標準解讀

《T/CPMA 010-2020 基于高通量測序的病原體篩查通用準則》是針對使用高通量測序技術進行病原體檢測的一項標準。該標準旨在規(guī)范基于此技術的病原體篩查流程，確保結果準確性與可靠性的同時，也促進了行業(yè)內相關實踐的一致性和可比性。它適用于各類醫(yī)療機構、科研機構以及第三方檢驗實驗室等采用高通量測序方法進行病原微生物鑒定和分析的工作場景。

根據(jù)文件內容，標準覆蓋了從樣本采集到數(shù)據(jù)分析報告生成的全過程要求。首先，在樣本處理方面，明確了不同類型生物樣本（如血液、尿液、痰液等）的最佳收集方式及其保存條件，以保證后續(xù)實驗的有效性；其次，對于核酸提取步驟，則詳細描述了推薦使用的試劑盒種類及操作指南，強調了避免交叉污染的重要性；再者，關于文庫構建環(huán)節(jié)，給出了不同應用場景下選擇合適建庫策略的原則，并對質量控制指標提出了具體要求；此外，還特別關注到了數(shù)據(jù)處理與分析部分，包括但不限于原始數(shù)據(jù)過濾、比對算法選取、結果解讀等方面的內容，確保最終能夠準確識別出目標病原體信息；最后，標準還涉及到了結果報告的形式與內容，提倡使用統(tǒng)一格式來展示關鍵發(fā)現(xiàn)，便于臨床醫(yī)生或研究人員快速理解并采取相應措施。


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....

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  • 正在執(zhí)行有效
  • 2020-07-01 頒布
  • 2020-10-01 實施
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文檔簡介

ICS07100

CCSC.01

團體標準

T/CPMA010—2020

基于高通量測序的病原體篩查通用準則

Generalcriteriaforpathogenscreeningbasedonhigh-throughputsequencing

2020-07-01發(fā)布2020-10-01實施

中華預防醫(yī)學會發(fā)布

T/CMPA010—2020

目次

前言

…………………………Ⅲ

范圍

1………………………1

規(guī)范性引用文件

2…………………………1

術語和定義

3………………1

試驗方法

4…………………2

技術指標

5…………………3

附錄規(guī)范性附錄實驗室功能分區(qū)

A()…………………6

Ⅰ

T/CMPA010—2020

前言

本標準按照給出的規(guī)則起草

GB/T1.1—2009。

本標準由中華預防醫(yī)學會歸口

。

本標準起草單位中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所北京化工大學和中國醫(yī)學科學院病原

:、

生物學研究所

。

本標準主要起草人張雯童貽剛任麗麗韓娜肖艷安小平王媛媛

:、、、、、、。

Ⅲ

T/CMPA010—2020

基于高通量測序的病原體篩查通用準則

1范圍

本標準規(guī)定了呼吸道樣本鼻咽拭子鼻咽吸取物痰液肺泡灌洗液等消化道樣本糞便肛拭

(/、、、)、(、

子等活檢組織生物體液樣本腦脊液血液胸腹水等蟲媒樣本環(huán)境樣本等類型樣本的病原體高

)、、(、、)、、

通量測序篩查通用準則

。

本標準適用于開展基于高通量測序的病原體篩查的實驗室

。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件

。,()。

病原微生物實驗室生物安全通用準則

WS233—2017

3術語和定義

下列術語和定義適用于本文件

。

31

.

文庫library

由兩端連有已有的特定序列中間為未知序列的核酸片段組成的核酸分子的集合

,。

32

.

高通量測序high-throughputsequencing

以一次并行幾十萬到幾十億條甚至更多核酸分子序列測定為標志適用于或的測序

,DNARNA

技術

。

33

.

病原體pathogens

致人類或動植物感染性疾病的生物總稱包括細菌病毒寄生蟲真菌等微生物或其他生物體

,、、、。

34

.

篩查screening

通過某種方法手段對導致人群疾病的可能的因素進行查找

。

35

.

核酸序列數(shù)據(jù)庫nucleotidedatabase

按照數(shù)據(jù)結構來組織存儲和管理核酸序列的數(shù)據(jù)倉庫

、DNA/RNA。

36

.

靶向測序targetedsequencing

檢測特定基因集或基因組區(qū)域內已知和新型變異的測序方法

。

37

.

鳥槍法測序shotgunsequencing

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