HLA基因SBT法分型產(chǎn)品培訓(xùn)2007-10-09

今日主題1、什么是HLA？2、HLA如何分型？3、SBT法分型及服務(wù)流程？4、為什么選擇SBT分型？5、為什么選擇華大？什么是HLA?

組織相容性抗原小鼠：H-2系統(tǒng)人類：人類白細(xì)胞抗原系統(tǒng)

(HumanLeukocyteAntigen)1954年12月23日，美國醫(yī)生約瑟夫.梅里為一對(duì)孿生兄弟實(shí)施腎臟移植手術(shù)，代表著人類器官移植手術(shù)首次取得成功

個(gè)體特異的蛋白質(zhì)基因水平上HLA有何特點(diǎn)？位于第六號(hào)染色體的短臂6p21.31區(qū)，長(zhǎng)3600kb,約占人類基因組的<萬分之一。經(jīng)典HLA基因分為Ｉ類和II類基因，直接參與免疫應(yīng)答的調(diào)控。Ｉ類基因包括A、B、C等座位。HLA-II類基因分為DR、DQ、DP、DO等亞區(qū)。極高的多態(tài)性HLAI類分子基因結(jié)構(gòu)HLA與器官移植有何關(guān)系？影響器官移植成功與否

移植物細(xì)胞表面I類和II類抗原都是強(qiáng)移植抗原，體液免疫和細(xì)胞免疫都參與了對(duì)移植物的排斥反應(yīng)對(duì)HLA配型在器官移植中的臨床意義的共識(shí)：

1)HLA配型在器官移植中是必要的。

2)不同器官的移植對(duì)HLA配型的要求并不一樣：骨髓移植的要求最高，不僅要考慮A、B、DR位點(diǎn)的配型，C和DP位點(diǎn)也應(yīng)予以考慮。自1987年以來，將HLA-A、B和DRB1六位點(diǎn)的配型作為器官移植的標(biāo)準(zhǔn)配型。

HLA如何分型？低分辨高分辨北京市東城區(qū)SBT分型原理？血清學(xué)水平引物設(shè)計(jì)很重要！華大健康采用SBT的分型方法

依托多年的測(cè)序技術(shù)和信息分析優(yōu)勢(shì)，通過優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方案、研發(fā)SBT分型試劑，從而有效降低了實(shí)驗(yàn)成本，使該方法能夠高質(zhì)量、程序化地實(shí)現(xiàn)。其主要優(yōu)點(diǎn)是能一次就進(jìn)行最高分辨率的分型，從而避免了目前常用的SSP和SSO試劑盒需要低、高分辨率的兩次分型，并且大大提高了分型的準(zhǔn)確程度。上海血液中心山東臍血庫解放軍302醫(yī)院

2003年,414例樣本進(jìn)行了HLA分型我們的分型結(jié)果與上述三個(gè)單位用其它試劑盒的分型結(jié)果的符合率為99.5%。需要指出的是，上述三個(gè)單位的分型結(jié)果的分辨率均低于我們的分辨率。到目前我們共完成進(jìn)6萬例服務(wù)流程檢測(cè)服務(wù)的前期咨詢、接收樣本提取樣品DNAPCR擴(kuò)增和PCR產(chǎn)物純化測(cè)序反應(yīng)ABI3730xl自動(dòng)測(cè)序儀測(cè)序?qū)I(yè)軟件分型發(fā)出報(bào)告樣品說明：要求2mlEDTA抗凝血，保存條件室溫(20-25℃)不超過1周。為什么選擇SBT分型？

核酸序列直接測(cè)定，直觀、準(zhǔn)確；易于自動(dòng)化；SSP和SSO方法得到的HLA新等位基因需要SBT驗(yàn)證；臨床資料顯示，高分辨水平（基因水平）匹配可以提高移植后5年存活率；經(jīng)濟(jì)效益；2004年，美國NMDP資料BLOOD,2004,104:1923-30

DNA測(cè)序是HLA分型的最終金標(biāo)準(zhǔn)。優(yōu)勢(shì)：結(jié)果更準(zhǔn)確、精度最高、能夠檢測(cè)新的等位基因、對(duì)其他方法疑難的樣本十分有效（尤其是HLA-B）。這一方法已經(jīng)成為國外組織配型實(shí)驗(yàn)室的必備技術(shù)，但是由于技術(shù)難度較高、測(cè)序儀器和SBT試劑盒價(jià)格昂貴影響了其在國內(nèi)的應(yīng)用。為什么選擇華大基因研究院？

1、世界一流的技術(shù)毛細(xì)管電泳通過分子量差異讀堿基373測(cè)序儀捕捉每個(gè)cluster上不同的熒光信號(hào)Solexa測(cè)序儀Megabace,3700,3730測(cè)序儀96×500bp=0.48M40,000,000×35bp=1400M高通量低成本的基因分析已成為可能基因分析平臺(tái)Sanger測(cè)序儀Megabase：200臺(tái)，AB37306臺(tái)----10M/天Solexa測(cè)序儀：3臺(tái)---2G/天，國際領(lǐng)先高性能計(jì)算與網(wǎng)格系統(tǒng)：深圳、北京、杭州一體化十兆光纖專網(wǎng)，數(shù)據(jù)無滯傳輸網(wǎng)格體系， 計(jì)算無地域分割北京深圳杭州北京：300CPUs，500G

內(nèi)存，73T

存儲(chǔ)，1.5T計(jì)算峰值

深圳：144CPUs，336G內(nèi)存100T存儲(chǔ)，3.0T

計(jì)算峰值目標(biāo)擴(kuò)大到30T杭州：80CPUs，

300G

內(nèi)存13T

存儲(chǔ)，

0.5T

計(jì)算峰值2、世界一流的科研成果

1%人類基因組（約三千萬個(gè)堿基）、水稻基因組、家蠶基因組、家豬基因組、SARS基因組等多個(gè)大型項(xiàng)目的測(cè)序任務(wù)。

深圳華大基因研究院近來將完成“炎黃計(jì)