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文檔簡介
ICS65.020.30
CCSB44
44
廣東省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB44/T2338—2021
實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原核酸液相芯片法定性分析
LaboratoryanimalsQualitativeanalysisofpathogennucleicacidswithsuspension
arraymethod
2021-10-18發(fā)布2022-01-18實(shí)施
廣東省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB44/T2338—2021
目次
前言.................................................................................II
1范圍...............................................................................1
2規(guī)范性引用文件.....................................................................1
3術(shù)語和定義.........................................................................1
4縮略語.............................................................................1
5原理...............................................................................2
6主要設(shè)備和材料.....................................................................2
7試劑...............................................................................2
8方法...............................................................................3
9結(jié)果...............................................................................6
10防止交叉污染的措施................................................................7
附錄A(規(guī)范性)溶液的配制...........................................................8
附錄B(資料性)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原液相基因芯片引物.........................................9
I
DB44/T2338—2021
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。
本文件由廣東省科學(xué)技術(shù)廳提出并組織實(shí)施。
本文件由廣東省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(GD/TC93)歸口。
本文件起草單位:廣東省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物監(jiān)測所。
本文件主要起草人:黃韌、袁文、王靜、徐鳳姣、朱余軍,伍妙梨、黃碧洪、羅銀珠、何麗芳、閔
凡貴、叢峰、張鈺、郭鵬舉。
II
DB44/T2338—2021
實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原核酸液相芯片法定性分析
1范圍
本文件規(guī)定了實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原核酸的液相芯片定性分析方法。
本文件適用于基于液相芯片方法的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原核酸的定性分析。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T19495.2轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要求
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
液相芯片技術(shù)suspensionarraytechnology
液相芯片技術(shù)又被稱為懸浮陣列、流式熒光術(shù)、xMAP技術(shù)等。它是在不同熒光編碼的微球上進(jìn)行抗
原-抗體、酶-底物、配體-受體的結(jié)合反應(yīng)及核酸雜交反應(yīng),通過紅、綠兩束激光分別識(shí)別微球編碼和
報(bào)告熒光來達(dá)到定性和定量的目的,一個(gè)反應(yīng)孔內(nèi)可以完成多達(dá)100種不同的生物學(xué)反應(yīng),是繼基因芯
片、蛋白芯片之后的新一代高通量多分子分析技術(shù)平臺(tái)。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
cDNA互補(bǔ)DNA(complementaryDNA)
CPE細(xì)胞病變效應(yīng)(cytopathiceffect)
DEPC焦碳酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)
DNA脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)
MFI中位熒光強(qiáng)度值(medianfluorescenceintensity)
PBS磷酸鹽緩沖液(phosphatebufferedsaline)
PCR聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerasechainreaction)
RNA核糖核酸(ribonucleicacid)
SA-PE鏈霉親和素-藻紅蛋白(streptavidinR-phycoerythrin)
xMAP多分子分析技術(shù)(flexiblemulti-analyteprofilingtechnology)
1
DB44/T2338—2021
5原理
本文件方法的核酸擴(kuò)增原理是基于每種病原微生物都可通過特異性的PCR引物來進(jìn)行核酸擴(kuò)增,在
每種特定目的片段的擴(kuò)增引物5′端與對(duì)應(yīng)的標(biāo)簽(TAG)序列的3′端通過間臂連接,另一條原始引物
的5′端添加生物素標(biāo)記;這樣所擴(kuò)增的基因片段既帶有TAG標(biāo)簽,也帶有生物素標(biāo)記,以供后期的液相
芯片特異性識(shí)別目標(biāo)分子。
本文件方法的液相芯片檢測原理是采用2種熒光染料對(duì)直徑約為5.6μmol/L帶磁性聚苯乙烯小球
(以下簡稱微球)進(jìn)行著色,通過不同混合比例產(chǎn)生100種不同配比的顏色,每一種顏色賦予唯一編碼,
通過編碼識(shí)別染色的微球。這些熒光微球表面帶有羧基基團(tuán)(如羧基、親和素和組氨酸等)可共鍵結(jié)合
(或稱偶聯(lián))不同類型的探針(如抗原、抗體、寡核苷酸探針等),形成帶標(biāo)記的熒光微球。待測樣本
(如蛋白、核酸等)以生物素標(biāo)記,再與結(jié)合了探針的熒光微球進(jìn)行特異性結(jié)合反應(yīng),生物素標(biāo)記與添
加到反應(yīng)體系中的以PE熒光染料標(biāo)記的鏈霉親和素(Streptavidin)或稱SA-PE發(fā)生連接可實(shí)現(xiàn)熒光信
號(hào)的放大。因此,整個(gè)反應(yīng)結(jié)束后形成的陽性復(fù)合物可檢測到微球的熒光和SA-PE的熒光信號(hào)。液相芯
片檢測儀工作時(shí),上述復(fù)合物在液流系統(tǒng)中快速通過,第一束紅色激光識(shí)別微球染料和編碼,第二束綠
色激光讀取SA-PE熒光信號(hào)的強(qiáng)弱,儀器將獲取到的兩種光信號(hào)進(jìn)行快速處理并形成數(shù)字信號(hào),經(jīng)軟件
分析后計(jì)算得到每一種待測樣本的含量。因此,液相芯片技術(shù)是集流式細(xì)胞技術(shù)、熒光標(biāo)記微球、激光、
數(shù)字信號(hào)處理和傳統(tǒng)的生化技術(shù)于一體,可以實(shí)現(xiàn)快速高通量多分子定性及定量分析的技術(shù)。
6主要設(shè)備和材料
液相芯片檢測儀。
PCR儀。
全自動(dòng)核酸提取儀。
超聲波儀。
高速冷凍離心機(jī)。
普通離心機(jī)。
漩渦振蕩器。
組織勻漿器。
生物安全柜。
PCR超凈工作臺(tái)。
冰箱(-20℃)。
微量移液器(0.1μL~2μL,1μL~10μL,10μL~100μL,100μL~1000μL)。
滅菌離心管(1.5mL、2mL、5mL、15mL),滅菌吸頭(10μL,200μL,1mL),滅菌PCR擴(kuò)
增反應(yīng)管(0.2mL,八連管或96孔板)。聚乙烯薄膜袋:90mm×150mm自封袋,使用前紫外滅菌20
min。
采樣工具:剪刀、鑷子和滅菌棉拭子等。
7試劑
以下所用的試劑除特別注明者外均為分析純,實(shí)驗(yàn)用水為雙蒸水或去離子水,應(yīng)符合GB/T6682
所規(guī)定一級(jí)水的要求。所有涉及分子生物學(xué)操作的水均為無DNA酶、無RNA酶水。
2
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表面帶有羧基的特定編碼微球(濃度為1.25×107beads/mL)。
滅菌PBS。配制方法見附錄A。
PCR用水:經(jīng)DEPC處理的水或商品無DNA酶、無RNA酶水,見附錄A。
核酸抽提試劑:推薦針對(duì)不同的樣本基質(zhì)類型和不同病原微生物的核酸類型選取不同的基
因組提取試劑盒。
反轉(zhuǎn)錄試劑:PrimeScriptRTreagentKit或其他類似產(chǎn)品。
注:PrimeScriptRTreagentKit是本文件中適合的市售產(chǎn)品的使用實(shí)例,給出這一信息是為了方便本文件使用
者,并不表示對(duì)這一產(chǎn)品的認(rèn)可。亦可使用其他類似試劑。
PCR試劑:QIAGENMultiplexPCRPlusKit或其他類似產(chǎn)品。
注:QIAGENMultiplexPCRPlusKit是本文件中適合的市售產(chǎn)品的使用實(shí)例,給出這一信息是為了方便本文件使
用者,并不表示對(duì)這一產(chǎn)品的認(rèn)可。亦可使用其他類似試劑。
SA-PE反應(yīng)液(1mg/mL)。
1×TM雜交緩沖液,配制見附錄A。
引物:各病原微生物特異性正向引物的5′端與對(duì)應(yīng)的TAG序列的3′端通過間臂(Spacer)連
接修飾,特異性反向引物5′端標(biāo)記生物素(biotin),所有的引物合成后均需要進(jìn)行色譜級(jí)(HPLC)
純化。
8方法
生物安全措施
對(duì)于可能潛在人獸共患病的樣本,應(yīng)在生物安全二級(jí)及以上實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行操作,采樣應(yīng)在生物安全柜
中進(jìn)行。采樣結(jié)束,動(dòng)物尸體及采樣器材應(yīng)高壓滅菌后處理。實(shí)驗(yàn)操作及處理按照GB19489的規(guī)定,由
具備相關(guān)資質(zhì)的工作人員進(jìn)行相應(yīng)操作。
采樣及樣本的處理
采樣過程中樣本不得交叉污染,采樣及樣本前處理過程中須戴一次性手套。采樣及樣本處理過程操
作人員應(yīng)做好個(gè)人防護(hù)。
8.2.1臟器組織
剖檢,無菌采集動(dòng)物臟器組織,剪取待檢樣本0.5g~2.0g于無菌離心管,加入5倍體積滅菌PBS,
使用勻漿器充分勻漿1min~2min,然后將組織懸液在4℃,5000g離心10min,取上清液轉(zhuǎn)入另一
無菌離心管中,編號(hào)備用。
8.2.2盲腸內(nèi)容物或糞便
無菌采集動(dòng)物盲腸內(nèi)容物或糞便,取待檢樣本1.0g~2.0g于無菌5mL離心管,加入5倍體積滅菌
PBS,使用勻漿器充分勻漿1min~2min,8000g離心5min,取上清液轉(zhuǎn)入另一無菌5mL離心管中,
編號(hào)備用。
8.2.3血液樣本
無菌采集動(dòng)物血液0.2mL~0.5mL,加入檸檬酸鈉或EDTA抗凝管中,輕輕顛倒混勻3次~5次,編號(hào)
備用。
3
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8.2.4拭子取樣
對(duì)活體動(dòng)物取樣可采集肛拭子、咽喉拭子、泄殖腔拭子、鼻拭子、皮膚拭子等,浸泡3mL無菌PBS
中,5min~10min,充分混勻后,4℃,8000g離心5min,取上清液轉(zhuǎn)入另一無菌5mL離心管中,
編號(hào)備用。
8.2.5細(xì)胞培養(yǎng)物
應(yīng)通過以下任一方法取樣:
——直接刮取樣本接種后出現(xiàn)CPE或可疑的細(xì)胞培養(yǎng)物于15mL離心管中,1500g離心5
min,棄上清,加1mL滅菌PBS重懸細(xì)胞,然后將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到無菌1.5mL離心管中,
編號(hào)備用;
——將樣本接種后出現(xiàn)CPE或可疑的細(xì)胞培養(yǎng)物反復(fù)凍融3次,細(xì)胞混懸液轉(zhuǎn)移于15mL離心管
中,8000g離心5min,去細(xì)胞碎片,上清液轉(zhuǎn)移到無菌15mL離心管中,編號(hào)備用。
8.2.6細(xì)菌分離培養(yǎng)物
經(jīng)選擇性培養(yǎng)基培養(yǎng)的固體菌落或液體培養(yǎng)物,或待鑒定的純化培養(yǎng)物,取適量樣本裝于無菌1.5
mL離心管中,編號(hào)備用。
8.2.7飼料、墊料和飲水
飼料、墊料:取約5g~10g飼料和墊料置于50mL無菌離心管中,加入3倍體積滅菌PBS(飼料和墊
料需全部浸泡于液體中)。密封后浸泡5min~10min,充分混勻,將混懸液轉(zhuǎn)移至15mL無菌離心管,
4℃,8000g離心5min,取上清液轉(zhuǎn)入另一無菌5mL離心管中,編號(hào)備用。
飲水:取200μL~1000μL實(shí)驗(yàn)動(dòng)物飲水直接轉(zhuǎn)移到無菌1.5mL離心管中,編號(hào)備用。
8.2.8設(shè)施設(shè)備
用滅菌棉拭子拭取實(shí)驗(yàn)動(dòng)物設(shè)施設(shè)備出風(fēng)口初效濾膜表面約5cm2沉積物,將拭子置入滅菌15mL離
心管,加入3mL滅菌PBS,浸泡5min~10min,充分混勻,取出棉拭子,將離心管于4℃,8000g離
心5min,取上清液轉(zhuǎn)入另一無菌5mL離心管中,編號(hào)備用。
8.2.9樣本的存放
采集或處理的樣本在2℃~8℃條件下保存應(yīng)不超過24h,若需長期保存,須放置于-80℃冰箱,
但應(yīng)避免反復(fù)凍融。
8.2.10采樣廢棄物處理
采樣結(jié)束,動(dòng)物尸體應(yīng)使用生物安全垃圾袋包裝完整,高壓滅菌后交由醫(yī)療垃圾處理單位進(jìn)行處理,
采樣器材應(yīng)使用消毒液浸泡或高壓滅菌消毒,并做好實(shí)驗(yàn)臺(tái)面及采樣室的消毒。
樣本核酸提取
8.3.1在核酸提取區(qū)操作,采用DNA或RNA提取商業(yè)試劑盒或其他類似試劑盒。
8.3.2取n個(gè)滅菌的1.5mL離心管,其中n為待檢樣品數(shù)+陽性對(duì)照+陰性對(duì)照,對(duì)每個(gè)離心管進(jìn)行
編號(hào),按試劑盒操作說明書進(jìn)行。
8.3.3提取好的DNA在2℃~8℃冰箱可保存一月,-20℃冰柜可穩(wěn)定保存兩年;提取好的RNA應(yīng)盡
4
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快進(jìn)行下一步PCR反應(yīng),若暫時(shí)不能進(jìn)行PCR反應(yīng),應(yīng)于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
核酸擴(kuò)增
8.4.1反轉(zhuǎn)錄(可選)
根據(jù)不同病原微生物的核酸類型選擇是否進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,DNA病毒和病原菌可直接進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
在PCR溶液配制區(qū)操作,RNA反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系見表1。反應(yīng)液的配制在冰上操作,反應(yīng)條件為37℃
25min;85℃5s。反應(yīng)產(chǎn)物即為cDNA,立即進(jìn)行下一步PCR反應(yīng),若不能立即進(jìn)行PCR,cDNA保存溫
度不能低于-20℃。長時(shí)間保藏應(yīng)置于-80℃冰箱。10μL反應(yīng)體系可最大使用500ng的TotalRNA。
表1RNA反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系
反應(yīng)組份用量/μL終濃度
5×PrimeScriptBuffer21×
PrimeScriptRTEnzymeMixI0.5
OliogdTPrimer(50μmol/L)0.525pmol
RandomPrimer6mers(100μmol/L)0.550pmol
RNA模板5
PCR用水1.5
總體積10
注:可使用其他類似的反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行,反應(yīng)體系和反應(yīng)參數(shù)可做相應(yīng)調(diào)整。
8.4.2PCR
8.4.2.1PCR反應(yīng)體系
PCR反應(yīng)體系見表2。反應(yīng)液的配制在冰浴上操作,每次反應(yīng)同時(shí)設(shè)計(jì)陽性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)
照,其中陽性對(duì)照以含有目的病原微生物的組織或培養(yǎng)物提取的核酸作為陽性對(duì)照模板,其中陰性對(duì)照
以不含有目的病原微生物(可以是正常動(dòng)物組織或正常培養(yǎng)物)作為陰性對(duì)照模板,空白對(duì)照即為不加
模板對(duì)照(NoTemplateControl,NTC),即在反應(yīng)中用水來代替模板。
表2PCR反應(yīng)體系配制表
反應(yīng)組份用量/μL終濃度
2×buffer101×
引物組合物混合液(10μmol/L)2200nmol/L
DNA/cDNA模板4
PCR用水4
總體積20
8.4.2.2PCR反應(yīng)參數(shù)
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PCR反應(yīng)參數(shù)見表3。
表3PCR反應(yīng)參數(shù)
步驟溫度時(shí)間循環(huán)數(shù)
預(yù)變性95℃2min1
變性95℃30s
退火60℃90s35
延伸72℃30s
延伸72℃10min1
注:可使用其他類似的一步法或兩步法RT-PCR試劑盒進(jìn)行,反應(yīng)體系和反應(yīng)參數(shù)可做相應(yīng)調(diào)整。
PCR產(chǎn)物雜交
8.5.1所有試劑恢復(fù)到室溫,所有的操作均應(yīng)避光,可選用不透明離心管或用鋁鉑膜包裹遮光的離心
管進(jìn)行操作。
8.5.2取出裝有偶聯(lián)好探針微球的貯存管,于旋渦震蕩器上震蕩,再用40khz超聲波儀處理20s,
使微球充分分散。
8.5.3熒光編碼微球工作液的制備:將2500個(gè)/μL熒光編碼微球用1×TmHybrdizationBuffer稀
釋到1μL約含有125個(gè)/種熒光編碼微球。
8.5.4SA-PE工作液制備:將1mg/mLSA-PE用1×TmHybrdizationBuffer稀釋到10μg/μL。
8.5.5充分重懸熒光編碼微球工作液,每個(gè)樣品孔和對(duì)照孔加入微球工作液20μL,隨后樣品孔中加
入5μLPCR產(chǎn)物,對(duì)照孔中也分別加入5μLPCR陽性對(duì)照、陰性對(duì)照和空白對(duì)照產(chǎn)物,最后加入75
μL的SA-PE工作液,充分混勻,于金屬加熱器中37℃~45℃孵育25min~45min。
液相芯片檢測儀讀取熒光
8.6.1在PCR擴(kuò)增進(jìn)行時(shí),打開液相芯片檢測所有相關(guān)儀器,并將儀器的上樣加熱底板預(yù)先加熱至
45℃。
8.6.2按照液相芯片檢測儀操作說明書,進(jìn)行各個(gè)參數(shù)的設(shè)置。
8.6.3每個(gè)樣品上機(jī)時(shí),應(yīng)同時(shí)選擇特定編碼微球,并填寫每種熒光微球?qū)?yīng)病原微生物名稱。
8.6.4檢測體積為75μL,流速為快速,每種熒光微球設(shè)置計(jì)數(shù)為至少50個(gè),計(jì)數(shù)時(shí)間為60s。
8.6.5取出雜交好的待檢樣本放入液相芯片檢測儀,并在軟件界面進(jìn)行相應(yīng)的標(biāo)注。開啟檢測。
8.6.6同一批樣品建議在30min內(nèi)讀取數(shù)據(jù)完畢。
9結(jié)果
數(shù)據(jù)有效性分析
每種特定編碼微球個(gè)數(shù)不少于50個(gè),空白對(duì)照熒光強(qiáng)度不高于100,陰性對(duì)照熒光強(qiáng)度不高于200,
陽性對(duì)照與自身對(duì)應(yīng)寡核苷酸探針特異性雜交熒光強(qiáng)度高于空白對(duì)照五倍以上。
結(jié)果計(jì)算
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液相芯片定性比值結(jié)果(Luminexqualitativeratioresult,LQRR)等于樣品校正后的熒光強(qiáng)度
中位值(Medianflorescenceintensity,MFI)與空白對(duì)照MFI的平均值(MFIB)的比值,見公式(1)。
LQRR=MFI/MFIB········································································(1)
式中:
LQRR———液相芯片定性比值;
MFI———檢測樣品熒光強(qiáng)度中位值;
MFIB———空白對(duì)照熒光強(qiáng)度中位值。
儀器檢測后,自帶的數(shù)據(jù)分析軟件自動(dòng)按上述公式進(jìn)行計(jì)算,直接輸出結(jié)果。
結(jié)果分析與定性判定
9.3.1關(guān)聯(lián)某種病原微生物的特定編碼微球在液相芯片檢測儀中獲得的數(shù)值如LQRR≥3,判定該樣本
為該種病原微生物核酸檢測結(jié)果陽性。
9.3.2關(guān)聯(lián)某種病原微生物的特定編碼微球在液相芯片檢測儀中獲得的數(shù)值如LQRR<2,判定該樣本為
該種病原微生物核酸檢測結(jié)果陰性。
9.3.3關(guān)聯(lián)某種病原微生物的特定編碼微球在液相芯片檢測儀中獲得的數(shù)值如2≤LQRR<3,判定該樣
本為該種病原微生物核酸檢測結(jié)果可疑??梢蓸悠窇?yīng)重新進(jìn)行試驗(yàn),如結(jié)果值仍介于此區(qū)間,則判定為
陰性。
10防止交叉污染的措施
按照GB/T19495.2中的要求執(zhí)行。
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A
A
附錄A
(規(guī)范性)
溶液的配制
A.10.02mol/LpH7.2磷酸鹽緩沖液(PBS)的配制
A.1.1A液
0.2mol/L磷酸二氫鈉溶液:稱取磷酸二氫鈉(NaH2PO4?H20)27.6g,先加適量去離子水溶解,最
后定容至1000mL,混勻。
A.1.2B液
0.2mol/L磷酸氫二鈉溶液:稱取磷酸氫二鈉NaH2PO4·7H2O53.6g(或Na2HPO4·12H2O71.6g或
Na2HPO4·2H2O35.6g),先加適量去離子水溶解,最后定容至1000mL,混勻。
A.1.30.02mol/LpH7.2磷酸鹽緩沖液(PBS)的配制
取A液14mL,B液36mL,加氯化鈉(NaCl)8.5g,加800mL無離子水溶解稀釋,用HCl調(diào)pH至7.2,
最后定容至1000mL,經(jīng)121℃高壓滅菌15min,冷卻備用。
A.2無RNase去離子水的配制
實(shí)驗(yàn)用去離子水按體積比0.1%加入DEPC搖勻,室溫靜置過夜,121℃高壓滅菌15min,冷卻備用。
A.31×TM雜交緩沖液
NaCl0.2mol/L
Tris0.1mol/L
TritonX-1000.08%
調(diào)pH至8.0過濾除菌,4℃保存?zhèn)溆谩?/p>
8
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B
B
附錄B
(資料性)
實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病原液相基因芯片引物
針對(duì)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物大、小鼠、猴、兔、禽類病原保守核酸序列設(shè)計(jì)液相基因芯片特異引物組合。
表B.1大小鼠病原液相基因芯片引物列表
病原序列(5′-3′)
小鼠腦脊髓炎病毒TTAAACAATCTACTATTCAATCAC-spacer18-GATCTAAGTYAACCGACTCC
(TMEV)Bio-GAAGGAAGGGGCAACACATA
小鼠肝炎病毒CACTTAATTCATTCTAAATCTATC-spacer18-TGGMATCCTCAAGAAGACCACTT
(MHV)Bio-ATGCCMGAAAACCARGAGTAATG
小鼠諾如病毒TACTTCTTTACTACAATTTACAAC-spacer18-TCTGTYCTGCGCTGGGTGC
(MNV)Bio-GCTGCGCCATCACTCATCC
呼腸孤病毒III型CACTACACATTTATCATAACAAAT-spacer18-CCTCGCCTACGTGAAGAAGT
(REO3)Bio-CATCATCGAGTCCCTGGGTG
小鼠細(xì)小病毒MVM株TACTACTTCTATAACTCACTTAAA-spacer18-TTGTTCCACCACCACTAAATG
(MVM)Bio-GGTTTGTGTTCAAGATCTAGTTC
小鼠細(xì)小病毒MPV株ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-spacer18-CACCAGCAACAGACAACCAA
(MVM)Bio-TGAATGCGTTGAGTGTTCTC
淋巴細(xì)胞脈絡(luò)叢腦膜炎AATAACAACTCACTATATCATAAC-spacer18-GAGTCCAGAAGCTTTCTGATGTCAT
病毒(LCMV)
Bio-CAAGTATTCACACGGCATGGAT
漢坦病毒ATACTTTACAAACAAATAACACAC-spacer18-GGACACAATCAATGGGGATACAAC
(HV)
Bio-CCATATCATCCCCTAAGTGGAA
仙臺(tái)病毒CTAAACATACAAATACACATTTCA–spacer18-CCCAGCCATATACTCAGTCGTGCT
(SV)
Bio-TCCACAACTTTTGTGACAGGACAC
小鼠肺炎病毒ATCTCAATTACAATAACACACAAA-spacer18-GATCACAGAGCCCGTCAAAAT
(PVM)
Bio-CATATAACATCCAATACGAGTTTGAA
小鼠流行性腹瀉病毒AATAACAACTCACTATATCATAAC-spacer18-ATCAAGCACGATTTGGAAC
(EDIM)
Bio-GATTCAGTTCGCAATGTAAGTCC
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表B.1大小鼠病原液相基因芯片引物列表(續(xù))
病原序列(5′-3′)
肺支原體TACTTCTTTACTACAATTTACAAC-spacer18-AGCGTTTGCTTCACTTTGAA
(Mpul)
Bio-GGGCATTTCCTCCCTAAGCT
鼠痘病毒CACTTAATTCATTCTAAATCTATC-spacer18-TACGGTGTATATGGCTACTCA
(ECT)
Bio-ACTGCTGCTTCCTATACTCG
小鼠腺病毒TTAAACAATCTACTATTCAATCAC-spacer18-AGACTCACACTGCGTATAGTCC
(MAD)
Bio-CCAGAACTCGGTTATCCCCA
小鼠巨細(xì)胞病毒CTTAAACTCTACTTACTTCTAATT-spacer18-GCCCTCTTCATCCCTTACCT
(MCMV)
Bio-GACCTCCATGTCCTTCATGC
多瘤病毒ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-spacer18-CCATGCTCCCTTCTATGCGAT
(POlY)
Bio-TCAGTCAGCCATAGATGCAA
大鼠冠狀病毒CACTTAATTCATTCTAAATCTATC-spacer18-TGGMATCCTCAAGAAGACCACTT
(RCV)
Bio-ATGCCMGAAAACCARGAGTAATG
大鼠泰勒病毒ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-spacer18-GGAAACTTAGAGCAGACATCG
(RTV)
Bio-TCCACAGAGAACAACCATCG
大鼠細(xì)小病毒RMV株TACTTCTTTACTACAATTTACAAC-Spacer18-ACACCATGCCAACTGCAGATG
(RMV)
Bio-ATTGTTCACTCCCTGTGTTTGTGTT
大鼠細(xì)小病毒RRV株AATAACAACTCACTATATCATAAC-Spacer18-GATGATAAGCGGTTCAGGG
(RPV)
Bio-AAGAGCTCCGGTATCTCTGTC
大鼠細(xì)小病毒H-1株CTAAACATACAAATACACATTTCA-Spacer18-CTCTAGCAACTCTGCTGAAG
(H1)
Bio-CAGTTATTCCTTGGAGGCAT
大鼠細(xì)小病毒KRV株ATTAAACAACTCTTAACTACACAA-Spacer18-AACCAGACGCTGGAATCGCTAA
(KRV)
Bio-TGTAGCAGTCTAGATGCATGA
ICATTAAACAACTCTTAACTACACAA-spacer18-CGCAGAATCGCAAATACAC
(內(nèi)標(biāo)基因)Bio-TAACAATAAGCTCGCAGTCG
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表B.2兔病原液相基因芯片引物列表
病原序列(5′-3′)
兔出血熱病毒CTTAAACTCTACTTACTTCTAATT-spacer18-CTCTCCACAAAATAACCCATTCACA
(RHDV)
Bio-CCAACCCTGGTCCAATCTCG
兔輪狀病毒TACTACTTCTATAACTCACTTAAA-spacer18-ATGGTTCGCTTGTGTCTTAGTTG
(RRV)
Bio-ATGCGTTGGGTGTAGTTCCTGTA
仙臺(tái)病毒CTAAACATACAAATACACATTTCA-spacer18-TGACAACAAACGGAGTAAACGC
(SV)
ACCATAGGTCCAAACAGCCATTC
表B.3猴病原液相基因芯片引物列表
病原序列(5′-3′)
猴免疫缺陷病毒CACTTAATTCATTCTAAATCTATC-spacer18-ACGACCCGGCGGAAAGAAAAAGT
(SIV)Bio-TGCACCAGATGACGCAGACAGT
猴T細(xì)胞淋巴白血病病毒TTAAACAATCTACTATTCAATCAC-spacer18-GTGCCAATCATGGACCTGCC
(STLV)Bio-TCCTGGAGCGTCGATTAGAAGG
猴逆轉(zhuǎn)錄病毒ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-spacer18-AYGGGGCTACTGCYCCATA
(SRV)Bio-GCCATTACCKGCYTGTTGATT
表B.4禽病原液相基因芯片引物列表
病原序列(5′-3′)
禽流感病毒TACTACTTCTATAACTCACTTAAA-spacer18-ATGAGTCTTCTACCCGAGG
(AIV)
Bio-TCAGAGGTGACAGGATTG
新城疫病毒ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-spacer18-CTCATCTCAGACAGGGTCAATC
(NDV)
Bio-ATGGAGTCACCAAGGGG
傳染性支氣管炎病毒ATTAAACAACTCTTAACTACACAA-spacer18-AATCACGCTCAAGTTCAAGGC
(IBV)
Bio-GCATTGTTCCTCTCCTCATC
傳染性喉氣管病毒ATCTCAATTACAATAACACACAAA-spacer18-GCAGCGAAAAGAAGGC
(ILTV)
Bio-TCATCGTGCTCGGTGTCC
雞毒支原體CACTACACATTTATCATAACAAAT-spacer18-ATCTAAAACCGTGTTGCTAA
(MG)
Bio-AGGAGGTAATCCACCCCCA
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表B.4禽病原液相基因芯片引物列表(續(xù))
病原序列(5′-3′)
滑液囊支原體CTTTCTTAATACATTACAACATAC-spacer18-CCTTTTAGACTGGAATAACGGT
(MS)
Bio-GCTAATGTTCCGCACCC
雞傳染性貧血病毒ATACTTTACAAACAAATAACACAC-spacer18-GCTCTC
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