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文檔簡(jiǎn)介
1、醫(yī)學(xué)研究數(shù)據(jù)管理與統(tǒng)計(jì)分析Data management & analysis,1,高等課堂,搜集資料,整理與分析資料,調(diào)查(研究)項(xiàng)目,分析表(指標(biāo),研究目的,回答,統(tǒng)計(jì)分析步驟,調(diào)查研究步驟,研究設(shè)計(jì)思路與數(shù)據(jù)管理分析步驟,解釋、呈現(xiàn)結(jié)果,2,高等課堂,確定調(diào)查和研究的目的是選定研究指標(biāo)的依據(jù) 研究指標(biāo)又是研究目的的具體體現(xiàn),一、明確調(diào)查和研究的目的,了解參數(shù),用以說明總體。 研究變量間的關(guān)系,通過確立統(tǒng)計(jì)學(xué)聯(lián)系來 探索病因或驗(yàn)證療效等。,3,高等課堂,二、確定研究對(duì)象和觀察單位,研究對(duì)象:對(duì)象來源總體是什么? 抽樣方法:如何抽樣?代表性? 觀察單位:個(gè)體?群體,4,高等課堂,三、研究設(shè)計(jì)
2、類型的選擇,根據(jù)研究目的選擇合適的設(shè)計(jì)類型: 描述疾病的或健康狀況的三間分布 探討病因 驗(yàn)證預(yù)防和控制措施的效果 評(píng)價(jià)疫苗的效果 新藥上市前臨床試驗(yàn),5,高等課堂,6,高等課堂,四、確定研究項(xiàng)目,擬定調(diào)查表(問卷,調(diào)查和研究項(xiàng)目的確定:分析項(xiàng)目、備選項(xiàng)目 調(diào)查表和原始數(shù)據(jù)記錄表的設(shè)計(jì),7,高等課堂,根據(jù)研究設(shè)計(jì)類型確定所需樣本量計(jì)算公式。 相關(guān)參數(shù): 一類錯(cuò)誤的概率:即檢驗(yàn)水準(zhǔn),越小所需樣本含量越多,對(duì)于相同的檢驗(yàn)水準(zhǔn),雙側(cè)檢驗(yàn)比單側(cè)檢驗(yàn)所需的樣本含量更大,通常取0.05。 把握度(power) 1-,一般0.8-0.9 單側(cè)檢驗(yàn)還是雙側(cè)檢驗(yàn),單側(cè)檢驗(yàn)所需樣本量小,雙側(cè)檢驗(yàn)所需樣本量大,五、樣
3、本含量的估計(jì),8,高等課堂,常用樣本含量的估計(jì)軟件:EpiCalc 2000,9,高等課堂,常用軟件:EPI INFO,10,高等課堂,常用軟件:OPENEPI,11,高等課堂,直接觀察法 采訪法 包括面訪、調(diào)查會(huì)及信訪、電話訪問等,六、原始資料的收集,原始資料的收集方式,12,高等課堂,七、調(diào)查和研究的質(zhì)量控制,真實(shí)性(效度) 可靠性(信度,偏倚及其如何控制,如何評(píng)價(jià),13,高等課堂,錄入前的核對(duì) 錄入計(jì)算機(jī),建立數(shù)據(jù)庫(kù)(database) Excel、Access、EpiData、STATA、SPSS、SAS軟件等 錄入后的核對(duì)和整理 邏輯檢查、核對(duì) 排序(sorting) 建立新變量 數(shù)
4、據(jù)的編碼和轉(zhuǎn)換 缺失值的處理,八、 數(shù)據(jù)資料的整理,14,高等課堂,Dbase, FoxBase,Visual FoxPro,Lotus,數(shù)據(jù)錄入和管理軟件,15,高等課堂,用Epidata構(gòu)建調(diào)查表數(shù)據(jù)庫(kù),16,高等課堂,用Epidata錄入調(diào)查表,17,高等課堂,統(tǒng)計(jì)分析常用軟件,18,高等課堂,讓我們從一個(gè)簡(jiǎn)單的調(diào)查開始,研究目的:了解本班同學(xué)年齡、性別、身高等信息。 Step1: 建立調(diào)查表 文本編輯軟件:Word,19,高等課堂,Step 2:調(diào)查表數(shù)據(jù)錄入,20,高等課堂,EpiData軟件概述,一、EpiData的設(shè)計(jì) 設(shè)計(jì)者:丹麥的Jens M、Michael Bruus和英國(guó)
5、的Mark Myatt 編程者:丹麥的Michael Bruus 開發(fā)思路和原理:基于Epi Info 6.0 二、軟件下載和登記注冊(cè) 下載地址:http:/www.epidata.dk/ download.htm 三、版本信息 EpiData 1.5(2001年2月22日);EpiData 2.1a(2002年) EpiData 3.02(2004); EpiData 3.10(NOW) 四、安裝和系統(tǒng)要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP/7等操作系統(tǒng)下運(yùn)行,21,高等課堂,EpiData軟件概述,EpiData軟件安裝如同拷貝程序文檔一樣簡(jiǎn)單。例如,它可以從U盤運(yùn)行,
6、并且占用內(nèi)存很小(2.5M)。 由于捐助和志愿者的工作,軟件免費(fèi)發(fā)布,22,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,http:/www.epidata.dk,23,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,數(shù)據(jù)錄入,24,高等課堂,EpiData 軟件,EpiData 軟件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 軟件優(yōu)點(diǎn)基礎(chǔ)上開發(fā)研制的 Windows版軟件,25,高等課堂,EpiData 軟件,它一方面吸收了Epi Info軟件的長(zhǎng)處,同時(shí)又極具自身特色。 與 視窗版Epi Info軟件相比,占用空間小,更加簡(jiǎn)單易學(xué),且界面友好,可以很方便的對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行儲(chǔ)存、核對(duì)和管理等,26,高等課堂,
7、用EpiData軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)錄入和管理,將產(chǎn)生三種基本的文件; 每種文件具有固定的后綴,在數(shù)據(jù)錄入和管理中發(fā)揮不同作用。 (1)調(diào)查表文件:后綴為.QES。通過建立調(diào)查表文件,系統(tǒng)根據(jù)特定規(guī)則自動(dòng)定義數(shù)據(jù)文件的結(jié)構(gòu),包括變量名、變量類型和長(zhǎng)度等,用于數(shù)據(jù)錄入。 (2)數(shù)據(jù)文件:后綴為.REC。數(shù)據(jù)文件包含錄入的數(shù)據(jù)信息以及已經(jīng)定義好的編碼,用于數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析。 (3)核對(duì)文件:后綴為.CHK。通過建立核對(duì)文件,系統(tǒng)將定義數(shù)據(jù)錄入的有效性規(guī)則,EpiData Entry 的文件組成,27,高等課堂,EpiData Entry 的特點(diǎn),調(diào)查表設(shè)計(jì)便捷 數(shù)據(jù)核查功能強(qiáng)大且實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)便 與調(diào)查表形式一致的
8、可視數(shù)據(jù)錄入界面 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換功能強(qiáng)大,28,高等課堂,講了半天, EpiData究竟長(zhǎng)什么樣,29,高等課堂,請(qǐng)打開電腦上EpiData主程序,為何我的電腦上沒有歡迎使用EpiData,30,高等課堂,EpiData軟件的窗口介紹,31,高等課堂,編輯過程工具條,工具欄,數(shù)據(jù)表預(yù)覽,粘貼,字段編輯器,編碼編輯器,32,高等課堂,調(diào)查表文件的建立,數(shù)據(jù)文件: 原始數(shù)據(jù) 文件結(jié)構(gòu)(庫(kù)結(jié)構(gòu)) 字段名 字段類型 字段長(zhǎng)度,調(diào)查表信息 數(shù)據(jù)文件,33,高等課堂,建立調(diào)查表文件,建立調(diào)查表文件是建立數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)錄入和管理的第一步,34,高等課堂,建立調(diào)查表文件有以下幾種方法,第一種:在菜單中,點(diǎn)擊 “文
9、件”(File)“生成調(diào)查表文件QES文件” 第二種:在工作欄的工作流程中,點(diǎn)擊“1. 打開文件”(1.Define Data)“建立新QES文件” 第三種:在按鈕欄中,點(diǎn)擊 ,這時(shí)窗口中會(huì)在工作區(qū)顯示一個(gè)空白的文檔,你可以在此文檔中鍵入調(diào)查表內(nèi)容和框架,編輯完成后,將調(diào)查表文件保存,文件的擴(kuò)展名統(tǒng)一為.QES,35,高等課堂,假定現(xiàn)有一調(diào)查表如下,如何建立.QES文件,調(diào)查表 姓名:_ 性別:(1)男 (2)女 身高:_._ CM 出生日期:_年_月_日,36,高等課堂,如果按原調(diào)查表格式直接建立數(shù)據(jù)庫(kù),結(jié)果會(huì)怎樣,37,高等課堂,必須定義字段名和字段類型,38,高等課堂,調(diào)用字段編輯器:
10、第一種方法:直接按CTRL-Q鍵。 第二種方法:在編輯器工具條上點(diǎn)擊字段編輯器圖標(biāo),手工輸入或使用字段編輯器,39,高等課堂,字段類型介紹,數(shù)值型字段:#,#.# ;僅接受數(shù)字和空格,不輸按空格處理,分析時(shí)作缺失值處理,以“.”顯示。數(shù)字位數(shù)由“#”個(gè)數(shù)決定,小數(shù)位數(shù)由小數(shù)點(diǎn)右邊的“#”個(gè)數(shù)確定。最長(zhǎng)可達(dá)14位,小數(shù)點(diǎn)按1個(gè)字符計(jì)算,40,高等課堂,文本型字段:包括三種。一種是常用的文本(或下劃線、或底線)型字段:_;該型字段由連續(xù)下劃線來定義,長(zhǎng)度由下劃線字符個(gè)數(shù)決定,最大值為80,空白字段(字段內(nèi)容空缺)時(shí),數(shù)據(jù)管理時(shí)將按缺失值處理。另一種為大寫文本型字段,41,高等課堂,日期型字段:包括
11、兩種。一種為常用日期字段:、,分美式、英式兩種,輸入時(shí)即進(jìn)行合法性檢驗(yàn);只需輸入日期,系統(tǒng)自動(dòng)插入斜杠。另一種為自動(dòng)日期型字段:、 ;儲(chǔ)存或修改數(shù)據(jù)時(shí)該字段自動(dòng)輸入系統(tǒng)日期,如系統(tǒng)日期正確,也即當(dāng)天日期,42,高等課堂,自動(dòng)ID號(hào)型字段:;這是一種專用字段,用作記錄識(shí)別號(hào),文件的第一個(gè)記錄為1,以后記錄自動(dòng)賦值順次較前增加1,并自動(dòng)保證編號(hào)的唯一性。輸入數(shù)據(jù)時(shí)光標(biāo)跳過此字段。如需使第一個(gè)記錄號(hào)大于1,則可在“文件”菜單“選擇項(xiàng)”中的“高級(jí)設(shè)置”中設(shè)置。 邏輯型字段(即布爾函數(shù)型字段):;只接受Y、N、空格或回車鍵。后兩者作缺失值處理。Y、N字符輸入后即轉(zhuǎn)為大寫字母,43,高等課堂,我們按照這些
12、要求重新建立數(shù)據(jù)庫(kù),這次應(yīng)該成功了吧,先預(yù)覽一下,44,高等課堂,怎么會(huì)這樣,45,高等課堂,定義字段名(Field Names,以調(diào)查表中字段的第一個(gè)詞命名 (First word in question is field names) 使用 內(nèi)的內(nèi)容自動(dòng)添加字段名(Automatic field names,46,高等課堂,定義字段名(Field Names,文件”(File)“選項(xiàng)”(Option)“生成REC文件”(Create data file) 在“如何生成字段名”(How to generate field names)中選擇字段的命名方式,47,高等課堂,更新問題為實(shí)際文件名
13、”如果未勾選,48,高等課堂,預(yù)覽顯示的并非真實(shí)的字段名,如“姓名”, 真實(shí)的字段名是Field1,49,高等課堂,50,高等課堂,按 命名規(guī)則修改調(diào)查表,然后預(yù)覽生成REC文件,51,高等課堂,別忘了修改“選項(xiàng),否則會(huì)是這樣的,52,高等課堂,制作調(diào)查表文件可用EpiData編輯器進(jìn)行。 也可用Word或其它文本編輯器編寫。注意,必須以純文本格式存盤,文件后綴名必須是“.qes”。 也可在其它文本編輯器編寫,再粘貼到EpiData編輯器窗口,如何編寫調(diào)查表文件,53,高等課堂,編寫調(diào)查表文件注意事項(xiàng)(一,編寫過程中及時(shí)保存文件,文件類型為.qes文件。 系統(tǒng)只會(huì)根據(jù)“特殊符號(hào)”來定義一個(gè)輸入
14、字段(包括類型和長(zhǎng)度),并根據(jù)符號(hào)前的字符給字段命名。建議在編寫過程中利用“字段快速清單”插入“特殊符號(hào)”,即:選擇字段類型,定義好長(zhǎng)度后,按“插入”圖標(biāo),可避免由于“特殊符號(hào)”輸入錯(cuò)誤而不能產(chǎn)生有效的輸入字段。 調(diào)查表用中文編寫時(shí),可用定界符(“”)將字段名定義為英文字符(英文字母或英文字母阿拉伯?dāng)?shù)字),有利于數(shù)據(jù)庫(kù)的管理和其他軟件的統(tǒng)計(jì)分析。注意:“”必須為半角型,而不能是全角型(“”,54,高等課堂,盡可能把字段定義數(shù)值型,有利于統(tǒng)計(jì)分析。如糖尿病史“dmhis”可定義為數(shù)值型字段,“1”表示“有”,“0”表示“無”。 調(diào)查表文件格式盡可能和原調(diào)查表一致,有利于直觀錄入數(shù)據(jù)。 如果用其他
15、文本編輯器編寫.qes文件,在運(yùn)行EpiData后,打開該.qes文件即可編輯。 調(diào)查表文件的編寫是否符合要求,可通過“數(shù)據(jù)表預(yù)覽”來查看,編寫調(diào)查表文件注意事項(xiàng)(二,55,高等課堂,數(shù)據(jù)文件的產(chǎn)生和修改,主菜單選擇數(shù)據(jù)導(dǎo)入/導(dǎo)出菜單“根據(jù)QES文件生成REC文件” 在工作過程工具條按第二個(gè)按鈕“生成REC文件” 在編輯器菜單REC文件菜單選擇“生成REC文件,56,高等課堂,生成REC文件,57,高等課堂,58,高等課堂,請(qǐng)大家根據(jù)EPIDATA建立調(diào)查表庫(kù)data.qes,生成數(shù)據(jù)庫(kù),保存為data.rec,調(diào)查表 姓名:_ 性別:(1)男 (2)女 身高:_._ CM 出生日期:_年_月
16、_日,59,高等課堂,現(xiàn)在我們已經(jīng)有了兩個(gè)文件: *.QES 調(diào)查表文件 *.REC 數(shù)據(jù)文件 *.REC文件是根據(jù)QES文件生成的,用于數(shù)據(jù)錄入,萬一我的QES文件丟了怎么辦,60,高等課堂,數(shù)據(jù)文件結(jié)構(gòu)的修改,61,高等課堂,調(diào)查表結(jié)構(gòu)重新修改后怎么辦,數(shù)據(jù)庫(kù)建立后,錄入了一部分分?jǐn)?shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)漏掉了一個(gè)字段,于是重新修改調(diào)查表,這里可以根據(jù)修改后的QES文件更新REC文件,62,高等課堂,我一邊QQ聊天,一邊錄入數(shù)據(jù),萬一錄錯(cuò)了,軟件會(huì)通知我嗎,嗨!有第3種人嗎,63,高等課堂,核對(duì)文件的建立,核對(duì)文件:CHECK文件或 .CHK文件,范圍/合法值(Range/Legal) 跳轉(zhuǎn)(Jumps
17、) 必須輸入(MustEnter) 重復(fù)輸入(Repeat,64,高等課堂,65,高等課堂,光標(biāo)懸停,會(huì)提示你命令格式,66,高等課堂,錄入錯(cuò)誤時(shí),軟件會(huì)彈出警告,67,高等課堂,試試,如果將1改為20會(huì)怎樣?改為15會(huì)怎樣,關(guān)鍵字段的定義,以編號(hào)code2為例,這個(gè)編號(hào)具有唯一性,為避免重復(fù)輸入,可在CHK文件中定義: code2 KEY UNIQUE 1 MUSTENTER END,68,高等課堂,練習(xí),請(qǐng)大家根據(jù)下列調(diào)查表內(nèi)容,利用EPIDATA建立調(diào)查表數(shù)據(jù)庫(kù),保存為data1.qes,并生成data1.rec用于錄入資料,69,高等課堂,調(diào)查表 1.地區(qū)號(hào): N J 2.調(diào)查表編號(hào):
18、 3. 錄入ID號(hào): 4.姓名:_ 5.性別:(1)男 (2)女 6.你吸煙嗎? (1)否跳問7 (2)是 續(xù)問6.1 6.1 你多在年齡開始吸煙的? _ 歲 6.2 平均每天吸煙支數(shù)? _ 支 7.身高:_._ CM 8.血壓值(收縮壓/舒張壓): _ /_mmHg 9.出生日期:_月_日_年 10. 你是否具有下列癥狀?如有請(qǐng)?jiān)谙鄳?yīng)癥狀前打勾。 咳嗽 咳痰 發(fā)熱 胸痛 呼吸困難 咯血 11.調(diào)查表錄入日期: _月_日_年,錄入時(shí)自動(dòng)編碼,70,高等課堂,請(qǐng)大家根據(jù)data1.rec數(shù)據(jù)庫(kù),建立CHK文件,保存為data1.chk 要求: (1)地區(qū)號(hào)自動(dòng)錄入 (2)編號(hào)、姓名必須錄入 (3
19、)性別只能填1或2 (4)是否吸煙只能填1、2或9 (5)是否吸煙能夠?qū)崿F(xiàn)跳轉(zhuǎn) (6)平均每天吸煙支數(shù)的范圍在1-40之間或填99 并請(qǐng)嘗試錄入35份調(diào)查表,存盤,71,高等課堂,記錄刪除,此處僅是在記錄加上刪除標(biāo)記, 徹底刪除需至“工具”清理REC文件,點(diǎn)擊,72,高等課堂,如果研究對(duì)象是(1)男性,而我卻錄成了(2)女性,軟件好象不會(huì)彈出警告嘛,73,高等課堂,雙錄入核對(duì) double entry,為了確保錄入質(zhì)量,可以采用雙人錄入法進(jìn)行核對(duì)。 首先利用工具-復(fù)制REC文件結(jié)構(gòu),復(fù)制已建立好的數(shù)據(jù)庫(kù)(包括CHK文件),另存為一新庫(kù),但已錄入的數(shù)據(jù)不會(huì)被復(fù)制,74,高等課堂,雙錄入核對(duì) do
20、uble entry,如需要,可不復(fù)制字符型變量 因?yàn)榧彝プ≈?、工作單位等很少有人愿意錄入兩?75,高等課堂,兩次錄入的一致性檢驗(yàn),雙軌錄入完成后可進(jìn)行一致檢驗(yàn) 比較兩次錄入不同的地方 注意選擇兩數(shù)據(jù)庫(kù)中的匹配字段用于比較,76,高等課堂,77,高等課堂,78,高等課堂,調(diào)查表錄入兩次,比較后發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤再修改,好象太麻煩! 有沒有邊錄入邊比較的方法,79,高等課堂,雙錄入實(shí)時(shí)校驗(yàn),先點(diǎn)擊工具-準(zhǔn)備雙錄入實(shí)時(shí)校驗(yàn),80,高等課堂,雙錄入實(shí)時(shí)校驗(yàn),指定第1 次已錄入的REC文件 創(chuàng)建1新的REC文件,用于雙錄入,81,高等課堂,雙錄入實(shí)時(shí)校驗(yàn),應(yīng)注意錄入調(diào)查表的順序,82,高等課堂,顯示數(shù)據(jù),瀏覽數(shù)據(jù)庫(kù),83,高等課堂,其它一些常用功能,打印調(diào)查表
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