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文檔簡介

2023國內(nèi)基因編輯技術(shù)走勢(shì)330~31日,由北京大學(xué)自然藥物及仿生藥物國家重點(diǎn)試驗(yàn)室主辦的2023基因編輯學(xué)術(shù)研討會(huì)將在京進(jìn)展。屆時(shí)眾多一線科研工作者將聚攏于此共襄學(xué)術(shù)盛宴。2023基因編輯技術(shù)期盼進(jìn)展一覽王皓毅CRISPR-Cas9在動(dòng)物模型構(gòu)建、T細(xì)胞治療以及基因表達(dá)調(diào)控中的應(yīng)用高效準(zhǔn)確的基因工程技術(shù)對(duì)于進(jìn)展基因治療,建立細(xì)胞和動(dòng)物疾病模型具有極為重要的價(jià)值。近年來特異性定點(diǎn)核酸酶的爭論取得了長足的進(jìn)步。為了突破傳統(tǒng)基因打靶方法的局CRISPR-Cas9一步獲得多基因敲除的小鼠。為了取代低通量且技術(shù)要求極高的顯微注射技術(shù),我們建立了受精卵電擊的方法,從而極大簡化了動(dòng)物模型的構(gòu)建。這一系列工作大大提高了基因修飾小鼠構(gòu)建效的率和速度,為疾病和發(fā)育生物學(xué)的體內(nèi)爭論供給了重要的工T細(xì)胞和表達(dá)嵌合性抗原受體的T細(xì)胞〔CART〕中建立了高效的單基因和多基因敲除技術(shù),為細(xì)胞免疫治療爭論供給了工具。除了基因編輯,我們也基于系統(tǒng)建立了技術(shù),用來調(diào)控基因的表達(dá)水平和表觀遺傳修飾狀態(tài)。王明媚 中國科學(xué)院生物物理爭論所Cas13a切割RNA的分子機(jī)制CRISPR/Cas系統(tǒng)是原核生物抗免疫防范系統(tǒng),是近年來覺察的由小分子RNA介導(dǎo)的免疫系統(tǒng)。CRISPR-Cas系統(tǒng)分為兩大類,Cas13a是其次大類VI型系統(tǒng)中的效應(yīng)蛋C2c2RNARNA酶切活性,是目前CRISPR-Cas系統(tǒng)覺察的唯一能夠降解RNA的蛋白,在RNA技術(shù)中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值,對(duì)開發(fā)爭論RNA工具,擴(kuò)展CRISPR系統(tǒng)在基因編輯方面的運(yùn)用具有重大價(jià)值。為了爭論Cas13a如何被激活來切割RNA,我們解析了與crRNA及其靶RNA結(jié)合的LeptotrichiabuccalsLbuCas13aLbuCas13a-crRNA復(fù)合物的cryo-EM構(gòu)造。爭論結(jié)果提示了crRNA-靶RNA〔NUC〕Cas13acrRNA在靶RNARNA雙鏈體形HEPN1HEPN2Cas13a蛋白的HEPNRNAtargetRNA的結(jié)合導(dǎo)致LbuCas13a的HEPN構(gòu)造域發(fā)生構(gòu)象變化,從而激發(fā)LbuCas13a非特異性地切割任意單鏈RNA果為爭論Cas13a發(fā)揮RNA酶活性的分子機(jī)制供給了重要的爭論的覺察為CRISPR-Cas13a系統(tǒng)的進(jìn)一步開發(fā)供給了牢靠的構(gòu)造根底,對(duì)深入理解細(xì)菌抵抗病毒入侵的分子機(jī)制供給了強(qiáng)有力的證據(jù),并將對(duì)病毒引起的疾病的預(yù)防、檢測(cè)、把握與治療產(chǎn)生重大意義,特別是基于Cas13a高效的RNA酶切活性,對(duì)其應(yīng)用于各類重大疾病的快速檢測(cè)具有格外寬闊的前景。吳強(qiáng)上海交通大學(xué)開發(fā)DNA大片段編輯技術(shù)爭論染色質(zhì)高級(jí)構(gòu)造源于細(xì)菌和古菌的Ⅱ型成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)系統(tǒng)[Clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats(CRISPR)/CRISPR-associatednuclease9(Cas9),CRISPR/Cas9]近年被改造成為基因組定點(diǎn)編輯的技術(shù)。由于它具有設(shè)計(jì)簡潔、操作便利、費(fèi)用低廉等巨大優(yōu)勢(shì),給遺傳操作領(lǐng)域帶來了一場革命性的轉(zhuǎn)變。基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的基因組DNA片段靶向編輯技術(shù)主要包括DNA片段的刪除、反轉(zhuǎn)、重復(fù)、插入和易位等,這一有效的DNA片段編輯方法為爭論基因功能、調(diào)控元件、組織發(fā)育和疾病發(fā)生發(fā)展供給了有力手段。我將著重匯報(bào)我們?cè)谠擃I(lǐng)域最的爭論CTCF等染色質(zhì)架構(gòu)蛋白在三維基因組組裝調(diào)控的進(jìn)展,為開展利用基因組DNA片段靶向編輯進(jìn)展基因調(diào)控和功能爭論供給參考。ManipulationofViralGenomeinConversionofLife-ThreateningVirusesasPrecisionTherapeuticsTheconversionoflife-threateningvirusesintolivebutavirulentvaccinesrepresentsarevolutioninvaccinology.Inaproof-of-principlestudy,weexpandedthegeneticcodeofthegenomeofinfluenzaAvirusviaatransgeniccelllinecontainingorthogonaltranslationmachinery.Thisgeneratedprematureterminationcodon(PTC)–harboringvirusesthatexertedfullinfectivitybutwerereplication-incompetentinconventionalcells.Genome-wideoptimizationofthesitesforincorporationofmultiplePTCsresultedinhighlyreproductiveandgeneticallystableprogenyvirusesintransgeniccells.Inmouse,ferret,andguineapigmodels,vaccinationwithPTCviruseselicitedrobusthumoral,mucosal,andTcell–mediatedimmunityagainstantigenicallydistinctinfluenzavirusesandevenneutralizedexistinginfectingstrains.Themethodspresentedheremaybecomeageneralapproachforgeneratinglivevirusvaccinesthatcanbeadaptedtoalmostanyvirus.王永明復(fù)旦大學(xué)建立高效的CRISPR/Cas9編輯技術(shù)CRISPR/Cas9我們從兩個(gè)方面著手提高CRISPR/Cas9附著體載體表達(dá)Cas9和gRNA,稱之為epiCRISPR技術(shù)。附著體載體不整合到基因組,但是可以隨著細(xì)胞的分裂而復(fù)制,因而可以長期的表達(dá)外源基因,實(shí)現(xiàn)長期的基因編輯。同時(shí)在附著體載體上表達(dá)嘌呤霉素抗性基因,可以富集轉(zhuǎn)染成功的細(xì)胞。編輯完成后撤除篩選藥物,附著體質(zhì)??焖賳适?,編輯后的細(xì)胞不再表達(dá)外源基因。利用附著體技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)高達(dá)100%CRISPR/Cas9編輯效率受gRNA序gRNAgRNA效率費(fèi)時(shí)費(fèi)力。我們建立了高通量的測(cè)試gRNA活性的方法,得到了5萬多條gRNA2萬多個(gè)人類基因。這些工作將會(huì)極大的便利基因編輯工作。氨酶進(jìn)展基因編輯單核苷酸的多樣性是遺傳多樣性的主要來源,是人類個(gè)體差異的重要遺傳學(xué)根底,同時(shí)也是分子進(jìn)化的動(dòng)力和很多疾病的直接誘因。然而,在哺乳動(dòng)物中,照舊缺乏有效誘導(dǎo)單核苷酸的突變的工具,無法通過試驗(yàn)高效和高通量的地爭論單核苷酸突變的功能?,F(xiàn)有的大局部試驗(yàn)技術(shù)只能擾亂基因的功能或者表達(dá),造成基因功能缺失,對(duì)誘導(dǎo)功能的獲得無能為力。而利用靶向性胞嘧啶脫氨酶介導(dǎo)的堿基編輯〔TargetedAID-mediatedmutagenesis,TAM〕技術(shù),可以在sgRNA靶向的基因組DNA上,將胞嘧啶和鳥嘌呤隨機(jī)地向其從而分析單核苷酸突變的功能或誘導(dǎo)蛋白質(zhì)的體內(nèi)進(jìn)化。同時(shí)在一種多肽抑制劑〔UGI〕的關(guān)心下,dCas9-AID可以誘導(dǎo)特定的胞嘧啶向胸腺嘧啶轉(zhuǎn)變,實(shí)現(xiàn)單堿基的準(zhǔn)確編輯,為治療單核苷酸突變誘導(dǎo)的遺傳病供給方案。利用這項(xiàng)技術(shù),已經(jīng)在慢性骨髓瘤細(xì)胞中,成功篩選出已報(bào)道的以及的imatinib耐藥性位點(diǎn)。因此,作為高效的哺乳動(dòng)物DNA堿基編輯技術(shù),TAM傳學(xué)爭論和基因治療等領(lǐng)域。朱潔廣州市婦女兒童醫(yī)療中心CRISPR-Cas9介導(dǎo)的光感受器細(xì)胞重編程治療視網(wǎng)膜色素變性 基因治療已經(jīng)在多種人類疾病治療中顯示出巨大的潛能。然而目前的方法通常只針對(duì)單個(gè)基因或單個(gè)突變,使得對(duì)多基因或多點(diǎn)突變的疾病治療受到極大限制。視網(wǎng)膜色素變性是臨床常見的致盲眼病,極具臨床和遺傳異質(zhì)性,是導(dǎo)致人類視力障礙最主要的疾病之一。目前已有超過40個(gè)基因和位點(diǎn)被報(bào)道與視網(wǎng)膜色素變性有關(guān)這里我們承受CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯方法,對(duì)視網(wǎng)膜色素變性小鼠進(jìn)展了基因治療。通過突變視桿細(xì)胞中重要的轉(zhuǎn)錄因子Nrl或Nr2e3,將視桿細(xì)胞重編程為視錐細(xì)胞。轉(zhuǎn)化后的視錐樣細(xì)胞對(duì)突變引起的感光細(xì)胞退化不敏感,從而使小鼠在發(fā)病后期仍能保存確定程度的視力。我們的覺察不僅為視網(wǎng)膜色素變性供給了的不依靠于基因突變的治療方法,而且證明白基因編輯技術(shù)介導(dǎo)的細(xì)胞重編程、細(xì)胞退化預(yù)防以及組織功能保護(hù)的巨大可能性。楊輝,中科院上海神經(jīng)所基因編輯在疾病模型建立及疾病治療中的應(yīng)用 基因修飾動(dòng)物是爭論在發(fā)育和疾病中基功能的重要工具。CRISPR/Cas9系統(tǒng)有效的應(yīng)用于構(gòu)建基因敲除和敲入小鼠。然而,該方法獲得的基因修飾動(dòng)物存在嚴(yán)峻的嵌合表達(dá)象,即動(dòng)物個(gè)體的一局部細(xì)胞被基因編輯,而另一局部則沒有。通過交配方法獲得純合的基因敲除小鼠需要很長的時(shí)間和花費(fèi),這在獲得多基因敲除小鼠中尤為明〔4-5生殖力氣低〔單胎動(dòng)物,通過交配方法來獲得純合突變的基因修飾猴則需要更長的時(shí)間和花費(fèi)。為此,我們通過優(yōu)化CRISPR/Cas9系統(tǒng),成功的在第一代就獲得了單基因或多基因功能完全敲除的小鼠及猴,可以直接用于表型分析,極大促進(jìn)了非人靈長類動(dòng)物模型的建立及其在腦科學(xué)及腦疾病中的爭論。同時(shí)我們?cè)O(shè)計(jì)了一種同源介導(dǎo)末端接合〔HMEJ〕策略,可以在分裂和非分裂細(xì)胞中均實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確且高效的基因整合。更重要的是,在小鼠和猴子胚胎或者體內(nèi)的肝細(xì)胞和神經(jīng)元中,該方法的效率均遠(yuǎn)高于以HR、NHEJ和MMEJHMEJ策略可能具有多種運(yùn)用性,譬如基因編輯來獲得動(dòng)物模型以及靶向基因治療。通過上述幾種方法,我們可以有效的在猴中獲得各種基因修PD,AD,ALS,DMD,RP,AS等,工具猴模型包括光遺傳猴,各種神經(jīng)元特異的Cre猴等。這些猴模型的建立將極大促進(jìn)我們對(duì)人類疾病的了解和治愈。此外,我們也致力于各種CRISPR相關(guān)工具的開發(fā)及優(yōu)化,包括CRISPR成體治療等等。馬燕琳海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院基因編輯與生殖安康基因編輯技術(shù)通過插入、缺失或替換的手段對(duì)基因組進(jìn)展定點(diǎn)改造,既能夠通過以突變基因代替正?;騺頎幷摶虻墓δ?,也能夠以正?;虼嫱蛔兓騺磉M(jìn)展基因治療。近年來,有著“基因剪刀”之稱的CRISPR/Cas9技術(shù)被認(rèn)為是能夠在活細(xì)胞中快速、準(zhǔn)確地編輯目的基因的有效方法。隨著人類在破譯基因的遺傳密碼和基因編輯技術(shù)上的不斷突破,通過修改基因從根本上治愈和預(yù)防疾病成為可能,特別是在單基因疾病的治療上,基因編輯有著寬闊的運(yùn)用前景。就生殖安康方面而言,卵巢早衰這類由表觀遺傳引起的疾病目前只能通過替代治療延緩病癥,不能根治。CRISPR/Cas9技術(shù)的消滅有望對(duì)表觀遺傳的靶點(diǎn)進(jìn)展遺傳編輯,改善生殖安康,也為生殖相關(guān)疾病供給了的治療思路。此外,利用基因編輯對(duì)胚胎特定基因集進(jìn)展敲除操作,造成相應(yīng)基因在胚胎中的缺失,可深入爭論人類胚胎早期發(fā)育中的功能、作用機(jī)理,幫助人類了解生物體的根本功能,也可以推動(dòng)人類安康事業(yè)的進(jìn)展,從根源上去除遺傳疾病。張淑君華中農(nóng)業(yè)大學(xué)建立和利用豬全基因組基因敲除CRISPR/Cas9技術(shù)篩選鑒定豬流感病毒感染相關(guān)的宿〔豬〕基因 在豬PK15細(xì)胞系中,證明白CRISPR/Cas9系統(tǒng)在豬細(xì)胞系中能高效地誘導(dǎo)豬基因敲除。設(shè)計(jì)和構(gòu)建了豬全基因組基因敲除CRISPR/Cas9文庫該文庫包含了65316個(gè)gRNAs、掩蓋了13229個(gè)基因,其中含有5個(gè)gRNAs的基因有11400個(gè)基因、含有4個(gè)gRNAs的基因有1829個(gè),并且全部的基因都含有至少2個(gè)gRNAs〔最多不超過5個(gè)gRNAs/基因利用該豬全基因組基因突變gRNAs文庫進(jìn)展大規(guī)模的基因篩選,初步篩選出了140個(gè)候選宿主基因,并證明白其中的32個(gè)候選基因在病毒復(fù)制增殖中具有確定的調(diào)控作用周峰復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)爭論院利用dcas9和超高靈敏度蛋白DNA-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)〔cis-〕和反式(trans-)作用元件進(jìn)展系統(tǒng)爭論成為當(dāng)前急需填補(bǔ)的領(lǐng)域空白。利用生物素化的〔biotinylated〕功能缺失的dcas9系統(tǒng)加上能與我們所感興趣位點(diǎn)能夠形成特定結(jié)合的SgRNA,在原位去分別純化我們感興趣位點(diǎn)DNA以及與這個(gè)位點(diǎn)有特定結(jié)合的蛋白質(zhì)復(fù)合物。我們利用該系統(tǒng)去爭論在白血病細(xì)胞系K562中,與血紅蛋白〔Hemoglobin〕的幾個(gè)亞型HBB、HBG、HBE1、以及與調(diào)控相關(guān)的幾個(gè)重要的HS1、HS2、HS3、/

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