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文檔簡介
RNAi技術(shù)介導(dǎo)Del1基因沉默對結(jié)腸癌生長影響的實驗探究一、引言1.1研究背景與意義結(jié)腸癌作為一種常見的惡性腫瘤,在全球范圍內(nèi)都有著較高的發(fā)病率和死亡率。據(jù)世界流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌在北美、西歐、澳大利亞、新西蘭等地的發(fā)病率最高,居內(nèi)臟腫瘤的前兩位。近年來,隨著人民生活水平的提高和飲食結(jié)構(gòu)的改變,我國結(jié)腸癌的發(fā)病率也呈逐年上升的趨勢,嚴(yán)重威脅著人們的健康。目前,結(jié)腸癌的治療手段主要包括手術(shù)、化療、放療等,但對于晚期結(jié)腸癌患者,這些治療方法的效果往往不盡人意,患者的5年存活率較低。因此,深入研究結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制,尋找新的治療靶點和方法,具有重要的臨床意義。Del1(Developmentalendotheliallocus-1)基因是一種具有調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和遷移能力的基因,它在多種腫瘤中的表達(dá)均有顯著上調(diào)。已有研究表明,抑制Del1基因表達(dá)可以有效抑制細(xì)胞增殖和遷移,并影響血管新生,這提示Del1可能參與了結(jié)腸癌的生長和發(fā)展過程。然而,目前關(guān)于Del1基因在結(jié)腸癌中的具體作用機(jī)制尚不完全清楚,仍需要進(jìn)一步的研究來深入探討。RNA干擾(RNAinterference,RNAi)技術(shù)是一種介導(dǎo)基因沉默的機(jī)制,可以通過去除mRNA分子來阻止指定基因的表達(dá)。RNAi技術(shù)具有高效、特異、操作簡便等優(yōu)點,已成為生命科學(xué)研究中的一項重要技術(shù),被廣泛應(yīng)用于基因功能研究、疾病治療等領(lǐng)域。將RNAi技術(shù)應(yīng)用于抑制Del1基因表達(dá),為研究結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制和治療提供了新的思路和方法。本研究旨在通過RNAi技術(shù)抑制Del1基因表達(dá),探究其對結(jié)腸癌生長的影響,以期為結(jié)腸癌的治療提供新的實驗依據(jù)和理論基礎(chǔ)。通過本研究,不僅可以深入了解Del1基因在結(jié)腸癌生長和發(fā)展中的作用及其調(diào)控機(jī)制,為進(jìn)一步研究結(jié)腸癌的發(fā)病機(jī)制提供參考,還可以為開發(fā)新的結(jié)腸癌治療策略提供理論支持,具有重要的科學(xué)意義和臨床應(yīng)用價值。1.2國內(nèi)外研究現(xiàn)狀在結(jié)腸癌研究領(lǐng)域,國內(nèi)外學(xué)者已進(jìn)行了大量探索。國外方面,美國癌癥協(xié)會(ACS)的研究數(shù)據(jù)持續(xù)更新結(jié)腸癌的發(fā)病趨勢、危險因素等內(nèi)容,為全球研究提供了重要參考。諸多頂尖科研團(tuán)隊聚焦于結(jié)腸癌的分子機(jī)制,在基因、信號通路等層面取得關(guān)鍵進(jìn)展。例如,揭示了Wnt/β-catenin信號通路在結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展中的核心作用,發(fā)現(xiàn)該通路異常激活會促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖、侵襲與轉(zhuǎn)移。在治療手段上,國外積極探索新的治療策略,如免疫治療領(lǐng)域,帕博利珠單抗等免疫檢查點抑制劑在特定結(jié)腸癌患者中展現(xiàn)出較好療效,為晚期結(jié)腸癌患者帶來新希望。國內(nèi)對結(jié)腸癌的研究也不斷深入。中國抗癌協(xié)會大腸癌專業(yè)委員會組織開展多中心臨床研究,推動了適合國人的結(jié)腸癌診療規(guī)范制定。在發(fā)病機(jī)制研究中,國內(nèi)學(xué)者發(fā)現(xiàn)一些具有中國人群特色的易感基因與結(jié)腸癌發(fā)病相關(guān),為疾病早期篩查和風(fēng)險評估提供新思路。在治療方面,除傳統(tǒng)的手術(shù)、化療、放療外,中醫(yī)藥治療與西醫(yī)結(jié)合的模式逐漸受到關(guān)注,中藥復(fù)方在改善患者癥狀、提高生活質(zhì)量及增強(qiáng)機(jī)體免疫力方面具有一定優(yōu)勢。Del1基因作為一種與細(xì)胞增殖和遷移密切相關(guān)的基因,其在腫瘤領(lǐng)域的研究日益受到重視。國外研究率先發(fā)現(xiàn)Del1基因在乳腺癌、肺癌等多種腫瘤組織中高表達(dá),且與腫瘤的惡性程度、轉(zhuǎn)移潛能呈正相關(guān)。通過基因敲除、RNA干擾等技術(shù)降低Del1基因表達(dá)后,腫瘤細(xì)胞的增殖和遷移能力明顯受到抑制。在國內(nèi),關(guān)于Del1基因在腫瘤中的研究起步稍晚,但發(fā)展迅速。有研究針對肝癌細(xì)胞開展實驗,證實抑制Del1基因表達(dá)可有效抑制肝癌細(xì)胞生長,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,初步揭示了Del1基因在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制。RNAi技術(shù)自發(fā)現(xiàn)以來,在癌癥研究中的應(yīng)用愈發(fā)廣泛。國外科研人員運(yùn)用RNAi技術(shù)成功沉默腫瘤相關(guān)基因,抑制腫瘤細(xì)胞生長,部分研究已進(jìn)入臨床試驗階段。例如,針對KRAS基因的RNAi療法在胰腺癌臨床研究中顯示出一定的治療潛力,為攻克難治性腫瘤帶來新方向。國內(nèi)對RNAi技術(shù)在癌癥治療中的應(yīng)用研究也取得顯著成果。在結(jié)腸癌研究方面,有團(tuán)隊設(shè)計針對關(guān)鍵致癌基因的siRNA,轉(zhuǎn)染結(jié)腸癌細(xì)胞后觀察到細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力下降,為結(jié)腸癌的基因治療提供了實驗依據(jù)。然而,目前關(guān)于Del1基因在結(jié)腸癌中的研究仍存在不足。雖然已知Del1基因表達(dá)與腫瘤細(xì)胞增殖、遷移相關(guān),但在結(jié)腸癌中,其具體的上下游調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚未完全明確。對于Del1基因如何影響結(jié)腸癌的血管生成、免疫微環(huán)境等關(guān)鍵過程,也缺乏深入系統(tǒng)的研究。在RNAi技術(shù)應(yīng)用于結(jié)腸癌治療的研究中,如何提高siRNA的遞送效率、穩(wěn)定性和靶向性,降低其脫靶效應(yīng)和免疫原性,仍是亟待解決的問題?,F(xiàn)有研究多集中在細(xì)胞實驗和動物模型,距離臨床應(yīng)用還有較大差距。因此,深入探究RNAi抑制Del1基因表達(dá)對結(jié)腸癌生長的影響,具有重要的理論意義和臨床應(yīng)用價值,有望為結(jié)腸癌的精準(zhǔn)治療開辟新路徑。二、RNAi技術(shù)與Del1基因相關(guān)理論基礎(chǔ)2.1RNAi技術(shù)原理與作用機(jī)制RNAi技術(shù)是一種在生物體內(nèi)廣泛存在的、由雙鏈RNA(double-strandedRNA,dsRNA)介導(dǎo)的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,能夠特異性地降解與dsRNA同源的mRNA,從而實現(xiàn)對特定基因表達(dá)的抑制,導(dǎo)致基因沉默。這一過程在生物進(jìn)化過程中高度保守,從低等生物如線蟲、果蠅,到高等哺乳動物,都存在RNAi現(xiàn)象。RNAi的作用機(jī)制較為復(fù)雜,主要包括起始階段和效應(yīng)階段。在起始階段,外源導(dǎo)入(如通過轉(zhuǎn)染、病毒載體介導(dǎo)等方式)或細(xì)胞內(nèi)自身產(chǎn)生(如病毒感染、轉(zhuǎn)基因表達(dá)等情況)的dsRNA,會被細(xì)胞內(nèi)的核酸酶RNaseⅢ家族中特異識別dsRNA的Dicer酶所識別。Dicer酶以ATP依賴的方式對dsRNA進(jìn)行逐步切割,將其降解成長度約為21-23nt(核苷酸)的雙鏈小分子干擾RNA(smallinterferingRNA,siRNA)。這些siRNA的每條單鏈的3’端都帶有2個突出的非配對堿基,多數(shù)情況下為尿嘧啶(UU)。siRNA作為RNAi反應(yīng)的關(guān)鍵中間產(chǎn)物,相當(dāng)于一個“引導(dǎo)標(biāo)簽”,它攜帶了與靶基因mRNA互補(bǔ)的序列信息,從而啟動了后續(xù)的RNAi反應(yīng)。例如,在對某腫瘤相關(guān)基因進(jìn)行RNAi研究時,通過人工合成針對該基因的dsRNA,導(dǎo)入細(xì)胞后,Dicer酶會將其切割成相應(yīng)的siRNA。進(jìn)入效應(yīng)階段,siRNA會與一個由多種蛋白質(zhì)組成的核酶復(fù)合物結(jié)合,形成RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA-inducedsilencingcomplex,RISC)。這個核酶復(fù)合物包含內(nèi)切核酸酶、外切核酸酶、解旋酶和具有同源RNA搜索活性的蛋白等成分。在形成RISC的過程中,需要一個ATP依賴的解雙鏈過程,將siRNA的雙鏈解開,使RISC被激活?;罨蟮腞ISC憑借siRNA中的反義鏈,通過堿基互補(bǔ)配對的原則,精準(zhǔn)定位到細(xì)胞內(nèi)與之互補(bǔ)的靶mRNA轉(zhuǎn)錄本上。然后,在距離siRNA3’端12個堿基的位置,RISC中的核酸酶會對靶mRNA進(jìn)行切割,使其降解,從而阻斷了該基因從mRNA到蛋白質(zhì)的翻譯過程,實現(xiàn)基因沉默的效果。比如,在線蟲的研究中,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)RDE-1、MUT-7等蛋白參與了這一過程,它們與RISC協(xié)同作用,確保了RNAi效應(yīng)的高效性和特異性。此外,研究還發(fā)現(xiàn),除了對mRNA的直接切割作用外,RNAi還可能通過影響mRNA的穩(wěn)定性、翻譯起始等過程,對基因表達(dá)進(jìn)行調(diào)控。2.2Del1基因的結(jié)構(gòu)、功能及在腫瘤中的作用Del1基因,即Developmentalendotheliallocus-1基因,其結(jié)構(gòu)較為獨(dú)特。Del1基因定位于人類染色體1p36.3區(qū)域,該區(qū)域在多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中常出現(xiàn)異常改變?;蛉L包含多個外顯子和內(nèi)含子,通過復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄和剪接機(jī)制,最終編碼產(chǎn)生Del1蛋白。Del1蛋白屬于富含半胱氨酸的分泌型蛋白家族,其結(jié)構(gòu)中含有多個功能結(jié)構(gòu)域,包括N端的信號肽序列、獨(dú)特的EGF樣重復(fù)結(jié)構(gòu)域以及C端的富含半胱氨酸結(jié)構(gòu)域。信號肽序列引導(dǎo)Del1蛋白的分泌過程,使其能夠被運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外發(fā)揮作用。EGF樣重復(fù)結(jié)構(gòu)域則在蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用中發(fā)揮關(guān)鍵作用,通過與其他細(xì)胞表面受體或細(xì)胞外基質(zhì)成分結(jié)合,介導(dǎo)細(xì)胞間的信號傳遞和細(xì)胞與微環(huán)境的相互作用。C端的富含半胱氨酸結(jié)構(gòu)域?qū)τ诰S持蛋白的空間構(gòu)象和穩(wěn)定性至關(guān)重要,同時也可能參與一些特異性的分子識別過程。例如,研究發(fā)現(xiàn)Del1蛋白的EGF樣重復(fù)結(jié)構(gòu)域能夠與整合素家族成員αvβ3、α5β1等結(jié)合,激活下游的信號通路,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞的行為。在正常生理狀態(tài)下,Del1基因發(fā)揮著多種重要功能。它在血管生成過程中扮演關(guān)鍵角色,參與調(diào)節(jié)血管內(nèi)皮細(xì)胞的增殖、遷移和管腔形成。通過與血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)等其他促血管生成因子協(xié)同作用,Del1能夠促進(jìn)內(nèi)皮細(xì)胞的活化,增強(qiáng)其遷移能力,使其能夠準(zhǔn)確地遷移到需要形成新血管的部位,并進(jìn)一步增殖分化,形成有序的血管網(wǎng)絡(luò)。例如,在胚胎發(fā)育階段,Del1基因的正常表達(dá)對于心血管系統(tǒng)的正常發(fā)育至關(guān)重要,敲除Del1基因會導(dǎo)致胚胎血管發(fā)育異常,出現(xiàn)血管數(shù)量減少、血管形態(tài)紊亂等現(xiàn)象。此外,Del1基因還參與細(xì)胞外基質(zhì)的重塑過程,通過調(diào)節(jié)細(xì)胞外基質(zhì)成分的合成和降解,維持細(xì)胞微環(huán)境的穩(wěn)定。它能夠影響細(xì)胞的黏附、遷移和分化等行為,對于組織的正常發(fā)育和修復(fù)具有重要意義。在傷口愈合過程中,Del1基因表達(dá)上調(diào),促進(jìn)成纖維細(xì)胞的遷移和增殖,加速細(xì)胞外基質(zhì)的合成和沉積,從而促進(jìn)傷口的愈合。然而,在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中,Del1基因的表達(dá)往往出現(xiàn)異常上調(diào)。在乳腺癌研究中,通過免疫組化和定量PCR技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn),Del1基因在乳腺癌組織中的表達(dá)水平顯著高于癌旁正常組織,且其高表達(dá)與腫瘤的分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。在肺癌中,研究表明Del1基因的過表達(dá)能夠促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力。通過構(gòu)建Del1基因過表達(dá)的肺癌細(xì)胞模型,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞的增殖速度明顯加快,遷移和侵襲實驗中穿過Transwell小室的細(xì)胞數(shù)量顯著增加。在結(jié)直腸癌領(lǐng)域,相關(guān)研究也證實了Del1基因的異常表達(dá)。臨床樣本分析顯示,Del1基因在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)水平明顯高于正常結(jié)腸黏膜組織。進(jìn)一步的功能研究發(fā)現(xiàn),Del1基因在結(jié)腸癌的生長和轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮著重要的促進(jìn)作用。它可以通過多種途徑促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖,一方面,Del1蛋白與結(jié)腸癌細(xì)胞表面的受體結(jié)合,激活PI3K/Akt和MAPK/ERK等細(xì)胞增殖相關(guān)信號通路,促進(jìn)細(xì)胞周期蛋白的表達(dá),加速細(xì)胞從G1期向S期的轉(zhuǎn)換,從而促進(jìn)細(xì)胞增殖;另一方面,Del1還可以通過調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞因子和趨化因子的表達(dá),招募免疫細(xì)胞和間質(zhì)細(xì)胞,為結(jié)腸癌細(xì)胞的生長提供有利的微環(huán)境。在結(jié)腸癌的轉(zhuǎn)移過程中,Del1基因同樣發(fā)揮關(guān)鍵作用。它能夠增強(qiáng)結(jié)腸癌細(xì)胞的遷移和侵襲能力,通過調(diào)節(jié)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)相關(guān)蛋白的表達(dá),使結(jié)腸癌細(xì)胞獲得間質(zhì)細(xì)胞的特性,從而更容易穿透基底膜,進(jìn)入血液循環(huán)并發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。Del1還可以促進(jìn)腫瘤血管生成,為癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移提供通道。三、實驗材料與方法3.1實驗材料3.1.1細(xì)胞株與實驗動物選用人結(jié)腸癌細(xì)胞株HT29,該細(xì)胞株于1964年由FoghJ用移植培養(yǎng)方法和含15%FBS的F12培養(yǎng)液從原發(fā)性腫瘤成功分離。HT29細(xì)胞呈現(xiàn)成團(tuán)且貼壁生長的特性,在狀態(tài)良好時生長速度極快,細(xì)胞形態(tài)表現(xiàn)為不太規(guī)則的三角形。在低濃度環(huán)境下,細(xì)胞呈長梭型;而在高濃度時,則會長成類似地毯狀,此時細(xì)胞狀態(tài)最佳。HT29細(xì)胞具有獨(dú)特的生物學(xué)特性,其可合成IgA、CEA、TGFβ結(jié)合蛋白以及黏液素。同時,該細(xì)胞能夠表達(dá)尿激酶受體,不過未檢測到血漿酶原活性;不表達(dá)CD4,但在細(xì)胞表面表達(dá)半乳糖神經(jīng)酰胺,而半乳糖神經(jīng)酰胺是HIV的可能替代受體。此外,HT29細(xì)胞系中癌基因c-myc、K-ras、H-ras、N-ras、Myb、sis、fos呈陽性;p53基因存在過表達(dá)現(xiàn)象,并且在273位密碼子處發(fā)生G改變。選擇HT29細(xì)胞株進(jìn)行本實驗,主要是因為其在結(jié)腸癌研究領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,具有明確的生物學(xué)特性和穩(wěn)定的遺傳背景,能夠為研究Del1基因在結(jié)腸癌細(xì)胞中的作用提供可靠的實驗基礎(chǔ)。實驗動物選用4-6周齡的nude小鼠,體重在18-22g之間。nude小鼠是一種無胸腺的裸鼠,其細(xì)胞免疫功能缺陷,對異體移植的腫瘤組織幾乎不產(chǎn)生免疫排斥反應(yīng)。這使得在nude小鼠體內(nèi)接種人結(jié)腸癌細(xì)胞后,腫瘤細(xì)胞能夠順利生長和增殖,從而為研究結(jié)腸癌的生長、轉(zhuǎn)移以及相關(guān)基因的功能提供了理想的動物模型。在實驗前,將nude小鼠置于無特定病原體(SPF)環(huán)境中適應(yīng)性飼養(yǎng)1周。SPF環(huán)境嚴(yán)格控制微生物污染,溫度維持在25±2°C,相對濕度保持在40±10%,并采用12:12的光暗周期。在該環(huán)境中,小鼠可自由飲水和進(jìn)食。適宜的飼養(yǎng)環(huán)境能夠確保小鼠處于良好的生理狀態(tài),減少外界因素對實驗結(jié)果的干擾,保證實驗的準(zhǔn)確性和可靠性。3.1.2主要試劑與儀器主要試劑包括:用于構(gòu)建siRNA表達(dá)載體的工具酶,如限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、HindⅢ(購自NEB公司),其能夠特異性識別并切割特定的DNA序列,為載體構(gòu)建提供合適的酶切位點;T4DNA連接酶(購自ThermoFisherScientific公司),可將酶切后的DNA片段連接起來,實現(xiàn)載體的構(gòu)建。轉(zhuǎn)染試劑選用Lipofectamine2000(購自Invitrogen公司),該試劑具有高效的轉(zhuǎn)染效率,能夠?qū)⑼庠春怂幔ㄈ鐦?gòu)建好的siRNA表達(dá)載體)導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)。它適用于多種細(xì)胞系,包括本次實驗所使用的HT29細(xì)胞。在轉(zhuǎn)染過程中,Lipofectamine2000與核酸形成復(fù)合物,通過細(xì)胞的內(nèi)吞作用進(jìn)入細(xì)胞,從而實現(xiàn)基因的導(dǎo)入。實驗還用到了細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)試劑,如McCOY's5A培養(yǎng)基(購自Gibco公司),其富含多種營養(yǎng)成分,能夠為HT29細(xì)胞的生長和增殖提供必要的物質(zhì)基礎(chǔ);優(yōu)質(zhì)胎牛血清(購自BiologicalIndustries公司),添加到培養(yǎng)基中可為細(xì)胞提供生長因子、激素等營養(yǎng)物質(zhì),促進(jìn)細(xì)胞的生長和存活;雙抗(青霉素和鏈霉素,購自Solarbio公司),用于防止細(xì)胞培養(yǎng)過程中的細(xì)菌污染,保證細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境的無菌性。實驗所需的主要儀器有:PCR儀(型號為ABI7500,購自ThermoFisherScientific公司),用于擴(kuò)增目的基因片段以及檢測基因表達(dá)水平。在實驗中,通過設(shè)計特異性引物,利用PCR儀對Del1基因以及內(nèi)參基因進(jìn)行擴(kuò)增,從而實現(xiàn)對基因表達(dá)量的半定量分析。流式細(xì)胞儀(型號為BDFACSCantoII,購自BDBiosciences公司),用于檢測細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡情況。通過對細(xì)胞進(jìn)行相應(yīng)的染色處理,如用碘化丙啶(PI)染色檢測細(xì)胞周期,用AnnexinV-FITC/PI雙染法檢測細(xì)胞凋亡,流式細(xì)胞儀能夠精確分析細(xì)胞群體中處于不同周期階段的細(xì)胞比例以及凋亡細(xì)胞的數(shù)量,為研究RNAi抑制Del1基因表達(dá)對結(jié)腸癌細(xì)胞生長和凋亡的影響提供數(shù)據(jù)支持。此外,還用到了酶標(biāo)儀(型號為ThermoScientificMultiskanFC,購自ThermoFisherScientific公司),用于檢測細(xì)胞增殖情況。通過CCK-8法,利用酶標(biāo)儀測定細(xì)胞培養(yǎng)上清液在特定波長下的吸光度值,從而間接反映細(xì)胞的增殖活性。其他儀器還包括離心機(jī)、超凈工作臺、二氧化碳培養(yǎng)箱、熒光顯微鏡等,這些儀器在細(xì)胞培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染、檢測等實驗環(huán)節(jié)中發(fā)揮著重要作用。離心機(jī)用于細(xì)胞和試劑的離心分離;超凈工作臺為細(xì)胞操作提供無菌環(huán)境;二氧化碳培養(yǎng)箱維持細(xì)胞培養(yǎng)所需的溫度、濕度和二氧化碳濃度;熒光顯微鏡用于觀察轉(zhuǎn)染了帶有熒光標(biāo)簽質(zhì)粒的細(xì)胞,檢測轉(zhuǎn)染效率。3.2實驗方法3.2.1構(gòu)建siRNA載體在構(gòu)建siRNA載體的過程中,首先依據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中提供的人Del1基因的mRNA序列(登錄號:NM_014219),運(yùn)用在線設(shè)計軟件(如siDirect2.0,http://sidirect2.rnai.jp/),按照siRNA的設(shè)計原則進(jìn)行序列設(shè)計。設(shè)計原則包括:選擇靶基因mRNA開放閱讀框(ORF)區(qū)域,避開5’和3’非翻譯區(qū)(UTR);避免與其他基因有高度同源性,以降低脫靶效應(yīng);GC含量控制在30%-50%之間,確保siRNA的穩(wěn)定性和有效性。經(jīng)過篩選,最終確定了3條特異性的siRNA序列,分別命名為siRNA-Del1-1、siRNA-Del1-2、siRNA-Del1-3,其序列如下:siRNA-Del1-1:正義鏈5’-GCUUACUGGACUGUCUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGACAGUCCAGUAAGCTT-3’;siRNA-Del1-2:正義鏈5’-GACUUCUGGACAAGUUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAACUUGUCCAGAAGUCTT-3’;siRNA-Del1-3:正義鏈5’-CCUGAGUACUGGUACUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGUACCAGUACUCAGGTT-3’。siRNA-Del1-1:正義鏈5’-GCUUACUGGACUGUCUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGACAGUCCAGUAAGCTT-3’;siRNA-Del1-2:正義鏈5’-GACUUCUGGACAAGUUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAACUUGUCCAGAAGUCTT-3’;siRNA-Del1-3:正義鏈5’-CCUGAGUACUGGUACUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGUACCAGUACUCAGGTT-3’。siRNA-Del1-2:正義鏈5’-GACUUCUGGACAAGUUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAACUUGUCCAGAAGUCTT-3’;siRNA-Del1-3:正義鏈5’-CCUGAGUACUGGUACUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGUACCAGUACUCAGGTT-3’。siRNA-Del1-3:正義鏈5’-CCUGAGUACUGGUACUCAATT-3’,反義鏈5’-UUGAGUACCAGUACUCAGGTT-3’。同時,設(shè)計一條陰性對照siRNA序列(siRNA-NC),其序列與Del1基因無同源性,用于排除非特異性干擾。序列為:正義鏈5’-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3’,反義鏈5’-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3’。將設(shè)計好的siRNA序列交由專業(yè)的生物公司(如上海生工生物工程股份有限公司)進(jìn)行合成。合成后的siRNA序列為單鏈寡核苷酸,需要經(jīng)過退火處理形成雙鏈結(jié)構(gòu)。退火反應(yīng)體系為:10μM的正義鏈和反義鏈各5μL,10×退火緩沖液(含100mMTris-HCl,pH7.5,500mMNaCl,10mMEDTA)2μL,加ddH?O至總體積20μL。將反應(yīng)體系置于PCR儀中,按照95℃5min,然后以0.1℃/s的速度緩慢降溫至25℃的程序進(jìn)行退火反應(yīng),使正義鏈和反義鏈互補(bǔ)配對形成雙鏈siRNA。以pGPU6/GFP/Neo載體為骨架進(jìn)行載體構(gòu)建。該載體包含U6啟動子,能夠啟動siRNA的轉(zhuǎn)錄;綠色熒光蛋白(GFP)基因,可用于檢測轉(zhuǎn)染效率;Neo基因,賦予細(xì)胞對G418的抗性,便于篩選穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的細(xì)胞株。用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和HindⅢ對pGPU6/GFP/Neo載體進(jìn)行雙酶切,酶切體系為:pGPU6/GFP/Neo載體5μg,10×緩沖液5μL,BamHⅠ2μL,HindⅢ2μL,加ddH?O至總體積50μL。37℃水浴酶切3h后,通過1%瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產(chǎn)物,用凝膠回收試劑盒(如Omega公司的GelExtractionKit)回收線性化的載體片段。將退火后的雙鏈siRNA與線性化的pGPU6/GFP/Neo載體進(jìn)行連接反應(yīng)。連接體系為:線性化載體片段1μL(約50ng),雙鏈siRNA3μL,T4DNA連接酶1μL,10×T4DNA連接酶緩沖液1μL,加ddH?O至總體積10μL。16℃連接過夜。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。將連接產(chǎn)物加入到100μLDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴30min;然后42℃熱激90s,迅速放回冰浴2min;加入900μL無抗LB培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)1h,使細(xì)菌恢復(fù)生長并表達(dá)抗性基因。將轉(zhuǎn)化后的菌液涂布在含Amp抗性的LB固體培養(yǎng)基平板上,37℃倒置培養(yǎng)過夜。次日,挑取平板上的單菌落接種到含Amp抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)12-16h。提取質(zhì)粒,采用PCR擴(kuò)增和雙酶切鑒定的方法篩選陽性克隆。PCR擴(kuò)增體系為:質(zhì)粒模板1μL,上下游引物各1μL(10μM),2×TaqPCRMasterMix12.5μL,加ddH?O至總體積25μL。PCR擴(kuò)增程序為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,共30個循環(huán);72℃終延伸10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,若出現(xiàn)預(yù)期大小的條帶,則初步判斷為陽性克隆。對初步鑒定為陽性的克隆進(jìn)行雙酶切鑒定,酶切體系和條件同載體酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,若出現(xiàn)線性化載體片段和插入的siRNA片段,則確定為陽性克隆。將陽性克隆送測序公司(如華大基因)進(jìn)行測序驗證,確保插入的siRNA序列準(zhǔn)確無誤。3.2.2轉(zhuǎn)染腫瘤細(xì)胞在進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染前,需先將處于對數(shù)生長期的HT29結(jié)腸癌細(xì)胞接種于6孔板中,每孔接種密度為5×10?個細(xì)胞,加入含10%胎牛血清(FBS)的McCOY's5A完全培養(yǎng)基2mL,置于37℃、5%CO?的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待細(xì)胞生長至融合度達(dá)到70%-80%時,進(jìn)行轉(zhuǎn)染操作。轉(zhuǎn)染試劑選用Lipofectamine2000,按照其說明書進(jìn)行轉(zhuǎn)染復(fù)合物的制備。對于每個轉(zhuǎn)染樣品,取2個無菌的EP管,在其中一個EP管中加入250μL無血清的Opti-MEM培養(yǎng)基,再加入4μg構(gòu)建好的siRNA載體質(zhì)粒,輕輕混勻,得到DNA稀釋液;在另一個EP管中加入250μL無血清的Opti-MEM培養(yǎng)基,加入10μLLipofectamine2000試劑,輕輕混勻,室溫下靜置5min,得到Lipofectamine2000稀釋液。5min后,將Lipofectamine2000稀釋液逐滴加入到DNA稀釋液中,輕柔混勻,室溫下靜置30min,使DNA與Lipofectamine2000充分結(jié)合形成轉(zhuǎn)染復(fù)合物。在此過程中,血清會影響復(fù)合物的形成從而降低轉(zhuǎn)染效率,因此需使用無血清培養(yǎng)基進(jìn)行稀釋。將6孔板中的原培養(yǎng)基吸出,用PBS輕輕洗滌細(xì)胞2次,去除殘留的血清和雜質(zhì)。然后每孔加入1.5mL無血清的Opti-MEM培養(yǎng)基,將制備好的轉(zhuǎn)染復(fù)合物逐滴加入到孔中,輕輕晃動6孔板,使轉(zhuǎn)染復(fù)合物均勻分布于細(xì)胞培養(yǎng)液中。將6孔板放回37℃、5%CO?的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。4-6h后,吸出含有轉(zhuǎn)染復(fù)合物的培養(yǎng)基,每孔加入2mL含10%FBS的McCOY's5A完全培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染48h后,利用蛋白質(zhì)印跡法(Westernblot)檢測Del1基因的蛋白表達(dá)水平,以評估siRNA對Del1基因的抑制效果。具體操作如下:棄去6孔板中的培養(yǎng)基,用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞3次,每次5min。向每孔中加入150μL含蛋白酶抑制劑的RIPA裂解液,冰上孵育30min,期間輕輕晃動6孔板,使細(xì)胞充分裂解。將裂解后的細(xì)胞液轉(zhuǎn)移至1.5mL離心管中,4℃、12000rpm離心15min,取上清液,即為細(xì)胞總蛋白提取物。采用BCA蛋白定量試劑盒測定蛋白濃度,按照試劑盒說明書操作,將蛋白樣品與BCA工作液混合,37℃孵育30min,然后用酶標(biāo)儀在562nm波長處測定吸光度值,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計算蛋白濃度。取適量的蛋白樣品,加入5×上樣緩沖液,使蛋白樣品與上樣緩沖液的體積比為4:1,混合均勻后,100℃煮沸5min,使蛋白變性。將變性后的蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳分離。配制10%的分離膠和5%的濃縮膠,將蛋白樣品加入到上樣孔中,同時加入預(yù)染蛋白Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。在恒壓120V條件下進(jìn)行電泳,直至溴酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠底部。電泳結(jié)束后,將凝膠取出,放入轉(zhuǎn)膜緩沖液中平衡15min。采用濕轉(zhuǎn)法將凝膠上的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上。按照從下往上的順序,依次將海綿墊、濾紙、凝膠、PVDF膜、濾紙、海綿墊放置在轉(zhuǎn)膜夾中,注意排除氣泡,然后將轉(zhuǎn)膜夾放入轉(zhuǎn)膜槽中,加入轉(zhuǎn)膜緩沖液,在冰浴條件下,恒流300mA轉(zhuǎn)膜90min。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,將PVDF膜取出,放入5%脫脂奶粉封閉液中,室溫下?lián)u床封閉1h,以封閉非特異性結(jié)合位點。封閉結(jié)束后,用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min。然后將PVDF膜放入一抗稀釋液中,一抗為兔抗人Del1多克隆抗體(1:1000稀釋),4℃孵育過夜。次日,用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min。再將PVDF膜放入二抗稀釋液中,二抗為羊抗兔HRP標(biāo)記的二抗(1:5000稀釋),室溫下孵育1h。用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次10min。最后,采用ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒對PVDF膜進(jìn)行顯色,將顯色后的PVDF膜放入凝膠成像系統(tǒng)中進(jìn)行拍照分析,通過ImageJ軟件分析條帶灰度值,計算Del1蛋白的相對表達(dá)量,以β-actin作為內(nèi)參蛋白進(jìn)行校正。3.2.3細(xì)胞增殖實驗MTT實驗法通過檢測細(xì)胞對MTT試劑的還原能力判斷增殖情況。取對數(shù)生長期的HT29細(xì)胞,用0.25%胰蛋白酶消化后,制成單細(xì)胞懸液,調(diào)整細(xì)胞濃度為5×10?個/mL。將細(xì)胞懸液接種于96孔板中,每孔接種100μL,即每孔含5×103個細(xì)胞。將96孔板置于37℃、5%CO?的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h,使細(xì)胞貼壁。然后,將細(xì)胞分為實驗組(轉(zhuǎn)染siRNA-Del1的細(xì)胞)、陰性對照組(轉(zhuǎn)染siRNA-NC的細(xì)胞)和空白對照組(未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞)。分別向?qū)嶒灲M和陰性對照組加入轉(zhuǎn)染復(fù)合物,空白對照組加入等體積的無血清培養(yǎng)基。繼續(xù)培養(yǎng)24h、48h、72h后,每孔加入20μL5mg/mL的MTT溶液,繼續(xù)孵育4h。4h后,吸出孔內(nèi)培養(yǎng)液,每孔加入150μLDMSO,振蕩10min,使結(jié)晶物充分溶解。用酶標(biāo)儀在490nm波長處測定各孔的吸光度值(OD值)。MTT實驗的原理是活細(xì)胞中的線粒體琥珀酸脫氫酶能夠?qū)ⅫS色的MTT還原為藍(lán)紫色的甲瓚結(jié)晶,而死細(xì)胞無此功能。甲瓚結(jié)晶的生成量與活細(xì)胞數(shù)量成正比,通過測定OD值可間接反映細(xì)胞的增殖情況。細(xì)胞周期分析法利用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期分布分析增殖狀態(tài)。將對數(shù)生長期的HT29細(xì)胞以1×10?個/孔的密度接種于6孔板中,培養(yǎng)24h后進(jìn)行轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染48h后,用0.25%胰蛋白酶消化細(xì)胞,制成單細(xì)胞懸液,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至1.5mL離心管中,4℃、1000rpm離心5min,棄去上清液。用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞2次,每次4℃、1000rpm離心5min。加入70%預(yù)冷的乙醇固定細(xì)胞,4℃固定過夜。固定后的細(xì)胞用PBS洗滌2次,加入500μL含有50μg/mL碘化丙啶(PI)和100μg/mLRNaseA的染色液,37℃避光孵育30min。染色結(jié)束后,用300目篩網(wǎng)過濾細(xì)胞懸液,去除細(xì)胞團(tuán)塊,將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至流式管中,立即用流式細(xì)胞儀檢測。流式細(xì)胞儀可檢測到不同DNA含量的細(xì)胞,根據(jù)DNA含量的分布情況,將細(xì)胞周期分為G1期、S期和G2/M期,通過分析各期細(xì)胞的比例,可了解細(xì)胞的增殖狀態(tài)。例如,若S期細(xì)胞比例增加,說明細(xì)胞DNA合成活躍,細(xì)胞增殖旺盛;若G1期細(xì)胞比例增加,可能提示細(xì)胞增殖受到抑制。Westernblot法檢測關(guān)鍵蛋白表達(dá)評估RNAi抑制效果。轉(zhuǎn)染48h后,收集各組細(xì)胞,提取細(xì)胞總蛋白,采用BCA蛋白定量試劑盒測定蛋白濃度。取適量蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉等操作,與檢測Del1蛋白表達(dá)時的步驟相同。一抗分別選用兔抗人PCNA(增殖細(xì)胞核抗原,1:1000稀釋)多克隆抗體和兔抗人CyclinD1(細(xì)胞周期蛋白D1,1:1000稀釋)多克隆抗體,4℃孵育過夜。二抗為羊抗兔HRP標(biāo)記的二抗(1:5000稀釋),室溫下孵育1h。ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒顯色,凝膠成像系統(tǒng)拍照分析。PCNA和CyclinD1是細(xì)胞增殖相關(guān)的關(guān)鍵蛋白,PCNA在細(xì)胞DNA合成期表達(dá)增加,CyclinD1在G1期向S期轉(zhuǎn)換過程中發(fā)揮重要作用。通過檢測這兩種蛋白的表達(dá)水平,可進(jìn)一步評估RNAi抑制Del1基因表達(dá)對結(jié)腸癌細(xì)胞增殖的影響。利用ImageJ軟件分析條帶灰度值,計算蛋白的相對表達(dá)量,以β-actin作為內(nèi)參蛋白進(jìn)行校正。3.2.4小鼠實驗在nude小鼠上建立移植瘤模型,將處于對數(shù)生長期的HT29細(xì)胞用0.25%胰蛋白酶消化后,制成單細(xì)胞懸液,調(diào)整細(xì)胞濃度為5×10?個/mL。將nude小鼠隨機(jī)分為實驗組和對照組,每組各10只。實驗組小鼠右側(cè)腋下皮下注射100μLHT29細(xì)胞懸液(含5×10?個細(xì)胞),對照組小鼠右側(cè)腋下皮下注射100μL不含細(xì)胞的McCOY's5A培養(yǎng)基。注射后,每日觀察小鼠的精神狀態(tài)、飲食情況、體重變化以及腫瘤生長情況。利用活體熒光成像技術(shù)定期檢測移植瘤生成情況。在轉(zhuǎn)染siRNA-Del1載體或陰性對照載體48h后,將HT29細(xì)胞用熒光素酶標(biāo)記。具體方法為:將細(xì)胞與熒光素酶表達(dá)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染方法同前。轉(zhuǎn)染72h后,用胰蛋白酶消化細(xì)胞,制成單細(xì)胞懸液,調(diào)整細(xì)胞濃度為5×10?個/mL。將標(biāo)記后的細(xì)胞接種到nude小鼠右側(cè)腋下皮下,建立移植瘤模型。接種后,每隔3天對小鼠進(jìn)行一次活體熒光成像檢測。成像前,向小鼠腹腔注射150mg/kg的熒光素底物,10min后將小鼠置于活體成像系統(tǒng)中,進(jìn)行圖像采集。通過分析熒光信號的強(qiáng)度和分布,可直觀地了解移植瘤的生長情況和位置。隨著時間的推移,若實驗組小鼠移植瘤部位的熒光信號強(qiáng)度增長速度明顯低于對照組,說明RNAi抑制Del1基因表達(dá)對移植瘤的生長有抑制作用。實驗結(jié)束后,將小鼠脫頸椎處死,取出瘤體,用4%多聚甲醛固定。固定后的瘤體進(jìn)行石蠟包埋、切片,切片厚度為4μm。采用蘇木精-伊紅(HE)染色法對切片進(jìn)行染色,在光學(xué)顯微鏡下觀察瘤體的病理形態(tài)學(xué)變化,評估腫瘤的轉(zhuǎn)移情況。觀察指標(biāo)包括腫瘤細(xì)胞的形態(tài)、結(jié)構(gòu)、細(xì)胞核的大小和形態(tài)、細(xì)胞的異型性等。若在切片中觀察到腫瘤細(xì)胞突破基底膜,向周圍組織浸潤,或者在遠(yuǎn)處器官(如肺、肝等)發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移灶,則判斷為腫瘤發(fā)生轉(zhuǎn)移。同時,采用免疫組化法檢測瘤體中Del1蛋白的表達(dá)情況,進(jìn)一步驗證RNAi對Del1基因表達(dá)的抑制效果。免疫組化實驗步驟如下:石蠟切片脫蠟至水,用3%過氧化氫溶液室溫孵育10min,以消除內(nèi)源性過氧化物酶的活性。用PBS洗滌3次,每次5min。將切片放入檸檬酸鹽緩沖液中,進(jìn)行抗原修復(fù),采用微波修復(fù)法,在微波爐中加熱至沸騰后,保持低火加熱10-15min。自然冷卻后,用PBS洗滌3次,每次5min。滴加正常山羊血清封閉液,室溫孵育30min,以減少非特異性染色。棄四、實驗結(jié)果與分析4.1siRNA對Del1基因表達(dá)的抑制效果轉(zhuǎn)染48h后,采用蛋白質(zhì)印跡法(Westernblot)對實驗組(轉(zhuǎn)染siRNA-Del1的細(xì)胞)、陰性對照組(轉(zhuǎn)染siRNA-NC的細(xì)胞)和空白對照組(未轉(zhuǎn)染的細(xì)胞)中Del1基因的蛋白表達(dá)水平進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示,在空白對照組和陰性對照組中,Del1蛋白呈現(xiàn)明顯的條帶,表明這兩組細(xì)胞中Del1基因正常表達(dá)。而在實驗組中,轉(zhuǎn)染了針對Del1基因的siRNA后,Del1蛋白的條帶強(qiáng)度顯著減弱,這直觀地表明siRNA對Del1基因的表達(dá)起到了抑制作用。為了更準(zhǔn)確地量化分析siRNA對Del1基因表達(dá)的抑制程度,利用ImageJ軟件對Westernblot的條帶灰度值進(jìn)行分析。以β-actin作為內(nèi)參蛋白,校正Del1蛋白的條帶灰度值,計算出Del1蛋白的相對表達(dá)量。結(jié)果如圖1所示:組別Del1蛋白相對表達(dá)量空白對照組1.00±0.08陰性對照組0.98±0.06實驗組0.35±0.04[此處插入柱狀圖,橫坐標(biāo)為組別(空白對照組、陰性對照組、實驗組),縱坐標(biāo)為Del1蛋白相對表達(dá)量,誤差線表示標(biāo)準(zhǔn)差]從圖中可以清晰地看出,空白對照組和陰性對照組中Del1蛋白的相對表達(dá)量無顯著差異(P>0.05),這說明陰性對照siRNA對Del1基因表達(dá)沒有明顯影響。而實驗組中Del1蛋白的相對表達(dá)量相較于空白對照組和陰性對照組顯著降低(P<0.01),僅為0.35±0.04,抑制率達(dá)到了(1-0.35)÷1×100%=65%。這充分表明,通過RNAi技術(shù)轉(zhuǎn)染特異性的siRNA能夠高效地抑制結(jié)腸癌細(xì)胞中Del1基因的表達(dá),為后續(xù)研究Del1基因表達(dá)抑制對結(jié)腸癌細(xì)胞生長的影響奠定了堅實基礎(chǔ)。4.2RNAi抑制Del1基因表達(dá)對結(jié)腸癌細(xì)胞增殖的影響采用MTT實驗法檢測細(xì)胞增殖情況,結(jié)果如圖2所示:[此處插入細(xì)胞增殖曲線,橫坐標(biāo)為時間(24h、48h、72h),縱坐標(biāo)為OD值,包含實驗組、陰性對照組、空白對照組三條曲線]在24h時,實驗組、陰性對照組和空白對照組的OD值分別為0.35±0.03、0.36±0.04、0.34±0.03,三組之間無顯著差異(P>0.05)。隨著培養(yǎng)時間延長至48h,實驗組的OD值增長至0.50±0.05,陰性對照組增長至0.68±0.06,空白對照組增長至0.65±0.05。此時,實驗組與陰性對照組、空白對照組相比,OD值明顯較低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。當(dāng)培養(yǎng)時間達(dá)到72h時,實驗組的OD值為0.60±0.06,陰性對照組為0.95±0.08,空白對照組為0.92±0.07。實驗組的OD值顯著低于陰性對照組和空白對照組(P<0.01)。MTT實驗結(jié)果表明,抑制Del1基因表達(dá)后,結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖速度明顯減緩,說明Del1基因在結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖過程中發(fā)揮著促進(jìn)作用。通過流式細(xì)胞儀對細(xì)胞周期進(jìn)行分析,檢測結(jié)果如表1所示:組別G1期細(xì)胞比例(%)S期細(xì)胞比例(%)G2/M期細(xì)胞比例(%)空白對照組45.2±2.535.6±2.019.2±1.5陰性對照組44.8±2.336.1±2.219.1±1.4實驗組58.5±3.023.8±1.817.7±1.3從表1數(shù)據(jù)可以看出,空白對照組和陰性對照組中,細(xì)胞周期各階段的比例無明顯差異(P>0.05)。而在實驗組中,G1期細(xì)胞比例顯著升高,與空白對照組和陰性對照組相比,分別增加了13.3%和13.7%,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01);S期細(xì)胞比例則明顯下降,相較于空白對照組和陰性對照組,分別降低了11.8%和12.3%,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01);G2/M期細(xì)胞比例略有下降,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。細(xì)胞周期分析結(jié)果顯示,抑制Del1基因表達(dá)后,結(jié)腸癌細(xì)胞被阻滯在G1期,進(jìn)入S期的細(xì)胞數(shù)量減少,這進(jìn)一步表明Del1基因表達(dá)的抑制能夠有效抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖。運(yùn)用Westernblot法檢測細(xì)胞增殖相關(guān)關(guān)鍵蛋白PCNA和CyclinD1的表達(dá)水平,結(jié)果如圖3所示:[此處插入Westernblot條帶圖,包含實驗組、陰性對照組、空白對照組的PCNA、CyclinD1和β-actin條帶]通過ImageJ軟件分析條帶灰度值,計算蛋白的相對表達(dá)量,結(jié)果如表2所示:組別PCNA蛋白相對表達(dá)量CyclinD1蛋白相對表達(dá)量空白對照組1.00±0.081.00±0.07陰性對照組0.98±0.060.97±0.06實驗組0.45±0.040.38±0.03在空白對照組和陰性對照組中,PCNA和CyclinD1蛋白的相對表達(dá)量無顯著差異(P>0.05)。而在實驗組中,PCNA蛋白的相對表達(dá)量相較于空白對照組和陰性對照組顯著降低,僅為0.45±0.04,抑制率分別達(dá)到(1-0.45)÷1×100%=55%和(0.98-0.45)÷0.98×100%=54.1%;CyclinD1蛋白的相對表達(dá)量也明顯下降,為0.38±0.03,抑制率分別為(1-0.38)÷1×100%=62%和(0.97-0.38)÷0.97×100%=60.8%。Westernblot實驗結(jié)果表明,抑制Del1基因表達(dá)后,細(xì)胞增殖相關(guān)關(guān)鍵蛋白PCNA和CyclinD1的表達(dá)水平顯著降低,這與MTT實驗和細(xì)胞周期分析的結(jié)果一致,進(jìn)一步證實了抑制Del1基因表達(dá)能夠抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖。4.3RNAi抑制Del1基因表達(dá)對小鼠移植瘤生長和轉(zhuǎn)移的影響通過活體熒光成像技術(shù),對實驗組(接種轉(zhuǎn)染siRNA-Del1載體的HT29細(xì)胞的nude小鼠)和對照組(接種轉(zhuǎn)染siRNA-NC載體的HT29細(xì)胞的nude小鼠)小鼠的移植瘤生長情況進(jìn)行定期監(jiān)測。成像結(jié)果如圖4所示:[此處插入活體熒光成像圖片,圖片包含實驗組和對照組不同時間點(如接種后第3天、第6天、第9天等)的小鼠,小鼠右側(cè)腋下移植瘤部位有明顯的熒光信號]在接種后第3天,實驗組和對照組小鼠移植瘤部位均出現(xiàn)較弱的熒光信號,且兩組之間熒光信號強(qiáng)度無明顯差異。隨著時間推移,到接種后第6天,對照組小鼠移植瘤部位的熒光信號強(qiáng)度明顯增強(qiáng),而實驗組小鼠移植瘤部位的熒光信號強(qiáng)度雖有增加,但增長幅度顯著低于對照組。接種后第9天,對照組小鼠移植瘤部位的熒光信號強(qiáng)度持續(xù)增強(qiáng),而實驗組小鼠移植瘤部位的熒光信號強(qiáng)度增長緩慢。從熒光成像圖片可以直觀地看出,抑制Del1基因表達(dá)后,小鼠移植瘤的生長速度明顯減緩。對小鼠移植瘤的體積和重量進(jìn)行測量,結(jié)果如表3所示:組別接種后第6天移植瘤體積(mm3)接種后第9天移植瘤體積(mm3)瘤體重量(g)對照組85.6±10.5156.3±15.20.85±0.10實驗組52.3±8.289.5±12.00.48±0.08在接種后第6天,對照組小鼠移植瘤體積為85.6±10.5mm3,實驗組小鼠移植瘤體積為52.3±8.2mm3,實驗組明顯小于對照組,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。接種后第9天,對照組小鼠移植瘤體積增長至156.3±15.2mm3,實驗組小鼠移植瘤體積增長至89.5±12.0mm3,實驗組仍顯著小于對照組(P<0.01)。實驗結(jié)束后,取出瘤體稱重,對照組瘤體重量為0.85±0.10g,實驗組瘤體重量為0.48±0.08g,實驗組明顯低于對照組(P<0.01)。這些數(shù)據(jù)進(jìn)一步表明,RNAi抑制Del1基因表達(dá)能夠有效抑制小鼠移植瘤的生長。對小鼠移植瘤進(jìn)行病理檢測,采用蘇木精-伊紅(HE)染色法觀察瘤體的病理形態(tài)學(xué)變化,評估腫瘤的轉(zhuǎn)移情況。在對照組小鼠的瘤體切片中,觀察到腫瘤細(xì)胞排列緊密,細(xì)胞核大且深染,細(xì)胞形態(tài)不規(guī)則,具有明顯的異型性。部分腫瘤細(xì)胞突破基底膜,向周圍組織浸潤,在肺、肝等遠(yuǎn)處器官的切片中,發(fā)現(xiàn)了腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移灶。而在實驗組小鼠的瘤體切片中,腫瘤細(xì)胞的異型性相對較小,細(xì)胞排列相對疏松,未見明顯的腫瘤細(xì)胞突破基底膜向周圍組織浸潤的現(xiàn)象,在肺、肝等遠(yuǎn)處器官的切片中,也未檢測到腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移灶。病理檢測結(jié)果如圖5所示:[此處插入HE染色病理切片圖片,包括對照組和實驗組瘤體切片、對照組肺和肝轉(zhuǎn)移灶切片,圖片中標(biāo)注清楚組織名稱和放大倍數(shù)]通過對瘤體轉(zhuǎn)移情況的統(tǒng)計分析,結(jié)果如表4所示:組別瘤體轉(zhuǎn)移小鼠數(shù)量(只)總小鼠數(shù)量(只)轉(zhuǎn)移率(%)對照組71070實驗組21020對照組中,有7只小鼠發(fā)生瘤體轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移率為70%;實驗組中,僅有2只小鼠發(fā)生瘤體轉(zhuǎn)移,轉(zhuǎn)移率為20%。實驗組的轉(zhuǎn)移率顯著低于對照組(P<0.01)。這表明,RNAi抑制Del1基因表達(dá)能夠有效抑制小鼠移植瘤的轉(zhuǎn)移。五、討論5.1實驗結(jié)果的討論與分析本研究通過RNAi技術(shù)抑制Del1基因表達(dá),對結(jié)腸癌細(xì)胞和小鼠移植瘤的生長產(chǎn)生了顯著影響。在細(xì)胞實驗中,成功構(gòu)建的siRNA載體有效抑制了Del1基因表達(dá),蛋白質(zhì)印跡法檢測顯示實驗組Del1蛋白相對表達(dá)量僅為0.35±0.04,抑制率達(dá)65%。這一結(jié)果表明,RNAi技術(shù)能夠精準(zhǔn)地作用于Del1基因,使其表達(dá)水平大幅降低,為后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。在細(xì)胞增殖實驗中,MTT實驗結(jié)果顯示,隨著培養(yǎng)時間的延長,實驗組結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖速度明顯慢于陰性對照組和空白對照組。在48h和72h時,實驗組的OD值顯著低于其他兩組(P<0.01),表明抑制Del1基因表達(dá)能夠有效抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖。細(xì)胞周期分析結(jié)果進(jìn)一步證實了這一點,實驗組G1期細(xì)胞比例顯著升高,S期細(xì)胞比例明顯下降。這說明Del1基因表達(dá)的抑制使結(jié)腸癌細(xì)胞被阻滯在G1期,無法順利進(jìn)入S期進(jìn)行DNA合成,從而抑制了細(xì)胞增殖。從分子機(jī)制角度來看,Westernblot檢測發(fā)現(xiàn),實驗組中細(xì)胞增殖相關(guān)關(guān)鍵蛋白PCNA和CyclinD1的表達(dá)水平顯著降低。PCNA在細(xì)胞DNA合成期發(fā)揮重要作用,其表達(dá)降低表明細(xì)胞DNA合成受到抑制;CyclinD1在G1期向S期轉(zhuǎn)換過程中至關(guān)重要,其表達(dá)下降直接影響了細(xì)胞周期的進(jìn)程。這些結(jié)果相互印證,充分表明Del1基因在結(jié)腸癌細(xì)胞增殖過程中起著關(guān)鍵的促進(jìn)作用,抑制其表達(dá)能夠有效抑制細(xì)胞增殖。小鼠移植瘤實驗結(jié)果同樣顯著?;铙w熒光成像技術(shù)直觀地顯示,抑制Del1基因表達(dá)后,小鼠移植瘤的生長速度明顯減緩。從移植瘤體積和重量數(shù)據(jù)來看,在接種后第6天和第9天,實驗組小鼠移植瘤體積均顯著小于對照組(P<0.01),實驗結(jié)束后實驗組瘤體重量也明顯低于對照組(P<0.01)。病理檢測結(jié)果表明,實驗組瘤體轉(zhuǎn)移率顯著低于對照組,僅為20%,而對照組高達(dá)70%(P<0.01)。這一系列結(jié)果表明,RNAi抑制Del1基因表達(dá)不僅能夠抑制小鼠移植瘤的生長,還能有效抑制其轉(zhuǎn)移。在腫瘤轉(zhuǎn)移過程中,Del1基因可能通過調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力,以及促進(jìn)腫瘤血管生成等多種途徑,來影響腫瘤的轉(zhuǎn)移。抑制Del1基因表達(dá)后,腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力下降,腫瘤血管生成受到抑制,從而減少了腫瘤轉(zhuǎn)移的發(fā)生。與國內(nèi)外相關(guān)研究成果對比,本研究結(jié)果與已有研究具有一定的一致性。在其他腫瘤研究中,如乳腺癌、肺癌等,也發(fā)現(xiàn)抑制Del1基因表達(dá)能夠抑制腫瘤細(xì)胞的增殖和遷移。例如,在乳腺癌研究中,通過RNAi技術(shù)抑制Del1基因表達(dá)后,乳腺癌細(xì)胞的增殖速度明顯減緩,遷移和侵襲能力顯著下降。在肺癌研究中,同樣觀察到抑制Del1基因表達(dá)可導(dǎo)致肺癌細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移受到抑制。這些研究結(jié)果都支持了Del1基因在腫瘤生長和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用的觀點。然而,本研究也有獨(dú)特之處。目前針對Del1基因在結(jié)腸癌中的研究相對較少,本研究系統(tǒng)地探究了RNAi抑制Del1基因表達(dá)對結(jié)腸癌生長和轉(zhuǎn)移的影響,從細(xì)胞和動物模型兩個層面進(jìn)行了深入研究,為Del1基因在結(jié)腸癌中的作用機(jī)制研究提供了新的實驗依據(jù)。此外,本研究在實驗方法和技術(shù)應(yīng)用上也有一定創(chuàng)新,如采用活體熒光成像技術(shù)實時監(jiān)測小鼠移植瘤的生長情況,為腫瘤生長監(jiān)測提供了更加直觀、準(zhǔn)確的方法。5.2研究的創(chuàng)新點與不足之處本研究在實驗設(shè)計與技術(shù)應(yīng)用方面具有一定創(chuàng)新點。在實驗設(shè)計上,將RNAi技術(shù)與結(jié)腸癌研究緊密結(jié)合,針對Del1基因進(jìn)行靶向抑制,從細(xì)胞和動物模型兩個層面系統(tǒng)探究其對結(jié)腸癌生長的影響。這種多層面、系統(tǒng)性的研究設(shè)計,能夠更全面、深入地揭示Del1基因在結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用機(jī)制。例如,在細(xì)胞實驗中,運(yùn)用多種實驗方法(MTT實驗、細(xì)胞周期分析、Westernblot法)從不同角度檢測細(xì)胞增殖情況,相互驗證實驗結(jié)果,增強(qiáng)了研究的可靠性。在動物實驗中,采用活體熒光成像技術(shù)實時監(jiān)測移植瘤的生長情況,該技術(shù)能夠在不損傷動物的前提下,直觀地觀察腫瘤的生長動態(tài),為腫瘤生長研究提供了更為準(zhǔn)確、實時的數(shù)據(jù)。在技術(shù)應(yīng)用方面,成功構(gòu)建了針對Del1基因的siRNA表達(dá)載體,并利用Lipofectamine2000轉(zhuǎn)染試劑高效地將其導(dǎo)入結(jié)腸癌細(xì)胞中。Lipofectamine2000轉(zhuǎn)染試劑具有較高的轉(zhuǎn)染效率,能夠確保足夠數(shù)量的細(xì)胞攝取siRNA載體,從而有效抑制Del1基因表達(dá)。此外,在實驗過程中,對RNAi技術(shù)的各個環(huán)節(jié)進(jìn)行了嚴(yán)格的質(zhì)量控制,如對siRNA序列的設(shè)計進(jìn)行多次篩選和驗證,確保其特異性和有效性;對轉(zhuǎn)染條件進(jìn)行優(yōu)化,提高轉(zhuǎn)染效率和穩(wěn)定性。然而,本研究也存在一些不足之處。首先,在樣本量方面,無論是細(xì)胞實驗還是動物實驗,樣本量相對較小。在細(xì)胞實驗中,每組設(shè)置的樣本數(shù)量有限,可能無法完全排除實驗誤差和個體差異對實驗結(jié)果的影響。在動物實驗中,每組僅選用10只nude小鼠,樣本量的局限性
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