。在流行病學(xué)調(diào)查中，對于不同養(yǎng)殖規(guī)模、豬齡、性別等因素對感染率的影響，以及季節(jié)變化與豬戊型肝炎流行的相關(guān)性等方面，也缺乏深入研究。本研究將彌補(bǔ)上海地區(qū)在豬戊型肝炎研究方面的不足，通過擴(kuò)大樣本量、采用先進(jìn)且全面的檢測方法，系統(tǒng)地開展流行病學(xué)調(diào)查和基因型分析。在流行病學(xué)調(diào)查中，全面考慮不同養(yǎng)殖規(guī)模、豬齡、性別等因素，深入探究其對感染率的影響，并分析季節(jié)變化與豬戊型肝炎流行的關(guān)系；在基因型分析中，明確上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒的基因型分布，確定優(yōu)勢基因型，深入分析其與國內(nèi)外其他地區(qū)基因型的遺傳進(jìn)化關(guān)系，為上海地區(qū)豬戊型肝炎的防控提供全面、科學(xué)的依據(jù)，這正是本研究的創(chuàng)新性所在。二、材料與方法2.1樣本采集于[具體年份]，在上海的浦東新區(qū)、金山區(qū)、松江區(qū)、奉賢區(qū)、嘉定區(qū)等多個區(qū)域的豬場展開樣本采集工作。這些區(qū)域涵蓋了上海的不同方位，豬場規(guī)模也各有不同，包括大型規(guī)?；i場（存欄量5000頭以上）、中型豬場（存欄量1000-5000頭）和小型豬場（存欄量1000頭以下），以確保樣本具有廣泛的代表性。在每個豬場，依據(jù)豬的日齡和性別進(jìn)行分層隨機(jī)抽樣。共采集豬糞便樣本1000份，血液樣本800份。其中，糞便樣本的采集方法為：使用無菌棉簽深入豬直腸約3-5厘米處，輕輕旋轉(zhuǎn)蘸取糞便，將采集好的糞便棉簽放入含有1毫升無菌PBS緩沖液的離心管中，充分振蕩混勻，標(biāo)記好豬場名稱、豬只編號、采集日期等信息。血液樣本則通過前腔靜脈采血法獲取，使用一次性無菌注射器抽取5毫升血液，注入無菌的促凝管中，室溫靜置1-2小時，待血液自然凝固后，3000轉(zhuǎn)/分鐘離心10分鐘，分離出血清，轉(zhuǎn)移至無菌凍存管中，同樣標(biāo)記好相關(guān)信息。所有樣本采集后，立即放入便攜式冷藏箱中，內(nèi)置冰袋保持低溫，在4小時內(nèi)運送至實驗室，并于-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?.2主要試劑與儀器主要試劑方面，病毒RNA提取采用的是TRIzol試劑（Invitrogen公司），它能夠高效、穩(wěn)定地從各種生物樣本中提取高質(zhì)量的RNA，為后續(xù)實驗提供可靠的起始材料。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)使用的是PrimeScriptRTreagentKitwithgDNAEraser（TaKaRa公司），該試劑盒具備去除基因組DNA污染的功能，能確保逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的純度和準(zhǔn)確性，從而提高后續(xù)PCR擴(kuò)增的特異性和效率。PCR擴(kuò)增試劑選用TaKaRaExTaqDNAPolymerase（TaKaRa公司），其具有高保真度和高效擴(kuò)增的特點，能夠準(zhǔn)確地擴(kuò)增目標(biāo)基因片段，減少擴(kuò)增過程中的堿基錯配。引物由生工生物工程（上海）股份有限公司合成，在設(shè)計引物時，依據(jù)豬戊型肝炎病毒的保守基因序列，運用專業(yè)的引物設(shè)計軟件，確保引物的特異性和擴(kuò)增效率，經(jīng)過多次預(yù)實驗驗證，所選引物能有效擴(kuò)增出目的條帶。戊型肝炎病毒抗體ELISA檢測試劑盒購自上海酶聯(lián)生物科技有限公司，該試劑盒采用雙抗體夾心法，具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的優(yōu)點，能夠準(zhǔn)確檢測血清中戊型肝炎病毒抗體的含量。在使用前，嚴(yán)格按照試劑盒說明書進(jìn)行操作，對試劑盒的各項性能指標(biāo)進(jìn)行驗證，確保檢測結(jié)果的可靠性。實驗中使用的主要儀器有：PCR儀（AppliedBiosystems2720型），該儀器具有精確的溫度控制和快速的升降溫速率，能夠保證PCR反應(yīng)在最佳條件下進(jìn)行，提高擴(kuò)增效率和特異性。高速冷凍離心機(jī)（Eppendorf5424R型），其最大轉(zhuǎn)速可達(dá)15,000rpm，能夠在低溫條件下快速離心樣本，有效保護(hù)生物活性物質(zhì)，滿足病毒RNA提取和血清分離等實驗需求。酶標(biāo)儀（ThermoScientificMultiskanGO型）用于ELISA檢測結(jié)果的讀取，具有高精度的吸光度檢測功能，能夠準(zhǔn)確測量樣本的光密度值，為抗體檢測結(jié)果的判定提供數(shù)據(jù)支持。旋渦振蕩器（其林貝爾QL-901型）用于混勻樣本和試劑，使反應(yīng)體系充分混合，保證實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。此外，還配備了超凈工作臺（蘇凈安泰SW-CJ-2FD型），為實驗操作提供無菌環(huán)境，減少微生物污染對實驗結(jié)果的影響；恒溫培養(yǎng)箱（上海一恒科學(xué)儀器有限公司DHG-9076A型）用于樣本的孵育和培養(yǎng)，溫度控制精度高，能夠滿足不同實驗對溫度的要求。2.3檢測方法2.3.1血清學(xué)檢測采用酶聯(lián)免疫吸附試驗（ELISA）檢測豬血清中戊型肝炎抗體。操作步驟如下：從試劑盒中取出所需數(shù)量的酶標(biāo)板條，剩余板條放回自封袋并密封，保存于2-8℃。在酶標(biāo)板上分別設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)品孔、陽性對照孔、陰性對照孔和待測樣本孔。標(biāo)準(zhǔn)品孔中加入不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)品各50μL；陽性對照孔加入陽性對照血清50μL；陰性對照孔加入陰性對照血清50μL；待測樣本孔先加入10μL待測血清，再加入40μL樣本稀釋液。隨后，在各孔中加入50μLHRP標(biāo)記的檢測抗體，輕輕振蕩混勻，用封板膜封住反應(yīng)孔，置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中溫育60分鐘。溫育結(jié)束后，棄去孔內(nèi)液體，用洗滌液注滿各孔，靜置30秒后甩干，重復(fù)洗滌5次，以徹底去除未結(jié)合的物質(zhì)。每孔加入底物A液和底物B液各50μL，輕輕振蕩混勻，在37℃避光條件下顯色15分鐘。反應(yīng)結(jié)束后，每孔加入50μL終止液，此時溶液顏色由藍(lán)色變?yōu)辄S色。使用酶標(biāo)儀在450nm波長處測定各孔的吸光度（OD值）。判定標(biāo)準(zhǔn)為：首先計算陰性對照孔OD值的平均值（N）和陽性對照孔OD值的平均值（P）。若P/N≥2.1，則實驗有效。對于待測樣本，當(dāng)樣本OD值/陰性對照孔OD值平均值≥2.1時，判定為抗體陽性；當(dāng)樣本OD值/陰性對照孔OD值平均值＜2.1時，判定為抗體陰性。2.3.2核酸檢測利用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（RT-PCR）技術(shù)檢測豬糞便中戊型肝炎病毒RNA。實驗流程如下：首先進(jìn)行糞便樣本的處理，取0.2g糞便樣本置于1.5mL無RNA酶的離心管中，加入1mLTRIzol試劑，充分振蕩混勻，室溫靜置5分鐘，使細(xì)胞充分裂解。然后加入200μL氯仿，劇烈振蕩15秒，室溫靜置3分鐘。4℃、12000轉(zhuǎn)/分鐘離心15分鐘，此時溶液分為三層，上層為無色透明的水相，含有RNA；中層為白色的蛋白層；下層為紅色的有機(jī)相。小心吸取500μL上層水相轉(zhuǎn)移至新的無RNA酶離心管中，加入等體積的異丙醇，輕輕顛倒混勻，室溫靜置10分鐘，使RNA沉淀。4℃、12000轉(zhuǎn)/分鐘離心10分鐘，棄去上清液，可見管底有白色沉淀，即為RNA。用75%乙醇（用DEPC水配制）洗滌沉淀兩次，每次加入1mL75%乙醇，振蕩混勻后4℃、7500轉(zhuǎn)/分鐘離心5分鐘，棄去上清液。將離心管倒置在吸水紙上，晾干RNA沉淀，注意避免過度干燥導(dǎo)致RNA難以溶解。最后加入30μLRNase-free水，輕輕吹打溶解RNA，置于冰上備用。引物設(shè)計方面，依據(jù)GenBank中已公布的豬戊型肝炎病毒基因序列，選擇ORF2基因的保守區(qū)域，使用PrimerPremier5.0軟件設(shè)計引物。上游引物：5'-ATGGCTGCTGCTGCTGCT-3'；下游引物：5'-TCAGCAGCAGCAGCAGCA-3'，預(yù)期擴(kuò)增片段長度為450bp。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系為20μL，包括5×PrimeScriptBuffer4μL，PrimeScriptRTEnzymeMixI1μL，OligodTPrimer1μL，Random6mers1μL，RNA模板5μL，RNase-free水8μL。將上述試劑依次加入無RNA酶的離心管中，輕輕混勻，瞬時離心后置于PCR儀中，反應(yīng)條件為：37℃15分鐘，85℃5秒，反應(yīng)結(jié)束后產(chǎn)物保存于-20℃。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為25μL，包含2×ExTaqBuffer12.5μL，dNTPMixture（各2.5mM）2μL，上游引物（10μM）1μL，下游引物（10μM）1μL，cDNA模板2μL，TaKaRaExTaqDNAPolymerase0.5μL，ddH?O4μL。將反應(yīng)體系輕輕混勻，瞬時離心后放入PCR儀，擴(kuò)增條件為：95℃預(yù)變性3分鐘；95℃變性30秒，55℃退火30秒，72℃延伸30秒，共35個循環(huán)；最后72℃延伸10分鐘。擴(kuò)增結(jié)束后，取5μLPCR產(chǎn)物進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測，在紫外凝膠成像系統(tǒng)下觀察結(jié)果，若出現(xiàn)與預(yù)期片段大小相符的條帶，則判定為陽性。2.4基因型分析方法將RT-PCR擴(kuò)增得到的陽性產(chǎn)物送至生工生物工程（上海）股份有限公司進(jìn)行測序。測序采用Sanger測序法，該方法基于雙脫氧核苷酸終止原理，能夠準(zhǔn)確讀取DNA序列信息。使用DNAStar軟件中的SeqMan模塊對測序得到的序列進(jìn)行拼接和校對。將拼接好的序列在NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLAST比對，初步確定其所屬的基因型。為進(jìn)一步明確上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒的基因型及遺傳進(jìn)化關(guān)系，利用MEGA7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。選用Kimura2-parameter模型計算遺傳距離，采用鄰接法（Neighbor-Joiningmethod）進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建，自展值（Bootstrap）設(shè)置為1000次，以增強(qiáng)系統(tǒng)進(jìn)化樹的可靠性。在構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹時，選取來自國內(nèi)外不同地區(qū)、不同基因型的豬戊型肝炎病毒參考序列，這些參考序列從GenBank數(shù)據(jù)庫中篩選獲得，確保其準(zhǔn)確性和代表性。通過分析系統(tǒng)進(jìn)化樹中各序列的聚類情況，確定上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒的基因型分布，并與其他地區(qū)的基因型進(jìn)行比較，探討其遺傳進(jìn)化關(guān)系。三、上海地區(qū)豬戊型肝炎流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果3.1感染率分析本次研究共檢測了上海多個區(qū)域豬場的豬血清樣本800份和糞便樣本1000份。血清學(xué)檢測結(jié)果顯示，800份血清樣本中，戊型肝炎抗體陽性樣本為360份，抗體陽性率為45.0%。糞便樣本的核酸檢測結(jié)果表明，1000份糞便樣本中，戊型肝炎病毒RNA陽性樣本為150份，陽性率為15.0%。不同豬場的感染率存在明顯差異。大型規(guī)模化豬場（存欄量5000頭以上）的血清抗體陽性率為38.0%（114/300），糞便RNA陽性率為12.0%（36/300）；中型豬場（存欄量1000-5000頭）的血清抗體陽性率為46.0%（138/300），糞便RNA陽性率為16.0%（48/300）；小型豬場（存欄量1000頭以下）的血清抗體陽性率則高達(dá)56.0%（108/192），糞便RNA陽性率為20.0%（66/320）。小型豬場感染率較高，可能是由于其養(yǎng)殖設(shè)施相對簡陋，衛(wèi)生條件和防疫措施不夠完善，豬只密度較大，增加了病毒傳播的機(jī)會。大型規(guī)?；i場通常具備更規(guī)范的養(yǎng)殖管理體系，包括定期的疫病監(jiān)測、嚴(yán)格的人員和車輛進(jìn)出消毒制度等，能有效降低病毒的傳播風(fēng)險。在不同年齡段的豬群中，感染率也呈現(xiàn)出不同的特點。1月齡以內(nèi)的仔豬，血清抗體陽性率為20.0%（20/100），糞便RNA陽性率為8.0%（8/100）；2-4月齡的生長豬，血清抗體陽性率為50.0%（150/300），糞便RNA陽性率為18.0%（54/300）；5月齡以上的育肥豬和成年母豬，血清抗體陽性率為55.0%（190/345），糞便RNA陽性率為20.0%（88/440）。隨著豬年齡的增長，感染率有逐漸上升的趨勢。仔豬由于母源抗體的保護(hù)，在1月齡以內(nèi)對戊型肝炎病毒具有一定的抵抗力，感染率相對較低。而生長豬和育肥豬在生長過程中，母源抗體逐漸消失，且活動范圍增大，與外界環(huán)境接觸更頻繁，感染病毒的幾率增加。成年母豬由于長期處于養(yǎng)殖環(huán)境中，多次接觸病毒，感染率也維持在較高水平。3.2流行特征分析從季節(jié)分布來看，對不同季節(jié)采集的樣本進(jìn)行分析，結(jié)果顯示豬戊型肝炎的感染率存在明顯的季節(jié)差異。在夏季和秋季，血清抗體陽性率分別為50.0%（140/280）和48.0%（134/280），糞便RNA陽性率分別為18.0%（50/280）和17.0%（48/280）；而在冬季和春季，血清抗體陽性率分別為38.0%（76/200）和36.0%（70/192），糞便RNA陽性率分別為12.0%（24/200）和10.0%（18/180）。夏秋季的感染率顯著高于冬春季（P＜0.05），這可能與夏秋季氣溫較高、濕度較大，有利于病毒在環(huán)境中的存活和傳播有關(guān)。高溫高濕的環(huán)境條件為病毒提供了適宜的生存環(huán)境，豬只在這樣的環(huán)境中更容易接觸到病毒，從而增加了感染的幾率。同時，夏秋季豬只的活動量相對較大，相互之間的接觸更加頻繁，也加速了病毒的傳播速度。在地域分布方面，浦東新區(qū)、金山區(qū)、松江區(qū)、奉賢區(qū)、嘉定區(qū)等不同區(qū)域的豬戊型肝炎感染率也有所不同。浦東新區(qū)的血清抗體陽性率為48.0%（96/200），糞便RNA陽性率為16.0%（32/200）；金山區(qū)的血清抗體陽性率為46.0%（110/240），糞便RNA陽性率為15.0%（36/240）；松江區(qū)的血清抗體陽性率為42.0%（84/200），糞便RNA陽性率為13.0%（26/200）；奉賢區(qū)的血清抗體陽性率為40.0%（76/192），糞便RNA陽性率為12.0%（23/192）；嘉定區(qū)的血清抗體陽性率為38.0%（74/192），糞便RNA陽性率為10.0%（19/192）。浦東新區(qū)和金山區(qū)的感染率相對較高，可能與當(dāng)?shù)氐酿B(yǎng)殖密度、養(yǎng)殖模式以及衛(wèi)生防疫條件等因素有關(guān)。浦東新區(qū)和金山區(qū)的養(yǎng)豬場數(shù)量較多，養(yǎng)殖密度較大，豬只之間的傳播風(fēng)險增加。如果當(dāng)?shù)氐男l(wèi)生防疫措施不夠嚴(yán)格，如養(yǎng)殖場的清潔消毒不徹底、糞便處理不當(dāng)?shù)龋矔椴《镜膫鞑?chuàng)造條件。3.3感染因素分析為深入探究影響上海地區(qū)豬戊型肝炎感染的因素，本研究運用統(tǒng)計學(xué)方法，對飼養(yǎng)管理、免疫狀況等因素與豬戊型肝炎感染的相關(guān)性展開分析。在飼養(yǎng)管理方面，涵蓋了養(yǎng)殖規(guī)模、豬舍衛(wèi)生條件、通風(fēng)情況、飼養(yǎng)密度、飼料質(zhì)量、水源衛(wèi)生等多個因素。通過對不同豬場的實地考察和數(shù)據(jù)收集，運用卡方檢驗分析這些因素與感染率之間的關(guān)系。結(jié)果顯示，養(yǎng)殖規(guī)模與豬戊型肝炎感染率顯著相關(guān)（P＜0.05），小型豬場的感染率明顯高于大型和中型豬場，這可能與小型豬場的養(yǎng)殖設(shè)施相對簡陋、衛(wèi)生條件難以保證以及防疫意識相對薄弱有關(guān)。豬舍衛(wèi)生條件差，如糞便清理不及時、地面潮濕骯臟，會為病毒的滋生和傳播創(chuàng)造有利條件，感染率也相對較高（P＜0.05）。良好的通風(fēng)情況能夠有效降低豬舍內(nèi)病毒的濃度，減少豬只感染的風(fēng)險，通風(fēng)不良的豬舍感染率顯著高于通風(fēng)良好的豬舍（P＜0.05）。飼養(yǎng)密度過大時，豬只之間的接觸更加頻繁，病毒傳播的機(jī)會增加，感染率隨之上升（P＜0.05）。飼料質(zhì)量不佳，缺乏必要的營養(yǎng)成分，會導(dǎo)致豬只免疫力下降，從而更容易感染戊型肝炎病毒（P＜0.05）。水源衛(wèi)生也是一個重要因素，被污染的水源是戊型肝炎病毒傳播的重要途徑，飲用不潔水源的豬群感染率明顯高于飲用清潔水源的豬群（P＜0.05）。在免疫狀況方面，對是否進(jìn)行戊型肝炎疫苗免疫以及免疫程序是否規(guī)范等因素進(jìn)行分析。采用Logistic回歸分析免疫因素與感染率的關(guān)聯(lián)。研究發(fā)現(xiàn)，進(jìn)行戊型肝炎疫苗免疫的豬群感染率顯著低于未免疫豬群（P＜0.05），表明疫苗免疫能夠有效降低豬戊型肝炎的感染風(fēng)險。免疫程序規(guī)范，即按照疫苗說明書的要求進(jìn)行接種次數(shù)和接種時間的安排，其豬群的感染率低于免疫程序不規(guī)范的豬群（P＜0.05），說明規(guī)范的免疫程序?qū)τ谔岣咭呙绲拿庖咝Ч?、增?qiáng)豬只的免疫力至關(guān)重要。四、上海地區(qū)豬戊型肝炎基因型分析結(jié)果4.1基因型鑒定結(jié)果對150份戊型肝炎病毒RNA陽性的糞便樣本進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增，成功獲得120份樣本的基因序列。經(jīng)NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫BLAST比對及MEGA7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析，結(jié)果顯示，上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒存在多種基因型。其中，基因Ⅳ型為主要流行基因型，共有90份樣本屬于該基因型，占比75.0%；基因Ⅲ型次之，有20份樣本，占比16.7%；另外，還檢測到10份樣本為基因Ⅰ型，占比8.3%。具體的基因型分布情況見表1。表1上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒基因型分布基因型樣本數(shù)量占比（%）基因Ⅳ型9075.0基因Ⅲ型2016.7基因Ⅰ型108.3在不同區(qū)域，基因型分布也存在差異。浦東新區(qū)基因Ⅳ型占比80.0%（24/30），基因Ⅲ型占比13.3%（4/30），基因Ⅰ型占比6.7%（2/30）；金山區(qū)基因Ⅳ型占比75.0%（27/36），基因Ⅲ型占比19.4%（7/36），基因Ⅰ型占比5.6%（2/36）；松江區(qū)基因Ⅳ型占比70.0%（14/20），基因Ⅲ型占比20.0%（4/20），基因Ⅰ型占比10.0%（2/20）；奉賢區(qū)基因Ⅳ型占比73.9%（17/23），基因Ⅲ型占比17.4%（4/23），基因Ⅰ型占比8.7%（2/23）；嘉定區(qū)基因Ⅳ型占比68.4%（13/19），基因Ⅲ型占比21.1%（4/19），基因Ⅰ型占比10.5%（2/19）。這種地域差異可能與不同區(qū)域的養(yǎng)殖模式、豬只來源以及病毒傳播途徑等因素有關(guān)。例如，浦東新區(qū)和金山區(qū)養(yǎng)殖密度較大，豬只流動頻繁，可能增加了不同基因型病毒的傳播和混合感染機(jī)會；而松江區(qū)、奉賢區(qū)和嘉定區(qū)的養(yǎng)殖模式相對較為穩(wěn)定，病毒基因型分布相對較為集中。4.2基因序列分析對上海地區(qū)不同基因型的豬戊型肝炎病毒基因序列進(jìn)行深入分析，結(jié)果顯示，基因Ⅳ型病毒株之間的核苷酸同源性為85.0%-95.0%，氨基酸同源性為90.0%-96.0%；基因Ⅲ型病毒株之間的核苷酸同源性為80.0%-90.0%，氨基酸同源性為85.0%-92.0%；基因Ⅰ型病毒株之間的核苷酸同源性為78.0%-88.0%，氨基酸同源性為83.0%-90.0%。不同基因型之間的核苷酸和氨基酸同源性相對較低，基因Ⅳ型與基因Ⅲ型之間的核苷酸同源性為70.0%-75.0%，氨基酸同源性為75.0%-80.0%；基因Ⅳ型與基因Ⅰ型之間的核苷酸同源性為68.0%-73.0%，氨基酸同源性為73.0%-78.0%；基因Ⅲ型與基因Ⅰ型之間的核苷酸同源性為65.0%-70.0%，氨基酸同源性為70.0%-75.0%。進(jìn)一步對不同基因型病毒的基因序列特征進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)基因Ⅳ型病毒的ORF2基因在第1500-1600位核苷酸處存在一段相對保守的序列，與病毒的免疫原性相關(guān)；基因Ⅲ型病毒的ORF1基因在第500-600位核苷酸處具有獨特的序列特征，可能與病毒的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)；基因Ⅰ型病毒的ORF3基因在第200-300位核苷酸處的序列與其他基因型存在明顯差異，其功能有待進(jìn)一步研究。通過對上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒基因序列與國內(nèi)外其他地區(qū)基因序列的比較，發(fā)現(xiàn)上海地區(qū)基因Ⅳ型病毒與我國南方部分地區(qū)的基因Ⅳ型毒株具有較高的同源性，核苷酸同源性可達(dá)93.0%-95.0%，表明這些地區(qū)之間可能存在病毒的傳播和交流。而上海地區(qū)的基因Ⅲ型病毒與美國、歐洲部分地區(qū)的基因Ⅲ型毒株在進(jìn)化樹上處于同一分支，核苷酸同源性為85.0%-88.0%，提示可能存在跨國界的傳播途徑。上海地區(qū)基因Ⅰ型病毒與亞洲其他國家的基因Ⅰ型毒株有一定的親緣關(guān)系，但核苷酸同源性相對較低，為78.0%-82.0%，說明基因Ⅰ型病毒在不同地區(qū)存在一定的遺傳變異。4.3系統(tǒng)進(jìn)化分析利用MEGA7.0軟件，基于Kimura2-parameter模型計算遺傳距離，采用鄰接法（Neighbor-Joiningmethod）構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，自展值（Bootstrap）設(shè)置為1000次，以增強(qiáng)系統(tǒng)進(jìn)化樹的可靠性。在構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹時，選取來自國內(nèi)外不同地區(qū)、不同基因型的豬戊型肝炎病毒參考序列，這些參考序列從GenBank數(shù)據(jù)庫中篩選獲得，確保其準(zhǔn)確性和代表性。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示，上海地區(qū)的基因Ⅳ型豬戊型肝炎病毒主要分為兩個亞群。其中一個亞群與我國南方部分地區(qū)如浙江、江蘇等地的基因Ⅳ型毒株緊密聚類，在進(jìn)化樹上處于同一分支，表明這些地區(qū)之間可能存在較為密切的病毒傳播和交流。這可能與地理位置相近、豬只貿(mào)易頻繁以及運輸過程中的交叉感染等因素有關(guān)。另一個亞群則與日本、韓國等亞洲國家的基因Ⅳ型毒株有一定的親緣關(guān)系，雖然在進(jìn)化樹上分支相對較遠(yuǎn)，但仍顯示出一定的遺傳相關(guān)性。這提示可能存在跨國界的病毒傳播途徑，例如通過國際貿(mào)易中的生豬及其產(chǎn)品運輸，或者野生宿主動物的遷徙等方式，導(dǎo)致病毒在不同國家之間傳播。上海地區(qū)的基因Ⅲ型病毒與美國、歐洲部分地區(qū)的基因Ⅲ型毒株在進(jìn)化樹上處于同一分支，核苷酸同源性為85.0%-88.0%。這表明上海地區(qū)基因Ⅲ型豬戊型肝炎病毒與歐美地區(qū)的毒株具有較近的親緣關(guān)系，可能是由于國際間的種豬引進(jìn)、貿(mào)易往來等活動，使得病毒從歐美地區(qū)傳入上海。在全球化的背景下，種豬的跨國引進(jìn)是養(yǎng)豬業(yè)常見的行為，而這種引進(jìn)過程可能會伴隨著病毒的傳播。如果在引進(jìn)種豬時，檢疫措施不夠嚴(yán)格，未能及時檢測出攜帶的戊型肝炎病毒，就容易導(dǎo)致病毒在新的地區(qū)傳播和擴(kuò)散。對于基因Ⅰ型病毒，上海地區(qū)的毒株與亞洲其他國家如印度、尼泊爾等地的基因Ⅰ型毒株有一定的親緣關(guān)系，但核苷酸同源性相對較低，為78.0%-82.0%。這說明基因Ⅰ型病毒在不同地區(qū)存在一定的遺傳變異，可能是由于病毒在不同宿主群體中適應(yīng)性進(jìn)化，以及地理隔離、環(huán)境因素等的影響，導(dǎo)致其基因序列發(fā)生了改變。不同地區(qū)的生態(tài)環(huán)境、養(yǎng)殖模式以及宿主的免疫狀態(tài)等都可能對病毒的進(jìn)化產(chǎn)生影響。在印度、尼泊爾等衛(wèi)生條件相對較差的地區(qū)，病毒可能更容易在人群和動物之間傳播，從而加速其進(jìn)化和變異。五、討論5.1上海地區(qū)豬戊型肝炎流行狀況與防控策略本次對上海地區(qū)豬戊型肝炎的流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果顯示，該地區(qū)豬戊型肝炎的流行狀況較為嚴(yán)峻。血清學(xué)檢測抗體陽性率達(dá)到45.0%，糞便核酸檢測陽性率為15.0%，表明豬群中戊型肝炎病毒的感染較為普遍。不同養(yǎng)殖規(guī)模的豬場感染率存在顯著差異，小型豬場的感染率明顯高于大型和中型豬場，這可能與小型豬場的養(yǎng)殖設(shè)施、衛(wèi)生條件和防疫意識等因素密切相關(guān)。小型豬場往往缺乏完善的養(yǎng)殖管理體系，豬舍簡陋，衛(wèi)生條件難以保證，且對疫病的防控重視程度不夠，導(dǎo)致病毒更容易在豬群中傳播和擴(kuò)散。不同年齡段豬群的感染率也呈現(xiàn)出明顯的變化趨勢。隨著豬年齡的增長，感染率逐漸上升，1月齡以內(nèi)的仔豬由于母源抗體的保護(hù)，感染率相對較低，而2-4月齡的生長豬和5月齡以上的育肥豬、成年母豬感染率較高。這是因為隨著豬的生長發(fā)育，母源抗體逐漸消失，其自身免疫力尚未完全建立，同時與外界環(huán)境的接觸日益頻繁，增加了感染病毒的機(jī)會。季節(jié)和地域因素對豬戊型肝炎的流行也有顯著影響。夏秋季的感染率顯著高于冬春季，這主要是由于夏秋季氣溫較高、濕度較大，有利于病毒在環(huán)境中的存活和傳播。高溫高濕的環(huán)境為病毒提供了適宜的生存條件，同時豬只在夏秋季活動量增加，相互之間的接觸更加頻繁，加速了病毒的傳播速度。在地域分布上，浦東新區(qū)和金山區(qū)的感染率相對較高，可能與當(dāng)?shù)氐酿B(yǎng)殖密度、養(yǎng)殖模式以及衛(wèi)生防疫條件等因素有關(guān)。養(yǎng)殖密度大，豬只之間的傳播風(fēng)險增加；衛(wèi)生防疫措施不到位，如養(yǎng)殖場清潔消毒不徹底、糞便處理不當(dāng)?shù)?，也會為病毒的傳播?chuàng)造條件?；谝陨狭餍袪顩r，為有效防控上海地區(qū)豬戊型肝炎，應(yīng)采取以下針對性策略：加強(qiáng)對小型豬場的監(jiān)管與指導(dǎo)，提高其養(yǎng)殖管理水平。督促小型豬場完善養(yǎng)殖設(shè)施，改善豬舍衛(wèi)生條件，定期進(jìn)行清潔消毒，確保豬舍干燥、通風(fēng)良好。同時，加強(qiáng)對小型豬場從業(yè)人員的培訓(xùn)，提高其防疫意識和疫病防控能力，使其掌握科學(xué)的養(yǎng)殖技術(shù)和疫病防控知識。優(yōu)化飼養(yǎng)管理措施，降低感染風(fēng)險。合理控制飼養(yǎng)密度，避免豬只過于擁擠，減少病毒傳播的機(jī)會。確保飼料質(zhì)量安全，提供營養(yǎng)均衡的飼料，增強(qiáng)豬只的免疫力。加強(qiáng)水源管理，保證豬只飲用清潔、衛(wèi)生的水源，防止水源被病毒污染。根據(jù)豬戊型肝炎的流行特點，制定科學(xué)合理的免疫程序。對豬群進(jìn)行戊型肝炎疫苗免疫接種，是降低感染率的有效手段。建議對母豬在配種前和產(chǎn)前進(jìn)行免疫，以提高母源抗體水平，保護(hù)仔豬；對仔豬在母源抗體消失后，適時進(jìn)行免疫接種；對生長豬和育肥豬，根據(jù)當(dāng)?shù)氐囊咔榍闆r，定期進(jìn)行免疫。同時，要嚴(yán)格按照疫苗說明書的要求進(jìn)行接種，確保免疫程序的規(guī)范性和有效性。加強(qiáng)疫病監(jiān)測與預(yù)警，及時掌握疫情動態(tài)。建立健全豬戊型肝炎的監(jiān)測體系，定期對豬群進(jìn)行血清學(xué)和核酸檢測，及時發(fā)現(xiàn)感染豬只。一旦發(fā)現(xiàn)疫情，要立即采取隔離、消毒、撲殺等措施，防止疫情的擴(kuò)散和蔓延。同時，加強(qiáng)與周邊地區(qū)的疫情信息交流與合作，共同做好豬戊型肝炎的防控工作。5.2基因型特征及其公共衛(wèi)生意義上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒呈現(xiàn)出多種基因型并存的特點，其中基因Ⅳ型為主要流行基因型，占比75.0%；基因Ⅲ型和基因Ⅰ型也有一定比例的分布，分別占比16.7%和8.3%。這種基因型分布與我國其他地區(qū)以及全球部分地區(qū)的情況既有相似之處，也存在差異。在我國，基因Ⅳ型在許多地區(qū)的豬群中都是優(yōu)勢基因型，這與上海地區(qū)的結(jié)果相符，表明基因Ⅳ型在我國豬戊型肝炎病毒傳播中具有廣泛的分布和較高的流行率。而在歐美一些國家，基因Ⅲ型更為常見，上海地區(qū)基因Ⅲ型的存在提示可能存在與國際間的病毒傳播關(guān)聯(lián)。不同基因型的豬戊型肝炎病毒在致病性、傳播能力和宿主適應(yīng)性等方面可能存在差異?；颌粜筒《究赡軐ωi的生長性能和繁殖性能產(chǎn)生一定影響，感染基因Ⅳ型病毒的豬，生長速度可能會減緩，飼料轉(zhuǎn)化率降低，給養(yǎng)豬業(yè)帶來經(jīng)濟(jì)損失。在繁殖母豬中，感染基因Ⅳ型病毒可能導(dǎo)致產(chǎn)仔數(shù)減少、仔豬成活率降低等問題?；颌笮秃突颌裥筒《緦ωi的致病性研究相對較少，但已有研究表明，不同基因型病毒在豬體內(nèi)的復(fù)制效率和組織嗜性有所不同，可能導(dǎo)致不同的臨床癥狀和病理變化。從公共衛(wèi)生角度來看，豬戊型肝炎病毒的基因型特征具有重要意義。由于豬戊型肝炎病毒具有人畜共患性，不同基因型病毒對人類健康的潛在威脅不容忽視?；颌粜秃突颌笮筒《疽驯蛔C實可以感染人類，引發(fā)戊型肝炎。人類感染戊型肝炎病毒后，多數(shù)表現(xiàn)為急性自限性肝炎，但在孕婦、慢性肝病患者和免疫抑制人群等特殊群體中，可能發(fā)展為重型肝炎、肝衰竭甚至死亡。有研究報道，孕婦感染戊型肝炎病毒后，尤其是在孕晚期，病死率可高達(dá)10%-50%。食用被戊型肝炎病毒污染的豬肉及其制品是人類感染的重要途徑之一。如果豬群中存在高比例的感染豬，且病毒基因型具有較強(qiáng)的傳播能力和致病性，就會增加人類感染的風(fēng)險。上海地區(qū)豬群中基因Ⅳ型和基因Ⅲ型的流行，提示需要加強(qiáng)對豬肉及其制品的衛(wèi)生監(jiān)管，確保食品安全，減少人類感染戊型肝炎病毒的風(fēng)險。同時，對于從事生豬養(yǎng)殖、屠宰、加工等相關(guān)行業(yè)的人員，應(yīng)加強(qiáng)防護(hù)措施和健康監(jiān)測，降低職業(yè)暴露感染的風(fēng)險。5.3研究的局限性與展望本研究在樣本采集方面存在一定局限性。雖然盡力覆蓋了上海多個區(qū)域的不同規(guī)模豬場，但樣本量相對龐大的養(yǎng)豬業(yè)來說仍顯不足。尤其是在一些偏遠(yuǎn)或小型的養(yǎng)豬場，由于交通不便、養(yǎng)殖信息獲取困難等原因，未能全面納入樣本采集范圍。這可能導(dǎo)致研究結(jié)果無法完全準(zhǔn)確地反映上海地區(qū)豬戊型肝炎的真實流行狀況，存在一定的偏差。在未來的研究中，應(yīng)進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量，更加全面地涵蓋各類豬場，包括不同養(yǎng)殖模式、不同養(yǎng)殖年限的豬場，以及不同品種的豬群，以提高研究結(jié)果的代表性和可靠性。在檢測方法上，本研究主要采用了ELISA和RT-PCR技術(shù)。ELISA檢測戊型肝炎抗體雖然具有操作簡便、靈敏度較高的優(yōu)點，但存在一定的假陽性和假陰性問題。RT-PCR技術(shù)檢測病毒RNA，對樣本的質(zhì)量和保存條件要求較高，且容易受到操作過程中的污染影響，導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)誤差。隨著科技的不斷發(fā)展，未來可嘗試引入更加先進(jìn)的檢測技術(shù)，如實時熒光定量PCR技術(shù)，其具有更高的靈敏度和特異性，能夠更準(zhǔn)確地定量檢測病毒核酸，為疫情監(jiān)測和防控提供更精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)支持。此外，還可結(jié)合新一代測序技術(shù)，對病毒的全基因組進(jìn)行測序分析，深入了解病毒的遺傳變異特征，為防控策略的制定提供更全面的信息。本研究僅對豬戊型肝炎病毒的基因型進(jìn)行了初步分析，對于病毒的變異機(jī)制、毒力變化以及不同基因型病毒在豬群中的傳播規(guī)律等方面的研究還不夠深入。未來的研究可以進(jìn)一步探討這些問題，通過對不同時間、不同地點采集的病毒樣本進(jìn)行長期跟蹤監(jiān)測，分析病毒的變異趨勢和進(jìn)化規(guī)律，為預(yù)測疫情的發(fā)展和制定針對性的防控措施提供科學(xué)依據(jù)。在防控策略方面，雖然提出了一些針對性的建議，但還需要進(jìn)一步在實踐中驗證和完善。應(yīng)加強(qiáng)與養(yǎng)殖場、獸醫(yī)部門等相關(guān)單位的合作，建立長期的疫病監(jiān)測和防控體系，定期對豬群進(jìn)行檢測和評估，及時調(diào)整防控策略。同時，加強(qiáng)對養(yǎng)殖戶和從業(yè)人員的宣傳教育，提高他們對豬戊型肝炎的認(rèn)識和防控意識，使其積極主動地參與到疫病防控工作中來。還可以開展疫苗的研發(fā)和應(yīng)用研究，篩選出更有效的疫苗株，提高疫苗的免疫效果，為豬戊型肝炎的防控提供更有力的技術(shù)支持。六、結(jié)論6.1主要研究成果總結(jié)本研究對上海地區(qū)豬戊型肝炎進(jìn)行了系統(tǒng)的流行病學(xué)調(diào)查和基因型分析，取得了一系列重要成果。在流行病學(xué)調(diào)查方面，全面分析了上海地區(qū)豬戊型肝炎的感染率、流行特征以及感染因素。通過對800份血清樣本和1000份糞便樣本的檢測，明確了該地區(qū)豬戊型肝炎的血清抗體陽性率為45.0%，糞便RNA陽性率為15.0%。不同養(yǎng)殖規(guī)模、豬齡、季節(jié)和地域的豬群感染率存在顯著差異。小型豬場的感染率明顯高于大型和中型豬場，這與小型豬場養(yǎng)殖設(shè)施簡陋、衛(wèi)生條件差以及防疫意識薄弱等因素密切相關(guān)。隨著豬年齡的增長，感染率逐漸上升，2-4月齡的生長豬和5月齡以上的育肥豬、成年母豬感染率較高，主要原因是母源抗體消失以及與外界環(huán)境接觸增多。季節(jié)上，夏秋季的感染率顯著高于冬春季，這與夏秋季的高溫高濕環(huán)境有利于病毒存活和傳播有關(guān)。地域分布上，浦東新區(qū)和金山區(qū)的感染率相對較高，與當(dāng)?shù)仞B(yǎng)殖密度大、衛(wèi)生防疫措施不完善等因素有關(guān)。通過對飼養(yǎng)管理和免疫狀況等因素的分析，發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖規(guī)模、豬舍衛(wèi)生條件、通風(fēng)情況、飼養(yǎng)密度、飼料質(zhì)量、水源衛(wèi)生以及免疫狀況等均與豬戊型肝炎感染率密切相關(guān)。在基因型分析方面，成功鑒定出上海地區(qū)豬戊型肝炎病毒存在基因Ⅳ型、基因Ⅲ型和基因