ICS07100

CCSC.01

團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)

T/CPMA010—2020

基于高通量測(cè)序的病原體篩查通用準(zhǔn)則

Generalcriteriaforpathogenscreeningbasedonhigh-throughputsequencing

2020-07-01發(fā)布2020-10-01實(shí)施

中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)發(fā)布

T/CMPA010—2020

目次

前言

…………………………Ⅲ

范圍

1………………………1

規(guī)范性引用文件

2…………………………1

術(shù)語和定義

3………………1

試驗(yàn)方法

4…………………2

技術(shù)指標(biāo)

5…………………3

附錄規(guī)范性附錄實(shí)驗(yàn)室功能分區(qū)

A()…………………6

Ⅰ

T/CMPA010—2020

前言

本標(biāo)準(zhǔn)按照給出的規(guī)則起草

GB/T1.1—2009。

本標(biāo)準(zhǔn)由中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)歸口

。

本標(biāo)準(zhǔn)起草單位中國(guó)疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所北京化工大學(xué)和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原

:、

生物學(xué)研究所

。

本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人張?chǎng)┩O剛?cè)嘻慃愴n娜肖艷安小平王媛媛

:、、、、、、。

Ⅲ

T/CMPA010—2020

基于高通量測(cè)序的病原體篩查通用準(zhǔn)則

1范圍

本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了呼吸道樣本鼻咽拭子鼻咽吸取物痰液肺泡灌洗液等消化道樣本糞便肛拭

(/、、、)、(、

子等活檢組織生物體液樣本腦脊液血液胸腹水等蟲媒樣本環(huán)境樣本等類型樣本的病原體高

)、、(、、)、、

通量測(cè)序篩查通用準(zhǔn)則

。

本標(biāo)準(zhǔn)適用于開展基于高通量測(cè)序的病原體篩查的實(shí)驗(yàn)室

。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件

。,()。

病原微生物實(shí)驗(yàn)室生物安全通用準(zhǔn)則

WS233—2017

3術(shù)語和定義

下列術(shù)語和定義適用于本文件

。

31

.

文庫library

由兩端連有已有的特定序列中間為未知序列的核酸片段組成的核酸分子的集合

,。

32

.

高通量測(cè)序high-throughputsequencing

以一次并行幾十萬到幾十億條甚至更多核酸分子序列測(cè)定為標(biāo)志適用于或的測(cè)序

,DNARNA

技術(shù)

。

33

.

病原體pathogens

致人類或動(dòng)植物感染性疾病的生物總稱包括細(xì)菌病毒寄生蟲真菌等微生物或其他生物體

,、、、。

34

.

篩查screening

通過某種方法手段對(duì)導(dǎo)致人群疾病的可能的因素進(jìn)行查找

。

35

.

核酸序列數(shù)據(jù)庫nucleotidedatabase

按照數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)來組織存儲(chǔ)和管理核酸序列的數(shù)據(jù)倉庫

、DNA/RNA。

36

.

靶向測(cè)序targetedsequencing

檢測(cè)特定基因集或基因組區(qū)域內(nèi)已知和新型變異的測(cè)序方法

。

37

.

鳥槍法測(cè)序shotgunsequencing