中科大現(xiàn)代環(huán)境生物技術(shù)課件第3章 基因工程_第1頁(yè)
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第三章基因工程

教學(xué)重點(diǎn)、難點(diǎn)、學(xué)時(shí)一、概述二、基因三、酶四、載體五、基因重組1、要點(diǎn)基因工程的分子生物學(xué)基礎(chǔ)、基因工程工具酶、基因工程載體、目的基因的獲得、目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞、重組體的篩選、DNA序列分析、基因工程在環(huán)境污染治理中的應(yīng)用2、重點(diǎn)基因工程的分子生物學(xué)、目的基因的獲得、基因工程工具酶、基因工程載體、目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞、重組體的篩選3、學(xué)時(shí)5學(xué)時(shí)教學(xué)要點(diǎn)、重點(diǎn)、學(xué)時(shí)一、概述(一)基因組的相關(guān)名詞1、DNA:遺傳物質(zhì)脫氧核糖核酸的簡(jiǎn)稱。每個(gè)DNA分子都包含螺旋結(jié)構(gòu)的雙股鏈。2、基因:DNA上有遺傳意義的片段叫基因,基因包含一定數(shù)量的堿基?;蚴腔A(chǔ)的遺傳單位,它們決定一個(gè)人眼睛的顏色、耳朵的大小、腦容量等所有人的生理特征和一些行為特征。更重要的是,基因與許多疾病有關(guān)。一、概述3、測(cè)序:確定DNA雙股鏈上每個(gè)獨(dú)立結(jié)構(gòu)單元或堿基的確切順序的過(guò)程。測(cè)序經(jīng)常被稱為“破譯”,因?yàn)槠浣Y(jié)果就像解碼一樣。解碼結(jié)果包含數(shù)百頁(yè)和成千上萬(wàn)行4種字母的序列,這些字母表示4種不同的堿基,它們是腺嘌呤、鳥(niǎo)嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶,分別用它們的首字母A、T、C、G表示,其排列順序中蘊(yùn)藏著各種各樣的遺傳信息和生命指令。4、基因診斷:也叫DNA診斷、分子診斷,是通過(guò)從患者體內(nèi)提取樣本用基因檢測(cè)方法來(lái)判斷患者是否有基因異?;驍y帶病原微生物。目前,基因診斷檢測(cè)的疾病主要有三大類:感染性疾病的病原診斷、各種腫瘤的生物學(xué)特性的判斷、遺傳病的基因異常分析。一、概述5、DNA芯片,又稱基因芯片(genechip),實(shí)質(zhì)上是一種高密度的寡聚核苷酸(DNA探針)陣列。它采用在位組合合成化學(xué)和微電子芯片的光刻技術(shù),或者利用其他方法將大量特定系列的DNA片段(探針)有序地固化在玻璃或磋襯底上,從而構(gòu)成儲(chǔ)存有大量生命信息的DNA芯片。6、所謂轉(zhuǎn)基因技術(shù)就是把外源基因整合到動(dòng)植物基因組中去。下面分別對(duì)轉(zhuǎn)基因動(dòng)物和轉(zhuǎn)基因植物來(lái)進(jìn)行描述。一、概述7、基因突變是指由于DNA堿基對(duì)的置換、增添或缺失而引起的基因結(jié)構(gòu)的變化,亦稱點(diǎn)突變。8、人類基因組(HumanGenome):是建立人體所需的化學(xué)密碼或藍(lán)圖,而這幅藍(lán)圖的基本組成是DNA。DNA是一條由磷酸鹽和糖組成的分子鏈,呈雙螺旋形,即兩條互相纏繞的螺旋形分子帶,中間以稱為堿基的橫條緊扣。除了孿生子女外,每個(gè)人的DNA都是獨(dú)一無(wú)二的。一、概述9、染色體(Chromosome):人體每個(gè)細(xì)胞內(nèi)皆有23對(duì)染色體,它們位于細(xì)胞的核心,當(dāng)中染色體XY是決定性別的。一個(gè)人體內(nèi)所有細(xì)胞的染色體的長(zhǎng)度加起來(lái),足足有1600億公里長(zhǎng)。10、克隆是英文clone的音譯,簡(jiǎn)單講就是一種人工誘導(dǎo)的無(wú)性繁殖方式。

一、概述(二)基因工程1、定義:將外源基因體外重組后導(dǎo)入受體細(xì)胞內(nèi),使這個(gè)基因能在受體細(xì)胞內(nèi)復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯表達(dá)的操作。2、理論和技術(shù)支撐(1)理論:40年代發(fā)現(xiàn)了生物的遺傳物質(zhì)是DNA、50年代弄清了DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)、60年代確定了遺傳信息的傳遞方式。一、概述(2)技術(shù):工具酶、載體、逆轉(zhuǎn)錄酶2、基因工程實(shí)施至少四個(gè)必要條件:工具酶、基因、載體、受體細(xì)胞3、基因工程的內(nèi)容4、遺傳工程、基因工程、DNA重組技術(shù)的區(qū)別5、基因工程操作的基本技術(shù)一、概述二、基因(一)結(jié)構(gòu)與功能(二)DNA的變性、復(fù)性與雜交(三)中心法則(一)結(jié)構(gòu)與功能1、DNA的組成堿基、脫氧核糖、磷酸基二、基因(一)結(jié)構(gòu)與功能2、DNA的結(jié)構(gòu)核心是堿基配對(duì)(A=T,G=C)1)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型:

a.兩鏈平行反向且右旋,也發(fā)現(xiàn)了三股DNA和左旋Z-DNAb.以堿基配對(duì)c.每周含10個(gè)堿基對(duì),現(xiàn)發(fā)現(xiàn)堿基對(duì)也可變,A-DNAd.磷酸-核糖主鏈在外側(cè),堿基以平面在內(nèi)側(cè)且與主鏈垂直e.超螺旋結(jié)構(gòu)普遍存在二、基因NucleotideGenes2)理論意義a.細(xì)胞減數(shù)分裂和有性生殖b.個(gè)體發(fā)育c.遺傳與變異d.性狀控制二、基因(一)結(jié)構(gòu)與功能3.DNA的復(fù)制1)在復(fù)制起始點(diǎn)形成復(fù)制起始叉;2)半保留復(fù)制;3)具有高度忠實(shí)性;4)需要多種酶4、DNA作為遺傳物質(zhì)的優(yōu)點(diǎn)1)信息量大,可以微縮;2)表面互補(bǔ),電荷互補(bǔ);3)在水溶液中穩(wěn)定性好4)可突變,能求進(jìn)化5)有T無(wú)U,基因組得以增大,不會(huì)帶來(lái)潛在危險(xiǎn)注:RNA擬酶?RNA蛋白質(zhì)?DNA世界二、基因(一)結(jié)構(gòu)與功能DNAReplication

變性(熔解)-在加熱或某些試劑的作用下,DNA配對(duì)堿基之間的氫鍵結(jié)構(gòu)受到破壞,雙鏈DNA多核苷酸鏈能完全分離,此分離過(guò)程稱為變性。

復(fù)性-變性DNA在一定條件下能恢復(fù)其雙是螺旋結(jié)構(gòu)的過(guò)程。二、基因(二)DNA的變性、復(fù)性與雜交1、變性1)變性表象a粘度降低b沉速加快c紫外吸收值增大2)影響因素aDNA本身穩(wěn)定性b外部條件3)變性研究

Tm二、基因(二)DNA的變性、復(fù)性與雜交2、復(fù)性1)影響因素aDNA分子的大小和順序復(fù)雜性b樣品的濃度c溶液的離子強(qiáng)度

d溫度2)復(fù)性條件a鹽濃度要高b溫度要高得適當(dāng)3)復(fù)性動(dòng)力學(xué)滿足二級(jí)動(dòng)力學(xué)

注:復(fù)雜度-DNA中最長(zhǎng)的沒(méi)有重復(fù)序列的核苷酸對(duì)的個(gè)數(shù)值。二、基因(二)DNA的變性、復(fù)性與雜交3、雜交當(dāng)復(fù)性的DNA分子由不同的兩單鏈分子形成時(shí),稱為雜交。復(fù)性是分子雜交的理論基礎(chǔ)。二、基因(二)DNA的變性、復(fù)性與雜交轉(zhuǎn)錄-利用DNA為模板合成RNA的過(guò)程。翻譯-以RNA為模板合成蛋白質(zhì)的過(guò)程。1、RNA的轉(zhuǎn)錄

1)RNA聚合酶結(jié)合于DNA分子上的特定位置;

2)使DNA雙鏈解旋,起始RNA合成;

3)RNA鏈的延伸;

4)RNA合成的終止和釋放。二、基因(三)中心法則2、逆轉(zhuǎn)錄和逆轉(zhuǎn)錄酶

逆轉(zhuǎn)錄-以RNA為模板在逆轉(zhuǎn)錄酶催化下合成DNA的過(guò)程。

逆轉(zhuǎn)錄酶-是一種依賴于RNA的DNA聚合酶。

意義:逆轉(zhuǎn)錄和逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)使我們可以用真核mRNA為模板,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄而獲得為特定蛋白質(zhì)編碼的基因。3、翻譯-蛋白質(zhì)的生物合成二、基因(三)中心法則RNARibonucleicAcidRNARibonucleicAcid-AMoreDetailedDescriptionmRNA依照DNA上面的核甘酸序列,可翻譯成蛋白質(zhì)的氨基酸序列,這是如何做到的?

(1)DNA的序列可以A=U及C=G的互補(bǔ)關(guān)系,轉(zhuǎn)成messengerRNA。

(2)mRNA與核糖體結(jié)合,準(zhǔn)備開(kāi)始進(jìn)行轉(zhuǎn)譯蛋白質(zhì)。

(3)mRNA序列以三個(gè)為一組,稱為“遺傳密碼”,每組密碼可對(duì)應(yīng)一種氨基酸。

(4)由RNA譯成胺基酸序列時(shí),需要有“翻譯者”,此翻譯者即為

tRNA。

(5)每個(gè)

tRNA可說(shuō)是一種介面,一邊認(rèn)得特定的

RNA密碼,一邊攜帶對(duì)應(yīng)的氨基酸。

(6)當(dāng)

tRNA

一邊認(rèn)出其特定密碼,一邊可把所攜帶的氨基酸接上連成蛋白質(zhì)。三、酶(一)限制性內(nèi)切酶(二)連接酶(三)修飾酶四、載體

(一)定義、分類、要求

(二)載體因宿主而不同1、原核2、真核3、植物4、動(dòng)物(一)定義、分類、要求1、定義

能承載外源DNA片段(基因)并帶入受體細(xì)胞的傳遞者。2、分類克隆載體、穿梭載體、表達(dá)載體3、要求(1)自主復(fù)制能力(2)可利用的限制酶切點(diǎn)(二)載體因宿主而不同1、原核(1)質(zhì)粒載體:能裝載10kb左右的DNA片段質(zhì)粒:是能自主復(fù)制的雙鏈環(huán)狀DNA分子,它們?cè)诩?xì)菌中以獨(dú)立于染色體之外的方式存在,一個(gè)質(zhì)粒就是一個(gè)DNA分子,1kb--200kb。a、pBR322(p100)b、pUC18/19(p101)顏色反應(yīng):帶有沒(méi)有插入DNA片段的Puc18/19質(zhì)柆的菌落呈藍(lán)色;插入有目的DNA片段,那么就會(huì)破壞lacZ’的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致細(xì)菌無(wú)法產(chǎn)生功能性的lacZ蛋白,也就無(wú)法形成雜合β-半乳糖苷酶,因而菌落是白色的。(2)噬菌體載體:能裝載24kb左右的外源DNA(p102)

噬菌體內(nèi)含雙鏈環(huán)形、單鏈環(huán)形、雙鏈線形、單鏈線形等多種形式、大小不一的DNA,且感染率高。(二)載體因宿主而不同(3)人工載體:大多具有大腸桿菌質(zhì)粒的抗藥性和噬菌體強(qiáng)感染力,同時(shí)滿足攜帶真核生物的目的基因大片段DNA。

柯斯質(zhì)粒:又稱質(zhì)粒載體,是將質(zhì)粒與λ

噬菌體DNA包裝有關(guān)的區(qū)段(cos序列)相結(jié)合構(gòu)建而成的克隆載體。能裝載35kb—45kb的外源DNA。(p103)(二)載體因宿主而不同2、真核穿梭載體:既可在原核中復(fù)制擴(kuò)增,也可在真核中擴(kuò)增、表達(dá)。具備p104的五個(gè)條件。(1)酵母質(zhì)粒(2)人工染色體載體:整合質(zhì)粒(YIP)、復(fù)制型載體(穿梭載體)YRP、附加體型載體(YEP)a、YACb、BACC、PACsd、MAC(二)載體因宿主而不同3、植物(1)Ti質(zhì)粒(2)植物DNA病毒(很少應(yīng)用)(3)植物轉(zhuǎn)座子(很有前景)4、動(dòng)物(1)取代型(2)病毒-質(zhì)粒重組型(二)載體因宿主而不同InsertingaDNASampleintoaPlasmidCloningintoaPlasmidTransferandCloningoftheInsulinGeneCloningintoaYeastArtificialChromosome(YAC)五、基因重組(一)目的基因的獲得1、基因的組成:結(jié)構(gòu)基因、調(diào)節(jié)基因、操縱基因2、目的基因的獲得(1)原核:基因文庫(kù)(2)真核:cDNA、DNA的化學(xué)合成、PCR

(二)目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞1、受體細(xì)胞及分類(1)定義:也稱宿主細(xì)胸或表達(dá)系統(tǒng),主目的基因的表達(dá),名手為復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、翻譯、后加工、分泌等提供條件。五、基因重組(2)受體細(xì)胞選擇的原則(p118)(3)分類:微生物表達(dá)系統(tǒng)、植物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)、動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)(4)注意區(qū)分幾個(gè)概念a融合系統(tǒng)與融合蛋白b瞬時(shí)表達(dá)系統(tǒng)與穩(wěn)定表達(dá)系統(tǒng)c導(dǎo)入方法:高等動(dòng)植物---顯微注射、電穿孔原核細(xì)胞---轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)化轉(zhuǎn)化:是指某一基因型的細(xì)胞從周圍介質(zhì)中吸收來(lái)自另一基因型細(xì)胞的DNA而使它的基因型和表型發(fā)生相應(yīng)變化的現(xiàn)象。轉(zhuǎn)導(dǎo):是由病毒介導(dǎo)的細(xì)胞間進(jìn)行遺傳交換的一種方式,即一個(gè)細(xì)胞的DNA或RNA通過(guò)病毒載體的感染轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞中。

2、導(dǎo)入過(guò)程(1)目的基因?qū)肟寺≥d體:強(qiáng)啟動(dòng)子、便于連接、因細(xì)胞不同選用合適的載體五、基因重組(2)重組DNA分子導(dǎo)入受體細(xì)胞:共有9種方法轉(zhuǎn)化、高壓電穿孔法、多聚物介導(dǎo)法、磷酸鈣或DEAE-葡聚糖介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染法、原生質(zhì)體融合法、脂質(zhì)體介導(dǎo)法、顯微注射法、粒子轟擊法、激光微束穿孔法(三)重組體的篩選1、物理方法:如電泳2、生物學(xué)方法(1)遺傳學(xué)方法:利用抗生素抗性基因、營(yíng)養(yǎng)缺陷互補(bǔ)法(2)免疫學(xué)方法(western、eastern)(3)利用噬菌斑篩選3、核酸雜交基本原理:(探針-prob)(1)原位雜交(2)southern(3)northern(四)DNA序列分析1、Maxam-Gilbert

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